Banca de QUALIFICAÇÃO: ERIC PATRICK BAIA DA SILVA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: ERIC PATRICK BAIA DA SILVA
DATA: 18/08/2023
HORA: 15:00
LOCAL: Auditorio do LGHM - ICB - UFPA
TÍTULO:

DESENVOLVIMENTO DE UM WORKFLOW AUTOMATIZADO PARA ANÁLISES DE EXPRESSÃO DIFERENCIAL DE CircRNAs E SUA APLICAÇÃO NO CÂNCER DE TIREÓIDE

PALAVRAS-CHAVES:

Câncer de tireóide; Sequenciamento; NGS; Workflow; circRNA; Expressão diferencial; RNA-seq

PÁGINAS: 5
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
SUBÁREA: Genética Humana e Médica
RESUMO:

A glândula tireoide é responsável pela liberação de hormônios e regularização do sistema endócrino no organismo humano. A desregulação desta glândula pode ocorrer por diversas causas, levando a concentrações excessivas ou insuficientes de hormônios, o que pode levar a diversos problemas de saúde. Sendo uma enfermidade de ocorrência relativamente frequente, o câncer de tireoide é mais detectado em mulheres do que homens. Diversos estudos observaram níveis alterados de expressão gênica nesse tipo de câncer, envolvendo tanto RNAs codificantes quanto os não codificantes. Os circRNAs são uma classe relativamente nova de RNA, com diversas funções regulatórias as quais podem estar envolvidas na fisiopatologia molecular da doença. Utilizando a análise de expressão diferencial de circRNAs para a comparação dos níveis de circRNAs entre tecidos de tireoide saudáveis e tecidos de tireoide cancerosos, é possível obter informações importantes sobre o papel dos circRNAs no desenvolvimento e progressão da doença. A análise de expressão diferencial de circRNAs pode ser realizada por meio de ferramentas de bioinformática em conjunto com técnicas de sequenciamento de nova geração, como o RNA-Seq. Essa técnica é capaz de gerar um alto volume de dados, necessitando de  aplicação de metodologias escaláveis para que os dados gerados sejam transformados em conhecimento de maneira eficaz. Os workflows para automatização de processos constituem uma destas metodologias e, entre seus benefícios, podemos citar a reprodutibilidade dos resultados, aumento da eficiência, redução de erros, escalabilidade e simplicidade na execução de tarefas complexas e recorrentes. Desta forma, o objetivo deste trabalho é desenvolver um workflow automatizado para análises bioinformáticas efetuadas no Laboratório de Genética Humana e Médica da Universidade Federal do Pará. Para tal, utilizaremos a Workflow Description Language, uma linguagem open–source que tem como proposta a facilidade na definição de tarefas de análises complexas, encadeando  fluxos de trabalho e paralelizando suas execuções, permitindo desta forma a automatização dos processos de aquisição e submissão de dados de NGS, a implementação de rotinas automatizadas de controle de qualidade para análises de RNA-Seq, o desenvolvimento de um workflow para a análise de expressão diferencial de circRNAs para identificação de biomarcadores de câncer de tireoide. Deste modo, esse trabalho contribuirá para uma análise mais rápida, objetiva, segura e que seja aplicável não somente a este projeto, mas também a diversos trabalhos desenvolvidos para análise de circRNAs por RNA-seq.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - 1065575 - GILDERLANIO SANTANA DE ARAUJO
Presidente - 3249098 - GIORDANO BRUNO SOARES SOUZA
Externo à Instituição - RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN