DESENVOLVIMENTO DE UMA FERRAMENTA PARA IDENTIFICAÇÃO DE PLASMÍDEOS EM DADOS METAGENÔMICOS.
metagenômica; bioinformática; plasmídeo; ARM; ferramenta computacional.
Plasmídeos são elementos genéticos móveis capazes de transferir genes entre bactérias, desempenhando um papel crucial na adaptação microbiana, incluindo a disseminação de genes de resistência a antibióticos e a degradação de compostos tóxicos. No contexto da bioinformática, a identificação precisa de plasmídeos em metagenomas é fundamental para a compreensão das interações microbianas em ambientes naturais e artificiais. No entanto, os métodos tradicionais de identificação apresentam limitações em termos de sensibilidade e especificidade, especialmente em metagenomas complexos. Este projeto de mestrado propõe o desenvolvimento de uma ferramenta computacional para a identificação de plasmídeos em metagenomas, utilizando técnicas de machine learning e análise de sequências de DNA. A ferramenta visa melhorar a acurácia e a eficiência da identificação, contribuindo para a pesquisa em microbiologia e biotecnologia. A validação será realizada através de testes em bancos de dados de metagenomas públicos e amostras ambientais, com foco em avaliar a performance em diferentes contextos ecológicos. Espera-se que os resultados deste estudo possam oferecer uma solução robusta para a detecção de plasmídeos, com aplicações em estudos de microbiomas, bioremediação e desenvolvimento de novas terapias antimicrobianas.