Banca de DEFESA: MARCOS DANIEL MENDES PADILHA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: MARCOS DANIEL MENDES PADILHA
DATA: 30/06/2023
HORA: 09:00
LOCAL: SALA 01 DO CENTRO DE GENÔMICA E BIOLOGIA DE SISTEMAS
TÍTULO:

OBTENÇÃO DE GENOMAS BACTERIANOS A PARTIR DE DADOS METAGENÔMICOS DA USINA HIDRELÉTRICA DE TUCURUÍ

PALAVRAS-CHAVES:

Adaptação microbiana, Metagenoma de lago; Bactéria de lagos de água doce; Bioquímica e metabolismo microbiano

PÁGINAS: 87
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
SUBÁREA: Genética Molecular e de Microorganismos
RESUMO:

Tucuruí é a segunda maior Usina Hidrelétrica (UHE) brasileira, o lago artificial no município de Tucuruí alterou o ecossistema da região. Muitos microrganismos de vida livre responsáveis pela degradação de biomassa, decomposição de matéria orgânica, ciclos biogeoquímicos e alguns de interesse clínico como no caso de bactérias com genes de resistência a antibióticos (ARGs) estão adaptados para viver no reservatório do lago. Esta pesquisa tem por objetivo a obtenção de genomas bacterianos por dados metagenômicos e identificar o perfil funcional e metabolismos de bactérias no lago. Amostras de água e sedimento foram coletadas no lago da UHE de Tucuruí nas camadas fótica, afótica e sedimentar das estações do montante 1 (M1) e do montante do novo repartimento (MR). Após a filtração em membrana de nitrocelulose as amostras de DNA foram extraídas usando o Ultraclean Microbial kitⓇ (Qiagen). O sequenciamento de metagenoma WGS foi realizado na plataforma Ion ProtonTM (Thermo Fisher Scientific). Foi utilizado o Megahit para a montagem de novo, Open Reading Frame (ORFs) foram previstas usando Prodigal e para quantificar a completude foi usado o Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO), os bins foram classificados nos banco de dados do RDP classifier e Blastn. Os filos foram definidos em nível de gênero e espécie onde foi encontrado uma microbiota diversa e extremamente conservada, o perfil funcional dos MAGs (Genomas montados em metagenomas) corroborou com outros estudos de metagenomas de lagos oligotróficos.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - 2170803 - ARTUR LUIZ DA COSTA DA SILVA
Externo à Instituição - DANIELLE MURICI BRASILIENSE
Presidente - 2266662 - DIEGO ASSIS DAS GRACAS
Interno - 2260881 - RAFAEL AZEVEDO BARAUNA