Os ecossistemas aquáticos de água doce estão entre os mais ameaçados do mundo devido a fatores
associados à intensificação das mudanças no uso e cobertura da terra. Insetos aquáticos da ordem
Odonata, por serem sensíveis aos efeitos de mudanças ambientais, são amplamente utilizados para
analisar qual o nível do impacto destas atividades, tornando-se importante desta forma, entender os
padrões de distribuição e composição desses insetos ao longo de gradientes ambientais. O presente
estudo avaliou o efeito de mudanças de uso da terra em diferentes componentes de diversidade de
comunidades de adultos de Odonata na Amazônia. Especificamente, avaliou-se diferentes métodos
baseados em diversidade beta e a capacidade preditiva da diversidade escura em refletir padrões de
composição de comunidade de Odonata ao longo de gradiente ambiental. Foram amostrados 98
igarapés em duas regiões da Amazônia, entre junho e agosto de 2010 em 48 igarapés na região dos
municípios de Santarém e Belterra, e entre junho e agosto de 2011 em 50 igarapés no município de
Paragominas, ambos no estado do Pará, Brasil. Em ambas as regiões, as coletas foram realizadas no
período de estiagem, quando ocorrem menos precipitações, ao longo de gradientes ambientais com
áreas de floresta primária bem preservada e com diferentes tipos de uso da terra. No capítulo 1 foi
apresentado um estudo em que demonstra que o índice de dissimilaridade de Sorensen pode ser capaz
de capturar com maior sensibilidade mudanças na composição de espécies de Odonata adultos em
igarapés amazônicos preservados e alterados em comparação ao índice de Jaccard, embora ambos os
índices sejam eficientes para avaliação da diversidade beta. Isso é importante quando comparar
comunidades pois eleva a chance de detectar os impactos das ações humanas nas comunidades
naturais. No capítulo 2 foi verificado que que a diversidade escura não possui a aplicabilidade de
conseguir prever a ausência espécies de Zygoptera (Odonata) indicadoras de ambientes preservados
a medida que os ambientes tornam-se degradados. Além disso, é sugerido que estudos futuros que
avaliem a dark diversity a partir de dados biológicos coletados em campo, considerem verificar se a
cobertura amostral está relacionada à detecção de ausências de espécies na dark diversity. Neste
sentido, esta tese traz informações a fim de colaborar om estudos de ecologia que avaliem padrões de
distribuição e composição de comunidades de Odonata em regiões tropicais, e assim auxiliar a gestão
de conservação da biodiversidade.

A Amazônia abriga 60% das florestas tropicais remanescentes. Tal característica faz do bioma crucial para a conservação da biodiversidade global e desempenha papéis essenciais na regulação climática e hidrológica. No entanto, atividades como a pecuária, expansão de monoculturas e mineração têm levado a uma significativa redução das áreas florestais. Esses impactos contribuem para mudanças climáticas regionais, com previsão de aumento de temperatura e redução das chuvas, impactando negativamente os ecossistemas e os serviços que prestam. Neste contexto, a perda de habitat e as alterações nas interações ecológicas entre as espécies podem aumentar os riscos de extinção local e reduzir os serviços ecossistêmicos. Diante desses desafios, as Áreas Protegidas (APs) emergem como uma estratégia importante para mitigar os impactos das mudanças climáticas e do desmatamento na biodiversidade amazônica. No entanto, estudos recentes destacam lacunas no sistema atual de APs, incluindo falta de representatividade das espécies ameaçadas e falta de recursos financeiros para a gestão adequada. A baixa conectividade entre as APs e os efeitos das mudanças climáticas também diminuem a eficácia das APs em alcançar seus objetivos. Para enfrentar esses desafios, a avaliação e expansão estratégica da rede de APs se torna necessária para mitigar os efeitos conjunto das mudanças climáticas e de uso da terra. Neste contexto, priorização espacial se apresenta como uma ferramenta de seleção de áreas importantes para aumentar a representatividade da biodiversidade e promover a conectividade entre áreas protegidas. Além disso, a inclusão de outras medidas de biodiversidade, como diversidade funcional e filogenética, é essencial para identificar áreas prioritárias para conservação e avaliar a eficácia das APs existentes. Diante do exposto, é fundamental que sejam identificados modelos biológicos que possam ser utilizadas de modo a avaliar os impactos das mudanças climáticas com o objetivo de mitigar as perdas de biodiversidade das regiões impactadas. As aves são reconhecidas com excelentes modelos biológicos e bioindicadores da qualidade de habitats, pois além de sua importância na realização de serviços ecossistêmicos, possuem uma elevada diversidade de espécies. Assim, essa tese irá avaliar os temas abordados a partir de dois capítulos. No primeiro capítulo, avaliamos os efeitos das mudanças climáticas sobre a distribuição da avifauna ameaçada e endêmica da Amazônia, além de avaliar se as Unidades de Conservação e as Terras Indígenas atuais estão sendo efetivas para a conservação das espécies de aves ameaçadas e se continuarão mantendo sua efetividade no futuro. No segundo capítulo, avaliamos o efeito das mudanças climáticas sobre a diversidade taxonômica, filogenética e funcional de aves ameaçadas do bioma amazônico, indicando áreas prioritárias para conservação destes organismos.

A família Proteocephalidae é reconhecida por apresentar individuos que infectam peixes teleósteos, anfíbios e répteis, com uma espécie sendo registrada parasitando um mamífero marsupial. Atualmente, 75 espécies de proteocefalídeos são conhecidas por parasitar serpentes, distribuídas em nove gêneros em todo o mundo. No Brasil, Ophiotaenia e Crepidobothrium foram relatadas em serpentes. A região Neotropical apresenta a maior diversidade de proteocefalídeos. Entretanto, a maioria dos estudos envolvendo esses parasitas concentra-se em peixes como principais hospedeiros, enquanto os estudos em répteis permanecem negligenciados. O presente estudo tem como objetivo caracterizar os de cestódoes da família Proteocephalidae, parasitas de serpentes da Amazônia Oriental brasileira. As serpentes provenientes de quatro localidades da Amazônia oriental brasileira foram coletadas, eutanasiadas e dissecadas para a coleta de cestódoes. As tênias encontradas foram lavadas em solução salina (NaCl) 0,9%, fixadas em etanol 70% aquecido e armazenadas no banco de amostras. Para a montagem das lâminas, os cestódoes foram corados com carmim acético, clarificados em salicilato de metila e montados em goma de damar. Para análise morfológica, as lâminas foram examinadas no Microscópio Olympus BX 41 equipado com câmara clara. Eletromicrografias foram realizadas no microscópio VEGA 3. Nós analisamos 58 espécimes pertencentes a 18 espécies de serpentes, das quais seis apresentaram individuos parasitados por oito táxons de cestódoes. Somente os cestódoes com proglotes maduras foram caracterizados. Descrevemos duas novas espécies do gênero Ophiotaenia: Ophiotaenia n. sp1., parasita de Erythrolamprus miliaris (Serra do Navio, Amapá) e Ophiotaenia n. sp2., parasita de Boa constrictor (Soure, ilha de Marajó, Pará), que diferem de seus congêneres por um conjunto único de caracteres morfológicos. Adicionalmente, redescrevemos e fornecemos novos dados morfológicos para Ophiotaenia arandasi, que foi registrada parasitando individuos de Erythrolamprus taeniogaster. Além disso, ampliamos o conhecimento sobre a distribuição geográfica e hospedeiros dos táxons de proteocefalídeos encontrados na Amazônia Oriental brasileira. Nosso estudo oferece novas perspectivas sobre a diversidade de proteocefalídeos parasitas de serpentes na região amazônica. 

Estudos experimentais abrangendo distúrbios ambientais e/ou antrópicos têm sido cada vez mais utilizados para explicar relações de causa e efeito nos organismos. Em um mundo em constante e rápida mudança, torna-se crucial analisarmos as respostas dos organismos aquáticos em todas as escalas de indivíduos, comunidades e níveis tróficos, em escalas de tempo relevantes para as respostas às mudanças ambientais. Os ecossistemas de água doce são continuamente ameaçados por múltiplas atividades antrópicas (por exemplo, poluentes emergentes e mudanças climáticas) que afetam a biodiversidade aquática e funções ecossistêmicas (p.e., decomposição da matéria orgânica). Em virtude desse cenário, nesta tese avaliamos os efeitos de diferenças metodológicas e de estressores antrópicos na decomposição foliar em ambientes aquáticos na Amazônia. No capítulo I, avaliamos como as diferenças metodológicas (p.e., espécie fragmentadora, oxigenação da água e remoção do abrigo, tipo de água e luminosidade) afetavam a performance dos fragmentadores (isto é, consumo e sobrevivência). Nós observamos que nem sempre as diferenças metodológicas em estudos em microcosmos culminam em alterações nas respostas dos fragmentadores, garantindo a comparabilidade entre os estudos realizados com fragmentadores neotropicais. No capítulo II, nós verificamos como estressores antrópicos (i.e., mudanças climáticas – aumento de temperatura e CO2; e microplásticos) interagem e afetam o consumo e sobrevivência de fragmentadores. Nós encontramos que tanto os cenários de mudanças climáticas quanto os microplásticos foram letais para os fragmentadores, mas não observamos interações entre estressores reduzindo ou não a sobrevivência. Um padrão oposto foi observado para o consumo dos fragmentadores, onde apenas os cenários de mudanças climáticas tiveram efeitos independentes. Além disso, a interação dos microplásticos e dos cenários de mudanças climáticas no consumo de fragmentadores foram dose dependente e mais intensa no cenário climático extremo, levando à redução do consumo. No capítulo III, nós avaliamos os efeitos independentes e interativos das mudanças climáticas e dos microplásticos sob a assembleia de fungos associados aos detritos foliares. Nós observamos que a assembleia de fungos foi alterada pelos cenários de mudanças climáticas, mas não foi afetada pelas concentrações de microplásticos. Por outro lado, a produção de conídios de algumas espécies de fungos teve efeitos independentes e interativos desses estressores. A partir dos resultados gerados nessa tese, concluímos que estudos experimentais em microcosmos utilizando fragmentadores neotropicais mesmo com alguma diferença metodológica nos desenhos experimentais são equiparáveis e robustos em termos 13 de resultados. As mudanças climáticas intensificam(rão) os efeitos de poluentes emergentes (p. e., microplásticos) sob organismos decompositores (p.e., fragmentadores e fungos aquáticos), afetando as funções ecossistêmicas desempenhadas por esses organismos. 

