rommel thiago juca ramos

ICBIO - INSTITUTO DE CIENCIAS BIOLOGICAS

Produção Intelectual

Artigos (154)

  • 2023, JESUS, HENDOR N. R., NAVAS, JESUS, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, AGUIAR, ERIC R. G. R., Mattos-Guaraldi, Ana L., Pacheco, Luis G. C., RAMOS, JULIANA N., ROCHA, DANILO J. P. G., ALVES, DANIELE A., SILVA, CAROLINA S., CRUZ, JOÃO V. O., VIEIRA, VERÔNICA V., SOUZA, CASSIUS, SANTOS, LOUISY S. , The pan-genome of the emerging multidrug-resistant pathogen Corynebacterium striatum, ISSN: 1438793X
  • 2023, BONNELLY, ROBERTO, FRANCO DE LOS SANTOS, EDIAN FRANKLIN, QUEIROZ CAVALCANTE, ANA LIDIA, CALDERON, VICTOR V., Baraúna, Rafael Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, RODRÍGUEZ-RODRÍGUEZ, YASET, DE FRANCISCO, LUIS ENRIQUE RODRÍGUEZ, MAROTO MARTÍN, LUIS ORLANDO, PERDOMO, OMAR PAINO , Beta-Lactam Susceptibility Profiles of Bacteria Isolated from the Ozama River in Santo Domingo, Dominican Republic, ISSN: 20711050
  • 2023, MARTINS BALBINOT, KAROLYNY, ALVES JUNIOR, SERGIO DE MELO, VIANA PINHEIRO, JOÃO DE JESUS, ALMEIDA LOUREIRO, FELIPPE JOSÉ, CHEMELO, GIORDANNA PEREIRA, ALVES MESQUITA, RICARDO, CRUZ RAMOS, ALINE MARIA PEREIRA, Rommel Thiago Juca Ramos, DA COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ, DE MENEZES, SÍLVIO AUGUSTO FERNANDES, DA SILVA KATAOKA, MARIA SUELI , Immunoexpression of stem cell markers SOX-2, NANOG AND OCT4 in ameloblastoma, ISSN: 21678359
  • 2023, LOBATO, AMALIA RAIANA FONSECA, ALVES, SANDY INGRID AGUIAR, Rommel Thiago Juca Ramos, RODRIGUES, YAN CORRÊA, BRASILIENSE, DANIELLE MURICI , Genomic analysis of Klebsiella pneumoniae high-risk clone ST11 co-harboring MCR-1.27 and KPC-2 recovered at a pediatric oncologic hospital in the Brazilian Amazon region, ISSN: 22137165
  • 2023, DOS SANTOS RIBEIRO, PRISCYLA, DE OLIVEIRA, DAIANA, JAISWAL, ARUN KUMAR, BRENIG, BERTRAM, Soares, Siomar, Rommel Thiago Juca Ramos, MATIUZZI, MATEUS, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, FIGUEIRA, CLÁUDIO PEREIRA, COSTA, FEDERICO, RISTOW, PAULA, CARVALHO, NATÁLIA BARBOSA, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, ABURJAILE, FLÁVIA, SOUSA, THIAGO, VERÍSSIMO, GRACIETE, GOMES, TALITA, NEVES, FÁBIO, BLANCO, LUIZA, LIMA, JOÃO ANTONIO , Environmental Biofilms from an Urban Community in Salvador, Brazil, Shelter Previously Uncharacterized Saprophytic Leptospira, ISSN: 00953628
  • 2023, MAIA, JOSÉ CLEVES DA SILVA, SOARES, SIOMAR CASTRO, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, COSTA, MATEUS MATIUZZI DA, GOUVEIA, JOÃO JOSÉ DE SIMONI, SILVA, GABRIEL AMORIM DE ALBUQUERQUE, CUNHA, LETÍCIA STHEFFANY DE BARROS, GOUVEIA, GISELE VENERONI, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, BRENIG, BERTRAM, ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA, ABURJAILE, FLÁVIA, Rommel Thiago Juca Ramos , Genomic Characterization of Aeromonas veronii Provides Insights into Taxonomic Assignment and Reveals Widespread Virulence and Resistance Genes throughout the World, ISSN: 20796382
  • 2023, ALVES, SANDY INGRID AGUIAR, FERREIRA, VICTOR BENEDITO COSTA, DANTAS, CARLOS WILLIAN DIAS, SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA DA, Rommel Thiago Juca Ramos , EasySSR: a user-friendly web application with full command-line features for large-scale batch microsatellite mining and samples comparison, ISSN: 16648021
  • 2022, CARDENAS-ALEGRIA, OSCAR VICTOR, DANTAS, CARLOS WILLIAN DIAS, SILVA GUEDES LOBATO, ELAINE MARIA, DA SILVA, SANDRO PATROCA, MORAES, CÁSSIA DE SOUSA, Cruz, Ana Cecília Ribeiro, Rommel Thiago Juca Ramos, Adriana Ribeiro Carneiro , Influence of soil management for soybean production under microbial diversity in amazon soils, ISSN: 2296665X
  • 2022, JESUS, HENDOR N. R., AGUIAR, ERIC R. G. R., MARTÍNEZ-MARTÍNEZ, LUIZ, OCAMPO, ALAIN, ALIBI, SANA, DORTA, ALEXIS, Pacheco, Luis G. C., NAVAS, JESUS, ROCHA, DANILO J. P. G., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, BRENIG, BERTRAM, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, COSTA, MATEUS M., Soares, Siomar C., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Pan-genomic analysis of Corynebacterium amycolatum gives insights into molecular mechanisms underpinning the transition to a pathogenic phenotype, ISSN: 1664302X
  • 2022, PINHEIRO, KENNY DA COSTA, GOIS, BRUNA VERÔNICA AZEVEDO, NOGUEIRA, WYLERSON GUIMARÃES, ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA, QUEIROZ, ANA LÍDIA CAVALCANTE, CARDENAS-ALEGRIA, OSCAR, DA SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA, JÚNIOR, ANTÔNIO MÁRCIO GOMES MARTINS, Rommel Thiago Juca Ramos , In silico approach to identify microsatellite candidate biomarkers to differentiate the biovar of Corynebacterium pseudotuberculosis genomes, ISSN: 26737647
  • 2022, PEREIRA, CARINE RODRIGUES, de Castro Soares, Siomar, Rommel Thiago Juca Ramos, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, MATIUZZI DA COSTA, MATEUS, LAGE, ANDREY PEREIRA, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, SELES DORNELES, ELAINE MARIA, DE JESUS SOUSA, THIAGO, LIMA DA SILVA, ALESSANDRA, GONÇALVES DOS SANTOS, ROSELANE, MINHARRO, SÍLVIA, COSTA CUSTÓDIO, DIRCEIA APARECIDA, PICKARD, DEREK J., O?CALLAGHAN, DAVID, FOSTER, JEFFREY T. , First report and whole-genome sequencing of Pseudochrobactrum saccharolyticum in Latin America, ISSN: 12864579
  • 2022, SCHULTZ, JÚNIA, de Castro Soares, Siomar, BRENIG, BERTRAM, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, ROSADO, ALEXANDRE S., PARISE, MARIANA TEIXEIRA DORNELLES, PARISE, DOGLAS, MEDEIROS, LAENNE G., SOUSA, THIAGO J., KATO, RODRIGO B., UETANABARO, ANA PAULA TROVATTI, ARAÚJO, FABRÍCIO, Rommel Thiago Juca Ramos , Unraveling the Genomic Potential of the Thermophilic Bacterium Anoxybacillus flavithermus from an Antarctic Geothermal Environment, ISSN: 20762607
  • 2022, DA SILVA, MARIANA BARBALHO FARIAS, SELDIN, LUCY, DA MOTA, FABIO FARIA, JURELEVICIUS, DIOGO, DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON, DA COSTA, MATEUS MATIUZZI, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, Rommel Thiago Juca Ramos, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, ROSADO, ALEXANDRE SOARES , Genomic analyses of a novel bioemulsifier-producing Psychrobacillus strain isolated from soil of King George Island, Antarctica, ISSN: 14322056
  • 2022, FORTUNATO COSTA, KELLE, ALMEIDA ARAÚJO, FABRÍCIO, Morais, Jefferson, LISBOA FRANCES, CARLOS RENATO, Rommel Thiago Juca Ramos , Text mining for identification of biological entities related to antibiotic resistant organisms, ISSN: 21678359
  • 2022, VIDAL AMARAL, JOÃO RICARDO, BRENIG, BERTRAM, SOARES DE OLIVEIRA, SELMA, SOARES ROSADO, ALEXANDRE, Rommel Thiago Juca Ramos, ALMEIDA ARAÚJO, FABRÍCIO, BENTES KATO, RODRIGO, FIGUEIRA ABURJAILE, FLÁVIA, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, MATIUZZI DA COSTA, MATEUS, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Bacteriocin Producing Streptococcus agalactiae Strains Isolated from Bovine Mastitis in Brazil, ISSN: 20762607
  • 2022, NOGUEIRA, WYLERSON GUIMARÃES, GOIS, BRUNA VERÔNICA AZEVEDO, PINHEIRO, KENNY DA COSTA, ARAGÃO, ANDRESSA DE OLIVEIRA, QUEIROZ, ANA LÍDIA CAVALCANTE, SILVA, ARTUR LUIZ DA, FOLADOR, ADRIANA CARNEIRO, Rommel Thiago Juca Ramos , Viral Metagenomics Reveals Widely Diverse Viral Community of Freshwater Amazonian Lake, ISSN: 22962565
  • 2022, SILVA, SHEILA DA, MACRAE, ANDREW, OLIVEIRA, SELMA SOARES DE, GUEDES, FERNANDA ALVES DE FREITAS, AMARAL, JOÃO RICARDO VIDAL, RIBEIRO, JOSÉ ROBERTO DE ASSIS, SOUZA, YURI PINHEIRO ALVES DE, FREITAS-ALMEIDA, ÂNGELA CORREA DE, THOMPSON, FABIANO LOPES, Rommel Thiago Juca Ramos, WHITELEY, ANDREW STEVEN , Aeromonas allosaccharophila Strain AE59-TE2 Is Highly Antagonistic towards Multidrug-Resistant Human Pathogens, What Does Its Genome Tell Us?, ISSN: 20751729
  • 2022, CARDENAS ALEGRIA, OSCAR, Adriana Ribeiro Carneiro, PIRES QUARESMA, MARIELLE, DIAS DANTAS, CARLOS WILLIAN, SILVA GUEDES LOBATO, ELAINE MARIA, DE OLIVEIRA ARAGÃO, ANDRESSA, PATROCA DA SILVA, SANDRO, COSTA BARROS DA SILVA, AMANDA, RIBEIRO CRUZ, ANA CECÍLIA, Rommel Thiago Juca Ramos , Impacts of soybean agriculture on the resistome of the Amazonian soil, ISSN: 1664302X
  • 2021, CALDERÓN, VÍCTOR V., BONNELLY, ROBERTO, DEL ROSARIO, CAMILA, DUARTE, ALBERT, BARAÚNA, RAFAEL, Rommel Thiago Juca Ramos, PERDOMO, OMAR P., RODRIGUEZ DE FRANCISCO, LUIS E., FRANCO, EDIAN F. , Distribution of Beta-Lactamase Producing Gram-Negative Bacterial Isolates in Isabela River of Santo Domingo, Dominican Republic, ISSN: 1664302X
  • 2021, OLIVEIRA DE ALMEIDA, MARCELLE, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, Silva, Artur, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, CANÁRIO VIANA, MARCUS VINICIUS, CARVALHO, RODRIGO, FIGUEIRA ABURJAILE, FLAVIA, MALCHER MIRANDA, FABIO, CANÁRIO CERQUEIRA, JANAÍNA, BRENIG, BERTRAM, GHOSH, PREETAM, Rommel Thiago Juca Ramos, KATO, RODRIGO BENTES , Characterization of the first vaginal genomes isolated in Brazil, ISSN: 21678359
  • 2021, ARAÚJO, SUSANA, TACÃO, MARTA, BARAÚNA, RAFAEL, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, HENRIQUES, ISABEL , Genome analysis of two multidrug-resistant Escherichia coli O8:H9-ST48 strains isolated from lettuce, ISSN: 03781119
  • 2021, ARAÚJO, S., SOUSA, M., TACÃO, M., BARAÚNA, R.A., Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos, ALVES, A., MANAIA, C.M., HENRIQUES, I. , Carbapenem-resistant bacteria over a wastewater treatment process: Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in untreated wastewater and intrinsically-resistant bacteria in final effluent, ISSN: 00489697
  • 2021, CARVALHO, RODRIGO, GHOSH, PREETAM, GOES-NETO, ARISTOTELES, FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P., Soares, Siomar, Rommel Thiago Juca Ramos, Pinto, Anne, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, ABURJAILE, FLAVIA, CANARIO, MARCUS, NASCIMENTO, ANDRÉA M. A., CHARTONE-SOUZA, EDMAR, DE JESUS, LUIS, ZAMYATNIN, ANDREY A., BRENIG, BERTRAM, Debmalya Barh , Genomic Characterization of Multidrug-Resistant Escherichia coli BH100 Sub-strains, ISSN: 1664302X
  • 2021, BRAGA, MARCUS DE BARROS, Rommel Thiago Juca Ramos, CARNEIRO, ADRIANA RIBEIRO, BRITO, SILVANA ROSSY DE, DINIZ, HUGO ALEX CARNEIRO, BOTELHO, MARCEL DO NASCIMENTO, VALLINOTO, ANTONIO CARLOS ROSÁRIO, FERNANDES, RAFAEL DA SILVA, SOUZA, GILBERTO NERINO DE, ROCHA, JONAS ELIAS CASTRO DA, DOLÁCIO, CÍCERO JORGE FONSECA, TAVARES, IVALDO DA SILVA, PINHEIRO, RAPHAEL RODRIGUES, NORONHA, FERNANDO NAPOLEÃO, RODRIGUES, LUANA LORENA SILVA , Artificial neural networks for short-term forecasting of cases, deaths, and hospital beds occupancy in the COVID-19 pandemic at the Brazilian Amazon, ISSN: 19326203
  • 2021, FELICE, ANDREI G., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, OLIVEIRA, LETÍCIA C., OLIVEIRA, CARLO J., SOARES, SIOMAR D. C., BENEVIDES, LEANDRO J., ALVES, LEANDRO G., FREITAS, ALISSA S. F., RODRIGUES, THAÍS C. V., JAISWAL, ARUN K., Tiwari, Sandeep, GOMES, LUCAS G. R., MIRANDA, FÁBIO M., Rommel Thiago Juca Ramos , Pan-genomic analyses of 47 complete genomes of the genus and prediction of new vaccine targets and virulence factors of the species, ISSN: 07391102
  • 2021, FRANCO, EDIAN F., RANA, PRATIP, CRUZ, ALINE, CALDERÓN, VÍCTOR V., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, GHOSH, PREETAM , Performance Comparison of Deep Learning Autoencoders for Cancer Subtype Detection Using Multi-Omics Data, ISSN: 20726694
  • 2020, ROCHA, DANILO J.P., MARTÍNEZ-MARTÍNEZ, LUIS, PACHECO, LUIS G.C., NAVAS, JESÚS, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, BRENIG, BERTRAM, Silva, Artur, BLOM, JOCHEN, Rommel Thiago Juca Ramos, AGUIAR, ERIC R.G., CHAPARTEGUI-GONZÁLEZ, ITZIAR, FERNÁNDEZ-MARTÍNEZ, MARTA , Whole genome sequencing reveals misidentification of a multidrug-resistant urine clinical isolate as Corynebacterium urealyticum, ISSN: 22137165
  • 2020, Marcus de Barros Braga, kenny C Pinheiro, ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA, MIRANDA, FÁBIO MALCHER, Artur Luis da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , Redundancy Treatment of NGS Contigs in Microbial Genome Finishing with Hashing-Based Approach, ISSN: 03029743
  • 2020, AQUIME, JOÃO RAFAEL HABIB SOUZA, ZAMPIERI, LARA CAROLINA D?ARAÚJO PINTO, KATAOKA, MARIA SUELI DA SILVA, RIBEIRO, NELSON ANTONIO BAILÃO, JAEGER, RUY GASTALDONI, DA SILVA, ARTUR LUIZ, Rommel Thiago Juca Ramos, ALVES JÚNIOR, SÉRGIO DE MELO, PINHEIRO, JOÃO DE JESUS VIANA , Metallothionein Expression and its Influence on the In Vitro Biological Behavior of Mucoepidermoid Carcinoma, ISSN: 20734409
  • 2020, Edwin J Ruenda, Rommel Thiago Juca Ramos, Edian Franklin de Los Santos, Orlando Belo, Jefferson Magalhães de Moraes , One-Class SVM to Identify Candidates to Reference Genes Based on the Augment of RNA-seq Data with Generative Adversarial Networks, ISSN: 03029743
  • 2020, ALVES, JORIANNE, FOLADOR, ADRIANA, DIAS, LARISSA, MATEUS, JACKELINE, MARQUES, JOANA, GRAÇAS, DIEGO, Rommel Thiago Juca Ramos, SELDIN, LUCY, HENRIQUES, ISABEL, Silva, Artur , Resistome in Lake Bolonha, Brazilian Amazon: Identification of Genes Related to Resistance to Broad-Spectrum Antibiotics, ISSN: 1664302X
  • 2020, LANNES-COSTA, PAMELLA SILVA, Silva, Artur, NAGAO, PRESCILLA EMY, Baraúna, Rafael Azevedo, RAMOS, JULIANA NUNES, VERAS, JOÃO FLAVIO CARNEIRO, CONCEIÇÃO, MARCOS VINÍCIUS REIS, VIEIRA, VERÔNICA VIANA, DE MATTOS-GUARALDI, ANA LUIZA, Rommel Thiago Juca Ramos, DORAN, KELLY S. , Comparative genomic analysis and identification of pathogenicity islands of hypervirulent ST-17 Streptococcus agalactiae Brazilian strain, ISSN: 15671348
  • 2020, Jonas Elias Castro da Rocha, Gilberto Nerino de Souza Júnior, Silvana Rossy de Brito, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO FOLADOR, Rommel Thiago Juca Ramos, Marcus de Barros Braga, Marcel do Nascimento Botelho , REDES NEURAIS ARTIFICIAIS NA PREVISÃO DE CONTÁGIO E ÓBITOS POR COVID-19: UM ESTUDO NOESTADO DO PARÁ, BRASIL, ISSN: 22309926
  • 2020, FRANCO, EDIAN F., RANA, PRATIP, QUEIROZ CAVALCANTE, ANA LIDIA, DA SILVA, ARTUR LUIZ, CYBELLE PINTO GOMIDE, ANNE, CARNEIRO FOLADOR, ADRIANA R., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, GHOSH, PREETAM, Rommel Thiago Juca Ramos , Co-Expression Networks for Causal Gene Identification Based on RNA-Seq Data of Corynebacterium pseudotuberculosis, ISSN: 20734425
  • 2019, Edian Franklin de Los Santos, MAUÉS, DENER, Ronnie Alves, Luís Carlos Guimarães, Vasco, Artur Luis da Costa da Silva, Preetam Ghosh, Jefferson Magalhães de Moraes, Rommel Thiago Juca Ramos , A Clustering Approach to Identify Candidates to Housekeeping Genes Based on RNA-seq Data, ISSN: 03029743
  • 2019, SOUSA, THIAGO DE JESUS, BRENIG, BERTRAM, COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ DA, GHOSH, PREETAM, Debmalya Barh, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, PARISE, DOGLAS, PROFETA, RODRIGO, PARISE, MARIANA TEIXEIRA DORNELLES, GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO, KATO, RODRIGO BENTOS, PEREIRA, FELIPE LUIZ, FIGUEIREDO, HENRIQUE CESAR PEREIRA, Rommel Thiago Juca Ramos , Re-sequencing and optical mapping reveals misassemblies and real inversions on Corynebacterium pseudotuberculosis genomes, ISSN: 20452322
  • 2019, RANA, PRATIP, FRANCO, EDIAN F., RAO, YUG, SYED, KHAJAMOINUDDIN, Debmalya Barh, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, GHOSH, PREETAM , Evaluation of the Common Molecular Basis in Alzheimer?s and Parkinson?s Diseases, ISSN: 14220067
  • 2019, ARAÚJO, CARLOS LEONARDO, ALVES, JORIANNE, NOGUEIRA, WYLERSON, PEREIRA, LINO CÉSAR, GOMIDE, ANNE CYBELLE, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, FOLADOR, ADRIANA , Prediction of new vaccine targets in the core genome of Corynebacterium pseudotuberculosis through omics approaches and reverse vaccinology, ISSN: 03781119
  • 2019, SANTANA, PRISCILA DI PAULA BESSA, OHASHI, OTÁVIO MITIO, MIRANDA, MOYSÉS DOS SANTOS, SILVA, ARTUR LUIS DA COSTA DA, Rommel Thiago Juca Ramos, GONÇALVES, ARNALDO ALGARANHAR, COSTA, NATHALIA NOGUEIRA DA, RAMOS, PRISCILLA DO CARMO AZEVEDO, SILVA, THIAGO VELASCO GUIMARÃES, CORDEIRO, MARCELA DA SILVA, SANTOS, SIMONE DO SOCORRO DAMASCENO , Contributions of RNA-seq to improve in vitro embryo production (IVP), ISSN: 19843143
  • 2019, FREITAS, DHARA Y., ARAÚJO, SUSANA, FOLADOR, ADRIANA R. C., Rommel Thiago Juca Ramos, AZEVEDO, JULIANA S. N., TACÃO, MARTA, Silva, Artur, HENRIQUES, ISABEL, BARAÚNA, RAFAEL A. , Extended Spectrum Beta-Lactamase-Producing Gram-Negative Bacteria Recovered From an Amazonian Lake Near the City of Belém, Brazil, ISSN: 1664302X
  • 2018, juliana nunes ramos, GARALDI, ANA LUIZA M., VIEIRA, VERONICA V., izabel dos santos rodrigues, Paulo Victor Pereira Baio, João Flávio Carneiro Veras, Rommel Thiago Juca Ramos, Luis Gustavo Carvalho Pacheco, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Hirata Júnior, Raphael, Michel Abanto Marín , Genome sequence of a multidrug-resistant Corynebacterium striatum isolated from bloodstream infection from a nosocomial outbreak in Rio de Janeiro, Brazil, ISSN: 16788060
  • 2018, SOUSA, AILTON LOPES DE, Rommel Thiago Juca Ramos, MAUÉS, DENER, LOBATO, AMÁLIA, FRANCO, EDIAN F., PINHEIRO, KENNY, ARAÚJO, FABRÍCIO, PANTOJA, YAN, COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ DA, Morais, Jefferson , PhageWeb - Web Interface for Rapid Identification and Characterization of Prophages in Bacterial Genomes, ISSN: 16648021
