A presença de Anticorpos Anti-Nucleares (ANA⁺) em diversas síndromes reumáticas e autoimunes vem sendo associada à infecção pelo HIV, devido ao mimetismo molecular, ao efeito direto do vírus e ao impacto da terapia anti-retroviral (TARV). Entretanto estudos revelam que a presença de polimorfirmos em genes da resposta imune podem permitir a perda da tolerância a antígenos próprios, predispondo um grupo de indivíduos a desenvolver doença autoimune. O gene Three Prime Repair Exonuclease-1 (TREX1), que possui a função a degradação de ssDNA, diminuindo assim a sua detecção no citosol, atua na manutenção da tolerância imunológica inata do indivíduo ao auto-DNA citosólico. Acredita-se que as células que possuem deficiência nesse processo acumulam espécies de ssDNA desencadeando a autoimunidade nesses indivíduos. O presente estudo objetivou descrever a prevalência dos autoanticorpos FAN Hep-2 (anticorpos anti-nucleares - ANA) em uma coorte de pacientes infectados com HIV, visando identificar possíveis correlações entre ANA⁺ e a presença do polimorfismo com o desenvolvimento de doenças autoimunes.