Banca de QUALIFICAÇÃO: JOSÉ CLEYTON NASCIMENTO GLINS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: JOSÉ CLEYTON NASCIMENTO GLINS
DATA: 31/01/2024
HORA: 10:00
LOCAL: Plataforma Google Meet
TÍTULO:

INVESTIGAÇÃO DO MODO DE LIGAÇÃO DA ENZIMA PLA2CB SOBRE O COMPLEXO E3-E2-E1 EM CHIKV ATRAVÉS DE ANCORAGEM, SIMULAÇÕES DE DINAMICA MOLECULAR CLÁSSICA E ACELERADA

PALAVRAS-CHAVES:

Chikungunya, Complexo E3-E2-E1, Fosfolipase A2; Ancoragem e
Dinâmica molecular.

PÁGINAS: 60
GRANDE ÁREA: Ciências da Saúde
ÁREA: Farmácia
RESUMO:

A doença do chikungunya é uma infecção causada pelo vírus Chikungunya (CHIKV)
pertencente à família Togaviridae. A transmissão tem como seus principais vetores a
picada dos mosquitos do gênero Anopheles, sendo os mais evidenciados o Aedes
Aegypti e Aedes Albopictus. Segundo dados fornecidos pela organização mundial da
saúde, a febre chikungunya, como é conhecida, apesentou um avanço em seus índices
de infecção em cerca de 60%, dentre estes dados está incluso o Brasil, em especial a
região amazônica, graças ao seu clima chuvoso que proporciona potencial de avanço
para o principal vetor da doença, o A. Aegypt. Um dos principais empecilhos no combate
dessa virulência, no Brasil, é a ausência de fármacos específicos aprovados; à luz disso,
o CHIKV apresenta um importante complexo glicoproteico conhecido como E3-E2-E1
(PDB: 3N42), que é responsável pela acepção viral à célula do hospedeiro, assim,
apresenta-se como um alvo promissor para o planejamento de novos inibidores, vacinas
e demais métodos profiláticos. Ademais, em 2021, novas pesquisas apresentaram o
potencial de inibição deste complexo de proteínas através de uma enzima, a fosfolipase
(PLA2CB) (PDB:3R0L), encontrada na peçonha de uma serpente ocorrente em território
brasileiro, Crotallus Curissus Terrifus, popularmente conhecida como cascavel. Com o
objetivo de compreender a forma de interação entre a fosfolipase e o complexo,
aplicamos técnicas de docking proteína-proteína com o auxílio do servidor LZerD, que
apresenta um eficiente algoritmo de busca baseado em 4 funções de pontuação. Com a
obtenção da melhor pose do complexo formado, foram geradas as topologias dos
sistemas (com o inibidor e sem o inibidor) com o auxílio do módulo TLeap (Amber 18).
Doravante, submetemos os sistemas a cálculos de dinâmica molecular acelerada
utilizando o pacote de programas Amber 18, assim avaliamos a estabilidade do sistema
através de cálculos de RMSD e RMSF e descrevemos os estados mínimos através de
PCA e FEL. Em seguida, discutimos a viabilidade do sistema com cálculos de energia
livre de ligação MM/GBSA em 3 réplicas de dinâmica molecular clássica. Em nossas
análises, percebemos que a PLACB se liga a regiões importantes do complexo
glicoproteico, principalmente na cadeia E1, principal responsável pela acepção. Nossos
resultados de energia livre também se mostraram promissores, apresentando valores em
torno de -50Kcal/mol, demonstrando boa relação de viabilidade do sistema.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1316033 - ANDERSON HENRIQUE LIMA E LIMA
Externo ao Programa - 1662562 - JERONIMO LAMEIRA SILVA
Interno - 1268476 - JOSE ROGERIO DE ARAUJO SILVA
Externo ao Programa - 3271096 - LUCAS DE SOUSA MARTINS