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ROMMEL THIAGO JUCA RAMOS

INSTITUTO DE CIENCIAS BIOLOGICAS

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rommel thiago juca ramos

ICBIO - INSTITUTO DE CIENCIAS BIOLOGICAS

Produção Intelectual

Artigos (154)

2023, JESUS, HENDOR N. R., NAVAS, JESUS, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, AGUIAR, ERIC R. G. R., Mattos-Guaraldi, Ana L., Pacheco, Luis G. C., RAMOS, JULIANA N., ROCHA, DANILO J. P. G., ALVES, DANIELE A., SILVA, CAROLINA S., CRUZ, JOÃO V. O., VIEIRA, VERÔNICA V., SOUZA, CASSIUS, SANTOS, LOUISY S. , The pan-genome of the emerging multidrug-resistant pathogen Corynebacterium striatum, ISSN: 1438793X
2023, BONNELLY, ROBERTO, FRANCO DE LOS SANTOS, EDIAN FRANKLIN, QUEIROZ CAVALCANTE, ANA LIDIA, CALDERON, VICTOR V., Baraúna, Rafael Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, RODRÍGUEZ-RODRÍGUEZ, YASET, DE FRANCISCO, LUIS ENRIQUE RODRÍGUEZ, MAROTO MARTÍN, LUIS ORLANDO, PERDOMO, OMAR PAINO , Beta-Lactam Susceptibility Profiles of Bacteria Isolated from the Ozama River in Santo Domingo, Dominican Republic, ISSN: 20711050
2023, MARTINS BALBINOT, KAROLYNY, ALVES JUNIOR, SERGIO DE MELO, VIANA PINHEIRO, JOÃO DE JESUS, ALMEIDA LOUREIRO, FELIPPE JOSÉ, CHEMELO, GIORDANNA PEREIRA, ALVES MESQUITA, RICARDO, CRUZ RAMOS, ALINE MARIA PEREIRA, Rommel Thiago Juca Ramos, DA COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ, DE MENEZES, SÍLVIO AUGUSTO FERNANDES, DA SILVA KATAOKA, MARIA SUELI , Immunoexpression of stem cell markers SOX-2, NANOG AND OCT4 in ameloblastoma, ISSN: 21678359
2023, LOBATO, AMALIA RAIANA FONSECA, ALVES, SANDY INGRID AGUIAR, Rommel Thiago Juca Ramos, RODRIGUES, YAN CORRÊA, BRASILIENSE, DANIELLE MURICI , Genomic analysis of Klebsiella pneumoniae high-risk clone ST11 co-harboring MCR-1.27 and KPC-2 recovered at a pediatric oncologic hospital in the Brazilian Amazon region, ISSN: 22137165
2023, DOS SANTOS RIBEIRO, PRISCYLA, DE OLIVEIRA, DAIANA, JAISWAL, ARUN KUMAR, BRENIG, BERTRAM, Soares, Siomar, Rommel Thiago Juca Ramos, MATIUZZI, MATEUS, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, FIGUEIRA, CLÁUDIO PEREIRA, COSTA, FEDERICO, RISTOW, PAULA, CARVALHO, NATÁLIA BARBOSA, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, ABURJAILE, FLÁVIA, SOUSA, THIAGO, VERÍSSIMO, GRACIETE, GOMES, TALITA, NEVES, FÁBIO, BLANCO, LUIZA, LIMA, JOÃO ANTONIO , Environmental Biofilms from an Urban Community in Salvador, Brazil, Shelter Previously Uncharacterized Saprophytic Leptospira, ISSN: 00953628
2023, MAIA, JOSÉ CLEVES DA SILVA, SOARES, SIOMAR CASTRO, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, COSTA, MATEUS MATIUZZI DA, GOUVEIA, JOÃO JOSÉ DE SIMONI, SILVA, GABRIEL AMORIM DE ALBUQUERQUE, CUNHA, LETÍCIA STHEFFANY DE BARROS, GOUVEIA, GISELE VENERONI, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, BRENIG, BERTRAM, ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA, ABURJAILE, FLÁVIA, Rommel Thiago Juca Ramos , Genomic Characterization of Aeromonas veronii Provides Insights into Taxonomic Assignment and Reveals Widespread Virulence and Resistance Genes throughout the World, ISSN: 20796382
2023, ALVES, SANDY INGRID AGUIAR, FERREIRA, VICTOR BENEDITO COSTA, DANTAS, CARLOS WILLIAN DIAS, SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA DA, Rommel Thiago Juca Ramos , EasySSR: a user-friendly web application with full command-line features for large-scale batch microsatellite mining and samples comparison, ISSN: 16648021
2022, CARDENAS-ALEGRIA, OSCAR VICTOR, DANTAS, CARLOS WILLIAN DIAS, SILVA GUEDES LOBATO, ELAINE MARIA, DA SILVA, SANDRO PATROCA, MORAES, CÁSSIA DE SOUSA, Cruz, Ana Cecília Ribeiro, Rommel Thiago Juca Ramos, Adriana Ribeiro Carneiro , Influence of soil management for soybean production under microbial diversity in amazon soils, ISSN: 2296665X
2022, JESUS, HENDOR N. R., AGUIAR, ERIC R. G. R., MARTÍNEZ-MARTÍNEZ, LUIZ, OCAMPO, ALAIN, ALIBI, SANA, DORTA, ALEXIS, Pacheco, Luis G. C., NAVAS, JESUS, ROCHA, DANILO J. P. G., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, BRENIG, BERTRAM, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, COSTA, MATEUS M., Soares, Siomar C., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Pan-genomic analysis of Corynebacterium amycolatum gives insights into molecular mechanisms underpinning the transition to a pathogenic phenotype, ISSN: 1664302X
2022, PINHEIRO, KENNY DA COSTA, GOIS, BRUNA VERÔNICA AZEVEDO, NOGUEIRA, WYLERSON GUIMARÃES, ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA, QUEIROZ, ANA LÍDIA CAVALCANTE, CARDENAS-ALEGRIA, OSCAR, DA SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA, JÚNIOR, ANTÔNIO MÁRCIO GOMES MARTINS, Rommel Thiago Juca Ramos , In silico approach to identify microsatellite candidate biomarkers to differentiate the biovar of Corynebacterium pseudotuberculosis genomes, ISSN: 26737647
2022, PEREIRA, CARINE RODRIGUES, de Castro Soares, Siomar, Rommel Thiago Juca Ramos, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, MATIUZZI DA COSTA, MATEUS, LAGE, ANDREY PEREIRA, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, SELES DORNELES, ELAINE MARIA, DE JESUS SOUSA, THIAGO, LIMA DA SILVA, ALESSANDRA, GONÇALVES DOS SANTOS, ROSELANE, MINHARRO, SÍLVIA, COSTA CUSTÓDIO, DIRCEIA APARECIDA, PICKARD, DEREK J., O?CALLAGHAN, DAVID, FOSTER, JEFFREY T. , First report and whole-genome sequencing of Pseudochrobactrum saccharolyticum in Latin America, ISSN: 12864579
2022, SCHULTZ, JÚNIA, de Castro Soares, Siomar, BRENIG, BERTRAM, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, ROSADO, ALEXANDRE S., PARISE, MARIANA TEIXEIRA DORNELLES, PARISE, DOGLAS, MEDEIROS, LAENNE G., SOUSA, THIAGO J., KATO, RODRIGO B., UETANABARO, ANA PAULA TROVATTI, ARAÚJO, FABRÍCIO, Rommel Thiago Juca Ramos , Unraveling the Genomic Potential of the Thermophilic Bacterium Anoxybacillus flavithermus from an Antarctic Geothermal Environment, ISSN: 20762607
2022, DA SILVA, MARIANA BARBALHO FARIAS, SELDIN, LUCY, DA MOTA, FABIO FARIA, JURELEVICIUS, DIOGO, DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON, DA COSTA, MATEUS MATIUZZI, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, Rommel Thiago Juca Ramos, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, ROSADO, ALEXANDRE SOARES , Genomic analyses of a novel bioemulsifier-producing Psychrobacillus strain isolated from soil of King George Island, Antarctica, ISSN: 14322056
2022, FORTUNATO COSTA, KELLE, ALMEIDA ARAÚJO, FABRÍCIO, Morais, Jefferson, LISBOA FRANCES, CARLOS RENATO, Rommel Thiago Juca Ramos , Text mining for identification of biological entities related to antibiotic resistant organisms, ISSN: 21678359
2022, VIDAL AMARAL, JOÃO RICARDO, BRENIG, BERTRAM, SOARES DE OLIVEIRA, SELMA, SOARES ROSADO, ALEXANDRE, Rommel Thiago Juca Ramos, ALMEIDA ARAÚJO, FABRÍCIO, BENTES KATO, RODRIGO, FIGUEIRA ABURJAILE, FLÁVIA, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, MATIUZZI DA COSTA, MATEUS, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Bacteriocin Producing Streptococcus agalactiae Strains Isolated from Bovine Mastitis in Brazil, ISSN: 20762607
2022, NOGUEIRA, WYLERSON GUIMARÃES, GOIS, BRUNA VERÔNICA AZEVEDO, PINHEIRO, KENNY DA COSTA, ARAGÃO, ANDRESSA DE OLIVEIRA, QUEIROZ, ANA LÍDIA CAVALCANTE, SILVA, ARTUR LUIZ DA, FOLADOR, ADRIANA CARNEIRO, Rommel Thiago Juca Ramos , Viral Metagenomics Reveals Widely Diverse Viral Community of Freshwater Amazonian Lake, ISSN: 22962565
2022, SILVA, SHEILA DA, MACRAE, ANDREW, OLIVEIRA, SELMA SOARES DE, GUEDES, FERNANDA ALVES DE FREITAS, AMARAL, JOÃO RICARDO VIDAL, RIBEIRO, JOSÉ ROBERTO DE ASSIS, SOUZA, YURI PINHEIRO ALVES DE, FREITAS-ALMEIDA, ÂNGELA CORREA DE, THOMPSON, FABIANO LOPES, Rommel Thiago Juca Ramos, WHITELEY, ANDREW STEVEN , Aeromonas allosaccharophila Strain AE59-TE2 Is Highly Antagonistic towards Multidrug-Resistant Human Pathogens, What Does Its Genome Tell Us?, ISSN: 20751729
2022, CARDENAS ALEGRIA, OSCAR, Adriana Ribeiro Carneiro, PIRES QUARESMA, MARIELLE, DIAS DANTAS, CARLOS WILLIAN, SILVA GUEDES LOBATO, ELAINE MARIA, DE OLIVEIRA ARAGÃO, ANDRESSA, PATROCA DA SILVA, SANDRO, COSTA BARROS DA SILVA, AMANDA, RIBEIRO CRUZ, ANA CECÍLIA, Rommel Thiago Juca Ramos , Impacts of soybean agriculture on the resistome of the Amazonian soil, ISSN: 1664302X
2021, CALDERÓN, VÍCTOR V., BONNELLY, ROBERTO, DEL ROSARIO, CAMILA, DUARTE, ALBERT, BARAÚNA, RAFAEL, Rommel Thiago Juca Ramos, PERDOMO, OMAR P., RODRIGUEZ DE FRANCISCO, LUIS E., FRANCO, EDIAN F. , Distribution of Beta-Lactamase Producing Gram-Negative Bacterial Isolates in Isabela River of Santo Domingo, Dominican Republic, ISSN: 1664302X
2021, OLIVEIRA DE ALMEIDA, MARCELLE, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, Silva, Artur, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, CANÁRIO VIANA, MARCUS VINICIUS, CARVALHO, RODRIGO, FIGUEIRA ABURJAILE, FLAVIA, MALCHER MIRANDA, FABIO, CANÁRIO CERQUEIRA, JANAÍNA, BRENIG, BERTRAM, GHOSH, PREETAM, Rommel Thiago Juca Ramos, KATO, RODRIGO BENTES , Characterization of the first vaginal genomes isolated in Brazil, ISSN: 21678359
2021, ARAÚJO, SUSANA, TACÃO, MARTA, BARAÚNA, RAFAEL, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, HENRIQUES, ISABEL , Genome analysis of two multidrug-resistant Escherichia coli O8:H9-ST48 strains isolated from lettuce, ISSN: 03781119
2021, ARAÚJO, S., SOUSA, M., TACÃO, M., BARAÚNA, R.A., Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos, ALVES, A., MANAIA, C.M., HENRIQUES, I. , Carbapenem-resistant bacteria over a wastewater treatment process: Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in untreated wastewater and intrinsically-resistant bacteria in final effluent, ISSN: 00489697
2021, CARVALHO, RODRIGO, GHOSH, PREETAM, GOES-NETO, ARISTOTELES, FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P., Soares, Siomar, Rommel Thiago Juca Ramos, Pinto, Anne, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, ABURJAILE, FLAVIA, CANARIO, MARCUS, NASCIMENTO, ANDRÉA M. A., CHARTONE-SOUZA, EDMAR, DE JESUS, LUIS, ZAMYATNIN, ANDREY A., BRENIG, BERTRAM, Debmalya Barh , Genomic Characterization of Multidrug-Resistant Escherichia coli BH100 Sub-strains, ISSN: 1664302X
2021, BRAGA, MARCUS DE BARROS, Rommel Thiago Juca Ramos, CARNEIRO, ADRIANA RIBEIRO, BRITO, SILVANA ROSSY DE, DINIZ, HUGO ALEX CARNEIRO, BOTELHO, MARCEL DO NASCIMENTO, VALLINOTO, ANTONIO CARLOS ROSÁRIO, FERNANDES, RAFAEL DA SILVA, SOUZA, GILBERTO NERINO DE, ROCHA, JONAS ELIAS CASTRO DA, DOLÁCIO, CÍCERO JORGE FONSECA, TAVARES, IVALDO DA SILVA, PINHEIRO, RAPHAEL RODRIGUES, NORONHA, FERNANDO NAPOLEÃO, RODRIGUES, LUANA LORENA SILVA , Artificial neural networks for short-term forecasting of cases, deaths, and hospital beds occupancy in the COVID-19 pandemic at the Brazilian Amazon, ISSN: 19326203
2021, FELICE, ANDREI G., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, OLIVEIRA, LETÍCIA C., OLIVEIRA, CARLO J., SOARES, SIOMAR D. C., BENEVIDES, LEANDRO J., ALVES, LEANDRO G., FREITAS, ALISSA S. F., RODRIGUES, THAÍS C. V., JAISWAL, ARUN K., Tiwari, Sandeep, GOMES, LUCAS G. R., MIRANDA, FÁBIO M., Rommel Thiago Juca Ramos , Pan-genomic analyses of 47 complete genomes of the genus and prediction of new vaccine targets and virulence factors of the species, ISSN: 07391102
2021, FRANCO, EDIAN F., RANA, PRATIP, CRUZ, ALINE, CALDERÓN, VÍCTOR V., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, GHOSH, PREETAM , Performance Comparison of Deep Learning Autoencoders for Cancer Subtype Detection Using Multi-Omics Data, ISSN: 20726694
2020, ROCHA, DANILO J.P., MARTÍNEZ-MARTÍNEZ, LUIS, PACHECO, LUIS G.C., NAVAS, JESÚS, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, BRENIG, BERTRAM, Silva, Artur, BLOM, JOCHEN, Rommel Thiago Juca Ramos, AGUIAR, ERIC R.G., CHAPARTEGUI-GONZÁLEZ, ITZIAR, FERNÁNDEZ-MARTÍNEZ, MARTA , Whole genome sequencing reveals misidentification of a multidrug-resistant urine clinical isolate as Corynebacterium urealyticum, ISSN: 22137165
2020, Marcus de Barros Braga, kenny C Pinheiro, ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA, MIRANDA, FÁBIO MALCHER, Artur Luis da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , Redundancy Treatment of NGS Contigs in Microbial Genome Finishing with Hashing-Based Approach, ISSN: 03029743
2020, AQUIME, JOÃO RAFAEL HABIB SOUZA, ZAMPIERI, LARA CAROLINA D?ARAÚJO PINTO, KATAOKA, MARIA SUELI DA SILVA, RIBEIRO, NELSON ANTONIO BAILÃO, JAEGER, RUY GASTALDONI, DA SILVA, ARTUR LUIZ, Rommel Thiago Juca Ramos, ALVES JÚNIOR, SÉRGIO DE MELO, PINHEIRO, JOÃO DE JESUS VIANA , Metallothionein Expression and its Influence on the In Vitro Biological Behavior of Mucoepidermoid Carcinoma, ISSN: 20734409
2020, Edwin J Ruenda, Rommel Thiago Juca Ramos, Edian Franklin de Los Santos, Orlando Belo, Jefferson Magalhães de Moraes , One-Class SVM to Identify Candidates to Reference Genes Based on the Augment of RNA-seq Data with Generative Adversarial Networks, ISSN: 03029743
2020, ALVES, JORIANNE, FOLADOR, ADRIANA, DIAS, LARISSA, MATEUS, JACKELINE, MARQUES, JOANA, GRAÇAS, DIEGO, Rommel Thiago Juca Ramos, SELDIN, LUCY, HENRIQUES, ISABEL, Silva, Artur , Resistome in Lake Bolonha, Brazilian Amazon: Identification of Genes Related to Resistance to Broad-Spectrum Antibiotics, ISSN: 1664302X
2020, LANNES-COSTA, PAMELLA SILVA, Silva, Artur, NAGAO, PRESCILLA EMY, Baraúna, Rafael Azevedo, RAMOS, JULIANA NUNES, VERAS, JOÃO FLAVIO CARNEIRO, CONCEIÇÃO, MARCOS VINÍCIUS REIS, VIEIRA, VERÔNICA VIANA, DE MATTOS-GUARALDI, ANA LUIZA, Rommel Thiago Juca Ramos, DORAN, KELLY S. , Comparative genomic analysis and identification of pathogenicity islands of hypervirulent ST-17 Streptococcus agalactiae Brazilian strain, ISSN: 15671348
2020, Jonas Elias Castro da Rocha, Gilberto Nerino de Souza Júnior, Silvana Rossy de Brito, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO FOLADOR, Rommel Thiago Juca Ramos, Marcus de Barros Braga, Marcel do Nascimento Botelho , REDES NEURAIS ARTIFICIAIS NA PREVISÃO DE CONTÁGIO E ÓBITOS POR COVID-19: UM ESTUDO NOESTADO DO PARÁ, BRASIL, ISSN: 22309926
2020, FRANCO, EDIAN F., RANA, PRATIP, QUEIROZ CAVALCANTE, ANA LIDIA, DA SILVA, ARTUR LUIZ, CYBELLE PINTO GOMIDE, ANNE, CARNEIRO FOLADOR, ADRIANA R., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, GHOSH, PREETAM, Rommel Thiago Juca Ramos , Co-Expression Networks for Causal Gene Identification Based on RNA-Seq Data of Corynebacterium pseudotuberculosis, ISSN: 20734425
2019, Edian Franklin de Los Santos, MAUÉS, DENER, Ronnie Alves, Luís Carlos Guimarães, Vasco, Artur Luis da Costa da Silva, Preetam Ghosh, Jefferson Magalhães de Moraes, Rommel Thiago Juca Ramos , A Clustering Approach to Identify Candidates to Housekeeping Genes Based on RNA-seq Data, ISSN: 03029743
2019, SOUSA, THIAGO DE JESUS, BRENIG, BERTRAM, COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ DA, GHOSH, PREETAM, Debmalya Barh, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, PARISE, DOGLAS, PROFETA, RODRIGO, PARISE, MARIANA TEIXEIRA DORNELLES, GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO, KATO, RODRIGO BENTOS, PEREIRA, FELIPE LUIZ, FIGUEIREDO, HENRIQUE CESAR PEREIRA, Rommel Thiago Juca Ramos , Re-sequencing and optical mapping reveals misassemblies and real inversions on Corynebacterium pseudotuberculosis genomes, ISSN: 20452322
2019, RANA, PRATIP, FRANCO, EDIAN F., RAO, YUG, SYED, KHAJAMOINUDDIN, Debmalya Barh, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, GHOSH, PREETAM , Evaluation of the Common Molecular Basis in Alzheimer?s and Parkinson?s Diseases, ISSN: 14220067
2019, ARAÚJO, CARLOS LEONARDO, ALVES, JORIANNE, NOGUEIRA, WYLERSON, PEREIRA, LINO CÉSAR, GOMIDE, ANNE CYBELLE, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, FOLADOR, ADRIANA , Prediction of new vaccine targets in the core genome of Corynebacterium pseudotuberculosis through omics approaches and reverse vaccinology, ISSN: 03781119
2019, SANTANA, PRISCILA DI PAULA BESSA, OHASHI, OTÁVIO MITIO, MIRANDA, MOYSÉS DOS SANTOS, SILVA, ARTUR LUIS DA COSTA DA, Rommel Thiago Juca Ramos, GONÇALVES, ARNALDO ALGARANHAR, COSTA, NATHALIA NOGUEIRA DA, RAMOS, PRISCILLA DO CARMO AZEVEDO, SILVA, THIAGO VELASCO GUIMARÃES, CORDEIRO, MARCELA DA SILVA, SANTOS, SIMONE DO SOCORRO DAMASCENO , Contributions of RNA-seq to improve in vitro embryo production (IVP), ISSN: 19843143
2019, FREITAS, DHARA Y., ARAÚJO, SUSANA, FOLADOR, ADRIANA R. C., Rommel Thiago Juca Ramos, AZEVEDO, JULIANA S. N., TACÃO, MARTA, Silva, Artur, HENRIQUES, ISABEL, BARAÚNA, RAFAEL A. , Extended Spectrum Beta-Lactamase-Producing Gram-Negative Bacteria Recovered From an Amazonian Lake Near the City of Belém, Brazil, ISSN: 1664302X
2018, juliana nunes ramos, GARALDI, ANA LUIZA M., VIEIRA, VERONICA V., izabel dos santos rodrigues, Paulo Victor Pereira Baio, João Flávio Carneiro Veras, Rommel Thiago Juca Ramos, Luis Gustavo Carvalho Pacheco, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Hirata Júnior, Raphael, Michel Abanto Marín , Genome sequence of a multidrug-resistant Corynebacterium striatum isolated from bloodstream infection from a nosocomial outbreak in Rio de Janeiro, Brazil, ISSN: 16788060
2018, SOUSA, AILTON LOPES DE, Rommel Thiago Juca Ramos, MAUÉS, DENER, LOBATO, AMÁLIA, FRANCO, EDIAN F., PINHEIRO, KENNY, ARAÚJO, FABRÍCIO, PANTOJA, YAN, COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ DA, Morais, Jefferson , PhageWeb - Web Interface for Rapid Identification and Characterization of Prophages in Bacterial Genomes, ISSN: 16648021
2018, SANTOS, ANDRÉ S., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, Hirata, Raphael, Mattos-Guaraldi, Ana L., Meyer, Roberto, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, FELICORI, LIZA, Pacheco, Luis G. C. , Searching whole genome sequences for biochemical identification features of emerging and reemerging pathogenic Corynebacterium species, ISSN: 14387948
2018, VERAS, ALLAN, ARAUJO, FABRICIO, PINHEIRO, KENNY, Guimarães, Luis, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Soares, Siomar, DA COSTA DA SILVA, ARTUR, Rommel Thiago Juca Ramos , Pan4Draft: A Computational Tool to Improve the Accuracy of Pan-Genomic Analysis Using Draft Genomes, ISSN: 20452322
2018, DIAS, LARISSA M, FOLADOR, ADRIANA R C, OLIVEIRA, AMANDA M, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, BARAÚNA, RAFAEL A , Genomic Architecture of the Two Cold-Adapted Genera Exiguobacterium and Psychrobacter: Evidence of Functional Reduction in the Exiguobacterium antarcticum B7 Genome, ISSN: 17596653
2018, FERREIRA, DALILA SOUZA SANTOS, BRENIG, BERTRAM, DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON, BENEVIDES, RAQUEL GUIMARÃES, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, KATO, RODRIGO BENTES, MIRANDA, FÁBIO MALCHER, DA COSTA PINHEIRO, KENNY, FONSECA, PAULA LUIZE CAMARGOS, TOMÉ, LUIZ MARCELO RIBEIRO, VAZ, ALINE BRUNA MARTINS, BADOTTI, FERNANDA, Rommel Thiago Juca Ramos , Draft genome sequence of Trametes villosa (Sw.) Kreisel CCMB561, a tropical white-rot Basidiomycota from the semiarid region of Brazil, ISSN: 23523409
2018, ARAUJO, FABRICIO ALMEIDA, Debmalya Barh, Silva, Artur, Guimarães, Luis, Rommel Thiago Juca Ramos , GO FEAT: a rapid web-based functional annotation tool for genomic and transcriptomic data, ISSN: 20452322
2018, Marcus Eslabao, Frederico Schmitt Kremer, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Luciano da Silva Pinto, Éverton Fagonde da Silva, odir antonio dellagostin , Genome of Leptospira borgpetersenii strain 4E, a highly virulent isolate obtained from Mus musculus in southern Brazil, ISSN: 00740276
2018, MIRANDA, FÁBIO MALCHER, Batista, Cassio, Artur Silva, Jefferson Magalhães de Moraes, NELSON CRUZ SAMPAIO NETO, Rommel Thiago Juca Ramos , Improving Metagenomic Assemblies Through Data Partitioning: A GC Content Approach, ISSN: 03029743
2017, BARAÚNA, RAFAEL A., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, RAMOS, ROMMEL T. J., VERAS, ADONNEY A. O., PINHEIRO, KENNY C., BENEVIDES, LEANDRO J., VIANA, MARCUS V. C., Luís Carlos Guimarães, EDMAN, JUDY M., SPIER, SHARON J. , Assessing the Genotypic Differences between Strains of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi through Comparative Genomics, ISSN: 19326203
2017, BARAÚNA, RAFAEL A., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, VERAS, ADONNEY A. O., DE SÁ, PABLO H. C. G., GUIMARÃES, LUÍS C., DAS GRAÇAS, DIEGO A., Carneiro, Adriana R., EDMAN, JUDY M., SPIER, SHARON J. , Genomic analysis of four strains of Corynebacterium pseudotuberculosis bv. Equi isolated from horses showing distinct signs of infection, ISSN: 19443277
2017, ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA, Rommel Thiago Juca Ramos, MARQUES, JOANA MONTEZANO, DE MOURA, VITÓRIA ALMEIDA GONÇALVES, Paula Schnneider, ANDRADE, SORAYA SILVA, LIMA, ALYNE CRISTINA SODRÉ, GUIMARÃES, LUIS CARLOS, FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO, Silva, Artur , Draft Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain PA07 Biovar ovis , Isolated from a Sheep Udder in Amazonia, ISSN: 21698287
2016, Guimarães, Luis C., BARBOSA, MARIA S., Guiso, Nicole, BADELL, EDGAR, Carneiro, Adriana R., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, VIANA, MARCUS V. C., BENEVIDES, LEANDRO J., MARIANO, DIEGO C. B., VERAS, ADOONEY A. O., SÁ, PABLO H. C., ROCHA, FLÁVIA S., VILAS BOAS, PRISCILLA C. B., Soares, Siomar C. , Draft Genome Sequence of Toxigenic Strain 04-7514, Isolated from a Dog in France, ISSN: 21698287
2016, LEÃO, TIAGO, GUIMARÃES, PEDRO IVO, DE MELO, ALINE GRASIELLE COSTA, Rommel Thiago Juca Ramos, LEÃO, PEDRO NUNO, Artur Luiz da Costa da Silva, FIORE, MARLI FATIMA, Paula Schnneider , Draft Genome Sequence of the N -Fixing Cyanobacterium CENA21, Isolated from the Brazilian Amazon Floodplain, ISSN: 21698287
2016, Guimarães, Luis C., BARBOSA, MARIA S., Guiso, Nicole, BADELL, EDGAR, Carneiro, Adriana R., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, VIANA, MARCUS V. C., BENEVIDES, LEANDRO J., MARIANO, DIEGO C. B., VERAS, ADOONEY A. O., SÁ, PABLO H. C., ROCHA, FLÁVIA S., VILAS BOAS, PRISCILLA C. B., Soares, Siomar C. , Draft Genome Sequence of Strain 04-3911, Isolated from Humans, ISSN: 21698287
2016, Luís Carlos Guimarães, BAGANO, PRISCILLA, PEREIRA, FELIPE LUIZ, DORELLA, FERNANDA ALVES, LEAL, CARLOS AUGUSTO, CARVALHO, ALEX FIORINI, BIZET, CHANTAL, GUISO, NICOLE, BADELL, EDGAR, FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA, Azevedo, Vasco, LOPES, THIAGO, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, CARNEIRO, ADRIANA RIBEIRO, CAVALCANTE, ANA LÍDIA QUEIROZ, BARRETO, DIEGO, DE SÁ, PABLO CARACCIOLO GOMES, VERAS, ADONNEY ALLAN OLIVEIRA, ROCHA, FLÁVIA SOUZA , Draft Genome Sequences of Two Pathogenic Corynebacterial Species Isolated from Cows, ISSN: 18399940
2016, Larissa Maranhão Dias, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Azevedo, Artur Silva, Adriana R Carneiro, Jorianne Thyeska Castro Alves, Adonney Allan de Oliveira Veras, BARÚNA, RAFAEL A., DE SA, P. H. C. G., SPIER, S. J., Edman, J., Luis Guimaraes, Flavia Rocha , Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 226, Isolated from the Abscess of a Goat in California, ISSN: 21698287
2016, ALVES, JORIANNE T. C., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, Carneiro, Adriana R., VERAS, ADONNEY A. O., CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q., DE SÁ, PABLO H. C. G., DIAS, LARISSA M., Guimarães, Luis C., MORAIS, EZEQUIEL, SILVA, ANDRÉ G. M., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain PA01, Isolated from Sheep in Pará, Brazil, ISSN: 21698287
2016, MARIANO, DIEGO C. B., Debmalya Barh, FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P., Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, AZEVEDO, VASCO A. C., PEREIRA, FELIPE L., AGUIAR, EDGAR L., OLIVEIRA, LETÍCIA C., BENEVIDES, LEANDRO, GUIMARÃES, LUÍS C., FOLADOR, EDSON L., SOUSA, THIAGO J., GHOSH, PREETAM , SIMBA: a web tool for managing bacterial genome assembly generated by Ion PGM sequencing technology, ISSN: 14712105
2016, MUGE, GABRIEL R. S., FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, VERAS, ADONNEY A. O., DE SÁ, PABLO H. C. G., CAVALCANTE, ANA LÍDIA QUEIROZ, ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO, MORAIS, EZEQUIEL, SILVA, ANDRÉ G. M., GUIMARÃES, LUÍS C., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Genome Sequence of Strain PA02 Isolated from an Ovine Host in the Amazon, ISSN: 21698287
2016, KAWASAKI, REGIANE, BARAÚNA, RAFAEL A., Silva, Artur, CAREPO, MARTA S. P., OLIVEIRA, RUI, MARQUES, RODOLFO, Rommel Thiago Juca Ramos, SCHNEIDER, MARIA P. C. , Reconstruction of the Fatty Acid Biosynthetic Pathway of B7 Based on Genomic and Bibliomic Data, ISSN: 23146133
2016, Guimarães, Luis C., BARBOSA, MARIA S., Guiso, Nicole, BADELL, EDGAR, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, VIANA, MARCUS V. C., BENEVIDES, LEANDRO J., MARIANO, DIEGO C. B., VERAS, ADONNEY A. O., SÁ, PABLO H. C., ROCHA, FLÁVIA S., VILAS BOAS, PRISCILLA C. B., SOARES, SIOMAR C. , Draft Genome Sequence of Toxigenic Strain 03-8664 Isolated from a Human Throat, ISSN: 21698287
2016, MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA, DORELLA, FERNANDA ALVES, DE CARVALHO, ALEX FIORINI, LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES, FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho, SOUSA, THIAGO DE JESUS, PEREIRA, FELIPE LUIZ, ABURJAILE, FLÁVIA, Debmalya Barh, ROCHA, FLÁVIA, PINTO, ANNE CYBELLE, HASSAN, SYED SHAH, SARAIVA, TESSÁLIA DINIZ LUERCE , Whole-genome optical mapping reveals a mis-assembly between two rRNA operons of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002, ISSN: 14712164
2016, DE SÁ, PABLO H. C. G., Rommel Thiago Juca Ramos, MIRANDA, FÁBIO, VERAS, ADONNEY, DE MELO, DIEGO MAGALHÃES, Soares, Siomar, PINHEIRO, KENNY, Guimarães, Luis, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur , GapBlaster-A Graphical Gap Filler for Prokaryote Genomes, ISSN: 19326203
2016, SANTOS, LEONARDO N., PINHEIRO, CARINA S., ALCANTARA-NEVES, NEUZA M., PACHECO, LUIS G.C., SILVA, EDUARDO S., SANTOS, ANDRÉ S., DE SÁ, PABLO H., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, COOPER, PHILIP J., BARRETO, MAURÍCIO L., LOUREIRO, SEBASTIÃO , De novo assembly and characterization of the Trichuris trichiura adult worm transcriptome using Ion Torrent sequencing, ISSN: 0001706X
2016, ARAÚJO, CARLOS LEONARDO DE A., Carneiro, Adriana R., DIAS, LARISSA M., VERAS, ADONNEY A. O., ALVES, JORIANNE T. C., CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q., DOWSON, CHRISTOPHER G., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva , Whole-Genome Sequence of 262 Biovar Isolated from Cow Milk, ISSN: 21698287
2015, SOUSA, THIAGO JESUS, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, FIGUEIREDO, HENRIQUE, Almeida, Sintia, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, MARIANO, DIEGO, PARISE, DOGLAS, PARISE, MARIANA, VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO, GUIMARÃES, LUIS CARLOS, BENEVIDES, LEANDRO JESUS, ROCHA, FLÁVIA, BAGANO, PRISCILLA , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 12C, ISSN: 21698287
2015, Luís Carlos Guimarães, Siomar Castro Soares, Trost, Eva, Jochen Blom, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Barh, Debmalya, Vasco , Genome informatics and vaccine targets in Corynebacterium urealyticum using two whole genomes, comparative genomics, and reverse vaccinology, ISSN: 14712164
2015, Joseph J Nalluri, Preetam Ghosh, Bhanu K Kamapantula, Debmalya Barh, Neha Jain, Antaripa Bhattacharya, Sintia Almeira, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Vasco , DISMIRA: Prioritization of disease candidates in miRNA-disease associations based on maximum weighted matching inference model and motif-based analysis, ISSN: 14712164
2015, DE OLIVEIRA VERAS, ADONNEY ALLAN, MARINHO, DIOGO, RODRIGUES, MATEUS, FREIRE, MATHEUS, ZAHLOUTH, RAMIRO, RENAN, WENDEL, LOPES, THIAGO SOUZA, MATTÉ, MARIA HELENA, DA SILVA MAYER, CINTIA CAROLINA, DE ALMEIDA VASCONCELOS BARBONI, SUZI, MATTÉ, GLAVUR ROGÉRIO, DA SILVA, MIRIAM LOPES, Carneiro, Adriana Ribeiro, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos, GOMES, JAQUELINE CONCEIÇÃO MEIRELES, DIAS, LARISSA MARANHÃO, DE SÁ, PABLO CARACCIOLO GOMES, ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO, CASTRO, WENDEL, MIRANDA, FÁBIO, KAZUO, EHILTON , Draft Genome Sequences of Vibrio fluvialis Strains 560 and 539, Isolated from Environmental Samples, ISSN: 21698287
2015, Amjad Ali, Debmalya Barh, FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA, USSERY, DAVID W., MIYOSHI, Anderson, Artur Luiz da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, NAZ, ANAM, Soares, Siomar C, BAKHTIAR, MARRIAM, Tiwari, Sandeep, HASSAN, SYED S, HANAN, FAZAL, Rommel Thiago Juca Ramos, PEREIRA, ULISSES , Pan-Genome Analysis of Human Gastric Pathogen : Comparative Genomics and Pathogenomics Approaches to Identify Regions Associated with Pathogenicity and Prediction of Potential Core Therapeutic Targets, ISSN: 23146133
2015, BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS, CARVALHO, ALEX FIORINI, SOARES, SIOMAR DE CASTRO, Carneiro, Adriana, Rommel Thiago Juca Ramos, BADELL-OCANDO, EDGAR, Guiso, Nicole, Artur Luiz da Costa da Silva, FIGUEIREDO, HENRIQUE, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, GUIMARÃES, LUIS CARLOS, VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO, MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA, ROCHA, FLÁVIA DE SOUZA, BAGANO, PRISCILLA CAROLINNE, FOLADOR, EDSON LUIZ, PEREIRA, FELIPE LUIZ, DORELLA, FERNANDA ALVES, LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES , Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain FRC11, ISSN: 21698287
2015, DE SÁ, PABLO H.C.G., Rommel Thiago Juca Ramos, VERAS, ADONNEY A.O., Carneiro, Adriana R., PINHEIRO, KENNY C., Pinto, Anne C., Soares, Siomar C., SCHNEIDER, MARIA P.C., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur , The impact of quality filter for RNA-Seq, ISSN: 03781119
2015, MARIANO, DIEGO CB, PEREIRA, FELIPE L, GHOSH, PREETAM, Barh, Debmalya, FIGUEIREDO, HENRIQUE CP, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , MapRepeat: an approach for effective assembly of repetitive regions in prokaryotic genomes, ISSN: 09732063
2015, Luis G. C. Pacheco, Alex F. Carvalho, Carlos G. Leal, Henrique C. P. Figueiredo, Juliana N. Ramos, Veronica V. Vieira, Eric Farfour, Nicole Guiso, Raphael Hirata Jr, Vasco Azevedo, Artur Silva, Ana L. Mattos Guarald, Rommel Thiago Juca Ramos, Carolina S. Santos, Adonney Allan de Oliveira Veras, GUIMARAES, L. C., Vinícius Abreu, Felipe L. Pereira, SOARES, SIOMAR C., Fernanda A. Dorella , Draft Genome Sequences of Two Species of -Difficult-to-Identify- Human-Pathogenic Corynebacteria: Implications for Better Identification Tests, ISSN: 18399940
2015, GUIMARÃES, PEDRO IVO, LEÃO, TIAGO FERREIRA, DE MELO, ALINE GRASIELLE COSTA, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, FIORE, MARLI FATIMA, Paula Schnneider , Draft Genome Sequence of the Picocyanobacterium sp. Strain GFB01, Isolated from a Freshwater Lagoon in the Brazilian Amazon, ISSN: 21698287
2015, Mattos-Guaraldi, Ana L., Hirata, Raphael, Azevedo, Vasco, Pacheco, Luis G. C., Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, Guimarães, Luis C., SANTOS, CAROLINA S., VERAS, ADONNEY A. O., Carneiro, Adriana R., Soares, Siomar C., RAMOS, JULIANA N., SOUZA, CASSIUS, VIEIRA, VERONICA V. , Draft Genome Sequence of Corynebacterium striatum 1961 BR-RJ/09, a Multidrug-Susceptible Strain Isolated from the Urine of a Hospitalized 37-Year-Old Female Patient, ISSN: 21698287
2015, DE SÁ, PABLO H.C.G., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, VERAS, ADONNEY A.O., Carneiro, Adriana R., BARÚNA, RAFAEL A., GUIMARÃES, LUÍS C., PINHEIRO, KENNY C., Pinto, Anne C., SOARES, SIOMAR C., SCHNEIDER, MARIA P.C. , Corynebacterium pseudotuberculosis RNA-seq data from abiotic stresses, ISSN: 23523409
2015, SOARES, SIOMAR C., Silva, Artur, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, GEYIK, HAKAN, Rommel Thiago Juca Ramos, DE SÁ, PABLO H.C.G., BARBOSA, EUDES G.V., Baumbach, Jan, FIGUEIREDO, HENRIQUE C.P., MIYOSHI, Anderson, Tauch, Andreas , GIPSy: genomic island prediction software, ISSN: 01681656
2015, GOMES DE SÁ, PABLO, SCHNEIDER, MARIA, Silva, Artur, VERAS, ADONNEY, FONTANA, CARLA SUERTEGARAY, ALEIXO, ALEXANDRE, BURLAMAQUI, TIBÉRIO, MELLO, CLAUDIO VIANNA, DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO, PROSDOCIMI, FRANCISCO, Rommel Thiago Juca Ramos , The assembly and annotation of the complete Rufous-bellied thrush mitochondrial genome, ISSN: 19401736
2015, CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, Carneiro, Adriana R., DIAS, LARISSA M., ALVES, JORIANNE T. C., VERAS, ADONNEY A. O., Guimarães, Luis C., ROCHA, FLÁVIA S., GALA-GARCÍA, ALFONSO, RETAMAL, PATRICIO, Rommel Thiago Juca Ramos , Complete Genome Sequence of Strain E19, Isolated from a Horse in Chile, ISSN: 21698287
2015, CARLOS GUIMARAES, LUIS, BENEVIDES DE JESUS, LEANDRO, VINICIUS CANARIO VIANA, MARCUS, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Inside of the Pan-Genome - Methods and Software Overview, ISSN: 13892029
2014, Diego Assis das Graças, Rommel Thiago Juca Ramos, SÁ, PABLO GOMES, Baraúna, Rafael Azevedo, GHILARDI JR., RUBENS, Paula Schnneider, Artur Luiz da Costa da Silva , Semiconductor Sequencing Reveals the Diversity of Bacterial Communities in an Amazonian Reservoir, ISSN: 21689148
2014, SILVA, A. D. S. D. S., DA SILVA, A. L. D. C., Rommel Thiago Juca Ramos, BARAUNA, R. A., DE SA, P. C. G., DAS GRACAS, D. A., Carneiro, A. R., THOUVENIN, M., Azevedo, V., BADELL, E., GUISO, N. , Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans FRC58, Isolated from the Bronchitic Aspiration of a Patient in France, ISSN: 21698287
2014, PINTO, ANNE CYBELLE, DE PAULA CASTRO, THIAGO LUIZ, Miyoshi, Anderson, SCHNEIDER, MARIA P, Silva, Artur, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, DE SÁ, PABLO HENRIQUE, Rommel Thiago Juca Ramos, BARBOSA, SILVANIRA, BARBOSA, HIVANA P, RIBEIRO, ADRIANA CARNEIRO, SILVA, WANDERSON MARQUES, ROCHA, FLÁVIA SOUZA, SANTANA, MARIANA PASSOS , Differential transcriptional profile of Corynebacterium pseudotuberculosis in response to abiotic stresses, ISSN: 14712164
2014, Eudes Guilherme Vieira Barbosa, Flavia Figueira Aburjaile, Rommel Thiago Juca Ramos, Adriana Ribeiro Carneiro, Le Loir, Y., Baumbach, Jan, Anderson Miyoshi, Artur Luiz Da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Value of a newly sequenced bacterial genome, ISSN: 19498454
2014, CARVALHO, DAIANE M., Meyer, Roberto, Artur Luiz da Costa da Silva, Azevedo, Vasco, Rommel Thiago Juca Ramos, Pacheco, Luis G. C., DE SÁ, PABLO H., Castro, Thiago L. P., CARVALHO, RODRIGO D., Pinto, Anne, GIL, DANILO J. P., BAGANO, PRISCILLA, BASTOS, BRUNO, COSTA, LILIA F. M. , Reference genes for RT-qPCR studies in Corynebacterium pseudotuberculosis identified through analysis of RNA-seq data, ISSN: 00036072
2014, CASTRO, W. D. O., TORRES-BALLESTEROS, A. M., NAKAYAMA, C. R., MELO, I. S., Vivian Helena Pellizari, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , Draft Genome Sequence of Haloferax sp. Strain ATB1, Isolated from a Semi-Arid Region in the Brazilian Caatinga, ISSN: 21698287
2014, FALCÃO, ALINE SEMBLANO CARREIRA, FREITAS, VANESSA M., JAEGER, RUY G., PINHEIRO, JOÃO J. V., KATAOKA, MARIA SUELI DA SILVA, RIBEIRO, NÉLSON ANTONIO BAILÃO, DINIZ, JOSÉ ANTONIO PICANÇO, ALVES, SÉRGIO MELO, RIBEIRO, ANDRÉ L. RIBEIRO, SIQUEIRA, ADRIANE SOUSA DE, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , A Novel Cell Line Derived from Pleomorphic Adenoma Expresses MMP2, MMP9, TIMP1, TIMP2, and Shows Numeric Chromosomal Anomalies, ISSN: 19326203
2014, OLIVEIRA, L. C., JUNIOR, A. F. O., Aderson Rodrigues dos Santos, PINTO, A. C., SOUZA, B. M., CASTRO, C. P., Diniz, C. A. A., ROCHA, C. S., MARIANO, D. C. B., DE AGUIAR, E. L., FOLADOR, E. L., SARAIVA, T. D. L., Eudes Guilherme Vieira Barbosa, Aburjaile, F. F., GONCALVES, L. A., Luís Carlos Guimarães, AZEVEDO, M., AGRESTI, P. C. M., SILVA, R. F., Tiwari, S., ALMEIDA, S. S., Hassan, S. S., Siomar Castro Soares, PEREIRA, V. B., Vinicíus AC Abreu, Pereira, U. P., Fernanda Alves Dorella, CARVALHO, A. F., PEREIRA, F. L., LEAL, C. A. G., FIGUEIREDO, H. C. P., Artur Luiz da Costa da Silva, MIYOSHI, A., Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Azevedo, SA, P. H. C. G., Adriana Ribeiro Carneiro, MIRANDA, F., FREIRE, M., RENAN, W. , Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA-Producing Strain, ISSN: 21698287
2014, BARBOSA, HIVANA P, Adriano MC Pimenta, Marta Carepo, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Vivian Helena Pellizari, SCHNEIDER, MARIA PAULA, Artur Luis da Costa da Silva, BARAÚNA, RAFAEL A, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, Rommel Thiago Juca Ramos, Felipe Nóbrega, Catarina Nunes, GRAÇAS, DIEGO A, Adriana R Carneiro, Daniel M Santos , Omics profiles used to evaluate the gene expression of Exiguobacterium antarcticum B7 during cold adaptation, ISSN: 14712164
2014, DE SA, P. C. G., MATTE, M. H., SATO, M. I. Z., HACHICH, E. M., MATTE, G. R., Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, DA SILVA, M. L., Carneiro, A. R., GOMES, J. C. M., DIAS, L. M., ALVES, J. T. C., DE OLIVEIRA VERAS, A. A., BARAUNA, R. A., DAS GRACAS, D. A. , Draft Genome Sequence of Non-O1 and Non-O139 Vibrio cholerae Strain VCC19, ISSN: 21698287
2014, BARAUNA, R. A., VIANA, M. V. C., Carneiro, A. R., Schneider, M. P. C., SPIER, S. J., EDMAN, J. M., Rommel Thiago Juca Ramos, Azevedo, V., Artur Luiz da Costa da Silva, Guimaraes, L. C., Adonney Allan de Oliveira Veras, DE SA, P. H. C. G., GRACAS, D. A., Kenny da Costa Pinheiro, SILVA, A. S. S., FOLADOR, E. L., BENEVIDES, L. J. , Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis MB20 bv. equi Isolated from a Pectoral Abscess of an Oldenburg Horse in California, ISSN: 21698287
2014, Adonney Allan de Oliveira Veras, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, kenny C Pinheiro, DAS GRAÇAS, DIEGO A, Rafael Baraúna, Maria Paula Cruz Schneider, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz Da Costa da Silva , Efficiency of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31 Genome Assembly with the Hi-Q Enzyme on an Ion Torrent PGM Sequencing Platform, ISSN: 0974276X
2014, Diego Assis das Graças, Rommel Thiago Juca Ramos, SÁ, PABLO GOMES, Baraúna, Rafael Azevedo, GHILARDI JR., RUBENS, Paula Schnneider, Artur Luiz da Costa da Silva , Semiconductor Sequencing Reveals the Diversity of Bacterial Communities in an Amazonian Reservoir, ISSN: 21689148
2014, SILVA, A. D. S. D. S., DA SILVA, A. L. D. C., Rommel Thiago Juca Ramos, BARAUNA, R. A., DE SA, P. C. G., DAS GRACAS, D. A., Carneiro, A. R., THOUVENIN, M., Azevedo, V., BADELL, E., GUISO, N. , Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans FRC58, Isolated from the Bronchitic Aspiration of a Patient in France, ISSN: 21698287
2014, PINTO, ANNE CYBELLE, DE PAULA CASTRO, THIAGO LUIZ, Miyoshi, Anderson, SCHNEIDER, MARIA P, Silva, Artur, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, DE SÁ, PABLO HENRIQUE, Rommel Thiago Juca Ramos, BARBOSA, SILVANIRA, BARBOSA, HIVANA P, RIBEIRO, ADRIANA CARNEIRO, SILVA, WANDERSON MARQUES, ROCHA, FLÁVIA SOUZA, SANTANA, MARIANA PASSOS , Differential transcriptional profile of Corynebacterium pseudotuberculosis in response to abiotic stresses, ISSN: 14712164
2014, Eudes Guilherme Vieira Barbosa, Flavia Figueira Aburjaile, Rommel Thiago Juca Ramos, Adriana Ribeiro Carneiro, Le Loir, Y., Baumbach, Jan, Anderson Miyoshi, Artur Luiz Da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Value of a newly sequenced bacterial genome, ISSN: 19498454
2014, CARVALHO, DAIANE M., Meyer, Roberto, Artur Luiz da Costa da Silva, Azevedo, Vasco, Rommel Thiago Juca Ramos, Pacheco, Luis G. C., DE SÁ, PABLO H., Castro, Thiago L. P., CARVALHO, RODRIGO D., Pinto, Anne, GIL, DANILO J. P., BAGANO, PRISCILLA, BASTOS, BRUNO, COSTA, LILIA F. M. , Reference genes for RT-qPCR studies in Corynebacterium pseudotuberculosis identified through analysis of RNA-seq data, ISSN: 00036072
2014, CASTRO, W. D. O., TORRES-BALLESTEROS, A. M., NAKAYAMA, C. R., MELO, I. S., Vivian Helena Pellizari, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , Draft Genome Sequence of Haloferax sp. Strain ATB1, Isolated from a Semi-Arid Region in the Brazilian Caatinga, ISSN: 21698287
2014, FALCÃO, ALINE SEMBLANO CARREIRA, FREITAS, VANESSA M., JAEGER, RUY G., PINHEIRO, JOÃO J. V., KATAOKA, MARIA SUELI DA SILVA, RIBEIRO, NÉLSON ANTONIO BAILÃO, DINIZ, JOSÉ ANTONIO PICANÇO, ALVES, SÉRGIO MELO, RIBEIRO, ANDRÉ L. RIBEIRO, SIQUEIRA, ADRIANE SOUSA DE, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , A Novel Cell Line Derived from Pleomorphic Adenoma Expresses MMP2, MMP9, TIMP1, TIMP2, and Shows Numeric Chromosomal Anomalies, ISSN: 19326203
2014, OLIVEIRA, L. C., JUNIOR, A. F. O., Aderson Rodrigues dos Santos, PINTO, A. C., SOUZA, B. M., CASTRO, C. P., Diniz, C. A. A., ROCHA, C. S., MARIANO, D. C. B., DE AGUIAR, E. L., FOLADOR, E. L., SARAIVA, T. D. L., Eudes Guilherme Vieira Barbosa, Aburjaile, F. F., GONCALVES, L. A., Luís Carlos Guimarães, AZEVEDO, M., AGRESTI, P. C. M., SILVA, R. F., Tiwari, S., ALMEIDA, S. S., Hassan, S. S., Siomar Castro Soares, PEREIRA, V. B., Vinicíus AC Abreu, Pereira, U. P., Fernanda Alves Dorella, CARVALHO, A. F., PEREIRA, F. L., LEAL, C. A. G., FIGUEIREDO, H. C. P., Artur Luiz da Costa da Silva, MIYOSHI, A., Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Azevedo, SA, P. H. C. G., Adriana Ribeiro Carneiro, MIRANDA, F., FREIRE, M., RENAN, W. , Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA-Producing Strain, ISSN: 21698287
