BIOMARCADORES GENÉTICOS DA FOSFORILAÇÃO OXIDATIVA NO CÂNCER DE MAMA.
O câncer de mama (CM) é o tipo de neoplasia mais incidente e o que mais leva mulheres à óbito no mundo, possuindo grande número de aumento dos casos nos últimos anos e se tornando um grave problema de saúde pública mundial. Desta forma, parte da influência neste tipo de câncer é decorrente de processos biológicos naturais intrínsecos como a formação de energia a partir do metabolismo energético da fosforilação oxidativa (OXPHOS) presente nas mitocôndrias. Estas organelas presentes em organismos eucariotos são responsáveis pela produção de até 70% da energia celular a partir dos cinco complexos da OXPHOS (complexo I, complexo II, complexo III, complexo IV e complexo V), que realizam a passagem de prótons de hidrogênio necessária para a força motriz do complexo V, mas também possuem outras funções importantes como o equilíbrio hidroeletrolítico, equilíbrio e diminuição do estresse oxidativo mitocondrial e reação da acepção final dos elétrons. Com isso, as funções importantes da OXPHOS podem implicar e estarem correlacionados com o CM, que podem ser afetadas por alterações genéticas como mutações nos genes codificadores da OXPHOS e na expressão destes, implicando seja na sua formação ou malignidade, o que, contudo, ainda não se encontra bem elucidado nesta doença. Deste modo, o objetivo deste trabalho é a investigação de biomarcadores genéticos da OXPHOS no CM que possam estar associados à sua progressão e malignidade. Assim, será realizado uma pesquisa in silico por meio da utilização do banco de dados (BD) The Cancer Genome Atlas (TCGA) com suas informações disponibilizadas gratuitamente, utilizando de amostras tumorais e de sangue, assim como de tecido adjacente normal, a fim de analisar possíveis biomarcadores. Os genes da
OXPHOS serão triados a partir da utilização da plataforma MitoXplorer2.0, para indicação apenas dos genes associados a essa função. Serão feitas a análise de mutações em pessoas com CM a partir de arquivos MAF e a predição destas alterações, assim como será feita a análise da expressão gênica dos genes a partir dos dados de reads destes genes. Será utilizada a linguagem R para as análises de bioinformática