Os microplásticos contaminam todos os ambientes e matrizes ambientais, distribuindo-se
dos ecossistemas terrestres aos aquáticos, passando pelo ar atmosférico. Morcegos são organismos
biomonitores da contaminação por microplásticos no ambiente terrestre, uma vez que, podem
auxiliar no monitoramento da contaminação por ingestão e inalação de micropartículas em habitats
fragmentados. Com isso, este estudo, visa avaliar a relação do uso e cobertura da terra com a
contaminação por MPs em morcegos. O trabalho foi realizado em municípios ao longo da rodovia
transamazônica no Pará. Coletamos em áreas com diferentes estruturas florestais, desde
preservadas, agroflorestas a áreas mais degradadas. Todos os morcegos coletados são pertencentes
a família Phyllostomidae. Para as análises de microplásticos utilizamos os sistemas digestório,
respiratório e o fígado e nas análises de dados utilizamos um modelo linear generalizado misto.
Analisamos 192 amostras biológicas, somando o estômago, intestino, pulmão e fígado,
predominando em tais amostras, as microfibras, principalmente branco/transparente. Os morcegos
insetívoros foram os mais contaminados por MPs sendo que o uso e cobertura da terra não teve
tanta influência na contaminação dos morcegos frugívoros. A presença de áreas florestadas
reduziu a contaminação, especialmente em morcegos insetívoros catadores da subfamília
Phyllostominae. Essa guilda trófica é conhecida por apresentar alta sensibilidade à perturbação
ambiental, especialmente relacionada ao desmatamento, tendo como principal habitat ambientes
mais florestados. Destacamos aqui a importância da preservação florestal para a diminuição da
contaminação por MPs em ambientes terrestres. Também destacamos a necessidade de pesquisas
adicionais sobre os efeitos desses contaminantes em mamíferos voadores.

As consequências ambientais do desenvolvimento desordenado da Amazônia têm sido grandes e as modificações estruturais e a perda de complexidade ambiental dos habitats nativos tem causado a diminuição de recursos ecológicos gerando alterações na riqueza e na abundância das espécies da fauna. Através do uso de armadilhas fotográficas avaliamos como as espécies respondem às variações nos habitats e dos impactos humanos, em mosaico de áreas degradadas. Foram observadas 28 espécies de mamíferos terrestres e os resultados mostram que a grande maioria da fauna de mamíferos terrestres está presente em todas as áreas antropogênicas estudadas. Em termos de riqueza de espécies os diferentes tipos de habitats não diferem da floresta primária conservada. No entanto, quando consideramos especialmente a abundância das espécies os resultados podem mudar. Nosso estudo reforça a importância de Florestas Primárias alteradas e da manutenção de Áreas de Regeneração florestal para a conservação de espécies, principalmente em contextos de alta pressão antrópica como o observado no arco do desmatamento.

A família Grallariidae, conhecidos como antpittas, composta por espécies insetívoras, com baixa
capacidade de voo que apresentam tamanhos variados. Trata-se de um grupo amplamente distribuído no
Neotropico, ocorrendo em áreas de sub-bosque desde o sul do México até o leste da Colômbia. Esta
família, abriga cinco gêneros, dentre eles Grallaria, que possui 32 espécies descritas, incluindo
Grallaria guatimalensis, conhecida popularmente como tovacuçu-corujinha. Indivíduos desse complexo

de espécies são reconhecidos por apresentarem os tarsos longos, a cauda curta e uma coloração marrom-
acinzentada, habitando o estrato inferior das florestas. G. guatimalensis é composta por 10 subespécies

descritas com base na morfologia e na coloração da plumagem. No presente estudo realizamos a revisão
sistemática e taxonômica do complexo G. guatimalensis, usando dados morfológicos, vocais e
moleculares. Para os dados morfológicos, foram considerados dados morfométricos e de plumagem; Os
dados vocais incluíram as frequências e durações das vocalizações. As analises moleculares incluíram
marcadores mitocondriais (ND2 e ND3) e nucleares (MUSK, BF5 e TGFB2), na geração das hipóteses
filogenéticas. O resultado da análise molecular mostrou que o complexo G. guatimalensis, pode ser
subdividido seis unidades evolutivas distintas, sendo cinco relacionadas ao grupo atualmente
reconhecido com G. guatimalensis, e uma linhagem que se agrupou filogeneticamente com G. varia.
Esses achados foram parcialmente confirmados pelos dados fenotípicos. Nossos resultados sugerem que
essas seis linhagens recuperadas pela filogenia podem sem tratadas como táxons válidos, sendo que uma
dessas linhagens não tem nome aplicável e deve ser formalmente descrita como uma nova espécie de
Grallaria.

O sistema de Exploração Madeireira de Impacto Reduzido (Reduced Impact Logging – RIL) que vem
sendo aplicado por algumas empresas na região da Floresta Amazônica busca reduzir os efeitos da
exploração madeireira e assegurar a sustentabilidade da produção florestal. No entanto, mesmo com
medidas rigorosas de redução de impactos, ainda são observados danos à floresta, tais como abertura
de clareiras, aberturas de pátios de estocagem e estradas, além de danos ao solo, que alteram a estrutura
da floresta. Nesta pesquisa, investigamos qual o efeito do RIL sobre a assembleia de mamíferos
terrestres de médio e grande porte em uma série histórica de 23 anos de exploração. Este estudo foi
realizado na Fazenda Rio Capim, na Amazônia oriental. Instalamos 22 armadilhas fotográficas, que
ficaram funcionando ininterruptamente, desde 2019 a 2023. Distribuímos as armadilhas em áreas de
exploração madeireira de baixo impacto de diferentes anos de exploração, sendo: Áreas exploradas em
2017, 2011, 2006 e 2000; além de áreas de Floresta primária conservada, sem exploração; e área de
Floresta secundária, desmatada para pasto e abandonada há 30 anos. Além disso, realizamos medidas
ambientais envolvendo variáveis que poderiam ser alteradas a partir da exploração madeireira, e que
poderiam influenciar positiva ou negativamente a presença de mamíferos, como: porcentagem de
cobertura de dossel, densidade de sub-bosque, quantidade de árvores mortas caídas, área basal, altura
de serrapilheira, e distância de corpos d’água. Não observamos diferença na riqueza de espécies de
mamíferos em nenhum dos habitats amostrados, no entanto, encontramos diferenças na composição e
abundância da assembleia de mamíferos nos habitats mais recentemente explorados (2017). Apenas
algumas espécies contribuíram para esta diferença, como Leopardus pardalis, Panthera onca e Puma
concolor. Nossos resultados sugerem que o RIL pode ser uma alternativa viável de produção florestal
compatível com a conservação da fauna de mamíferos terrestres na Amazônia.