2014, BARBOSA, HIVANA P, Adriano MC Pimenta, Marta Carepo, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Vivian Helena Pellizari, SCHNEIDER, MARIA PAULA, Artur Luis da Costa da Silva, BARAÚNA, RAFAEL A, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, Rommel Thiago Juca Ramos, Felipe Nóbrega, Catarina Nunes, GRAÇAS, DIEGO A, Adriana R Carneiro, Daniel M Santos , Omics profiles used to evaluate the gene expression of Exiguobacterium antarcticum B7 during cold adaptation, ISSN: 14712164
2014, DE SA, P. C. G., MATTE, M. H., SATO, M. I. Z., HACHICH, E. M., MATTE, G. R., Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, DA SILVA, M. L., Carneiro, A. R., GOMES, J. C. M., DIAS, L. M., ALVES, J. T. C., DE OLIVEIRA VERAS, A. A., BARAUNA, R. A., DAS GRACAS, D. A. , Draft Genome Sequence of Non-O1 and Non-O139 Vibrio cholerae Strain VCC19, ISSN: 21698287
2014, BARAUNA, R. A., VIANA, M. V. C., Carneiro, A. R., Schneider, M. P. C., SPIER, S. J., EDMAN, J. M., Rommel Thiago Juca Ramos, Azevedo, V., Artur Luiz da Costa da Silva, Guimaraes, L. C., Adonney Allan de Oliveira Veras, DE SA, P. H. C. G., GRACAS, D. A., Kenny da Costa Pinheiro, SILVA, A. S. S., FOLADOR, E. L., BENEVIDES, L. J. , Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis MB20 bv. equi Isolated from a Pectoral Abscess of an Oldenburg Horse in California, ISSN: 21698287
2014, Adonney Allan de Oliveira Veras, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, kenny C Pinheiro, DAS GRAÇAS, DIEGO A, Rafael Baraúna, Maria Paula Cruz Schneider, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz Da Costa da Silva , Efficiency of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31 Genome Assembly with the Hi-Q Enzyme on an Ion Torrent PGM Sequencing Platform, ISSN: 0974276X
2013, Deb Barh, Carneiro, Adriana R, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho , Exoproteome and Secretome Derived Broad Spectrum Novel Drug and Vaccine Candidates in Vibrio cholerae Targeted by Piper betel Derived Compounds, ISSN: 19326203
2013, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, Carneiro, Adriana Ribeiro, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, BARBOSA, SILVANIRA, VARUZZA, LEONARDO, ORABONA, GUILHERME, Tauch, Andreas, Azevedo, Vasco, SCHNEIDER, MARIA PAULA , High efficiency application of a mate-paired library from Next-Generation Sequencing to PostLight sequencing: Corynebacterium pseudotuberculosis as a case study for microbial de novo genome assembly, ISSN: 01677012
2013, Siomar Soares, Anderson2, Sintia Almeira, Luis Guimarães, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Vasco , The Pan-Genome of the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis Reveals Differences in Genome Plasticity between the Biovar ovis and equi Strains, ISSN: 19326203
2013, LEAO, S. C., Artur Luiz da Costa da Silva, MATSUMOTO, C. K., VIANA-NIERO, C., Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, A. R., Barbosa, M. S., LIMA, K. V. B., LOPES, M. L., Azevedo, V. , Draft Genome Sequence of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii INCQS 00594, ISSN: 21698287
2013, DORELLA, FERNANDA A, SEYFFERT, NUBIA, EL-AOUAR, RACHID A, SILVA, RENATA, HASSAN, SYED S, CASTO, THIAGO LP, MARQUES, WANDERSON S, Rommel Thiago Juca Ramos, CARNEIRO, ADRIANA, SÁ, PABLO DE, Miyoshi, Anderson, GALA-GARCIA, ALFONSO, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, PINTO, ANNE C, SARROUH, BOUTROS, ANTUNES, CAMILA A, RIBEIRO, DAYANA, ABURJAILE, FLÁVIA, FIAUX, KARINA K, Guimarães, Luis C , Progression of 'OMICS' methodologies for understanding the pathogenicity of Corynebacterium pseudotuberculosis: the Brazilian experience, ISSN: 20010370
2013, Castro, Thiago L. P., Seyffert, Núbia, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana R, Paula Schnneider, Vasco, Artur Luis da Costa da Silva , Ion Torrent-based transcriptional assessment of a Corynebacterium pseudotuberculosis equi strain reveals denaturing high-performance liquid chromatography a promising rRNA depletion method, ISSN: 17517915
2013, LEÃO, SYLVIA CARDOSO, AZEVEDO, VASCO ARISTON, DA COSTA DA SILVA, ARTUR, MATSUMOTO, CRISTIANNE KAYOKO, CARNEIRO, ADRIANA, Rommel Thiago Juca Ramos, NOGUEIRA, CHRISTIANE LOURENÇO, JUNIOR, JAMES DALTRO LIMA, LIMA, KARLA VALÉRIA, LOPES, MARIA LUIZA, Schneider, Horacio , The Detection and Sequencing of a Broad-Host-Range Conjugative IncP-1β Plasmid in an Epidemic Strain of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii, ISSN: 19326203
2013, MARINHO ALMEIDA, D., ARAUJO, W. L., Artur Luiz da Costa da Silva, Artur Luiz da Costa da Silva, DINI-ANDREOTE, F., CAMARGO NEVES, A. A., Rommel Thiago Juca Ramos, ANDREOTE, F. D., Adriana Ribeiro Carneiro, OLIVEIRA DE SOUZA LIMA, A., CARACCIOLO GOMES DE SA, P. H., RIBEIRO BARBOSA, M. S. , Draft Genome Sequence of Methylobacterium mesophilicum Strain SR1.6/6, Isolated from Citrus sinensis, ISSN: 21698287
2013, ASSIS DAS GRACAS, D., Vivian Pellizari, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos, VIEIRA ARAUJO, A. C., ZAHLOUTH, R., RIBEIRO CARNEIRO, A., SOUZA LOPES, T., AZEVEDO BARAUNA, R., Azevedo, V., CRUZ SCHNEIDER, M. P. , Complete Genome of a Methanosarcina mazei Strain Isolated from Sediment Samples from an Amazonian Flooded Area, ISSN: 21698287
2013, HENRIQUES, I., SAAVEDRA, M. J., EGAS, C., Artur Luiz da Costa da Silva, CORREIA, A., Rommel Thiago Juca Ramos, BARAUNA, R. A., DE SA, P. H., MARINHO ALMEIDA, D., Carneiro, A. R., BARBOSA, S., PEREIRA, A., ALVES, A. , Draft Genome Sequence of Serratia fonticola UTAD54, a Carbapenem-Resistant Strain Isolated from Drinking Water, ISSN: 21698287
2013, Rommel Thiago Juca Ramos, CARNEIRO, ADRIANA, Pablo Sá, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Paula Schnneider, Barh, Debmalya, Artur Luis da Costa da Silva , Graphical contig analyzer for all sequencing platforms (G4ALL): a new stand-alone tool for finishing and draft generation of bacterial genomes, ISSN: 09732063
2013, Barh, Debmalya, Hassan, Syed S., Anderson Rodrigues dos Santos, Amjad Ali, Guimarães, Luis C., Rommel Thiago Juca Ramos, Pratap Devarapalli, Neha Barve, Bakhtiar, Syeda M., Ranjith Kumavath, Preetam Ghosh, Gupta, Krishnakant, Anderson Miyoshi, Artur Luiz Da Costa da Silva, Anil Kumar, Misra, Amarendra Narayan, Kenneth Blum, Baumbach, J., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Jain, Neha, Gourav Khatri, Nidia Leo´n-Sicairos, Adrian Canizalez-Roman, Sandeep Tiwari, Ankit Verma, Sachin Rahangdale , Conserved host?pathogen PPIs? Globally conserved inter-species bacterial PPIs based conserved host-pathogen interactome derived novel target in C. pseudotuberculosis, C. diphtheriae, M. tuberculosis, C. ulcerans, Y. pestis, and E. coli targeted by Piper betel compounds, ISSN: 17579694
2013, Adonney Allan de Oliveira Veras, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, Vasco, Artur Luis da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , AutoAssemblyD: a graphical user interface system for several genome assemblers, ISSN: 09738894
2013, PEREIRA, ULISSES DE PÁDUA, Rommel Thiago Juca Ramos, CARLOS DINIZ, Silvânia V. M. Mattos, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, Amjad Ali, Bakhtiar, Syeda M., Fernanda Alves Dorella, Zerlotini, Adhemar, Flávio Marcos Gomes Araújo, Laura Rabelo Leite, Guilherme Correa de Oliveira, Anderson Rodrigues dos Santos, Anderson Miyoshi, Artur Luiz Da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Henrique César Pereira Figueiredo, Hassan, Syed S., Flavia Figueira Aburjaile, Siomar Castro Soares, Adriana R Carneiro, Luís Carlos Guimarães, Sintia Silva de Almeida , Complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain SA20-06, a fish pathogen associated to meningoencephalitis outbreaks, ISSN: 19443277
2013, PEREIRA, U.P., SANTOS, A.R., Miyoshi, A., Artur Luiz da Costa da Silva, Tauch, A., Barh, D., Azevedo, V., FIGUEIREDO, H.C.P., SOARES, S.C., BLOM, J., LEAL, C.A.G., Rommel Thiago Juca Ramos, GUIMARÃES, L.C., OLIVEIRA, L.C., ALMEIDA, S.S., HASSAN, S.S. , In silico prediction of conserved vaccine targets in Streptococcus agalactiae strains isolated from fish, cattle, and human samples, ISSN: 16765680
2013, Carneiro, A. R., CORREIA, A., HENRIQUES, I., Silva, A., Rommel Thiago Juca Ramos, BARAUNA, R. A., DE SA, P. H., MARINHO ALMEIDA, D., BARBOSA, S., PEREIRA, A., ALVES, A., EGAS, C. , Draft Genome Sequence of Serratia fonticola LMG 7882T Isolated from Freshwater, ISSN: 21698287
2013, Marli Fiori, Janaina Rigonato, Paula Schnneider, Danillo Alvarenga, Alessandro Varani, Caroline Hoff-Risseti, Elaine Crespim, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Patricia Schaker, Karina Heck , Draft Genome Sequence of the Brazilian Toxic Bloom-Forming Cyanobacterium Microcystis aeruginosa Strain SPC777, ISSN: 21698287
2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana R, Hivana Melo, Paula Schnneider, Deb Barh, Vasco, Artur Luis da Costa da Silva , Quality of prokaryote genomes assembly: Indispensable issues of factors affecting prokaryote genome assembly quality, ISSN: 03781119
2012, Soares, Siomar C., Mattos-Guaraldi, Ana L., Miyoshi, Anderson, Azevedo, Vasco, Abreu, Vinícius A. C., Rommel Thiago Juca Ramos, Cerdeira, Louise, Silva, Artur, Baumbach, Jan, Trost, Eva, Tauch, Andreas, Hirata, Raphael , PIPS: Pathogenicity Island Prediction Software, ISSN: 19326203
2012, Soares, Siomar C., DINIZ, CARLOS A.A., Hassan, Syed S., FIAUX, KARINA, Guimarães, Luis C., Bakhtiar, Syeda M., PEREIRA, ULISSES, Almeida, Sintia S., Abreu, Vinícius A.C., ROCHA, FLÁVIA S., Dorella, Fernanda A., Trost, Eva, Miyoshi, Anderson, Silva, Artur, Azevedo, Vasco, Tauch, Andreas, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana R., Santos, Anderson R., Pinto, Anne C., Barbosa, Eudes, ABURJAILE, FLÁVIA, Ali, Amjad , Genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi strain 258 and prediction of antigenic targets to improve biotechnological vaccine production, ISSN: 01681656
2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Barbosa, E. G. V., Dorella, F. A., Rocha, F. S., Cerdeira, L. T., Barbosa, M. S., Tauch, A., Edman, J., Spier, S., Miyoshi, A., Schneider, M. P. C., Artur Luiz da Costa da Silva, Azevedo, V., Carneiro, A. R., Pinto, A. C., Soares, S. d. C., Anderson2, Almeida, S. S., Guimaraes, L. C., Aburjaile, F. F. , Genome Sequence of the Corynebacterium pseudotuberculosis Cp316 Strain, Isolated from the Abscess of a Californian Horse, ISSN: 00219193
2012, Carneiro, A. R., DAS GRACAS, D. A., FRANCO, L. C., Ali, A., Hassan, S. S., NUNES, C. I. P., Barbosa, M. S., Fiaux, K. K., Aburjaile, F. F., Barbosa, E. G. V., Bakhtiar, S. M., Rommel Thiago Juca Ramos, VILELA, D., NOBREGA, F., DOS SANTOS, A. L., CAREPO, M. S. P., Azevedo, V., Schneider, M. P. C., Vivian Pellizari, Artur Luiz da Costa da Silva, DALL'AGNOL, H., Pinto, A. C., de Castro Soares, S., Anderson2, Guimaraes, L. C., Almeida, S. S., BARAUNA, R. A. , Genome Sequence of Exiguobacterium antarcticum B7, Isolated from a Biofilm in Ginger Lake, King George Island, Antarctica, ISSN: 00219193
2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, Carneiro, Adriana Ribeiro, SOARES, SIOMAR DE CASTRO, SANTOS, ANDERSON RODRIGUES DOS, Almeida, Sintia, Guimarães, Luis, FIGUEIRA, FLÁVIA, Barbosa, Eudes, Tauch, Andreas , Tips and tricks for the assembly of a Corynebacterium pseudotuberculosis genome using a semiconductor sequencer, ISSN: 17517915
2012, Gordo, Sheila M C, Schneider, Horacio, Silva, Wilson A, Sampaio, Iracilda, Darnet, Sylvain, Pinheiro, Daniel G, Moreira, Edith CO, Rodrigues, Simone M, Poltronieri, Marli C, De Lemos, Oriel F, da Silva, Israel Tojal, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur , High-throughput sequencing of black pepper root transcriptome, ISSN: 14712229
2012, Lopes, T., Barbosa, E. G. V., Ribeiro, D., Fiaux, K. K., Diniz, C. A. A., de Abreu, V. A. C., de Almeida, S. S., Hassan, S. S., Ali, A., Bakhtiar, S. M., Aburjaile, F. F., Silva, A., Anne Cybelle Pinto, Soares, S. d. C., Pereira, U. d. P., Schneider, M. P. C., Myoshi, Edman, J., Spier, S., Vasco, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, A., Dorella, F. A., Rocha, F. S., dos Santos, A. R., Lima, A. R. J., Guimaraes, L. C. , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp267, Isolated from a Llama, ISSN: 00219193
2012, Pablo Sá, Vasco, Paula Schnneider, Deb Barh, Artur Luis da Costa da Silva, Anne Cybelle Pinto, Rommel Thiago Juca Ramos, Nilson Coimbra, Barauna, Hivana Melo, Carneiro, Adriana Ribeiro, Alex Ranieri, Agenor Valadares , FunSys: Software for functional for functional analysis of prokariotyc transcriptome and proteome, ISSN: 09732063
2012, Hassan, S. S., Luis Guimarães, Ulisses Pereira, Bakhtiar, Syeda M., Carneiro, Adriana Ribeiro, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Vasco , Complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar ovis strain P54B96 isolated from antelope in South Africa obtained by rapid next generation sequencing technology, ISSN: 19443277
2012, Hassan, S. S., Paula Schnneider, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana Ribeiro, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho, Artur Luis da Costa da Silva , Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp162, Isolated from Camel, ISSN: 00219193
2012, Carneiro, Adriana Ribeiro, Rommel Thiago Juca Ramos, Ana Cecilia Ribeiro Cruz, Pedro Vasconcelos , Molecular characterisation of dengue virus type 1 reveals lineage replacement during circulation in Brazilian territory, ISSN: 00740276
2012, Ali, Amjad, Bakhtiar, Syeda M., Hassan, Syed S., Ussery, David W., On, Stephen, Silva, Artur, Schneider, Maria P., Lage, Andrey P., Miyoshi, Anderson, Azevedo, Vasco, Soares, Siomar C., Santos, Anderson R., Guimarães, Luis C., Barbosa, Eudes, Almeida, Sintia S., Abreu, Vinícius A.C., Carneiro, Adriana R., Rommel Thiago Juca Ramos , Campylobacter fetus subspecies: Comparative genomics and prediction of potential virulence targets, ISSN: 03781119
2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Anne Cybelle Pinto, Wanderson Marques Silva, Flavia Souza Rocha, Silvanira, Miyoshi, Anderson, Paula Schnneider, Silva, Artur, Vasco , The core stimulon of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002 identified using ab initio methodologies, ISSN: 17579694
2012, Pethick, F. E., Lopes, T. S., Barbosa, M. S., Pinto, A. C., dos Santos, A. R., Soares, S. C., Almeida, S. S., Guimaraes, L. C., Aburjaile, F. F., Abreu, V. A. C., Ribeiro, D., Lainson, A. F., Fiaux, K. K., Diniz, C. A. A., Barbosa, E. G. V., Pereira, U. P., Hassan, S. S., Ali, A., Bakhtiar, S. M., Dorella, F. A., Carneiro, A. R., Rommel Thiago Juca Ramos, Yaga, R., Rocha, F. S., Schneider, M. P. C., Miyoshi, A., Azevedo, V., Fontaine, M. C., Flockhart, A., Smith, D. G. E., Donachie, W., Cerdeira, L. T., Artur Luiz da Costa da Silva, Bol, E. , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 1/06-A, Isolated from a Horse in North America, ISSN: 00219193
2012, GRAÇAS, DIEGO A, Silva, Artur, JESUS, EDERSON C, FILHO, LUCIANO C F, JR, RUBENS GUILHARDI, BARBOSA, MARIA SR, Rommel Thiago Juca Ramos, LEÃO, TIAGO F, BARAÚNA, RAFAEL A, Schneider, Maria PC , Changes in Microbial Communities along a Water Column in an Amazonian Flooded Area, ISSN: 21689148
2012, Florence Pethick, Barbosa, M. S., Anne Cybelle Pinto, Anderson2, Siomar Soares, Sintia Almeira, Luis Guimarães, Flavia Aburjaile, Vinicius Abreu, Ribeiro, D., Karina Fiaux, Lainson, A. F., Diniz, C. A. A., Barbosa, E. G. V., Pereira, U. P., Hassan, S. S., Ali, Amjad, Bakhtiar, S. M., Dorella, Fernanda A., Carneiro, Adriana R, Rommel Thiago Juca Ramos, Flavia Souza Rocha, Flockhart, A., Schneider, Maria Paula C., Myoshi, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho, Fontaine, M. C., Smith, D. G. E., Donachie, W., Louise Teixeira Cerdeira, Artur Luis da Costa da Silva, Erick Bol, Lopes, T. S. , Complete Genome Sequences of Corynebacterium pseudotuberculosis Strains 3/99-5 and 42/02-A, Isolated from Sheep in Scotland and Australia, Respectively, ISSN: 00219193
2012, Azevedo, Vasco, Eslabão,, Almeida,, Abreu,, Neto,, Carneiro,, Cerdeira, Louise, Rommel Thiago Juca Ramos, Hirata-Jr,, Mattos-Guaraldi, AL, Trost,, D'Afonseca, V, Tauch,, Silva,, Schneider,, Miyoshi,, Azevedo, Vasco, Ali,, Santos, Anderson, Pinto,, Magalhães,, Faria,, Barbosa,, Guimarães, , Reannotation of the Corynebacterium diphtheriae NCTC13129 genome as a new approach to studying gene targets connected to virulence and pathogenicity in diphtheria, ISSN: 11792701
