Banca de QUALIFICAÇÃO: ANA LIDIA QUEIROZ CAVALCANTE

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: ANA LIDIA QUEIROZ CAVALCANTE
DATA: 01/03/2016
HORA: 14:00
LOCAL: Centro de Genômica e Biologia de Sistemas
TÍTULO:

“MONTAGEM DE GENOMA, PREDIÇÃO in silico E ANÁLISE DE EXPRESSÃO DE sRNA EM Corynebacterium  seudotuberculosis”.

PALAVRAS-CHAVES:

Genômica, Transcriptoma, small RNAs, Corynebacterium pseudotuberculosis.

PÁGINAS: 56
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Biologia Geral
RESUMO:

Corynebacterium pseudotuberculosis é uma bactéria Gram-positiva patogênica, que ocasiona diversas doenças de cunho veterinário. Entre estas, as doenças mais caracterizadas são a Linfadenite Caseosa que acomete caprinos e ovinos e a Linfagite ulcerativa provocada em equinos. Além destes, este patógeno pode infectar bovinos, camelídeos, bubalinos e humanos, ocasionando grandes perdas econômicas à agropecuária mundial. Esta bactéria pode ser classificada como biovar ovis ou equi a partir da capacidade de redução de nitrato a nitrito. A identificação e caracterização dos elementos do genoma desta bactéria, através do sequenciamento por tecnologias de nova geração (NGS) proporcionam informações fundamentais para o entendimento da organização e composição gênica, nos quais direcionam os estudos pós-genômicos como a transcriptômica. A partir desta abordagem ômica, é possível elucidar os mecanismos moleculares que estão envolvidos na regulação global da expressão gênica bacteriana através da regulação pós-transcricional por RNAs não-codificantes (ncRNAs) presentes no genoma. Estes ncRNAs podem ser obtidos a partir da célula sob determinada condição abiótica que possibilita a identificação e análise de expressão destes transcritos. Entre estes, o small RNA (sRNA), está envolvido em todas as principais respostas adaptativas em bactérias, como virulência e resposta a estresse. Desta forma, o presente estudo propõe realizar a montagem e anotação de C. pseudotuberculosis linhagem E19, realizar predição in silico de small RNAs presentes na linhagem E19 e em outros 29 genomas de C. pseudotuberculosis disponibilizados no banco de dados NCBI, e analisar o perfil de expressão de small RNAs das linhagens C. pseudotuberculosis 258 (biovar equi) e C. pseudotuberculosis 1002 (biovar ovis) submetidas ás condições dos estresses abióticos: térmico, ácido e osmótico in vitro. Este estudo proporcionará conhecer as informações estruturais deste microrganismo, além da identificação dos tipos de classes de small RNAs presentes nos biovares equi e ovis de C. pseudotuberculosis e avaliação da expressão dos tipos de pequenos RNAs, das linhagens 258 (equi) e 1002 (ovis) de C. pseudotuberculosis, que podem estar envolvidos na resposta adaptativa da bactéria frente a diferentes condições de estresse enfrentas no hospedeiro.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2012979 - ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO
Interno - 2434806 - CHUBERT BERNARDO CASTRO DE SENA
Interno - 1913763 - ROMMEL THIAGO JUCÁ RAMOS