Mischocyttarus de Saussure é o único gênero da tribo Mischocyttarini. Possui mais de 250 espécies
descritas, sendo o maior gênero de Polistinae, essencialmente neotropical. O grupo de espécies
relacionadas a M. artifex foi elevado à categoria de subgênero por Silveira. Atualmente M. (Artifex)
agrega 22 espécies neotropicais, entre elas, Mischocyttarus synoecus descrita por Richards, tendo
como localidade tipo Rio Potaro, Amatuk na Guyana. A espécie foi comparada a M. oecothrix,
descrita no mesmo trabalho e difere pelo padrão de coloração da cabeça, tórax, antenas, distância
entre ocelos posteriores, coloração dos tarsos posteriores, e principalmente pelo padrão de tamanho
do corpo, sendo uma espécie menor. A arquitetura de ninhos de M. synoecus também difere de M.
oecothrix, sendo um pequeno favo oval com pecíolo no final de uma das fileiras. O último trabalho
taxonômico, que incluiu a espécie, foi realizado por Cooper, que não analisou material da fauna
brasileira. Somado a isso, exemplares depositados na Coleção Entomológica do Museu Paraense
Emílio Goeldi, apresentam variações morfológicas, as quais merecem reconhecimento como espécies
novas, e estas apresentam morfologia mais próxima de M. synoecus. Este trabalho teve como objetivo
realizar uma revisão taxonômica de M. synoecus e espécies novas, morfologicamente afins, baseada
na análise de caracteres de morfologia externa, principalmente das fêmeas, em material proveniente
de coleções entomológicas. Como resultados, M. synoecus foi redescrita, e cinco novas espécies são
descritas neste trabalho. Uma chave de identificação das espécies é apresentada, baseada em dados
da morfologia externa das fêmeas, arquitetura de ninhos e genitália dos machos disponíveis. A
distribuição geográfica de M. synoecus é ampliada, com novos registros para os estados do Acre,
Amapá, Amazonas e Rondônia. As espécies morfologicamente afins de M. synoecus apresentam o
ápice do clípeo estreito e bidentado, distância entre os ocelos igual a um diâmetro ocelar, tergo 1
pouco alongado e menos campanulado, sendo espécies menores, com comprimento da asa posterior
8.5 – 10.4 mm (com exceção de uma fêmea de Mischocyttarus sp. nov. 3, em que a asa posterior
mede 11mm), e menos robustas que as demais incluídas em Artifex. Os machos têm o clípeo coberto
com cerdas prateadas, antenas com cerdas eretas com os últimos artículos achatados ventralmente.
Com exceção de Mischocyttarus sp. nov. 3 que foi coletado na região Sudeste do Brasil, as demais
espécies de M. synoecus, são eminentemente amazônicas, e ocorrem em áreas de floresta. Três das
espécies novas são provenientes de áreas em Unidades de Conservação (UCs); Mischocyttarus sp.
nov. 1 e Mischocyttarus sp. nov. 2 da FLONA Caxiuanã e Mischocyttarus sp. nov. 4 da FLONA do
Amapá.

Erythrolamprus é um dos gêneros mais especiosos e morfologicamente diverso de serpentes
Neotropicais. A maioria das espécies do gênero consideradas válidas são reconhecidas
principalmente com base no padrão de coloração, no entanto, muitas apresentam polimorfismos, o
que pode acarretar problemas de identificação e delimitação dos táxons. Erythrolamprus
carajasensis foi descrita para a Serra Norte, nas áreas de Canga da região de Carajás, Estado do
Pará, com distribuição conhecida apenas para sua localidade-tipo. Historicamente, E. carajasensis
foi relacionada morfologicamente à E. poecilogyrus, espécie politípica e amplamente distribuída na
diagonal seca Sul-Americana, sendo E. p. schotti simpátrica à E. carajasensis. Também foi relatada
similaridade no padrão de desenho de E. carajasensis e E. almadensis, principalmente em relação à
presença da mancha clara parietal. Neste trabalho, testamos a validade taxonômica de
Erythrolamprus carajasensis, com base em caracteres moleculares e morfológicos. Geramos
sequências dos genes mitocondriais 12S e 16S para um topótipo de E. carajasensis e 11 espécimes
de E. almadensis, assim como utilizamos sequências no GenBank. Examinamos 68 espécimes de E.
carajasensis, incluindo sua série-tipo, e comparamos com espécimes de E. almadensis e E.
poecilogyrus. Recuperamos o parafiletismo de E. almadensis com E. carajasensis, formando um
clado fortemente suportado, com baixa divergência genética entre os táxons. Além disso, não
observamos diferenças morfológicas significativas entre E. carajasensis e E. almadensis, com
grande sobreposição no padrão de coloração, morfologia hemipeniana e craniana, assim como nos
caracteres merísticos e morfométricos. Considerando a ausência de diferenças morfológicas e
genéticas entre E. carajasensis e E. almadensis, reconhecemos E. carajasensis como sinônima de E.
almadensis. Redescrevemos E. almadensis apresentando uma nova diagnose, incluindo a variação
dos caracteres morfológicos, morfométricos e merísticos e apresentamos o mapa de distribuição.
Este documento está organizado em Introdução Geral, Capítulo 1 (artigo que será submetido para
publicação) e Conclusões Gerais.

O aumento da demanda mundial por produtos plásticos vem sendo acompanhado pelo descarte inadequado desses resíduos. Tal atividade produz o fenômeno global de contaminação por estres resíduos, sendo agravado pela alta dispersão de partículas plásticas menores, tal como os microplásticos (MPs). Partículas microplásticas já foram identificadas em diversos grupos animais por apresentarem alta taxa de bioacumulação e biomagnificação. Dentre os grupos expostos, destacam-se os anfíbios anuros, os quais são importantes bioindicadores de ambiente aquático em fase larvar e ambiente terrestre em fase adulta. Os trabalhos atuais com esse grupo durante a fase adulta se concentram na exposição por apenas uma via (digestiva), logo o nível de exposição desse grupo segue subestimado. Tendo isso em vista, o presente trabalho tem como objetivo avaliar a contaminação por MP em duas espécies de anuros adultos endêmicos da Amazônia (Physalaemus ephippifer e Boana multifasciata), in situ, a partir de três vias de exposição: digestiva, tegumentar e respiratória. A partir disso, caracterizamos as partículas microplásticas identificadas quanto a forma e cor. Avaliamos os efeitos das variáveis morfométricas sobre o nível de contaminação total por MP e no trato gastrointestinal (TGI). Determinamos o nível de contaminação total para cada espécies e os índices de contaminação: MP total ponderador pela massa, MP total ponderado pelo comprimento rostro-cloacal e MP no TGI. Além disso, analisamos o nível de contaminação para cada via de exposição com o quantitativo absoluto de MP e ponderados pela massa total. A partir dos dados obtidos, identificamos que a forma predominante foi a fibra, enquanto as cores predominantes foram transparente e azul. As medidas de massa total e CRC não apresentaram efeito sobre o nível total de MP, já o nível de contaminação no TGI apresentaram relação das medidas morfométricas do TGI. Quanto aos índices de contaminação, a espécies P. ephippifer apresentou maior risco de exposição ao MP para os valores de MP total foram ponderados pela massa total. As vias de exposição digestiva e tegumentar foram as mais significativas para as duas espécies, cuja via respiratória apresentou menor nível de exposição. Já os níveis de contaminação para cada via ponderados pela massa total, a variação entre as espécies foi significativa, no qual o P. ephippifer apresentou maiores níveis de contaminação em todos as vias estudadas. Portanto, concluímos que as três vias de exposição estudadas são relevantes no processo de contaminação por MP em anfíbios anuros adultos. Sendo este o primeiro trabalho a indicar a contaminação por MP em ambiente terrestre na região amazônica a partir da analise das duas espécies modelo estudadas

Os anuros correspondem a um grupo diverso de animais que habitam variados micro-
habitats, estando sujeitos a inúmeros tipos de pressões ambientais e antropogênicas. Devido às

suas características biológicas, estão expostos à uma ampla variedade de vetores hematófagos que
transmitem uma grande diversidade de parasitos sanguíneos os quais, quando em elevada taxa de
infecção, podem levar à sua debilidade e, em muitos casos, à sua morte. Nosso objetivo nesse
estudo foi identificar e caracterizar os hemoparasitos presentes em indivíduos de algumas espécies
de anuros das famílias Hylidae (Boana multifasciata e Scinax x-signatus) e Leptodactylidae
(Leptodactylus fuscus e Leptodactylus mystaceus), além de verificar as consequências do
parasitismo nesses indivíduos, coletados em um fragmento florestal localizado na região leste da
Amazônia. As coletas ocorreram durante os períodos caracterizados, aqui na região amazônica,
com maiores índices de pluviosidade. Para a captura dos espécimes utilizamos o método de busca
ativa visual, vistoriando todos os micro-habitats disponíveis, como serapilheira, vegetação
arbustiva, troncos caídos, ocos de árvores e interior dos corpos d’água. Todos os anuros coletados
foram levados ao laboratório e mortos através de aplicação de overdose de anestésico na região
torácica. Em seguida realizamos a retirada, em cada indivíduo, de amostras de sangue por punção
cardíaca, das quais realizamos esfregaços sanguíneos e imprint do fígado, para verificar a presença
de parasitismo com o auxílio de microscópio, além da retirada de tecido para as análises e
identificação molecular dos parasitos. Nossos resultados mostram como as populações de anuros
abordadas estão parasitadas em ambientes diferentes e quanto a grande diversidade de espécies do
gênero Trypanosoma encontrados nesses hospedeiros.

A identificação de peixes de riachos amazônicos demanda grandes investimentos financeiros e de tempo, obstáculos que retardam os planos de conservação de riachos. A utilização de substitutos biológicos pode ser uma alternativa para mitigar esses problemas, contudo, esta alternativa ainda não tinha sido avaliada usando a composição de famílias de peixes. Ao priorizar certas famílias, o número de peixes a serem identificados é reduzido, acelerando o desenvolvimento de estudos. Dado esse benefício, o objetivo da tese foi analisar o potencial de famílias taxonômicas como substitutas da diversidade de peixes de riachos amazônicos. No primeiro capítulo, foram utilizados dados de riachos conservados em seis bacias de drenagem da amazônicas, separadas em duas extensões espaciais. Na extensão bioma, os dados foram analisados conjuntamente; enquanto na extensão regional, as análises das bacias de regiões de alta altitude foram separadas das bacias de planície. No segundo capítulo, o teste do uso de famílias como substitutas foi realizado utilizando dados de riachos em uma região com longo histórico impactos ambientais e incluindo o efeito de variações temporais. Como resultado, em riachos conservados, as famílias Cichlidae e Lebiasinidae se mostraram potenciais substitutas nas seis bacias hidrográficas estudadas. Crenuchidae e Hypopomidae foram mais congruentes com peixes das bacias da planície. Já Characidae, Gymnotidae e Rivulidae foram mais similares aos peixes das bacias de alta altitude. Nos riachos impactados, especialmente Cichlidae demonstrou potencial como substituta, mantendo alta similaridade com a assembleias ao longo do período estudado. Enquanto o potencial de substituição de Characidae foi restrito ao período chuvoso. Em todas as relações houve concordância nos padrões encontrados com dados de abundância e ocorrência das espécies. Com esses resultados, demonstramos que há alto potencial para utilização da composição de famílias como substitutas da diversidade de peixes de riachos amazônicos. De modo que na prática, essa estratégia pode contribuir para monitoramentos rápidos e de baixo custo em riachos conservados e impactados. Assim, reforçamos que a substituição biológica é uma alternativa útil diante da acelerada perda de diversidade nos ecossistemas aquáticos, por demandar menos tempo e recursos para o monitoramento ambiental na Amazônia brasileira.

