Banca de QUALIFICAÇÃO: WALBER DA SILVA NOGUEIRA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: WALBER DA SILVA NOGUEIRA
DATA: 15/12/2023
HORA: 09:00
LOCAL: ADIADA
TÍTULO:

DIVERSIDADE GENOTÍPICA DE ISOLADOS CLÍNICOS DE LEVEDURAS DOS COMPLEXOS Cryptococcus neoformans/Cryptococcus gattii, OBTIDOS NO ESTADO DO PARÁ

PALAVRAS-CHAVES:

 Cryptococcus; complexo de espécies; diversidade; genótipos.

PÁGINAS: 35
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Microbiologia
RESUMO:

Todos os isolados de Cryptococcus recuperados de amostras clínicas (líquor- LCR) de pacientes internados em hospital de referência serão preliminarmente identificados por procedimentos micológicos padrão. O genótipo dos isolados será determinado por análise de PCR do gene URA5 (RFLP). Os isolados serão ainda genotipados por AFLP –(Amplified Fragment Length Polymorphism - AFLP) e por MLST (Multilocus sequence typing) (GPD1, LAC1, URA5, SOD1, CAP59, PLB1 e região IGS1). Os sete loci serão amplificados e sequenciados usando o BigDye Terminator Kit v3.1 (Applied Biosystems, Foster City, CA, EUA) de acordo com as recomendações do fabricante e analisadas em um ABI 3130xL (Applied Biosystems). Para atribuir os números dos alelos a cada sequência, todas as seqüências serão carregadas no banco de dados MLST para as espécies do complexo Cryptococcus neoformans PPG BAIP – ICB - UFPA: Cidade Universitária “Professor José da Silveira Netto”, Campus Básico I, Rua Augusto Corrêa, n o 1, Bairro Guamá, CEP: 66.075-900, Belém, Pará, Brasil. (www.baip.ufpa.br) / C. gattii (http://mlst.mycologylab.org). Números do alelo tipo(AT) e um número da sequência tipo (ST) serão atribuídos a cada isolado após serem comparados ao site do banco de dados MLST. As sequências concatenadas dos sete loci serão alinhadas com o software MEGA v.6.06 (http://megasoftware.net). As análises filogenéticas serão realizadas usando 2.000 bootstrap replicações pelo método Neighbor Joining (NJ). Além disso, árvores mínimas de expansão serão também geradas usando o algoritmo geo BURST para determinar os complexos clonais representantes de clusters vinculados e intimamente relacionados (http://goeburst.phyloviz.net/).O mating type será determinado por PCR utilizando um par de primers da sequência do mating-type específica. Serão incluídas cepas de referência dos 8 tipos moleculares (VNI-VNIV; VGI – VGIV). Será realizado teste de suscetibilidade antifúngica (fluconazol, Itraconazol, anfotericina B) utilizando-se o protocolo M27-A3 do CLSI, para determinar o perfil de sensibilidade dos isolados deste estudo 

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 330.495.642-53 - SILVIA HELENA MARQUES DA SILVA - IEC
Interno - 069.263.726-59 - ANA PAULA DRUMMOND RODRIGUES - IEC
Externo à Instituição - CINTYA DE OLIVEIRA SOUZA