  • 2018, SANTOS, ANDRÉ S., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, Hirata, Raphael, Mattos-Guaraldi, Ana L., Meyer, Roberto, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, FELICORI, LIZA, Pacheco, Luis G. C. , Searching whole genome sequences for biochemical identification features of emerging and reemerging pathogenic Corynebacterium species, ISSN: 14387948
  • 2018, VERAS, ALLAN, ARAUJO, FABRICIO, PINHEIRO, KENNY, Guimarães, Luis, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Soares, Siomar, DA COSTA DA SILVA, ARTUR, Rommel Thiago Juca Ramos , Pan4Draft: A Computational Tool to Improve the Accuracy of Pan-Genomic Analysis Using Draft Genomes, ISSN: 20452322
  • 2018, DIAS, LARISSA M, FOLADOR, ADRIANA R C, OLIVEIRA, AMANDA M, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, BARAÚNA, RAFAEL A , Genomic Architecture of the Two Cold-Adapted Genera Exiguobacterium and Psychrobacter: Evidence of Functional Reduction in the Exiguobacterium antarcticum B7 Genome, ISSN: 17596653
  • 2018, FERREIRA, DALILA SOUZA SANTOS, BRENIG, BERTRAM, DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON, BENEVIDES, RAQUEL GUIMARÃES, GÓES-NETO, ARISTÓTELES, KATO, RODRIGO BENTES, MIRANDA, FÁBIO MALCHER, DA COSTA PINHEIRO, KENNY, FONSECA, PAULA LUIZE CAMARGOS, TOMÉ, LUIZ MARCELO RIBEIRO, VAZ, ALINE BRUNA MARTINS, BADOTTI, FERNANDA, Rommel Thiago Juca Ramos , Draft genome sequence of Trametes villosa (Sw.) Kreisel CCMB561, a tropical white-rot Basidiomycota from the semiarid region of Brazil, ISSN: 23523409
  • 2018, ARAUJO, FABRICIO ALMEIDA, Debmalya Barh, Silva, Artur, Guimarães, Luis, Rommel Thiago Juca Ramos , GO FEAT: a rapid web-based functional annotation tool for genomic and transcriptomic data, ISSN: 20452322
  • 2018, Marcus Eslabao, Frederico Schmitt Kremer, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Luciano da Silva Pinto, Éverton Fagonde da Silva, odir antonio dellagostin , Genome of Leptospira borgpetersenii strain 4E, a highly virulent isolate obtained from Mus musculus in southern Brazil, ISSN: 00740276
  • 2018, MIRANDA, FÁBIO MALCHER, Batista, Cassio, Artur Silva, Jefferson Magalhães de Moraes, NELSON CRUZ SAMPAIO NETO, Rommel Thiago Juca Ramos , Improving Metagenomic Assemblies Through Data Partitioning: A GC Content Approach, ISSN: 03029743
  • 2017, BARAÚNA, RAFAEL A., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, RAMOS, ROMMEL T. J., VERAS, ADONNEY A. O., PINHEIRO, KENNY C., BENEVIDES, LEANDRO J., VIANA, MARCUS V. C., Luís Carlos Guimarães, EDMAN, JUDY M., SPIER, SHARON J. , Assessing the Genotypic Differences between Strains of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi through Comparative Genomics, ISSN: 19326203
  • 2017, BARAÚNA, RAFAEL A., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, VERAS, ADONNEY A. O., DE SÁ, PABLO H. C. G., GUIMARÃES, LUÍS C., DAS GRAÇAS, DIEGO A., Carneiro, Adriana R., EDMAN, JUDY M., SPIER, SHARON J. , Genomic analysis of four strains of Corynebacterium pseudotuberculosis bv. Equi isolated from horses showing distinct signs of infection, ISSN: 19443277
  • 2017, ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA, Rommel Thiago Juca Ramos, MARQUES, JOANA MONTEZANO, DE MOURA, VITÓRIA ALMEIDA GONÇALVES, Paula Schnneider, ANDRADE, SORAYA SILVA, LIMA, ALYNE CRISTINA SODRÉ, GUIMARÃES, LUIS CARLOS, FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO, Silva, Artur , Draft Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain PA07 Biovar ovis , Isolated from a Sheep Udder in Amazonia, ISSN: 21698287
  • 2016, Guimarães, Luis C., BARBOSA, MARIA S., Guiso, Nicole, BADELL, EDGAR, Carneiro, Adriana R., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, VIANA, MARCUS V. C., BENEVIDES, LEANDRO J., MARIANO, DIEGO C. B., VERAS, ADOONEY A. O., SÁ, PABLO H. C., ROCHA, FLÁVIA S., VILAS BOAS, PRISCILLA C. B., Soares, Siomar C. , Draft Genome Sequence of Toxigenic Strain 04-7514, Isolated from a Dog in France, ISSN: 21698287
  • 2016, LEÃO, TIAGO, GUIMARÃES, PEDRO IVO, DE MELO, ALINE GRASIELLE COSTA, Rommel Thiago Juca Ramos, LEÃO, PEDRO NUNO, Artur Luiz da Costa da Silva, FIORE, MARLI FATIMA, Paula Schnneider , Draft Genome Sequence of the N -Fixing Cyanobacterium CENA21, Isolated from the Brazilian Amazon Floodplain, ISSN: 21698287
  • 2016, Guimarães, Luis C., BARBOSA, MARIA S., Guiso, Nicole, BADELL, EDGAR, Carneiro, Adriana R., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, VIANA, MARCUS V. C., BENEVIDES, LEANDRO J., MARIANO, DIEGO C. B., VERAS, ADOONEY A. O., SÁ, PABLO H. C., ROCHA, FLÁVIA S., VILAS BOAS, PRISCILLA C. B., Soares, Siomar C. , Draft Genome Sequence of Strain 04-3911, Isolated from Humans, ISSN: 21698287
  • 2016, Luís Carlos Guimarães, BAGANO, PRISCILLA, PEREIRA, FELIPE LUIZ, DORELLA, FERNANDA ALVES, LEAL, CARLOS AUGUSTO, CARVALHO, ALEX FIORINI, BIZET, CHANTAL, GUISO, NICOLE, BADELL, EDGAR, FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA, Azevedo, Vasco, LOPES, THIAGO, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, CARNEIRO, ADRIANA RIBEIRO, CAVALCANTE, ANA LÍDIA QUEIROZ, BARRETO, DIEGO, DE SÁ, PABLO CARACCIOLO GOMES, VERAS, ADONNEY ALLAN OLIVEIRA, ROCHA, FLÁVIA SOUZA , Draft Genome Sequences of Two Pathogenic Corynebacterial Species Isolated from Cows, ISSN: 18399940
  • 2016, Larissa Maranhão Dias, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Azevedo, Artur Silva, Adriana R Carneiro, Jorianne Thyeska Castro Alves, Adonney Allan de Oliveira Veras, BARÚNA, RAFAEL A., DE SA, P. H. C. G., SPIER, S. J., Edman, J., Luis Guimaraes, Flavia Rocha , Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 226, Isolated from the Abscess of a Goat in California, ISSN: 21698287
  • 2016, ALVES, JORIANNE T. C., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, Carneiro, Adriana R., VERAS, ADONNEY A. O., CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q., DE SÁ, PABLO H. C. G., DIAS, LARISSA M., Guimarães, Luis C., MORAIS, EZEQUIEL, SILVA, ANDRÉ G. M., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain PA01, Isolated from Sheep in Pará, Brazil, ISSN: 21698287
  • 2016, MARIANO, DIEGO C. B., Debmalya Barh, FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P., Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, AZEVEDO, VASCO A. C., PEREIRA, FELIPE L., AGUIAR, EDGAR L., OLIVEIRA, LETÍCIA C., BENEVIDES, LEANDRO, GUIMARÃES, LUÍS C., FOLADOR, EDSON L., SOUSA, THIAGO J., GHOSH, PREETAM , SIMBA: a web tool for managing bacterial genome assembly generated by Ion PGM sequencing technology, ISSN: 14712105
  • 2016, MUGE, GABRIEL R. S., FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, VERAS, ADONNEY A. O., DE SÁ, PABLO H. C. G., CAVALCANTE, ANA LÍDIA QUEIROZ, ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO, MORAIS, EZEQUIEL, SILVA, ANDRÉ G. M., GUIMARÃES, LUÍS C., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Genome Sequence of Strain PA02 Isolated from an Ovine Host in the Amazon, ISSN: 21698287
  • 2016, KAWASAKI, REGIANE, BARAÚNA, RAFAEL A., Silva, Artur, CAREPO, MARTA S. P., OLIVEIRA, RUI, MARQUES, RODOLFO, Rommel Thiago Juca Ramos, SCHNEIDER, MARIA P. C. , Reconstruction of the Fatty Acid Biosynthetic Pathway of B7 Based on Genomic and Bibliomic Data, ISSN: 23146133
  • 2016, Guimarães, Luis C., BARBOSA, MARIA S., Guiso, Nicole, BADELL, EDGAR, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, VIANA, MARCUS V. C., BENEVIDES, LEANDRO J., MARIANO, DIEGO C. B., VERAS, ADONNEY A. O., SÁ, PABLO H. C., ROCHA, FLÁVIA S., VILAS BOAS, PRISCILLA C. B., SOARES, SIOMAR C. , Draft Genome Sequence of Toxigenic Strain 03-8664 Isolated from a Human Throat, ISSN: 21698287
  • 2016, MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA, DORELLA, FERNANDA ALVES, DE CARVALHO, ALEX FIORINI, LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES, FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho, SOUSA, THIAGO DE JESUS, PEREIRA, FELIPE LUIZ, ABURJAILE, FLÁVIA, Debmalya Barh, ROCHA, FLÁVIA, PINTO, ANNE CYBELLE, HASSAN, SYED SHAH, SARAIVA, TESSÁLIA DINIZ LUERCE , Whole-genome optical mapping reveals a mis-assembly between two rRNA operons of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002, ISSN: 14712164
  • 2016, DE SÁ, PABLO H. C. G., Rommel Thiago Juca Ramos, MIRANDA, FÁBIO, VERAS, ADONNEY, DE MELO, DIEGO MAGALHÃES, Soares, Siomar, PINHEIRO, KENNY, Guimarães, Luis, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur , GapBlaster-A Graphical Gap Filler for Prokaryote Genomes, ISSN: 19326203
  • 2016, SANTOS, LEONARDO N., PINHEIRO, CARINA S., ALCANTARA-NEVES, NEUZA M., PACHECO, LUIS G.C., SILVA, EDUARDO S., SANTOS, ANDRÉ S., DE SÁ, PABLO H., Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, COOPER, PHILIP J., BARRETO, MAURÍCIO L., LOUREIRO, SEBASTIÃO , De novo assembly and characterization of the Trichuris trichiura adult worm transcriptome using Ion Torrent sequencing, ISSN: 0001706X
  • 2016, ARAÚJO, CARLOS LEONARDO DE A., Carneiro, Adriana R., DIAS, LARISSA M., VERAS, ADONNEY A. O., ALVES, JORIANNE T. C., CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q., DOWSON, CHRISTOPHER G., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva , Whole-Genome Sequence of 262 Biovar Isolated from Cow Milk, ISSN: 21698287
  • 2015, SOUSA, THIAGO JESUS, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, FIGUEIREDO, HENRIQUE, Almeida, Sintia, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, MARIANO, DIEGO, PARISE, DOGLAS, PARISE, MARIANA, VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO, GUIMARÃES, LUIS CARLOS, BENEVIDES, LEANDRO JESUS, ROCHA, FLÁVIA, BAGANO, PRISCILLA , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 12C, ISSN: 21698287
  • 2015, Luís Carlos Guimarães, Siomar Castro Soares, Trost, Eva, Jochen Blom, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Barh, Debmalya, Vasco , Genome informatics and vaccine targets in Corynebacterium urealyticum using two whole genomes, comparative genomics, and reverse vaccinology, ISSN: 14712164
  • 2015, Joseph J Nalluri, Preetam Ghosh, Bhanu K Kamapantula, Debmalya Barh, Neha Jain, Antaripa Bhattacharya, Sintia Almeira, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Vasco , DISMIRA: Prioritization of disease candidates in miRNA-disease associations based on maximum weighted matching inference model and motif-based analysis, ISSN: 14712164
  • 2015, DE OLIVEIRA VERAS, ADONNEY ALLAN, MARINHO, DIOGO, RODRIGUES, MATEUS, FREIRE, MATHEUS, ZAHLOUTH, RAMIRO, RENAN, WENDEL, LOPES, THIAGO SOUZA, MATTÉ, MARIA HELENA, DA SILVA MAYER, CINTIA CAROLINA, DE ALMEIDA VASCONCELOS BARBONI, SUZI, MATTÉ, GLAVUR ROGÉRIO, DA SILVA, MIRIAM LOPES, Carneiro, Adriana Ribeiro, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos, GOMES, JAQUELINE CONCEIÇÃO MEIRELES, DIAS, LARISSA MARANHÃO, DE SÁ, PABLO CARACCIOLO GOMES, ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO, CASTRO, WENDEL, MIRANDA, FÁBIO, KAZUO, EHILTON , Draft Genome Sequences of Vibrio fluvialis Strains 560 and 539, Isolated from Environmental Samples, ISSN: 21698287
  • 2015, Amjad Ali, Debmalya Barh, FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA, USSERY, DAVID W., MIYOSHI, Anderson, Artur Luiz da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, NAZ, ANAM, Soares, Siomar C, BAKHTIAR, MARRIAM, Tiwari, Sandeep, HASSAN, SYED S, HANAN, FAZAL, Rommel Thiago Juca Ramos, PEREIRA, ULISSES , Pan-Genome Analysis of Human Gastric Pathogen : Comparative Genomics and Pathogenomics Approaches to Identify Regions Associated with Pathogenicity and Prediction of Potential Core Therapeutic Targets, ISSN: 23146133
  • 2015, BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS, CARVALHO, ALEX FIORINI, SOARES, SIOMAR DE CASTRO, Carneiro, Adriana, Rommel Thiago Juca Ramos, BADELL-OCANDO, EDGAR, Guiso, Nicole, Artur Luiz da Costa da Silva, FIGUEIREDO, HENRIQUE, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, GUIMARÃES, LUIS CARLOS, VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO, MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA, ROCHA, FLÁVIA DE SOUZA, BAGANO, PRISCILLA CAROLINNE, FOLADOR, EDSON LUIZ, PEREIRA, FELIPE LUIZ, DORELLA, FERNANDA ALVES, LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES , Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain FRC11, ISSN: 21698287
  • 2015, DE SÁ, PABLO H.C.G., Rommel Thiago Juca Ramos, VERAS, ADONNEY A.O., Carneiro, Adriana R., PINHEIRO, KENNY C., Pinto, Anne C., Soares, Siomar C., SCHNEIDER, MARIA P.C., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur , The impact of quality filter for RNA-Seq, ISSN: 03781119
  • 2015, MARIANO, DIEGO CB, PEREIRA, FELIPE L, GHOSH, PREETAM, Barh, Debmalya, FIGUEIREDO, HENRIQUE CP, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , MapRepeat: an approach for effective assembly of repetitive regions in prokaryotic genomes, ISSN: 09732063
  • 2015, Luis G. C. Pacheco, Alex F. Carvalho, Carlos G. Leal, Henrique C. P. Figueiredo, Juliana N. Ramos, Veronica V. Vieira, Eric Farfour, Nicole Guiso, Raphael Hirata Jr, Vasco Azevedo, Artur Silva, Ana L. Mattos Guarald, Rommel Thiago Juca Ramos, Carolina S. Santos, Adonney Allan de Oliveira Veras, GUIMARAES, L. C., Vinícius Abreu, Felipe L. Pereira, SOARES, SIOMAR C., Fernanda A. Dorella , Draft Genome Sequences of Two Species of -Difficult-to-Identify- Human-Pathogenic Corynebacteria: Implications for Better Identification Tests, ISSN: 18399940
  • 2015, GUIMARÃES, PEDRO IVO, LEÃO, TIAGO FERREIRA, DE MELO, ALINE GRASIELLE COSTA, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, FIORE, MARLI FATIMA, Paula Schnneider , Draft Genome Sequence of the Picocyanobacterium sp. Strain GFB01, Isolated from a Freshwater Lagoon in the Brazilian Amazon, ISSN: 21698287
  • 2015, Mattos-Guaraldi, Ana L., Hirata, Raphael, Azevedo, Vasco, Pacheco, Luis G. C., Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, Guimarães, Luis C., SANTOS, CAROLINA S., VERAS, ADONNEY A. O., Carneiro, Adriana R., Soares, Siomar C., RAMOS, JULIANA N., SOUZA, CASSIUS, VIEIRA, VERONICA V. , Draft Genome Sequence of Corynebacterium striatum 1961 BR-RJ/09, a Multidrug-Susceptible Strain Isolated from the Urine of a Hospitalized 37-Year-Old Female Patient, ISSN: 21698287
  • 2015, DE SÁ, PABLO H.C.G., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, VERAS, ADONNEY A.O., Carneiro, Adriana R., BARÚNA, RAFAEL A., GUIMARÃES, LUÍS C., PINHEIRO, KENNY C., Pinto, Anne C., SOARES, SIOMAR C., SCHNEIDER, MARIA P.C. , Corynebacterium pseudotuberculosis RNA-seq data from abiotic stresses, ISSN: 23523409
  • 2015, SOARES, SIOMAR C., Silva, Artur, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, GEYIK, HAKAN, Rommel Thiago Juca Ramos, DE SÁ, PABLO H.C.G., BARBOSA, EUDES G.V., Baumbach, Jan, FIGUEIREDO, HENRIQUE C.P., MIYOSHI, Anderson, Tauch, Andreas , GIPSy: genomic island prediction software, ISSN: 01681656
  • 2015, GOMES DE SÁ, PABLO, SCHNEIDER, MARIA, Silva, Artur, VERAS, ADONNEY, FONTANA, CARLA SUERTEGARAY, ALEIXO, ALEXANDRE, BURLAMAQUI, TIBÉRIO, MELLO, CLAUDIO VIANNA, DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO, PROSDOCIMI, FRANCISCO, Rommel Thiago Juca Ramos , The assembly and annotation of the complete Rufous-bellied thrush mitochondrial genome, ISSN: 19401736
  • 2015, CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, Carneiro, Adriana R., DIAS, LARISSA M., ALVES, JORIANNE T. C., VERAS, ADONNEY A. O., Guimarães, Luis C., ROCHA, FLÁVIA S., GALA-GARCÍA, ALFONSO, RETAMAL, PATRICIO, Rommel Thiago Juca Ramos , Complete Genome Sequence of Strain E19, Isolated from a Horse in Chile, ISSN: 21698287
  • 2015, CARLOS GUIMARAES, LUIS, BENEVIDES DE JESUS, LEANDRO, VINICIUS CANARIO VIANA, MARCUS, Silva, Artur, Rommel Thiago Juca Ramos, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Inside of the Pan-Genome - Methods and Software Overview, ISSN: 13892029
  • 2014, Diego Assis das Graças, Rommel Thiago Juca Ramos, SÁ, PABLO GOMES, Baraúna, Rafael Azevedo, GHILARDI JR., RUBENS, Paula Schnneider, Artur Luiz da Costa da Silva , Semiconductor Sequencing Reveals the Diversity of Bacterial Communities in an Amazonian Reservoir, ISSN: 21689148
  • 2014, SILVA, A. D. S. D. S., DA SILVA, A. L. D. C., Rommel Thiago Juca Ramos, BARAUNA, R. A., DE SA, P. C. G., DAS GRACAS, D. A., Carneiro, A. R., THOUVENIN, M., Azevedo, V., BADELL, E., GUISO, N. , Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans FRC58, Isolated from the Bronchitic Aspiration of a Patient in France, ISSN: 21698287
  • 2014, PINTO, ANNE CYBELLE, DE PAULA CASTRO, THIAGO LUIZ, Miyoshi, Anderson, SCHNEIDER, MARIA P, Silva, Artur, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, DE SÁ, PABLO HENRIQUE, Rommel Thiago Juca Ramos, BARBOSA, SILVANIRA, BARBOSA, HIVANA P, RIBEIRO, ADRIANA CARNEIRO, SILVA, WANDERSON MARQUES, ROCHA, FLÁVIA SOUZA, SANTANA, MARIANA PASSOS , Differential transcriptional profile of Corynebacterium pseudotuberculosis in response to abiotic stresses, ISSN: 14712164
  • 2014, Eudes Guilherme Vieira Barbosa, Flavia Figueira Aburjaile, Rommel Thiago Juca Ramos, Adriana Ribeiro Carneiro, Le Loir, Y., Baumbach, Jan, Anderson Miyoshi, Artur Luiz Da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Value of a newly sequenced bacterial genome, ISSN: 19498454
  • 2014, CARVALHO, DAIANE M., Meyer, Roberto, Artur Luiz da Costa da Silva, Azevedo, Vasco, Rommel Thiago Juca Ramos, Pacheco, Luis G. C., DE SÁ, PABLO H., Castro, Thiago L. P., CARVALHO, RODRIGO D., Pinto, Anne, GIL, DANILO J. P., BAGANO, PRISCILLA, BASTOS, BRUNO, COSTA, LILIA F. M. , Reference genes for RT-qPCR studies in Corynebacterium pseudotuberculosis identified through analysis of RNA-seq data, ISSN: 00036072
  • 2014, CASTRO, W. D. O., TORRES-BALLESTEROS, A. M., NAKAYAMA, C. R., MELO, I. S., Vivian Helena Pellizari, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , Draft Genome Sequence of Haloferax sp. Strain ATB1, Isolated from a Semi-Arid Region in the Brazilian Caatinga, ISSN: 21698287
  • 2014, FALCÃO, ALINE SEMBLANO CARREIRA, FREITAS, VANESSA M., JAEGER, RUY G., PINHEIRO, JOÃO J. V., KATAOKA, MARIA SUELI DA SILVA, RIBEIRO, NÉLSON ANTONIO BAILÃO, DINIZ, JOSÉ ANTONIO PICANÇO, ALVES, SÉRGIO MELO, RIBEIRO, ANDRÉ L. RIBEIRO, SIQUEIRA, ADRIANE SOUSA DE, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , A Novel Cell Line Derived from Pleomorphic Adenoma Expresses MMP2, MMP9, TIMP1, TIMP2, and Shows Numeric Chromosomal Anomalies, ISSN: 19326203
  • 2014, OLIVEIRA, L. C., JUNIOR, A. F. O., Aderson Rodrigues dos Santos, PINTO, A. C., SOUZA, B. M., CASTRO, C. P., Diniz, C. A. A., ROCHA, C. S., MARIANO, D. C. B., DE AGUIAR, E. L., FOLADOR, E. L., SARAIVA, T. D. L., Eudes Guilherme Vieira Barbosa, Aburjaile, F. F., GONCALVES, L. A., Luís Carlos Guimarães, AZEVEDO, M., AGRESTI, P. C. M., SILVA, R. F., Tiwari, S., ALMEIDA, S. S., Hassan, S. S., Siomar Castro Soares, PEREIRA, V. B., Vinicíus AC Abreu, Pereira, U. P., Fernanda Alves Dorella, CARVALHO, A. F., PEREIRA, F. L., LEAL, C. A. G., FIGUEIREDO, H. C. P., Artur Luiz da Costa da Silva, MIYOSHI, A., Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Azevedo, SA, P. H. C. G., Adriana Ribeiro Carneiro, MIRANDA, F., FREIRE, M., RENAN, W. , Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA-Producing Strain, ISSN: 21698287
  • 2014, BARBOSA, HIVANA P, Adriano MC Pimenta, Marta Carepo, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Vivian Helena Pellizari, SCHNEIDER, MARIA PAULA, Artur Luis da Costa da Silva, BARAÚNA, RAFAEL A, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, Rommel Thiago Juca Ramos, Felipe Nóbrega, Catarina Nunes, GRAÇAS, DIEGO A, Adriana R Carneiro, Daniel M Santos , Omics profiles used to evaluate the gene expression of Exiguobacterium antarcticum B7 during cold adaptation, ISSN: 14712164
  • 2014, DE SA, P. C. G., MATTE, M. H., SATO, M. I. Z., HACHICH, E. M., MATTE, G. R., Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, DA SILVA, M. L., Carneiro, A. R., GOMES, J. C. M., DIAS, L. M., ALVES, J. T. C., DE OLIVEIRA VERAS, A. A., BARAUNA, R. A., DAS GRACAS, D. A. , Draft Genome Sequence of Non-O1 and Non-O139 Vibrio cholerae Strain VCC19, ISSN: 21698287
  • 2014, BARAUNA, R. A., VIANA, M. V. C., Carneiro, A. R., Schneider, M. P. C., SPIER, S. J., EDMAN, J. M., Rommel Thiago Juca Ramos, Azevedo, V., Artur Luiz da Costa da Silva, Guimaraes, L. C., Adonney Allan de Oliveira Veras, DE SA, P. H. C. G., GRACAS, D. A., Kenny da Costa Pinheiro, SILVA, A. S. S., FOLADOR, E. L., BENEVIDES, L. J. , Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis MB20 bv. equi Isolated from a Pectoral Abscess of an Oldenburg Horse in California, ISSN: 21698287
  • 2014, Adonney Allan de Oliveira Veras, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, kenny C Pinheiro, DAS GRAÇAS, DIEGO A, Rafael Baraúna, Maria Paula Cruz Schneider, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz Da Costa da Silva , Efficiency of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31 Genome Assembly with the Hi-Q Enzyme on an Ion Torrent PGM Sequencing Platform, ISSN: 0974276X
  • 2014, Diego Assis das Graças, Rommel Thiago Juca Ramos, SÁ, PABLO GOMES, Baraúna, Rafael Azevedo, GHILARDI JR., RUBENS, Paula Schnneider, Artur Luiz da Costa da Silva , Semiconductor Sequencing Reveals the Diversity of Bacterial Communities in an Amazonian Reservoir, ISSN: 21689148
  • 2014, SILVA, A. D. S. D. S., DA SILVA, A. L. D. C., Rommel Thiago Juca Ramos, BARAUNA, R. A., DE SA, P. C. G., DAS GRACAS, D. A., Carneiro, A. R., THOUVENIN, M., Azevedo, V., BADELL, E., GUISO, N. , Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans FRC58, Isolated from the Bronchitic Aspiration of a Patient in France, ISSN: 21698287
  • 2014, PINTO, ANNE CYBELLE, DE PAULA CASTRO, THIAGO LUIZ, Miyoshi, Anderson, SCHNEIDER, MARIA P, Silva, Artur, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, DE SÁ, PABLO HENRIQUE, Rommel Thiago Juca Ramos, BARBOSA, SILVANIRA, BARBOSA, HIVANA P, RIBEIRO, ADRIANA CARNEIRO, SILVA, WANDERSON MARQUES, ROCHA, FLÁVIA SOUZA, SANTANA, MARIANA PASSOS , Differential transcriptional profile of Corynebacterium pseudotuberculosis in response to abiotic stresses, ISSN: 14712164
  • 2014, Eudes Guilherme Vieira Barbosa, Flavia Figueira Aburjaile, Rommel Thiago Juca Ramos, Adriana Ribeiro Carneiro, Le Loir, Y., Baumbach, Jan, Anderson Miyoshi, Artur Luiz Da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo , Value of a newly sequenced bacterial genome, ISSN: 19498454
  • 2014, CARVALHO, DAIANE M., Meyer, Roberto, Artur Luiz da Costa da Silva, Azevedo, Vasco, Rommel Thiago Juca Ramos, Pacheco, Luis G. C., DE SÁ, PABLO H., Castro, Thiago L. P., CARVALHO, RODRIGO D., Pinto, Anne, GIL, DANILO J. P., BAGANO, PRISCILLA, BASTOS, BRUNO, COSTA, LILIA F. M. , Reference genes for RT-qPCR studies in Corynebacterium pseudotuberculosis identified through analysis of RNA-seq data, ISSN: 00036072
  • 2014, CASTRO, W. D. O., TORRES-BALLESTEROS, A. M., NAKAYAMA, C. R., MELO, I. S., Vivian Helena Pellizari, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , Draft Genome Sequence of Haloferax sp. Strain ATB1, Isolated from a Semi-Arid Region in the Brazilian Caatinga, ISSN: 21698287
  • 2014, FALCÃO, ALINE SEMBLANO CARREIRA, FREITAS, VANESSA M., JAEGER, RUY G., PINHEIRO, JOÃO J. V., KATAOKA, MARIA SUELI DA SILVA, RIBEIRO, NÉLSON ANTONIO BAILÃO, DINIZ, JOSÉ ANTONIO PICANÇO, ALVES, SÉRGIO MELO, RIBEIRO, ANDRÉ L. RIBEIRO, SIQUEIRA, ADRIANE SOUSA DE, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , A Novel Cell Line Derived from Pleomorphic Adenoma Expresses MMP2, MMP9, TIMP1, TIMP2, and Shows Numeric Chromosomal Anomalies, ISSN: 19326203
  • 2014, OLIVEIRA, L. C., JUNIOR, A. F. O., Aderson Rodrigues dos Santos, PINTO, A. C., SOUZA, B. M., CASTRO, C. P., Diniz, C. A. A., ROCHA, C. S., MARIANO, D. C. B., DE AGUIAR, E. L., FOLADOR, E. L., SARAIVA, T. D. L., Eudes Guilherme Vieira Barbosa, Aburjaile, F. F., GONCALVES, L. A., Luís Carlos Guimarães, AZEVEDO, M., AGRESTI, P. C. M., SILVA, R. F., Tiwari, S., ALMEIDA, S. S., Hassan, S. S., Siomar Castro Soares, PEREIRA, V. B., Vinicíus AC Abreu, Pereira, U. P., Fernanda Alves Dorella, CARVALHO, A. F., PEREIRA, F. L., LEAL, C. A. G., FIGUEIREDO, H. C. P., Artur Luiz da Costa da Silva, MIYOSHI, A., Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Azevedo, SA, P. H. C. G., Adriana Ribeiro Carneiro, MIRANDA, F., FREIRE, M., RENAN, W. , Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA-Producing Strain, ISSN: 21698287
  • 2014, BARBOSA, HIVANA P, Adriano MC Pimenta, Marta Carepo, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Vivian Helena Pellizari, SCHNEIDER, MARIA PAULA, Artur Luis da Costa da Silva, BARAÚNA, RAFAEL A, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, Rommel Thiago Juca Ramos, Felipe Nóbrega, Catarina Nunes, GRAÇAS, DIEGO A, Adriana R Carneiro, Daniel M Santos , Omics profiles used to evaluate the gene expression of Exiguobacterium antarcticum B7 during cold adaptation, ISSN: 14712164
  • 2014, DE SA, P. C. G., MATTE, M. H., SATO, M. I. Z., HACHICH, E. M., MATTE, G. R., Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, DA SILVA, M. L., Carneiro, A. R., GOMES, J. C. M., DIAS, L. M., ALVES, J. T. C., DE OLIVEIRA VERAS, A. A., BARAUNA, R. A., DAS GRACAS, D. A. , Draft Genome Sequence of Non-O1 and Non-O139 Vibrio cholerae Strain VCC19, ISSN: 21698287
  • 2014, BARAUNA, R. A., VIANA, M. V. C., Carneiro, A. R., Schneider, M. P. C., SPIER, S. J., EDMAN, J. M., Rommel Thiago Juca Ramos, Azevedo, V., Artur Luiz da Costa da Silva, Guimaraes, L. C., Adonney Allan de Oliveira Veras, DE SA, P. H. C. G., GRACAS, D. A., Kenny da Costa Pinheiro, SILVA, A. S. S., FOLADOR, E. L., BENEVIDES, L. J. , Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis MB20 bv. equi Isolated from a Pectoral Abscess of an Oldenburg Horse in California, ISSN: 21698287
  • 2014, Adonney Allan de Oliveira Veras, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, kenny C Pinheiro, DAS GRAÇAS, DIEGO A, Rafael Baraúna, Maria Paula Cruz Schneider, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz Da Costa da Silva , Efficiency of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31 Genome Assembly with the Hi-Q Enzyme on an Ion Torrent PGM Sequencing Platform, ISSN: 0974276X
  • 2013, Deb Barh, Carneiro, Adriana R, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luiz da Costa da Silva, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho , Exoproteome and Secretome Derived Broad Spectrum Novel Drug and Vaccine Candidates in Vibrio cholerae Targeted by Piper betel Derived Compounds, ISSN: 19326203
  • 2013, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur, Carneiro, Adriana Ribeiro, DE CASTRO SOARES, SIOMAR, BARBOSA, SILVANIRA, VARUZZA, LEONARDO, ORABONA, GUILHERME, Tauch, Andreas, Azevedo, Vasco, SCHNEIDER, MARIA PAULA , High efficiency application of a mate-paired library from Next-Generation Sequencing to PostLight sequencing: Corynebacterium pseudotuberculosis as a case study for microbial de novo genome assembly, ISSN: 01677012
  • 2013, Siomar Soares, Anderson2, Sintia Almeira, Luis Guimarães, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Vasco , The Pan-Genome of the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis Reveals Differences in Genome Plasticity between the Biovar ovis and equi Strains, ISSN: 19326203
  • 2013, LEAO, S. C., Artur Luiz da Costa da Silva, MATSUMOTO, C. K., VIANA-NIERO, C., Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, A. R., Barbosa, M. S., LIMA, K. V. B., LOPES, M. L., Azevedo, V. , Draft Genome Sequence of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii INCQS 00594, ISSN: 21698287
  • 2013, DORELLA, FERNANDA A, SEYFFERT, NUBIA, EL-AOUAR, RACHID A, SILVA, RENATA, HASSAN, SYED S, CASTO, THIAGO LP, MARQUES, WANDERSON S, Rommel Thiago Juca Ramos, CARNEIRO, ADRIANA, SÁ, PABLO DE, Miyoshi, Anderson, GALA-GARCIA, ALFONSO, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, PINTO, ANNE C, SARROUH, BOUTROS, ANTUNES, CAMILA A, RIBEIRO, DAYANA, ABURJAILE, FLÁVIA, FIAUX, KARINA K, Guimarães, Luis C , Progression of 'OMICS' methodologies for understanding the pathogenicity of Corynebacterium pseudotuberculosis: the Brazilian experience, ISSN: 20010370
  • 2013, Castro, Thiago L. P., Seyffert, Núbia, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana R, Paula Schnneider, Vasco, Artur Luis da Costa da Silva , Ion Torrent-based transcriptional assessment of a Corynebacterium pseudotuberculosis equi strain reveals denaturing high-performance liquid chromatography a promising rRNA depletion method, ISSN: 17517915
  • 2013, LEÃO, SYLVIA CARDOSO, AZEVEDO, VASCO ARISTON, DA COSTA DA SILVA, ARTUR, MATSUMOTO, CRISTIANNE KAYOKO, CARNEIRO, ADRIANA, Rommel Thiago Juca Ramos, NOGUEIRA, CHRISTIANE LOURENÇO, JUNIOR, JAMES DALTRO LIMA, LIMA, KARLA VALÉRIA, LOPES, MARIA LUIZA, Schneider, Horacio , The Detection and Sequencing of a Broad-Host-Range Conjugative IncP-1β Plasmid in an Epidemic Strain of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii, ISSN: 19326203
  • 2013, MARINHO ALMEIDA, D., ARAUJO, W. L., Artur Luiz da Costa da Silva, Artur Luiz da Costa da Silva, DINI-ANDREOTE, F., CAMARGO NEVES, A. A., Rommel Thiago Juca Ramos, ANDREOTE, F. D., Adriana Ribeiro Carneiro, OLIVEIRA DE SOUZA LIMA, A., CARACCIOLO GOMES DE SA, P. H., RIBEIRO BARBOSA, M. S. , Draft Genome Sequence of Methylobacterium mesophilicum Strain SR1.6/6, Isolated from Citrus sinensis, ISSN: 21698287
  • 2013, ASSIS DAS GRACAS, D., Vivian Pellizari, Artur Luiz da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos, VIEIRA ARAUJO, A. C., ZAHLOUTH, R., RIBEIRO CARNEIRO, A., SOUZA LOPES, T., AZEVEDO BARAUNA, R., Azevedo, V., CRUZ SCHNEIDER, M. P. , Complete Genome of a Methanosarcina mazei Strain Isolated from Sediment Samples from an Amazonian Flooded Area, ISSN: 21698287
  • 2013, HENRIQUES, I., SAAVEDRA, M. J., EGAS, C., Artur Luiz da Costa da Silva, CORREIA, A., Rommel Thiago Juca Ramos, BARAUNA, R. A., DE SA, P. H., MARINHO ALMEIDA, D., Carneiro, A. R., BARBOSA, S., PEREIRA, A., ALVES, A. , Draft Genome Sequence of Serratia fonticola UTAD54, a Carbapenem-Resistant Strain Isolated from Drinking Water, ISSN: 21698287
  • 2013, Rommel Thiago Juca Ramos, CARNEIRO, ADRIANA, Pablo Sá, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Paula Schnneider, Barh, Debmalya, Artur Luis da Costa da Silva , Graphical contig analyzer for all sequencing platforms (G4ALL): a new stand-alone tool for finishing and draft generation of bacterial genomes, ISSN: 09732063
  • 2013, Barh, Debmalya, Hassan, Syed S., Anderson Rodrigues dos Santos, Amjad Ali, Guimarães, Luis C., Rommel Thiago Juca Ramos, Pratap Devarapalli, Neha Barve, Bakhtiar, Syeda M., Ranjith Kumavath, Preetam Ghosh, Gupta, Krishnakant, Anderson Miyoshi, Artur Luiz Da Costa da Silva, Anil Kumar, Misra, Amarendra Narayan, Kenneth Blum, Baumbach, J., Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Jain, Neha, Gourav Khatri, Nidia Leo´n-Sicairos, Adrian Canizalez-Roman, Sandeep Tiwari, Ankit Verma, Sachin Rahangdale , Conserved host?pathogen PPIs? Globally conserved inter-species bacterial PPIs based conserved host-pathogen interactome derived novel target in C. pseudotuberculosis, C. diphtheriae, M. tuberculosis, C. ulcerans, Y. pestis, and E. coli targeted by Piper betel compounds, ISSN: 17579694
  • 2013, Adonney Allan de Oliveira Veras, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, Vasco, Artur Luis da Costa da Silva, Rommel Thiago Juca Ramos , AutoAssemblyD: a graphical user interface system for several genome assemblers, ISSN: 09738894
  • 2013, PEREIRA, ULISSES DE PÁDUA, Rommel Thiago Juca Ramos, CARLOS DINIZ, Silvânia V. M. Mattos, Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá, Amjad Ali, Bakhtiar, Syeda M., Fernanda Alves Dorella, Zerlotini, Adhemar, Flávio Marcos Gomes Araújo, Laura Rabelo Leite, Guilherme Correa de Oliveira, Anderson Rodrigues dos Santos, Anderson Miyoshi, Artur Luiz Da Costa da Silva, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Henrique César Pereira Figueiredo, Hassan, Syed S., Flavia Figueira Aburjaile, Siomar Castro Soares, Adriana R Carneiro, Luís Carlos Guimarães, Sintia Silva de Almeida , Complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain SA20-06, a fish pathogen associated to meningoencephalitis outbreaks, ISSN: 19443277
  • 2013, PEREIRA, U.P., SANTOS, A.R., Miyoshi, A., Artur Luiz da Costa da Silva, Tauch, A., Barh, D., Azevedo, V., FIGUEIREDO, H.C.P., SOARES, S.C., BLOM, J., LEAL, C.A.G., Rommel Thiago Juca Ramos, GUIMARÃES, L.C., OLIVEIRA, L.C., ALMEIDA, S.S., HASSAN, S.S. , In silico prediction of conserved vaccine targets in Streptococcus agalactiae strains isolated from fish, cattle, and human samples, ISSN: 16765680
  • 2013, Carneiro, A. R., CORREIA, A., HENRIQUES, I., Silva, A., Rommel Thiago Juca Ramos, BARAUNA, R. A., DE SA, P. H., MARINHO ALMEIDA, D., BARBOSA, S., PEREIRA, A., ALVES, A., EGAS, C. , Draft Genome Sequence of Serratia fonticola LMG 7882T Isolated from Freshwater, ISSN: 21698287
  • 2013, Marli Fiori, Janaina Rigonato, Paula Schnneider, Danillo Alvarenga, Alessandro Varani, Caroline Hoff-Risseti, Elaine Crespim, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Patricia Schaker, Karina Heck , Draft Genome Sequence of the Brazilian Toxic Bloom-Forming Cyanobacterium Microcystis aeruginosa Strain SPC777, ISSN: 21698287
  • 2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana R, Hivana Melo, Paula Schnneider, Deb Barh, Vasco, Artur Luis da Costa da Silva , Quality of prokaryote genomes assembly: Indispensable issues of factors affecting prokaryote genome assembly quality, ISSN: 03781119
  • 2012, Soares, Siomar C., Mattos-Guaraldi, Ana L., Miyoshi, Anderson, Azevedo, Vasco, Abreu, Vinícius A. C., Rommel Thiago Juca Ramos, Cerdeira, Louise, Silva, Artur, Baumbach, Jan, Trost, Eva, Tauch, Andreas, Hirata, Raphael , PIPS: Pathogenicity Island Prediction Software, ISSN: 19326203
  • 2012, Soares, Siomar C., DINIZ, CARLOS A.A., Hassan, Syed S., FIAUX, KARINA, Guimarães, Luis C., Bakhtiar, Syeda M., PEREIRA, ULISSES, Almeida, Sintia S., Abreu, Vinícius A.C., ROCHA, FLÁVIA S., Dorella, Fernanda A., Trost, Eva, Miyoshi, Anderson, Silva, Artur, Azevedo, Vasco, Tauch, Andreas, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana R., Santos, Anderson R., Pinto, Anne C., Barbosa, Eudes, ABURJAILE, FLÁVIA, Ali, Amjad , Genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi strain 258 and prediction of antigenic targets to improve biotechnological vaccine production, ISSN: 01681656
  • 2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Barbosa, E. G. V., Dorella, F. A., Rocha, F. S., Cerdeira, L. T., Barbosa, M. S., Tauch, A., Edman, J., Spier, S., Miyoshi, A., Schneider, M. P. C., Artur Luiz da Costa da Silva, Azevedo, V., Carneiro, A. R., Pinto, A. C., Soares, S. d. C., Anderson2, Almeida, S. S., Guimaraes, L. C., Aburjaile, F. F. , Genome Sequence of the Corynebacterium pseudotuberculosis Cp316 Strain, Isolated from the Abscess of a Californian Horse, ISSN: 00219193
  • 2012, Carneiro, A. R., DAS GRACAS, D. A., FRANCO, L. C., Ali, A., Hassan, S. S., NUNES, C. I. P., Barbosa, M. S., Fiaux, K. K., Aburjaile, F. F., Barbosa, E. G. V., Bakhtiar, S. M., Rommel Thiago Juca Ramos, VILELA, D., NOBREGA, F., DOS SANTOS, A. L., CAREPO, M. S. P., Azevedo, V., Schneider, M. P. C., Vivian Pellizari, Artur Luiz da Costa da Silva, DALL'AGNOL, H., Pinto, A. C., de Castro Soares, S., Anderson2, Guimaraes, L. C., Almeida, S. S., BARAUNA, R. A. , Genome Sequence of Exiguobacterium antarcticum B7, Isolated from a Biofilm in Ginger Lake, King George Island, Antarctica, ISSN: 00219193
  • 2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Silva, Artur, Carneiro, Adriana Ribeiro, SOARES, SIOMAR DE CASTRO, SANTOS, ANDERSON RODRIGUES DOS, Almeida, Sintia, Guimarães, Luis, FIGUEIRA, FLÁVIA, Barbosa, Eudes, Tauch, Andreas , Tips and tricks for the assembly of a Corynebacterium pseudotuberculosis genome using a semiconductor sequencer, ISSN: 17517915
  • 2012, Gordo, Sheila M C, Schneider, Horacio, Silva, Wilson A, Sampaio, Iracilda, Darnet, Sylvain, Pinheiro, Daniel G, Moreira, Edith CO, Rodrigues, Simone M, Poltronieri, Marli C, De Lemos, Oriel F, da Silva, Israel Tojal, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, Artur , High-throughput sequencing of black pepper root transcriptome, ISSN: 14712229
  • 2012, Lopes, T., Barbosa, E. G. V., Ribeiro, D., Fiaux, K. K., Diniz, C. A. A., de Abreu, V. A. C., de Almeida, S. S., Hassan, S. S., Ali, A., Bakhtiar, S. M., Aburjaile, F. F., Silva, A., Anne Cybelle Pinto, Soares, S. d. C., Pereira, U. d. P., Schneider, M. P. C., Myoshi, Edman, J., Spier, S., Vasco, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, A., Dorella, F. A., Rocha, F. S., dos Santos, A. R., Lima, A. R. J., Guimaraes, L. C. , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp267, Isolated from a Llama, ISSN: 00219193
  • 2012, Pablo Sá, Vasco, Paula Schnneider, Deb Barh, Artur Luis da Costa da Silva, Anne Cybelle Pinto, Rommel Thiago Juca Ramos, Nilson Coimbra, Barauna, Hivana Melo, Carneiro, Adriana Ribeiro, Alex Ranieri, Agenor Valadares , FunSys: Software for functional for functional analysis of prokariotyc transcriptome and proteome, ISSN: 09732063
  • 2012, Hassan, S. S., Luis Guimarães, Ulisses Pereira, Bakhtiar, Syeda M., Carneiro, Adriana Ribeiro, Rommel Thiago Juca Ramos, Artur Luis da Costa da Silva, Vasco , Complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar ovis strain P54B96 isolated from antelope in South Africa obtained by rapid next generation sequencing technology, ISSN: 19443277
  • 2012, Hassan, S. S., Paula Schnneider, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana Ribeiro, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho, Artur Luis da Costa da Silva , Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain Cp162, Isolated from Camel, ISSN: 00219193
  • 2012, Carneiro, Adriana Ribeiro, Rommel Thiago Juca Ramos, Ana Cecilia Ribeiro Cruz, Pedro Vasconcelos , Molecular characterisation of dengue virus type 1 reveals lineage replacement during circulation in Brazilian territory, ISSN: 00740276
  • 2012, Ali, Amjad, Bakhtiar, Syeda M., Hassan, Syed S., Ussery, David W., On, Stephen, Silva, Artur, Schneider, Maria P., Lage, Andrey P., Miyoshi, Anderson, Azevedo, Vasco, Soares, Siomar C., Santos, Anderson R., Guimarães, Luis C., Barbosa, Eudes, Almeida, Sintia S., Abreu, Vinícius A.C., Carneiro, Adriana R., Rommel Thiago Juca Ramos , Campylobacter fetus subspecies: Comparative genomics and prediction of potential virulence targets, ISSN: 03781119
  • 2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Anne Cybelle Pinto, Wanderson Marques Silva, Flavia Souza Rocha, Silvanira, Miyoshi, Anderson, Paula Schnneider, Silva, Artur, Vasco , The core stimulon of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002 identified using ab initio methodologies, ISSN: 17579694
  • 2012, Pethick, F. E., Lopes, T. S., Barbosa, M. S., Pinto, A. C., dos Santos, A. R., Soares, S. C., Almeida, S. S., Guimaraes, L. C., Aburjaile, F. F., Abreu, V. A. C., Ribeiro, D., Lainson, A. F., Fiaux, K. K., Diniz, C. A. A., Barbosa, E. G. V., Pereira, U. P., Hassan, S. S., Ali, A., Bakhtiar, S. M., Dorella, F. A., Carneiro, A. R., Rommel Thiago Juca Ramos, Yaga, R., Rocha, F. S., Schneider, M. P. C., Miyoshi, A., Azevedo, V., Fontaine, M. C., Flockhart, A., Smith, D. G. E., Donachie, W., Cerdeira, L. T., Artur Luiz da Costa da Silva, Bol, E. , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 1/06-A, Isolated from a Horse in North America, ISSN: 00219193
  • 2012, GRAÇAS, DIEGO A, Silva, Artur, JESUS, EDERSON C, FILHO, LUCIANO C F, JR, RUBENS GUILHARDI, BARBOSA, MARIA SR, Rommel Thiago Juca Ramos, LEÃO, TIAGO F, BARAÚNA, RAFAEL A, Schneider, Maria PC , Changes in Microbial Communities along a Water Column in an Amazonian Flooded Area, ISSN: 21689148
  • 2012, Florence Pethick, Barbosa, M. S., Anne Cybelle Pinto, Anderson2, Siomar Soares, Sintia Almeira, Luis Guimarães, Flavia Aburjaile, Vinicius Abreu, Ribeiro, D., Karina Fiaux, Lainson, A. F., Diniz, C. A. A., Barbosa, E. G. V., Pereira, U. P., Hassan, S. S., Ali, Amjad, Bakhtiar, S. M., Dorella, Fernanda A., Carneiro, Adriana R, Rommel Thiago Juca Ramos, Flavia Souza Rocha, Flockhart, A., Schneider, Maria Paula C., Myoshi, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho, Fontaine, M. C., Smith, D. G. E., Donachie, W., Louise Teixeira Cerdeira, Artur Luis da Costa da Silva, Erick Bol, Lopes, T. S. , Complete Genome Sequences of Corynebacterium pseudotuberculosis Strains 3/99-5 and 42/02-A, Isolated from Sheep in Scotland and Australia, Respectively, ISSN: 00219193
  • 2012, Azevedo, Vasco, Eslabão,, Almeida,, Abreu,, Neto,, Carneiro,, Cerdeira, Louise, Rommel Thiago Juca Ramos, Hirata-Jr,, Mattos-Guaraldi, AL, Trost,, D'Afonseca, V, Tauch,, Silva,, Schneider,, Miyoshi,, Azevedo, Vasco, Ali,, Santos, Anderson, Pinto,, Magalhães,, Faria,, Barbosa,, Guimarães, , Reannotation of the Corynebacterium diphtheriae NCTC13129 genome as a new approach to studying gene targets connected to virulence and pathogenicity in diphtheria, ISSN: 11792701
  • 2012, Casseb, S.M.M., Cardoso, J.F., Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, A., Nunes, M., Vasconcelos, P.F.C., Artur Luiz da Costa da Silva , Optimization of dengue virus genome assembling using GSFLX 454 pyrosequencing data: evaluation of assembling strategies, ISSN: 16765680
  • 2012, Anderson2, Rommel Thiago Juca Ramos, Sintia Almeira, Siomar Soares, Ulisses Pereira, Vinicius Abreu, Silva, Artur, Myoshi, Vasco, Carneiro, Adriana Ribeiro, Anne Cybelle Pinto, Deb Barh, Barbosa, E. G. V., Flavia Aburjaile, Dorella, Fernanda A., Flavia Souza Rocha, Luis Guimarães , The Corynebacterium pseudotuberculosis in silico predicted pan-exoproteome, ISSN: 14712164
  • 2012, Artur Luiz da Costa da Silva, VIEIRA BARBOSA, E. G., ALVES DORELLA, F., SOUZA ROCHA, F., SOUZA LOPES, T., KAWASAKI, R., GOMES SA, P., DA ROCHA COIMBRA, N. A., TEIXEIRA CERDEIRA, L., SILVANIRA BARBOSA, M., CRUZ SCHNEIDER, M. P., Rommel Thiago Juca Ramos, Miyoshi, A., SELIM, S. A. K., MOAWAD, M. S., Azevedo, V., RIBEIRO CARNEIRO, A., CYBELLE PINTO, A., de Castro Soares, S., RODRIGUES SANTOS, A., SILVA ALMEIDA, S., Guimaraes, L. C., FIGUEIRA ABURJAILE, F. , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31, Isolated from an Egyptian Buffalo, ISSN: 00219193
  • 2012, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana Ribeiro, Azevedo, Vasco, Paula Schnneider, Deb Barh, Artur Luis da Costa da Silva , Simplifier: the web tool to eliminate redundant NGS contigs, ISSN: 09732063
  • 2011, Louise Teixeira Cerdeira, Rommel Thiago Juca Ramos, de Oliveira, R. S., Barh, D., Barve, N., Zambare, V., Belchior, S. E., Guimaraes, L. C., de Castro Soares, S., Dorella, F. A., Rocha, F. S., Anne Cybelle Pinto, de Abreu, V. A. C., Tauch, A., Trost, E., Myoshi, Vasco, Silva, A., Schneider, M. P. C., de Almeida, S. S., dos Santos, A. R., Barbosa, E. G. V., Ali, A., Barbosa, M. S., Carneiro, A. R. , Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina, ISSN: 00219193
  • 2011, Siomar Soares, Amjad Ali, Anderson2, Vinicius Abreu, Anne Cybelle Pinto, Artur Luis da Costa da Silva, Vasco, Rocha, Aryanne A. M. C., Barbosa, E. G. V., Luis Guimarães, Sintia Almeira, Myoshi, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana Ribeiro, Louise Teixeira Cerdeira , Plasticidade genômica e evolução bacteriana, ISSN: 19821301
  • 2011, Cerdeira, Louise Teixeira, Azevedo, Vasco Ariston Carvalho, Silva, Artur, Carneiro, Adriana Ribeiro, Rommel Thiago Juca Ramos, de Almeida, Sintia Silva, D´Afonseca, Vivian, Paula Schnneider, Baumbach, Jan, Tauch, Andreas, McCulloch, John Anthony , Rapid hybrid de novo assembly of a microbial genome using only short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis I19 as a case study, ISSN: 01677012
  • 2011, Ruiz, Jerônimo C., Pacheco, Luis G. C., Costa, Marcília P., Turk, Meritxell Z., Seyffert, Núbia, Moraes, Pablo M. R. O., Soares, Siomar C., Almeida, Sintia S., Castro, Thiago L. P., Abreu, Vinicius A. C., Trost, Eva, D'Afonseca, Vívian, Baumbach, Jan, Tauch, Andreas, Schneider, Maria Paula C., McCulloch, John, Cerdeira, Louise T., Rommel Thiago Juca Ramos, Zerlotini, Adhemar, Dominitini, Anderson, Resende, Daniela M., Coser, Elisângela M., Silva, Artur, Oliveira, Luciana M., Pedrosa, André L., Vieira, Carlos U., Guimarães, Cláudia T., Bartholomeu, Daniela C., Oliveira, Diana M., Santos, Fabrício R., Rabelo, Élida Mara, Lobo, Francisco P., Franco, Glória R., Ali, Amjad, Costa, Ana Flávia, Pinto, Anne C., Santos, Anderson R., Rocha, Aryanne A. M. C., Lopes, Débora O., Dorella, Fernanda A. , Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains, ISSN: 19326203
  • 2011, Stynen, A. P. R., Soares, S. d. C., de Abreu, V. A. C., Rocha, A. A. C. M., dos Santos, A. R., Barbosa, E. G. V., Costa, D. F., Dorella, F. A., Myoshi, de Lima, A. R. J., Campos, F. D. d. S., Lage, A. P., Pablo LPDNA, Lopes, T. S., Rodrigues, R. M. A., Carneiro, A. R., Leao, T., Louise Teixeira Cerdeira, Rommel Thiago Juca Ramos, Silva, A., Vasco, Jerônimo da Conceição Ruiz, Moore, R. J., Rezende, A. M., de Resende, V. D. d. S., Ruy, P. d. C., Daher, N., Resende, D. d. M., de Almeida, S. S. , Complete Genome Sequence of Type Strain Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354T, ISSN: 00219193
  • 2011, Louise Teixeira Cerdeira, Guimaraes, L. C., Soares, S. d. C., Dorella, F. A., Rocha, F. S., Erick Bol, Gomes de Sa, P. H. C., Thiago Lopes, Barbosa, M. S., Carneiro, A. R., Rommel Thiago Juca Ramos, Schneider, M. P. C., Coimbra, N. A. d. R., Lima, A. R. J., Barh, D., Jain, N., Tiwari, S., Raja, R., Zambare, V., Ghosh, P., Trost, E., Tauch, A., Anne Cybelle Pinto, Myoshi, Vasco, Silva, A., de Almeida, S. S., dos Santos, A. R., Barbosa, E. G. V., Ali, A., Aburjaile, F. F., de Abreu, V. A. C. , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain CIP 52.97, Isolated from a Horse in Kenya, ISSN: 00219193
  • 2011, Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, Adriana R, Baumbach, Jan, Azevedo, Vasco, Schneider, Maria PC, Silva, Artur , Analysis of quality raw data of second generation sequencers with Quality Assessment Software, ISSN: 17560500
  • 2010, Silva, A., Anderson2, Soares, S. C., Anne Cybelle Pinto, Ali, A., Dorella, F. A., Rocha, F., de Abreu, V. A. C., Shpigel, N., Myoshi, Vasco, Schneider, M. P. C., Cerdeira, L., Barbosa, M. S., Rommel Thiago Juca Ramos, Carneiro, A. R., Santos, R., Lima, M., Sintia Almeira , Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis I-19, strain isolated from Israel Bovine mastitis, ISSN: 00219193
  • 2009, Jerônimo da Conceição Ruiz, Anderson2, Anne Cybelle Pinto, Daniela Resende, Louise Teixeira Cerdeira, Rommel Thiago Juca Ramos, Sara, Sintia Almeira , Segunda revolução genômica: Utilização de sequenciadores de nova geração., ISSN: 19821301

Trabalho de Fim de Curso(17)

  • Análise comparativas dos genes de diferentes biovares de corynabcterium pseudotuberculosis, LUDMILLA FERREIRA COSTA , 03/2017
  • Criação de um ambiente computacional para a caracterização de fagos em genomas bacterianos completos., AILTON LOPES DE SOUSA , 07/2016
  • Ambiente computacional para identificação e caracterização de fagos em genomas bacterianos , AILTON LOPES DE SOUSA , 12/2016
  • Desenvolvimento do Programa de Computador GapBlaster: uma ferramenta gráfica para fechamento de gaps em genomas procariotos, FABIO MALCHER MIRANDA , 03/2017
  • ANÁLISE DA EXPRESSÃO DE GENES DE REPARO DE DNA EM Corynebacterium Pseudotuberculosis EM RESPOSTA A CONDIÇÕES DE ESTRESSE ABIÓTICO, SAVIO DE SOUZA COSTA , 04/2017
  • Caracterização de componentes genéticos provenientes de bacteriófagos transferidos horizontalmente entre linhagens da espécie bacteriana Corynebacterium pseudotuberculosis, AMÁLIA RAIANA FONSECA LOBATO , 09/2017
  • ANÁLISE DA EXPRESSÃO DE GENES DE REPARO DE DNA EM Corynebacterium pseudotuberculosis EM RESPOSTA A CONDIÇÕES DE ESTRESSE ABIÓTICO, SAVIO DE SOUZA COSTA , 08/2017
  • CARACTERIZAÇÃO DE SEQUÊNCIAS PROVENIENTES DE PROFAGOS EM GENOMAS DE Corynebacterium pseudotuberculosis, AMÁLIA RAIANA FONSECA LOBATO , 01/2018
  • PREDIÇÃO IN SILICO DE EPÍTOPOS DO PAN-EXOPROTEOMA DE Corynebacterium pseudotuberculosis, WYLERSON GUIMARAES NOGUEIRA , 01/2018
  • Predição in silico de alvos antigênicos em pan-exoproteoma de Corynebacterium pseudotuberculosis, WYLERSON GUIMARAES NOGUEIRA , 07/2018
  • CLustGClosed: ferramenta para o fechamento de gaps no genoma baseado em clustering, DENER MAUES NEGRAO , 12/2018
  • CLUSTGCLOSED: UMA FERRAMENTA BASEADA EM CLUSTER PARA FECHAMENTO DE GAPS NA MONTAGEM DE GENOMA, DENER MAUES NEGRAO , 12/2019
  • Análises forenses a partir de DNA mitocondrial e DNA de toque: uma revisão sistemática, CIRO ARIEL DOS SANTOS NEVES , 06/2021
  • IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE PADRÕES DE MICROSSATÉLITES EM GENOMAS DE Corynebacterium pseudotuberculosis, SANDY INGRID AGUIAR ALVES , 10/2021
  • IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE PADRÕES MICROSSATÉLITES EM GENOMAS DE Corynebacterium pseudotuberculosis, SANDY INGRID AGUIAR ALVES , 06/2022
  • Salamander-like tail regeneration in the West African lungfish, CIRO ARIEL DOS SANTOS NEVES , 11/2022
  • ANÁLISE GENÔMICA DE CEPA DE SALMONELLA ENTERICA ISOLADA DO RIO YAQUE, VALERIA ALVES CHAVES , 12/2023

Orientações de Pós-Graduação (35)

  • Doutorado, PEDRO HENRIQUE DE AVIZ SILVA, 05/2019 - 08/2021 , Finalizada em 08/2021
  • Doutorado, EDIAN FRANKLIN FRANCO DE LOS SANTOS, 03/2017 - , Orientação em Andamento
  • Doutorado, CLAUDIA MARIA REYES GUTIERREZ, 07/2023 - , Orientação em Andamento
  • Doutorado, LENA VEIGA E SILVA, 04/2016 - 03/2018 , Finalizada em 03/2018
  • Doutorado, ANA LIDIA QUEIROZ CAVALCANTE, 01/2017 - , Orientação em Andamento
  • Doutorado, ADONNEY ALLAN DE OLIVEIRA VERAS, 02/2016 - , Orientação em Andamento
  • Doutorado, AILTON LOPES DE SOUSA, 03/2019 - 09/2019 , Finalizada em 09/2019
  • Doutorado, FABRICIO ALMEIDA ARAUJO, 04/2016 - , Orientação em Andamento
  • Doutorado, KENNY DA COSTA PINHEIRO, 03/2015 - , Orientação em Andamento
  • Doutorado, VICTOR BENEDITO COSTA FERREIRA, 07/2023 - , Orientação em Andamento
  • Doutorado, ANA LIDIA QUEIROZ CAVALCANTE, 01/2017 - 01/2019 , Finalizada em 01/2019
  • Mestrado, YAN PATRICK DE MORAES PANTOJA, 05/2017 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, JAILTON WAGNER RODRIGUES TAVARES, 02/2019 - 03/2021 , Finalizada em 03/2021
  • Mestrado, EDBRUNO PRESTES CORRÊA E SILVA, 03/2020 - 06/2020 , Finalizada em 06/2020
  • Mestrado, DARALYNS BORGES MACEDO, 07/2023 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, CARLOS WILLIAN DIAS DANTAS, 08/2018 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, AMÁLIA RAIANA FONSECA LOBATO, 04/2018 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, HEYDER COUTINHO ALMEIDA, 03/2020 - 08/2021 , Finalizada em 08/2021
  • Mestrado, JAILTON WAGNER RODRIGUES TAVARES, 03/2021 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, DAVID TAVARES MARTINS, 10/2022 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, THAIS AZEVEDO CARDOSO, 10/2022 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, THAIS MAYARA CASTRO DOS ANJOS, 03/2023 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, VICTOR BENEDITO COSTA FERREIRA, 07/2021 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, WELLINGTON VASCONCELOS MORAES, 03/2016 - 09/2017 , Finalizada em 09/2017
  • Mestrado, ELTON COSTA FRANCO ANTUNES, 09/2023 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, WENDEL DE OLIVEIRA CASTRO, 09/2012 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, KENNY DA COSTA PINHEIRO, 09/2013 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, EDIAN FRANKLIN FRANCO DE LOS SANTOS, 03/2015 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, FABIO MALCHER MIRANDA, 03/2017 - 09/2018 , Finalizada em 09/2018
  • Mestrado, SEBASTIAO RODRIGUES DA COSTA NETO, 03/2019 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, DIEGO MAGALHÃES DE MELO, 03/2018 - 03/2020 , Finalizada em 03/2020
  • Mestrado, AILTON LOPES DE SOUSA, 05/2017 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, SANDY INGRID AGUIAR ALVES, 09/2022 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, GLEN JASPER YUPANQUI GARCIA, 02/2016 - , Orientação em Andamento
  • Mestrado, EDBRUNO PRESTES CORRÊA E SILVA, 03/2020 - 06/2021 , Finalizada em 06/2021

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