A Amazônia Legal contribui de forma significativa na manutenção da biodiversidade e no equilíbrio
hídrico e climático da região. Mas diante pressões antrópicas como o desmatamento ilegal tem
comprometido o equilíbrio ambiental e gerando perdas irremediáveis da biodiversidade e mudanças
climáticas. Gerando como consequência a formação de fragmentos florestais cada vez mais disjuntos
e isolados para as espécies, que são submetidas a condições de vida estressantes, podendo resultar em
uma alta probabilidade de extinção local. Para controlar as atividades antrópicas nocivas a
conservação da biodiversidade, foram criadas áreas protegidas dentre elas as Reservas Legais,
consideradas como mecanismo de mitigação dos impactos que ocorrem de forma heterogenia em
todas as regiões do bioma. Sendo que neste bioma está localizado o Centro de Endemismos Belém,
o mais ameaçado e que compromete a sobrevivência da espécie Psophia obscura Pelzeln, 1857, a
qual é endêmica do CEB e corre sérios riscos de extinção. Este estudo então se propôs a avaliar se as
áreas de Reserva Legal (RL) das propriedades rurais estão cumprindo a função de preservar as
espécies ameaçadas de extinção no cenário atual e em cenários futuros alternativos. Para isso foram,
gerados modelos de adequabilidade climática do táxon alvo nos cenários presente e futuro (ano de
2100), sendo selecionado dois cenários futuros alternativos, sendo o SSP4.5 um cenário otimista e o
SSP8.5 um cenário pessimista. O estudo indicou 27 ocorrências únicas dentro da área do CEB para a
espécie Psophia obscura e através do modelo de distribuição da espécie comparou a área propicia
climaticamente para a sobrevivência dela em dois cenários presente e futuro, sendo este submetido a
previsão da área adequada a espécie disponível nas Reservas Legais dentro do CEB, levando em conta
os dois cenários futuros alternativos, sendo o primeiro otimista com e sem mitigação (Fut 4.5 da
Reservas Legais Implementadas - RLI e Fut 4.5 Reservas Legais Totais - RLT) e segundo pessimista
com e sem mitigação (Fut 8.5 da RLI e Fut 8.5 RLT). Diante a previsão realizada foi observada que
as Reservas Legais implementadas atualmente não estão cumprindo o seu papel de conservação da
espécie, mas através da implementação das RLT que compõe o cenário futuro com mitigação poderá
contribuir para reverte de forma positiva esta situação.

Quatro grupos de espécies dentro de Hypaeus Simon, 1900 são propostos, com base em
características morfológicas compartilhadas por seus membros: 1) O grupo de espécies
H. taczanowskii (incluindo cinco espécies descritas: H. taczanowskii (Mello-Leitão,
1948), H. annulifer Simon, 1900, H. pauciaculeis (Caporiacco, 1947), H. poseidon
Araújo & Ruiz, 2015, e H. tridactylus Araújo & Ruiz, 2015); 2) O grupo de espécies H.
miles (incluindo três espécies descritas: H. miles Simon, 1900, H. femoratus Araújo &
Ruiz, 2015, e H. terraemediae Araújo & Ruiz, 2015); 3) O grupo de espécie H.
ignicomus (também incluindo três espécies descritas: H. ignicomus Simon, 1900, H.
concinnus Simon, 1900 e H. luridomaculatus Simon, 1900); e 4) O grupo-espécie H.
porcatus, que é revisado neste trabalho, como segue: machos frescos de H. porcatus
(Taczanowski, 1871), H. flavipes Simon, 1900 e H. frontosus Simon, 1900 são
descritos, e as fêmeas das três espécies são descritas pela primeira vez. Dasyophrys
nigra Mello-Leitão, 1930 (♂) (atualmente sinonimizada com H. frontosus) é revalidada,
e Dasyophrys Mello-Leitão, 1930 é corroborado como sinônimo júnior de Hypaeus.
Maenola lunata Mello-Leitão, 1940 (♀) é transferida para Hypaeus e sinonimizada com
H. niger comb. nov. Ambos os sexos de H. niger são redescritos. Noegus lodovicoi
Ruiz & Brescovit, 2008 (♀) e Agelista petrusewiczi Caporiacco, 1947 (♀) (atualmente
em Noegus Simon, 1900) são transferidas para Hypaeus. Hypaeus petrusewiczi comb.
nov. é proposta como sinônimo júnior de H. flavipes. Duas novas espécies de Hypaeus
Simon, 1900 do Brasil são descritas: H. nigriceps sp. nov. (♂♀) e Hypaeus tapajonicus
sp. nov. (♂♀). O grupo de espécies H. porcatus passa a incluir sete espécies.

A família Pentatomidae é a terceira com maior número de espécies dentro de Heteroptera, possui dez
subfamílias, dentre elas a subfamília Edessinae. A subfamília Edessinae é a segunda maior em
número de espécies dentro de Pentatomidae (Hemiptera, Heteroptera). Atualmente a subfamília é
composta por 17 gêneros, dentre eles o gênero Edessa que não possui características diagnósticas
claras e apresenta muitos problemas de taxonomia e de nomenclatura. Dentro do gênero Edessa existe
o subgênero nominal. Esse subgênero foi recentemente revisado por Silva (2017), com base em uma
análise cladística em que vários grupos de espécies foram propostos. O subgênero se mostrou
monofilético e composto por aproximadamente 160 espécies. Dentre esses grupos existe um que é
composto por aproximadamente 74 espécies (23 espécies descritas e 51 espécies novas para a ciência)
e aqui é tratado como grupo E. sexdens, este é considerado o maior grupo de espécie do subgênero.
As espécies que pertencem ao grupo E. sexdens foram poucas representadas no trabalho de Silva
(2017), aparecendo em dois ramos filéticos distinto. O grupo E. sexdens é caracterizado por possuir
a genitália masculina com parâmeros com três lobos; processo superior da taça genital de formato
laminar; e os segmentos do conexivo com um par de manchas escuras. Com isso, o objetivo desse
trabalho foi propor a atualização da diagnose do subgênero Edessa e do grupo E. sexdens e análise
cladística do grupo de espécies E. sexdens. Foram feitas descrições, medições e fotografias do corpo
em vista dorsal e ventral e da genitália da fêmea e do macho; bem como, mapas para verificar a
distribuição das espécies. A análise cladística foi feita como base em uma matriz de dados feita no
programa Mesquite. A matriz foi calculada no programa TNT e o cladograma foi editado no programa
WinClada. A máxima parcimônia foi usada para rodar a análise cladística. Foi utilizado à pesagem
implícita (k=3). Para verificar os valores dos índices de suporte dos clados foi utilizado o suporte de
bremer relativo e o método symmetric resampling. Como resultados foi refeita a descrição do
subgênero Edessa, foi proposto o grupo E. sexdens e apresentadas as descrições das 74 espécies do
grupo. Foi feita uma chave de identificação para o grupo E. sexdens, dez nomes foram sinonimizados
e a espécie E. (E.) magnifica foi transferida do gênero Olbia para o gênero Edessa. A matriz final é
composta por 90 caracteres morfológicos e 94 táxons, sendo 20 táxons compondo o grupo externo e
74 táxons compondo o grupo interno. Com base no cladograma o subgênero se mostrou monofilético,
assim como na análise de Silva (2017) e o grupo E. sexdens também se mostrou monofilético,
diferente da análise de Silva (2017). O grupo de espécies E. sexdens possui uma boa resolução interna
baixa e a adição de mais caracteres na análise é necessária para melhorar essa resolução.

O gênero Pseudacanthicus pertence ao grupo Acanthicus e suas espécies podem ser reconhecidas por
caracteres como: corpo fortemente quilhado, com odontódeos desenvolvidos; pré-maxilares estreitos
com pequeno número de dentes bastante alongados (quando comparado às demais espécies de
Loricariidae) e presença de duas pequenas placas na área posterior do pterótico composto. Ao
contrário da maioria dos táxons de Loricariidae, os representantes do gênero possuem hábitos
carnívoros, alimentando-se principalmente de pequenos invertebrados aquáticos. Atualmente, o
gênero compreende oito espécies válidas: P. spinosus, P. histrix e P. pirarara distribuídas na bacia
Amazônica, P. pitanga e P. major na bacia Tocantins-Araguaia e P. fordii, P. leopardus e P. serratus
nas drenagens costeiras da Guiana ao Suriname. Apenas P. pirarara é descrita para o rio Xingu, e
estima-se a existência de grande quantidade de espécies de peixes endêmicas desta região que ainda
não foram formalmente descritas, como é o caso de Pseudacanthicus sp. “açacu-preto”. Desta forma,
neste trabalho foi feita a descrição da nova espécie de Pseudacanthicus, afim de aumentar o
conhecimento taxonômico do gênero para a bacia do rio Xingu e, consequentemente, contribuir para
estudos de conservação da espécie, uma vez que a ictiofauna das drenagens amazônicas carece de
conhecimento taxonômico e biológico, e alterações provenientes de ações antrópicas crescem
desenfreadamente, ocasionando que muitas espécies sejam extintas antes mesmo de serem

Ações antrópicas têm ocasionado graves alterações ambientais, levando a uma rápida e massiva perda da biodiversidade. Por este motivo, taxonomistas estão em constante busca por novas tecnologias e métodos que acelerem a descrição das espécies, antes que desapareçam. Nesta perspectiva, tecnologias espectroscópicas na faixa do infravermelho próximo têm se mostrado promissoras em diferenciar, caracterizar, classificar e discriminar espécies animais, ao extrair informações químicas de uma amostra em formato de comprimento de onda. Uma das tecnologias mais famosas e versáteis, que utilizam essa região do espectro eletromagnético, é o imageamento hiperspectral. Com esse método, operando na faixa do infravermelho próximo, é possível extrair não só informações químicas de uma amostra, mas também como essas moléculas estão distribuídas. Aqui, nós avaliamos o potencial da tecnologia de imageamento hiperspectral em imfravermelho próximo como uma ferramenta alternativa a ser empregada na taxonomia de insetos pertencentes à ordem Orthoptera. Utilizamos espécimes alfinetados e acondicionados em coleções de museu. Está tese está divida em dois capítulos. O primeiro, é dedicado a realizar uma abordagem metodológica, buscando superar as dificuldades experimentais e investigar as propriedades de resposta da interação entre a radiação do infravermelho próximo e os insetos, como a capacidade de penetração, a qual revelou que as informações acessadas, não correspondem somente à compostos orgânicos expressos na cutícula, mas também em componentes internos, como a musculatura. Neste capítulo, também é discutido os passos analíticos que facilitarão e acelerarão futuros trabalhos empregando a técnica. Posteriormente, foi testada capacidade de imagens hiperspectrais de serem utilizadas para a construção de um modelo de classificação para diferenciar espécies. Neste caso, foram utilizadas quatro espécies de esperança do gênero Conocephalus Thunberg. O modelo construído conseguiu classificar 83% dos pixels das amostras, com uma acurácia de 95%. Ao testar o modelo em predizer outras amostras, este também se mostrou bem efetivo e conseguiu diferenciar a maiorias das amostrar. Assim, concluímos que a tecnologia de imageamento hiperspectral é uma excelente ferramenta, ainda pouco explorada, a ser utilizada para acessar novas informações e auxiliar na tomada de decisões na taxonomia de Orthoptera, a partir de uma perspectiva alternativa.

Ao longo da história, os humanos modificaram drasticamente o ambiente terrestre. As conversões de florestas em diversos tipos de usos da terra, tais como pastagem, agricultura e monocultura, que têm como principal objetivo a produção de alimento em larga escala, têm promovido perdas irreparáveis na região amazônica. Essas modificações que ocorrem nos ambientes, em decorrência das mudanças de usos da terra, geram perdas de biodiversidade e, consequentemente, de funções importantes no provimento de serviços ecossistêmicos. Com isso, estudos que investigam os efeitos dos múltiplos usos da terra sobre o ambiente, as espécies e os atributos funcionais são imprescindíveis para subsidiar estratégias mais eficientes para a redução e recuperação dos ambientes impactados, visando à conservação da biodiversidade. Diante disso, esta tese busca responder as seguintes questões: 1) Quais fatores explicam a diversidade escura de peixes em riachos amazônicos, ao longo de gradientes ambientais? 2) O que influencia a heterogeneidade ambiental, a riqueza de espécies e a riqueza funcional e qual o papel da heterogeneidade ambiental na abundância de espécies e atributos funcionais de peixes de riachos? Para responder essas questões, nós amostramos 71 riachos de 1ª a 3ª ordem em áreas com diferentes tipos de usos da terra nas bacias hidrográficas do Acará-Capim, Amazônia Oriental. Para o capítulo 1, avaliamos os efeitos de variáveis ambientais, da paisagem, heterogeneidade ambiental, conectividade e de atributos funcionais dos peixes sobre a diversidade escura, mensurada através de padrões de coocorrência. A diversidade local média excedeu a diversidade escura observada. A magnitude da diversidade escura foi diretamente associada à proporção de floresta secundária ao nível da bacia imediata e ao índice de proximidade ao impacto antropogênico. Espécies que possuem alta afinidade por ambientes com maior velocidade de corrente, baixa capacidade de natação e que capturam alimentos principalmente na superfície contribuíram mais para a diversidade escura, o que sugere que a capacidade de natação, preferência de habitat e aspectos relacionados à alimentação são fundamentais preditores da probabilidade de uma determinada espécie estar presente em locais com habitat adequado. Para o capítulo 2, avaliamos o efeito do desmatamento na heterogeneidade ambiental, na riqueza de espécies e na riqueza funcional e o papel da heterogeneidade ambiental na abundância de espécies e grupos funcionais de peixes de riachos. Os resultados mostram que a maior porcentagem de floresta clímax favoreceu as árvores de grande porte, e a de floresta secundária favoreceu as plantas herbáceas de sub-bosque. Apenas a maior quantidade de sedimentos influenciou negativamente a heterogeneidade ambiental. Portanto, não houve influência indireta dos usos da terra na heterogeneidade ambiental, riqueza de espécies e riqueza funcional. Espécies com alta habilidade natatória, pertencentes às guildas tróficas piscívoros e invertívoros, foram favorecidas com o aumento da heterogeneidade ambiental. Nossos resultados podem ser úteis para projetos que visem a restauração da vegetação ripária, visando a recuperação do funcionamento do ecossistema em ambientes degradados.

O desenvolvimento de novas técnicas associadas à um arcabouço teórico da biologia do desenvolvimento em conjunto com a sistemática filogenética tem reascendido o interesse nos estudos embriológicos em diversos grupos de vertebrados. O estudo do desenvolvimento embrionário dos Squamata (Serpentes e lagartos) teve um papel fundamental no estabelecimento dos padrões de relacionamento entre os tetrápodes, na identificação de estruturas homólogas e para entender questões fundamentais sobre a evolução da diversidade morfológica. Apesar do crescente interesse na embriologia dos vertebrados, há poucos estudos sobre o desenvolvimento embrionário em serpentes, especialmente de espécies Neotropicais. Embora uma grande parcela da diversidade de serpentes se encontre na região Neotropical, o conhecimento embriológico sobre os grupos de serpentes amazônicas é ainda mais limitado. A jararaca comum Bothrops atrox é uma serpente pertencente à Família Viperidae, que apresenta ampla distribuição na região norte da América do Sul, incluindo a Amazônia brasileira. É o viperídeo mais comum da região, de hábitos predominantemente noturnos e dieta generalista, pode ser encontrado em ambientes florestais e áreas perturbadas em toda bacia amazônica. Vários estudos sobre a biologia de B. atrox apontam a presença de dimorfismo sexual no tamanho do corpo e cabeça, onde as fêmeas apresentam tamanho corporal maior e cabeça mais larga que os machos, e relatam mudanças ontogenéticas em vários aspectos: na composição de veneno, na dieta e no uso do substrato, onde os juvenis são mais arbóreos e se alimentam de presas ectotérmicas enquanto os adultos são terrestres e se alimentam de presas endotérmicas. Apesar dessas informações, nenhum estudo mais complexo com o seu desenvolvimento embrionário foi realizado. Por se tratar de uma espécie comum com ampla distribuição e facilidade de encontro, Bothrops atrox representa um bom modelo de estudo onde, a partir do estudo inédito de sua embriologia, pretende-se descrever os possíveis processos do desenvolvimento embrionário que podem ser responsáveis por variações morfológicas presentes na espécie. Esta tese encontra-se organizada em dois capítulos apresentados em formato de artigo científico. O capítulo I corresponde à caracterização do desenvolvimento embrionário de Bothrops atrox, através da análise de caracteres morfológicos externos para elaboração da tabela de estadiamento para a espécie. O capítulo II tem como foco estudo da morfogênese da genitália externa (hemipênis) de Bothrops atrox

