Banca de DEFESA: PAMELA KETRYA BARREIROS BAKER

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: PAMELA KETRYA BARREIROS BAKER
DATA: 29/09/2022
HORA: 09:30
LOCAL: Auditório do Centro de Genômica e Biologia de Sistemas da UFPA
TÍTULO:

AVALIAÇÃO IN SILICO DE EVENTOS DE SPLICING ALTERNATIVO EM PEIXE-BOI

PALAVRAS-CHAVES:

Splicing Alternativo, peixe-boi, expressão diferencial

PÁGINAS: 94
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
SUBÁREA: Genética Molecular e de Microorganismos
RESUMO:

A complexidade dos genomas eucariotos não resulta, exclusivamente, de seu conteúdo gênico, mas deve-se, sobretudo, à expressão de diferentes transcritos e proteínas a partir de um mesmo gene. O splicing alternativo é um dos mecanismos mais importantes associados ao processamento de RNAs, expandindo significativamente o conteúdo da informação do genoma para o transcriptoma. A resposta imune de um indivíduo está diretamente ligada ao ambiente e a como esse indivíduo dispõe sua maquinaria celular para reagir a um tipo de infecção. Com a descoberta de que efetivas mudanças no mecanismo de splicing constitutivo ocorriam de acordo com estímulos externos que o organismo sofria, conscientizou-se de que havia uma possibilidade de mudança de função dos linfócitos e de outras células de defesa no processo de resposta imune. Esse mecanismo ocorre através da ativação e desativação das células efetoras do sistema imune por proteínas codificadas através de splicing alternativo. O splicing alternativo é um evento molecular complexo e finamente regulado. Entender as circunstâncias nas quais os eventos de processamento constitutivo são preteridos, os mecanismos associados à regulação do processamento alternativo – e que definem a formação de mRNAs funcionais ou não. Com o objetivo de identificar in silico a ocorrência de eventos de processamento alternativo de genes de peixes-boi da subespécie Trichechus manatus latirostris reanalisamos um transcritoma disponível em banco de dados de domínio público e verificamos a ocorrência de processamento alternativo por diferentes estratégias. Nossos resultados evidenciaram maior número de eventos de processamento alternativo utilizando o pipeline Cufflinks em comparação com os resultados obtidos aplicando a ferramenta IsoformSwitchAnalyzeR. A primeira ferramenta, no entanto, não permitiu definir a quais tipos de splicing cada uma das isoformas está relacionada. Observamos ainda que o sistema imune dos peixes-boi não somente sofreu intensa modulação transcricional, como apresenta grande número de genes processados de forma alternativa em resposta ao efeito de toxinas da maré vermelha. Finalmente, observamos que os padrões de evento de splicing obtidos com a ferramenta IsoformSwitchAnalyzeR diferem do perfil geral observado na literatura. Nossos dados precisam ser mais bem explorados, utilizando outras ferramentas de identificação de eventos de splicing, para que possamos assumir que os eventos de processamento alternativo ocorrem de forma distinta em peixes-boi em relação a outros mamíferos. Concluímos que, assim como a modulação da expressão de genes é importante como resposta dos peixes-boi ao efeito tóxico produzido pelo evento da maré vermelha, aqui evidenciamos que muitos genes são transcritos de forma alternativa também como uma estratégia de resistência aos efeitos nocivos das toxinas.

MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - ANDRÉ LUIZ ALVES DE SÁ
Externo ao Programa - 1774491 - LEONARDO DOS SANTOS SENA
Interno - 326353 - MARIA IRACILDA DA CUNHA SAMPAIO
Presidente - 326026 - MARIA PAULA CRUZ SCHNEIDER
Externo ao Programa - 2315294 - RENATA COELHO RODRIGUES NORONHA