Banca de QUALIFICAÇÃO: ALBERTO MONTEIRO DOS SANTOS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: ALBERTO MONTEIRO DOS SANTOS
DATA: 05/06/2017
HORA: 14:00
LOCAL: Instituto de Ciências Biológicas - SAT 02
TÍTULO:

Métodos computacionais aplicados ao estudo de mecanismos de reações enzimáticas.

PALAVRAS-CHAVES:

epsp sintase. qm/mm. Via do chiquimato. Mecanismo de reação.

PÁGINAS: 55
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Biologia Geral
RESUMO:

A enzima 5-enolpiruvil chiquimato-3-fosfato (EPSP) sintase catalisa a transferência de enolpiruvil do fosfoenolpiruvato (PEP) para o grupo hidroxilo do chiquimato-5-OH-3-fosfato (S3P) em uma reação incomum que inclui a quebra da ligação C-O do PEP. A catálise envolve um mecanismo de adição-eliminação coma formação de um intermediário tetraédrico (THI). Vários estudos experimentais tem sido realizados para elucidar o mecanismo da formação e quebra do THI. No entanto, o mecanismo catalítico da EPSP sintase e o papel individual dos dois resíduos catalíticos Asp313 e Glu341 não são bem esclarecidos. No presente trabalho, foram utilizadas superfícies de energia livre (SEL) dentro da abordagem híbrida Mecânica Quântica/Mecânica Molecular (MQ/MM) para explorar a reação catalisada pela EPSP sintase. De acordo com os resultados, o Glu341 é o catalisador ácido/base mais favorável. Os resultados também indicaram que a protonação do C3 do PEP precede o ataque nucleofílico ao C2 do PEP no mecanismo de adição. Verificou-se também que a quebra da ligação C-O do THI para formar um intermediário EPSP catiônico deve ocorrer antes da transferência de prótons do C3 do PEP para o Glu341 no mecanismo de eliminação. A análise da SEL sustenta a formação de intermediários catiônicos durante a reação catalisada pela EPSP sintase. Finalmente, o modelo computacional indica um deslocamento dos estados de transição para a transferência de prótons do Glu341 para o C3 para a reação da enzima (efeito descrito pelo postulado de Hammond), com o estado de transição deslocando para uma posição anterior quando comparado com a reação de referência em água.

MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 1866874 - AGNALDO DA SILVA CARNEIRO
Externo ao Programa - 2278490 - DAVI DO SOCORRO BARROS BRASIL
Presidente - 1662562 - JERONIMO LAMEIRA SILVA
Interno - 1627551 - SYLVAIN HENRI DARNET