As aranhas saltadoras ou papa-moscas (Salticidae) compõem a família mais diversa de aranhas, contando atualmente com mais de 6.300 espécies. Ao contrário de outros grupos de aranhas, não usam uma teia de seda para caçar, mas buscam ativamente suas presas com seus grandes olhos anteriores e saltam rapidamente sobre
elas com precisão usando pernas curtas adaptadas à propulsão hidrostática. A tribo Amycini F.O. Pickard-Cambridge, 1900 inclui atualmente 14 gêneros de salticídeos neotropicais. Embora alguns desses gêneros tenham distribuição ao longo da Mata Atlântica, a maior parte ocorre exclusivamente na região amazônica. São aranhas pequenas, presentes no solo e na vegetação. Têm carapaças altas, quelíceras com muitos dentes e terceiro par de pernas mais longo que o quarto, o que possivelmente resulta em um salto diferente do padrão observado para a família. O gênero Matinta Ruiz & Maddison, 2019 foi proposto para incluir 19 espécies amazônicas (Guiana, Guiana Francesa, Equador, Peru e Brasil) até então alocadas no gênero Mago O. Pickard- Cambridge, 1882. Inclui amicíneos com o palpo do macho (estrutura copulatória) portando um tégulo dividido obliquamente por uma fenda inflável (hematodoca) que articula as duas metades, característica ausente nos demais gêneros da tribo. Esta característica está presente em 16 das 19 espécies e sua ausência nas outras três espécies ainda não foi entendida em um contexto filogenético. As espécies do gênero foram agrupadas em cinco grupos com base em características dos palpos dos machos, porém estes grupos não foram testados formalmente. Somente um desses grupos foi revisado taxonomicamente. O objetivo deste projeto foi descrever novos táxons amazônicos e redescrever algumas espécies pouco estudadas. Consequentemente, incrementar o conhecimento sobre a riqueza e diversificação de Matinta. Os machos das espécies Matinta opiparis (Simon, 1900), M. silvae (Crane, 1943), M. fonsecai (Soares & Camargo, 1948), M. vicana (Simon, 1900) e a fêmea de M. silvae foram redescritos com base em material fresco. E a fêmea de M. opiparis foi descrita pela primeira vez. Além disso, foram descritas cinco novas espécies para o gênero: Matinta maddisoni sp. nov. de Morona Santiago, Equador (macho e fêmea); Matinta pereirae sp. nov. do Amazonas, Brasil (macho); Matinta aragog sp. nov. da Guiana Francesa (macho); Matinta tatianae sp. nov. do Acre, Brasil (macho); e Matinta exasperata sp. nov. do Amazonas, Brasil (macho). Foi feita uma descrição detalhada dos dentes encontrados nas quelíceras, detalhando os dentes intermaginais e assim enriquecendo ainda mais o conhecimento a respeito desses animais. Foi concluído que a dentição dentro de Amycini deve ser revisada e mais estudada.

O morcego Furipterus horrens é uma espécie rara com ampla distribuição com ocorrência da Costa rica ao Sul do Brasil, possui uma associação mais estrita com ambientes cársticos, abrigando-se particularmente em grutas e cavernas. Todavia, no Brasil, ambientes deste tipo tem passado por alterações devido a exploração mineral, a expansão agropecuária e os impactos direto e indireto da geração de energia elétrica. A espécie F. horrens ocorre em quase todas as regiões brasileiras, com exceção dos biomas Pampas e Pantanal. Apesar da ampla distribuição, os registros de ocorrência desta espécie são raros, bem como, os estudos que descrevem características básicas de sua história natural ou biologia comportamental. O presente estudo teve como objetivo caracterizar a ecologia comportamental da espécie Furipterus horrens, em ambiente antropizado no sudeste do estado do Pará. São estudados os padrões da biologia comportamental, atividades de forrageio, ocupação espacial do interior do abrigo, tamanho da colônia e tipo de agrupamentos. Para tanto foram utilizadas as seguintes metodologias: contagem de indivíduos por observação direta de registros fotográficos, monitoramento por filmagens em vídeo do comportamento diurno e da atividade de forrageio noturna. Nos resultados, o agrupamento apresentou uma média 94±20,26 indivíduos, sendo, o de menor quantitativo (n = 67) na estação mais seca (agosto) e maior quantitativo (n= 132) no período chuvoso (janeiro de 2022). A variação na abundância dos indivíduos ao longo das estações seca e chuvosa, mostrou diferenças significativas (p < 0,001). A diferença da abundância de registros das amostras obtidas em cada fase lunar, não foi significativa (ANOVA, F = 0,26681; p = 0,848). Nas análises dos vídeos, 20 tipos de atividades comportamentais foram identificados, categorizados em seis estado e dois eventos, os quais auxiliaram na elaboração do primeiro Etograma para a espécie F. horrens. Os 10 comportamentos diurnos mais comuns e duradouro selecionados, quando testada a frequência total do comportamento diurno por Estimativa de Densidade de Kernel (KDE), foi altamente significativa (p < 0,001), com maiores atividades comportamentais no período vespertino. O início do horário de saída dos morcegos mostrou uma relação altamente significativa com o pôr do sol (p < 0,001). No geral, o agrupamento de F. horrens observado no abrigo da Fazenda Paloma, mostrou um padrão bimodal de atividade diurna e de atividade predatória durante o período amostrado . Por fim, Este estudo representa um novo registro geográfico de F. horrens no bioma amazônico.

A Floresta Amazônica contém uma das maiores biodiversidades na região Neotropical, e várias teorias foram postuladas para explicar essa biodiversidade. Este estudo teve como objetivo analisar os padrões de variabilidade genética e morfológica de Amphisbaena fuliginosa, uma espécie amplamente distribuída principalmente na Floresta Amazônica, atualmente com cinco subespécies reconhecidas (Amphisbaena fuliginosa fuliginosa, A. f. varia, A. f. amazonica, A. f. bassleri e A. f. wiedi). Como objetivos específicos avaliamos se os padrões de diversidade genética e morfológica são congruentes com as subespécies; descrevemos os padrões morfológicos e moleculares de Amphisbaena fuliginosa ao longo de sua distribuição; averiguamos se existe estruturação molecular nas populações. As análises morfológicas revelaram grande sobreposição de todos os caracteres diagnósticos das subespécies, sem estruturação definida nas áreas de endemismo da Floresta Amazônica ou entre as subespécies. Dentro dos morfotipos, alguns apresentaram estruturação geográfica em relação às subespécies, mas ainda com sobreposição da distribuição nas áreas de endemismo. As análises moleculares, na árvore filogenética e as redes de haplótipos, indicaram populações estruturadas entre os interflúvios da Floresta Amazônica, nas áreas de endemismo e em regiões adjacentes, como o Domínio Pacífico e populações no Cerrado. Os testes de neutralidade indicaram uma diversificação em populações com tamanhos estáveis. Algumas populações, como a de Juruti, estavam delimitadas por interflúvios menores, como o do Rio Aripuanã, que divide a área de endemismo de Rondônia. Com base nos dados morfológicos e moleculares, propomos a sinonimização das cinco subespécies com A. fuliginosa, e nosso estudo mostra a importância de incluir mais répteis e vertebrados com hábitos fossoriais em estudos filogeográficos, a fim de entender os processos evolutivos que ocorrem na Floresta Amazônica e na região Neotropical como um todo.

Sepsidae é uma pequena família de dípteros acaliptrados com 385 espécies descritas em 38 gêneros. A maioria de suas espécies, tanto no estádio larval e adulto são morfologicamente parecidas. A fauna de dípteros da Amazônia brasileira permanece pouco conhecida, inclusive com interesse forense, como Sepsidae. A fauna de sepsídeos adultos de duas florestas secundárias na Amazônia Oriental foi pesquisada utilizando pulmão bovino apodrecido, fezes humanas, bovinas e de macacos. Foram obtidas 17 espécies pertencente a seis gêneros, a maioria em esterco bovino e pulmão bovino em decomposição. Duas novas espécies são descritas: Archisepsis sp. nov. 1 e Archisepsis sp. nov. 2. O gênero Palaeosepsis e as espécies Archisepsis polychaeta (Ozerov, 1993), Archisepsis diversiformis (Ozerov, 1993), Microsepsis mitis (Curran, 1927) e Meropliosepsis sexsetosa Duda, 1926, são novos registros para a Amazônia brasileira. Os estudos morfológicos sobre os estágios larvais dos dípteros, são uma importante fonte de caracteres para estudos taxonômicos e filogenéticos. No entanto, o conhecimento sobre as larvas das espécies neotropicais de Sepsidae, também são escassos e, até o momento, apenas três espécies de Archisepis e uma espécie de Microsepsis foram descritas. Neste trabalho, foram descritas as larvas de terceiro estádio de oito espécies dos gêneros Archisepsis (6 spp.) e Microsepsis (2 spp.) coletadas na Amazônia. As larvas analisadas são muito parecidas morfologicamente, apresentando corpo alongado, cilíndrico, afilando em direção à cabeça, com gancho da maxila desenvolvido e último segmento abdominal bulboso com muitos espinhos. As principais diferenças observadas estão nos espiráculos posteriores e na ornamentação do último segmento abdominal. Uma chave dicotômica para a identificação das larvas de terceiro estádio conhecidas das espécies de Archisepsis e Microsepsis da Amazônia brasileira é apresentada.