2012, Casseb, S.M.M., Cardoso, J.F., Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, A., Nunes, M., Vasconcelos, P.F.C., Artur Luiz da Costa da Silva , Optimization of dengue virus genome assembling using GSFLX 454 pyrosequencing data: evaluation of assembling strategies, ISSN: 16765680
2012, Anderson2, Rommel Thiago Juca Ramos, Sintia Almeira, Siomar Soares, Ulisses Pereira, Vinicius Abreu, Silva, Artur, Myoshi, Vasco, Carneiro, Adriana Ribeiro, Anne Cybelle Pinto, Deb Barh, Barbosa, E. G. V., Flavia Aburjaile, Dorella, Fernanda A., Flavia Souza Rocha, Luis Guimarães , The Corynebacterium pseudotuberculosis in silico predicted pan-exoproteome, ISSN: 14712164
2012, Artur Luiz da Costa da Silva, VIEIRA BARBOSA, E. G., ALVES DORELLA, F., SOUZA ROCHA, F., SOUZA LOPES, T., KAWASAKI, R., GOMES SA, P., DA ROCHA COIMBRA, N. A., TEIXEIRA CERDEIRA, L., SILVANIRA BARBOSA, M., CRUZ SCHNEIDER, M. P., Rommel Thiago Juca Ramos, Miyoshi, A., SELIM, S. A. K., MOAWAD, M. S., Azevedo, V., RIBEIRO CARNEIRO, A., CYBELLE PINTO, A., de Castro Soares, S., RODRIGUES SANTOS, A., SILVA ALMEIDA, S., Guimaraes, L. C., FIGUEIRA ABURJAILE, F. , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31, Isolated from an Egyptian Buffalo, ISSN: 00219193
2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana Ribeiro, Azevedo, Vasco, Paula Schnneider, Deb Barh, Artur Luis da Costa da Silva , Simplifier: the web tool to eliminate redundant NGS contigs, ISSN: 09732063
2011, Louise Teixeira Cerdeira, Rommel Thiago Juca Ramos, de Oliveira, R. S., Barh, D., Barve, N., Zambare, V., Belchior, S. E., Guimaraes, L. C., de Castro Soares, S., Dorella, F. A., Rocha, F. S., Anne Cybelle Pinto, de Abreu, V. A. C., Tauch, A., Trost, E., Myoshi, Vasco, Silva, A., Schneider, M. P. C., de Almeida, S. S., dos Santos, A. R., Barbosa, E. G. V., Ali, A., Barbosa, M. S., Carneiro, A. R. , Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina, ISSN: 00219193
2011, Siomar Soares, Amjad Ali, Anderson2, Vinicius Abreu, Anne Cybelle Pinto, Artur Luis da Costa da Silva, Vasco, Rocha, Aryanne A. M. C., Barbosa, E. G. V., Luis Guimarães, Sintia Almeira, Myoshi, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana Ribeiro, Louise Teixeira Cerdeira , Plasticidade genômica e evolução bacteriana, ISSN: 19821301
2011, Cerdeira, Louise Teixeira, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho, Silva, Artur, Carneiro, Adriana Ribeiro, Rommel Thiago Juca Ramos, de Almeida, Sintia Silva, D´Afonseca, Vivian, Paula Schnneider, Baumbach, Jan, Tauch, Andreas, McCulloch, John Anthony , Rapid hybrid de novo assembly of a microbial genome using only short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis I19 as a case study, ISSN: 01677012
2011, Ruiz, Jerônimo C., Pacheco, Luis G. C., Costa, Marcília P., Turk, Meritxell Z., Seyffert, Núbia, Moraes, Pablo M. R. O., Soares, Siomar C., Almeida, Sintia S., Castro, Thiago L. P., Abreu, Vinicius A. C., Trost, Eva, D'Afonseca, Vívian, Baumbach, Jan, Tauch, Andreas, Schneider, Maria Paula C., McCulloch, John, Cerdeira, Louise T., Rommel Thiago Juca Ramos, Zerlotini, Adhemar, Dominitini, Anderson, Resende, Daniela M., Coser, Elisângela M., Silva, Artur, Oliveira, Luciana M., Pedrosa, André L., Vieira, Carlos U., Guimarães, Cláudia T., Bartholomeu, Daniela C., Oliveira, Diana M., Santos, Fabrício R., Rabelo, Élida Mara, Lobo, Francisco P., Franco, Glória R., Ali, Amjad, Costa, Ana Flávia, Pinto, Anne C., Santos, Anderson R., Rocha, Aryanne A. M. C., Lopes, Débora O., Dorella, Fernanda A. , Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains, ISSN: 19326203
2011, Stynen, A. P. R., Soares, S. d. C., de Abreu, V. A. C., Rocha, A. A. C. M., dos Santos, A. R., Barbosa, E. G. V., Costa, D. F., Dorella, F. A., Myoshi, de Lima, A. R. J., Campos, F. D. d. S., Lage, A. P., Pablo LPDNA, Lopes, T. S., Rodrigues, R. M. A., Carneiro, A. R., Leao, T., Louise Teixeira Cerdeira, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, A., Vasco, Jerônimo da Conceição Ruiz, Moore, R. J., Rezende, A. M., de Resende, V. D. d. S., Ruy, P. d. C., Daher, N., Resende, D. d. M., de Almeida, S. S. , Complete Genome Sequence of Type Strain Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354T, ISSN: 00219193
2011, Louise Teixeira Cerdeira, Guimaraes, L. C., Soares, S. d. C., Dorella, F. A., Rocha, F. S., Erick Bol, Gomes de Sa, P. H. C., Thiago Lopes, Barbosa, M. S., Carneiro, A. R., Rommel Thiago Juca Ramos, Schneider, M. P. C., Coimbra, N. A. d. R., Lima, A. R. J., Barh, D., Jain, N., Tiwari, S., Raja, R., Zambare, V., Ghosh, P., Trost, E., Tauch, A., Anne Cybelle Pinto, Myoshi, Vasco, Silva, A., de Almeida, S. S., dos Santos, A. R., Barbosa, E. G. V., Ali, A., Aburjaile, F. F., de Abreu, V. A. C. , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain CIP 52.97, Isolated from a Horse in Kenya, ISSN: 00219193
2011, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana R, Baumbach, Jan, Azevedo, Vasco, Schneider, Maria PC, Silva, Artur , Analysis of quality raw data of second generation sequencers with Quality Assessment Software, ISSN: 17560500
2010, Silva, A., Anderson2, Soares, S. C., Anne Cybelle Pinto, Ali, A., Dorella, F. A., Rocha, F., de Abreu, V. A. C., Shpigel, N., Myoshi, Vasco, Schneider, M. P. C., Cerdeira, L., Barbosa, M. S., Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, A. R., Santos, R., Lima, M., Sintia Almeira , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis I-19, strain isolated from Israel Bovine mastitis, ISSN: 00219193
2009, Jerônimo da Conceição Ruiz, Anderson2, Anne Cybelle Pinto, Daniela Resende, Louise Teixeira Cerdeira, Rommel Thiago Juca Ramos, Sara, Sintia Almeira , Segunda revolução genômica: Utilização de sequenciadores de nova geração., ISSN: 19821301

Trabalho de Fim de Curso(17)

Análise comparativas dos genes de diferentes biovares de corynabcterium pseudotuberculosis, LUDMILLA FERREIRA COSTA , 03/2017
Criação de um ambiente computacional para a caracterização de fagos em genomas bacterianos completos., AILTON LOPES DE SOUSA , 07/2016
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ANÁLISE DA EXPRESSÃO DE GENES DE REPARO DE DNA EM Corynebacterium Pseudotuberculosis EM RESPOSTA A CONDIÇÕES DE ESTRESSE ABIÓTICO, SAVIO DE SOUZA COSTA , 04/2017
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Orientações de Pós-Graduação (35)

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Doutorado, AILTON LOPES DE SOUSA, 03/2019 - 09/2019 , Finalizada em 09/2019
Doutorado, PEDRO HENRIQUE DE AVIZ SILVA, 05/2019 - 08/2021 , Finalizada em 08/2021
Doutorado, EDIAN FRANKLIN FRANCO DE LOS SANTOS, 03/2017 - , Orientação em Andamento
Doutorado, ANA LIDIA QUEIROZ CAVALCANTE, 01/2017 - 01/2019 , Finalizada em 01/2019
Doutorado, CLAUDIA MARIA REYES GUTIERREZ, 07/2023 - , Orientação em Andamento
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Doutorado, ADONNEY ALLAN DE OLIVEIRA VERAS, 02/2016 - , Orientação em Andamento
Doutorado, VICTOR BENEDITO COSTA FERREIRA, 07/2023 - , Orientação em Andamento
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Mestrado, EDBRUNO PRESTES CORRÊA E SILVA, 03/2020 - 06/2021 , Finalizada em 06/2021
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Mestrado, DARALYNS BORGES MACEDO, 07/2023 - , Orientação em Andamento
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Mestrado, HEYDER COUTINHO ALMEIDA, 03/2020 - 08/2021 , Finalizada em 08/2021
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Mestrado, ELTON COSTA FRANCO ANTUNES, 09/2023 - , Orientação em Andamento
Mestrado, DAVID TAVARES MARTINS, 10/2022 - , Orientação em Andamento
Mestrado, SANDY INGRID AGUIAR ALVES, 09/2022 - , Orientação em Andamento
Mestrado, WELLINGTON VASCONCELOS MORAES, 03/2016 - 09/2017 , Finalizada em 09/2017
Mestrado, WENDEL DE OLIVEIRA CASTRO, 09/2012 - , Orientação em Andamento
Mestrado, KENNY DA COSTA PINHEIRO, 09/2013 - , Orientação em Andamento
Mestrado, EDIAN FRANKLIN FRANCO DE LOS SANTOS, 03/2015 - , Orientação em Andamento
Mestrado, FABIO MALCHER MIRANDA, 03/2017 - 09/2018 , Finalizada em 09/2018
Mestrado, SEBASTIAO RODRIGUES DA COSTA NETO, 03/2019 - , Orientação em Andamento
Mestrado, DIEGO MAGALHÃES DE MELO, 03/2018 - 03/2020 , Finalizada em 03/2020
Mestrado, AILTON LOPES DE SOUSA, 05/2017 - , Orientação em Andamento