ANÁLISE DE REDE DE CO-EXPRESSÃO DIFERENCIAL NO GIRO FUSIFORME DESTACA NOVAS INTERAÇÕES GENE-GENE NA DOENÇA DE ALZHEIMER
Doença de Alzheimer, giro fusiforme, redes de co-expressão, módulos de
genes, redes de co-expressão diferencial
A Doença de Alzheimer (DA) é uma doença neurodegenerativa complexa, progressiva e irreversível que leva à perda de memória, demência grave e à gradual incapacidade em adultos, predominantemente em idosos. Atualmente, a caracterização molecular da DA baseia-se na presença de placas β-amilóides e depósitos eurofbrilares de tau no neocórtex. Poucos estudos apontam que, a região do giro fusiforme, uma estrutura que se encontra na superfície basal dos lobos temporal e occipital, responsável por memória e reconhecimento de objetos, tem apresentado alterações moleculares e um sintoma comum observado em pacientes é a incapacidade de reconhecer os membros da família. Alterações distintas na conectividade funcional do giro fusiforme foram relatadas em pacientes com comprometimento cognitivo leve, apresentando maior risco de conversão para DA. Assim, genes ligados a DA no giro fusiforme podem ser críticos no início e progressão da DA e podem ser alvos promissores para diagnóstico e terapia precoces. Para melhorar nossa compreensão das interações moleculares na DA, dados públicos de RNA-seq de DA (n = 219) e amostras saudáveis (n = 80) foram extraídos da série GSE125583 do GEO e submetidos as análises de rede de co-expressão e de co- expressão diferencial. Estas análises buscaram identifcar e defnir o papel das interações gene-gene no giro fusiforme de pacientes com DA, bem como o poder preditivo em relação ao diagnóstico. Para verifcar a pressão específca de genes no giro fusiforme e outras regiões do cérebro, examinamos dados de RNA-seq de amostras com e sem demência catalogadas no GTEx (13 regiões do cérebro) e no Aging, Dementia, and TBI study (quatro regiões cerebrais). Nossos resultados destacaram três vias enriquecidas (Cascatas de receptores Toll-like, Interações L1CAM e eventos de sinalização G alfa (q)) e um total de oito genes hub, cinco encontrados na Análise de co-expressão (DLGAP1, FNDC3A, MED23, NRIP1 e PKN2) e três em análise de co-expressão diferencial (GABRD, TSPYL1 e VSNL1). Por fm, destacamos genes com desempenho moderado na previsão de demência em diferentes tecidos cerebrais. Nossas descobertas levantam novas vias biológicas e genes na patologia molecular do desenvolvimento da DA, expandindo aspectos signifcativos do conhecimento das redes
reguladoras de genes no giro fusiforme