Os pelos-guarda são mais longos, grossos, apresentam função mecanorreceptora, juntamente com os pelos que se sobressaem na pelagem, e de dissimulação no ambiente, produzindo o padrão geral de coloração da pelagem. Possuem três camadas definidas: a mais interna, medula; a intermediaria, córtex; e a mais externa, cutícula. No caso da cutícula e medula, por apresentarem padrões morfológicos distintos entre as espécies, podem ser usados para a identificação. Nossos objetivos foram avaliar a variabilidade intraespecífica de padrões da cutícula e medula dos pelos de marsupiais com ampla distribuição na Amazônia brasileira e áreas de transição com o Cerrado, e relacionar os padrões dos pelos-guarda com os tipos de habitats e hábitos das espécies analisadas. Além disso, propor hipóteses do processo de evolução dos padrões cuticulares e medulares dentro de Didelphimorphia. Analisamos a cutícula e medula dos pelos-guarda em nove espécies de marsupiais depositadas em coleções cientificas. Fizemos a primeira descrição para Philander pebas, P. canus e Didelphis imperfecta. Não encontramos nenhuma variação intraespecífica e relação entre os padrões cuticulares com o habitat, porém há uma possível relação entre os padrões cuticulares conoidal e losângico com os hábitos arborícola e terrícola, respectivamente. Os padrões folidáceo (cuticular) e escalariforme (medular) são caracteres basais dentro de Didelphidae, com os demais padrões ocorrendo em momentos diferentes. A utilização da microestrutura dos pelos-guarda possui grandes vantagens para a identificação de mamíferos, entretanto, para a grande diversidade de marsupiais, principalmente na Amazônia, a identificação ao nível de espécie é bem dificultada, pois os padrões tendem a se repetir, sendo usados caracteres mais subjetivos para a sua diagnose.

Richards (1978) propôs o subgênero Hypopolybia para um grupo de três espécies (P. bifasciata de Saussure 1854, P. quadricinctaa de Saussure 1854 e P. signata Ducke 1910). Carpenter & Day (1988) verificaram que o nome criado por Richards era um sinônimo de Alpha de Saussure (1854) criado para uma “divisão” dentro de Polybia. Apesar deste subgênero apresentar apenas três espécies válidas, não há estudos recentes sobre as espécies. As descrições originais já têm todas mais que um século, e até o trabalho de Richards (1978) já tem mais de 40 anos. Os limites entre as espécies não são tão claros quanto a literatura indica. Assim, um estudo revisional dessas espécies é de grande importância no âmbito do conhecimento da diversidade em Polybia, com reflexos na conservação das espécies. O estudo abrangeu observações morfológicas e mensurações morfométricas, bem como uma análise de morfometria geométrica das interseções de veias da asa anterior. A genitália do macho foi descrita e documentada pela primeira vez nessas espécies. Uma chave de identificação atualizada, com melhorias, e novas diagnoses mais precisas também são apresentadas, bem como mapas de distribuição das espécies.

A busca por recursos realizada pelas abelhas operárias em benefício da colônia é designada como
atividade de forrageio e apresenta gastos de tempo e energia para procurar, coletar e carregar
diferentes tipos de recursos. O tempo gasto nesta atividade pode ser observado como uma variável
equivalente do esforço de forrageio e está diretamente relacionado com a longevidade das abelhas
operárias. O objetivo deste trabalho foi estudar o efeito do esforço de forrageio sobre a longevidade
das operárias de Melipona flavolineata. Dessa forma, quatro colônias de M. flavolineata, tiveram 338
abelhas operárias recém emergidas capturadas e marcadas individualmente. A longevidade foi
registrada diariamente, até que não houvesse mais registro de abelhas marcadas vivas visíveis dentro
da colônia. Das abelhas observadas, 53 assumiram a função de forrageio e foram recapturadas com
uso de sugador manual, para a adição das cargas de peso extra, pequenos pedaços de chumbo, que
foram colados na região dorso central do tórax. As abelhas forrageiras marcadas foram separadas por
grupos, um controle (C) sem adição de peso extra (P0) e três com adição de peso extra (grupo P1 com
pesos de 0,1 a 0,10 mg; P2 = 11 a 20 mg; P3 = 21 a 30 mg). Para estes grupos foram observadas duas
atividades, o tempo gasto no forrageio e o tipo de recurso coletado, no horário das 07:00h às 12:00h,
em intervalos de tempo alternados de 1 hora para cada colônia. Para análise de dados foi utilizado o
programa R. Nossos principais resultados mostraram que aumento na carga de trabalhos reduziu a
atividade de forrageio e consequentemente, diminuiu a expectativa de vida das abelhas operárias
forrageiras, em particular para abelhas carregavam mais de 20 mg de peso extra (grupo P3). Nossas
observações sugerem que exista uma compensação maior no custo de vida das abelhas com cargas mais
pesadas, pois elas reduziram o número de viagens de forrageamento por períodos de atividade dentro da
colônia ou mesmo foram rapidamente levadas ao desaparecimento (morte). Nossas outras observações
indicam que apenas as cargas de trabalho excessivas levam a uma redução na duração da atividade de
forrageio, pois, as cargas de peso moderadas próximas às cargas de trabalho normalmente adotadas pelas
abelhas forrageiras (P1) parecem ter pouco efeito. Também observamos que a idade que abelhas iniciaram
a atividade de forrageio foi consequentemente determinante para exercer esforço de trabalho extra, abelhas
que saíram no período esperado de forrageio tiveram maior atividade de trabalho, mostrando que a
senescência é também um fator natural, que causa a diminuição desempenho fisiológico.

O gênero Hypoxys é potencialmente o segundo mais diverso de Edessinae, mas ainda possui muitas espécies a serem descritas. O táxon é dividido em quatro grupos de espécies, dentre estes o grupo H. triangularis é atualmente o contém o menor número de espécies. O grupo é formado por H. triangularis (Dallas, 1851), H. capito (Breddin, 1904) e H. subrastratus (Bergroth, 1891). Nestes estudo são descritas cinco espécies novas: H. myrtacivorus sp. n.; H. striatus sp. n.; H. saltensis sp. n.; H. curvatus sp. n. and H. ocanensis sp. n. Características adicionais foram incluídas para o grupo de espécies H. triangularis e as espécies descritas. A genitália interna de ambos os sexos de Hypoxys são apresentadas pela primeira vez. São fornecidas diagnoses para as novas espécies, mapa de distribuição e uma chave de identificação.

Sciurillus pusillus, conhecido como esquilo pigmeu neotropical, ou quatipuruzinho (no Brasil) é o menor dos esquilos sul-americanos, dificilmente encontrado, e apresenta especializações comportamentais e morfológicas relacionadas à coleta de cascas e exsudatos para a alimentação. A espécie é a única representante do gênero Sciurillus e da subfamília Sciurillinae, e é conhecida de poucas localidades, apresentando uma distribuição disjunta entre a floresta tropical da planície ocidental e oriental da América do Sul. Porém, ainda há muitas lacunas sobre o entendimento de seus limites geográficos. Além disso, algumas linhas de evidência, incluindo variação morfológica e genética, sugerem que o gênero Sciurillus possui mais diversidade do que reconhecido atualmente, e que mais de uma espécie possa estar representada sob o nome Sciurillus pusillus. O objetivo deste trabalho consiste em investigar a diversidade da subfamília Sciurillinae (gênero Sciurillus) através de análises detalhadas da morfologia do grupo. Foram compilados dados morfológicos discretos e contínuos de espécimes disponíveis em coleções científicas da América do Sul, América do Norte e Europa, incluindo espécimes tipo e espécimes representantes de grupos filogeográficos distintos de acordo com estudos prévios de filogenia molecular. Os dados morfológicos foram analisados para averiguar se a variação morfológica presente no grupo permite ou não a distinção de subgrupos diagnosticáveis, e se corrobora ou não a hipótese de que mais de uma espécie esteja presente em Sciurillus. Os dados de localidades de coleta dos espécimes analisados foram compilados e utilizados para providenciar um mapa atualizado de distribuição geográfica do gênero.

Padrões e processos que mantêm a biodiversidade são dependentes da escala espacial de observação.
A diversidade beta (β), comumente definida como a variação da composição de espécies entre locais
situados em uma região, se configura como elo entre a diversidade local (α) e a regional (γ). Assim,
nossos objetivos foram identificar quais níveis espaciais mais contribuem para a diversidade regional
(γ) de insetos aquáticos imaturos (Ephemeroptera, Plecoptera e Trichoptera - EPT) de riachos
amazônicos e verificar quais mecanismos (substituição vs diferença de riqueza) são mais importantes
para a diversidade beta observada em cada nível espacial. Para isso, utilizamos a abordagem de
partição aditiva da diversidade em um desenho experimental hierarquizado abrangendo os seguintes
níveis espaciais: unidades amostrais dentre de trechos de riachos, trechos de riachos e áreas da
Amazônia. O maior valor de diversidade beta foi observado entre áreas (β3 = 21 gêneros,
correspondendo a 37,50 % da riqueza total), seguido pela diversidade beta entre trechos de riachos
(β2 = 16,6 gêneros, correspondendo a 29,64% da riqueza total) e pela diversidade beta entre unidades
amostrais (β1 = 14,1 gêneros, correspondendo a 25,18% da riqueza total). A substituição foi o
mecanismo mais importante para a diversidade beta entre trechos de riachos (βrepl = 61,13%). Já a
diferença de riqueza foi mais importante para a diversidade beta entre unidades amostrais (βrich =
56,99%) e entre áreas (βrich = 68,91%). Assim, verificamos que a diversidade beta aumentou
conforme o aumento da extensão espacial. O componente β3 (entre áreas) foi o que mais contribuiu
para a composição da diversidade γ, embora as demais componentes de diversidade beta (β2 e β1)
também tenham sido importantes para a diversidade regional (γ). Os padrões de diversidade
observados sugerem que fatores como a diversidade de habitats disponíveis entre unidades amostrais,
a variação ambiental entre riachos e mesmo fatores espaciais, como a distância geográfica entre áreas,
podem estar atuando sobre a distribuição da diversidade de insetos aquáticos em riachos amazônicos.
Para fins de conservação, nossos resultados indicam a importância de direcionar estratégias voltadas
a múltiplos níveis espaciais, considerando a importância de conservar a variação da diversidade que
ocorre dentro de riachos, entre riachos e sobretudo, entre diferentes áreas na Amazônia.

Os insetos das Ordens Ephemeroptera, Plecoptera e Trichoptera (EPT) são muito utilizados como ferramentas para detectar mudanças ambientais que ocorrem nos ambientes aquáticos. No entanto, a maior parte desses estudos são exclusivamente para a fase larval, existindo poucas informações sobre as respostas dos EPT as mudanças ambientais em sua fase adulta. Em virtude desse cenário, realizamos uma revisão sistemática para tentar responder: i) em quais regiões do mundo foram realizados estudos que avaliam o efeito das mudanças de uso da terra sobre a comunidade de EPT adultos? ii) quais táxons de EPT adultos são mais utilizados? iii) quais são os principais métodos de coleta dos EPT adultos utilizados? iv) Como é a colaboração entre os autores que estudam EPT adultos junto as mudanças de uso da terra? Além disso, nós testamos a relação dos diferentes tipos de uso da terra com as comunidades de EPT adulta por meio de uma abordagem de meta-análise. Para selecionar os artigos realizamos uma busca utilizando palavras relacionadas ao tema de interesse no Web of Science. Foram encontrados 454 artigos, entre os quais 31 eram pertinentes aos objetivos e foram utilizados na análise cienciométrica e 8 na meta-análise. Além do baixo número de artigos sobre o tema, eles se concentram na América do Norte e na Europa. Os Trichoptera é o grupo mais utilizado, o que provavelmente relaciona-se com a sua grande diversidade e maior tempo de vida como adulto quando comparado com as outras duas ordens. O método de armadilha luminosa foi o mais utilizado para a captura de EPT adultos, este fato pode estar relacionado por este tipo de armadilha atrair um maior número de insetos voadores com hábitos noturnos. Assim como o número de artigos, a nacionalidade dos autores foi maior em países da zona temperada (principalmente dos Estados Unidos e Reino Unido), onde a maioria das colaborações foi restrita a poucos países. As maiores diferenças entre os EPT adultos ocorreram em comparações entre ambientes florestais e áreas abertas, como Floresta e Charneca e Floreta e Pradaria. Nossos resultados apontam indícios de que a conversão de áreas de floresta para áreas abertas impacta os EPT adultos. Além disso, a revisão ajuda na escolha de métodos de coleta e de qual grupo taxonômico são mais indicados para trabalhos futuros que venham a suprir essa grande lacuna de conhecimento sobre os impactos das mudanças de uso da terra sobre os EPT adultos.

As maiores ameaçadas à biodiversidade amazônica atualmente são às mudanças climáticas e a perda e a fragmentação de habitats naturais. A Amazônia, é considerada a porção mais significativa de floresta tropical do mundo, vem sofrendo com intensas atividades de expansão no agronegócio e constantes incêndios florestais, além de eventos extremos de seca observados nessa região. Esse cenário contribuiu com a devastação de cerca de 23% desse território, transformando as paisagens do bioma e forçando o surgimento de diversos fatores que atuam na capacidade de dispersão das espécies na busca de áreas de nicho climático e condições de habitat adequados para sua sobrevivência. Por ser uma região de clima abafado e úmido, muitas espécies que ocupam esse bioma apresentam alta vulnerabilidade climática devido, principalmente, à proximidade de seus limites de tolerância térmica e por possuírem nichos climáticos estreitos. Isso reflete uma baixa capacidade de adaptação e dispersão das espécies em ambientes degradados e, consequentemente, causando eventos de defaunação em algumas regiões. Os mamíferos amazônicos são muito vulneráveis aos efeitos antropogênicos e vêm sofrendo impactos negativos na Amazônia. Devido aos papéis ecológicos críticos que esse grupo de fauna desempenha nas florestas tropicais, reduções drásticas em suas populações podem gerar, em breve, consequências graves para os ecossistemas amazônicos. Avaliamos, nesse estudo, como as mudanças climáticas e o desmatamento afetam os mamíferos terrestres de médio e grande porte. Os resultados estão apresentados em três capítulos. O primeiro consiste em um capítulo de livro, intitulado “Efeitos das mudanças climáticas antropogênicas nos ecossistemas e na biodiversidade, especialmente nos mamíferos amazônicos”, submetido e em análise pelos editores (Adrian A. Barnette, Sarah Boye & Wilson R. Spironello), a ser publicado no livro intitulado “Amazonian Mammals – Current Knowledge and Conservation Priorities” – Springer (publicação do INPA). O segundo consiste em um artigo já em fase de submissão, intitulado “Canídeos selvagens e as armadilhas ecológicas frente às mudanças climáticas e ao desmatamento na Floresta Amazônica”, submetido à revista OIKOS. O terceiro capítulo consiste em um artigo que será submetido em breve, em periódico ainda a ser definido, intitulado “O futuro da fauna de ungulados no arco do desmatamento na Amazônia: definindo áreas para conservação e restauração de habitats”. 

O gênero de formigas Megalomyrmex Forel, 1885 atualmente é composto por 45 espécies válidas, que estão distribuídas ao longo da região Neotropical. As espécies variam dramaticamente em estilos de vida e biologia, exibindo uma variedade de comportamentos de nidificação, dieta, estratégias reprodutivas, estrutura social e diversidade estrutural de alcalóides. O gênero inclui desde espécies de vida livre até espécies com diferentes graus de parasitismo social, que se associam com espécies de formigas cultivadoras de fungos. Desde a última revisão taxonômica abrangente, mais de 10 espécies, além de castas/sexos foram descritos. A história natural, assim como a distribuição geográfica dessas espécies foram atualizadas, porém esses estudos focaram nas espécies registradas para a América Central. A delimitação das espécies foi questionada e novos caracteres foram revelados, sugerindo que o estudo da fauna da América do Sul poderia contribuir com o avanço do conhecimento do gênero. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi realizar um estudo do gênero Megalomyrmex, sob as perspectivas taxonômica, ecológica e de história natural. Do ponto de vista taxonômico (Capítulo 1), nossos resultados indicaram a existência de 13 possíveis espécies novas para o gênero, além de fornecer uma atualização sobre a taxonomia do gênero. Em relação aos aspectos ecológicos das fêmeas reprodutivas (Capítulo 2), observamos que em geral, as médias corporais das rainhas sem asas de Megalomyrmex são maiores que a das rainhas aladas. Além disso, esses resultados podem estar relacionados aos desafios encontrados durante a fundação e estebelecimento da colônia e características do ambiente. Sobre a história natural de Megalomyrmex, ao longo do trabalho foram fornecidas atualizações sobre a biologia das espécies, com ênfase na espécie Megalomyrmex ayri Brandão, 1990, que teve sua história natural detalhadamente descrita (Capítulo 3). Nosso estudo contribuiu para o preenchimento de diversas lacunas de conhecimento presentes sobre as espécies do gênero, e também identificou outras lacunas que precisam ser investigadas para melhor compreensão de aspectos sobre a evolução e diversidade presente no gênero.

As aves da família Apodidae conhecidas como andorinhões, são insetívoras de pequeno e médio porte, distribuídas globalmente. Nos últimos 20 anos, análises filogenéticas usando dados moleculares elucidaram as relações de alguns dos grupos dentro da família, porém, para muitas espécies não existem filogenias com ampla amostragem e que melhor representem a distribuição geográfica dos táxons. Assim, o desenvolvimento desta tese de doutorado se motiva na compreensão das relações filogenéticas entre os Apodidae e os processos evolutivos que estão por trás delas através do uso de milhares de marcadores moleculares. Nesse sentido, a principal questão deste projeto é: quais são as relações evolutivas entre os Apodidae? Esta pergunta será abordada ao longo de três capítulos, através da estimativa da filogenia molecular do grupo com a maior amostragem geográfica já feita, e de métodos que buscam inferir sobre os processos ecológicos e históricos que determinaram seus atuais padrões de distribuição. No capítulo I é apresentado um artigo já publicado sobre o desenvolvimento de marcadores microssatélites para Apodidae neotropicais. No capítulo II é apresentada a redescrição do gênero Chaeturella Mathews, 1918, com base em dados morfológicos e moleculares. No capitulo III é apresentada a filogenia molecular da família Apodidae. Foram sequenciadas 211 amostras de 103 táxons, representando todos os gêneros descritos para a família, sendo que para os Apodidae do Novo Mundo foram sequenciadas em quase sua totalidade representantes de todas as subespécies descritas até o presente. As árvores filogenéticas geradas tanto com UCEs apontaram que os Hemiprocnidae são o grupo irmão dos Apodidae. Dentro de Apodidae três grupos foram reciprocamente monofiléticos com 100% de suporte: as subfamílias Cypseloidinae, Apodinae e um terceiro grupo composto pelo gênero Hirundapus e pela espécie Mearnsia novaeguineae. As relações filogenéticas dentro da subfamilia Apodinae não foram de acordo com a classificação atual, sendo que as tribos Collocaliini, Chaeturini e Apodini se mostraram parafiléticas. Diversos gêneros se mostraram parafiléticos: Mearnsia, Rhaphidura, Zoonavena, Tachornis, