Banca de QUALIFICAÇÃO: ARTHUR RIBEIRO DOS SANTOS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: ARTHUR RIBEIRO DOS SANTOS
DATA: 23/10/2021
HORA: 14:00
LOCAL: PLATAFORMA ON LINE GOOGLE MEET
TÍTULO:

IDENTIFICAÇÃO, ANOTAÇÃO E SUMARIZAÇÃO DE MÓDULOS DE GENES DIFERENCIALMENTE CÓ-EXPRESSOS NO PROCESSO DE NEURODEGENERAÇÃO

PALAVRAS-CHAVES:

Doença de Alzheimer, co-expressão, redes de co-expressão, módulos de genes, co-expressão diferencial.

PÁGINAS: 46
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
SUBÁREA: Genética Humana e Médica
RESUMO:

A Doença de Alzheimer (DA) é uma patologia neurodegenerativa progressiva e irreversível que resulta na perda de memória e em uma gradativa incapacitação em adultos. Ela afeta predominantemente idosos, podendo ocorrer de forma precoce em decorrência de fatores familiares consequentes de mutações nos genes APP, PSEN1 e PSEN2. Diversos estudos apontam a variante ε4 do gene APOE como um dos principais fatores de risco para a doença. Apesar de ser uma das principais causas de morte em todo o mundo, com prevalência crescente conforme aumenta a expectativa de vida global, nosso entendimento sobre a DA continua incompleto principalmente no que diz respeito às possíveis modificações moleculares e interações celulares que podem originar a doença. Nesse contexto, pouco tem se estudado sobre módulos de genes diferencialmente coexpressos em tecidos cerebrais. A fim de identificar novos genes associados com modificações moleculares e observar interações de genes associados DA, o presente estudo se propõe a desenvolver uma abordagem computacional integrativa para identificar características dos genes e de módulos de genes a partir de diferenças de perfil de co-expressão entre condições utilizando as técnicas de modelagem de redes de co-expressão e co-expressão diferencial. Para alcançar estes objetivos, amostras de três estudos depositados no GEO (GSE95587, GSE104705 e GSE125583) foram pré-processadas e serão submetidas às ferramentas de análise de co-expressão (WGCNA, CEMiTool e coseq) e de análise de co-expressão diferencial (diffcoexp e dcanr). Amostras da série GSE95587 foram coletados do giro fusiforme de pacientes com DA confirmado por autopsia (n = 84) e de controles neurologicamente normais (n = 33). Tecidos do estudo GSE104705 pertencem ao lobo temporal e foram divididos entre controles adultos (n = 8), controles idosos (n = 10) e paciente com DA (n = 12). Amostras de giro fusiforme da série GSE125583 foram dividas entre controles normais (n = 70) e pacientes com DA (n = 219). As anotações clínicas para hubs e módulos de genes diferencialmente co-expressos serão integradas, analisadas e sumarizadas a partir de bancos de dados públicos de diversidade genética, clínicos e de vias biológicas tais como o DANCE, ClinVar, OMIM, Reactome, KEGG e GTEx

MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 3137470 - BRUNO LOPES DOS SANTOS LOBATO
Presidente - 3065575 - GILDERLANIO SANTANA DE ARAUJO
Externo à Instituição - RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN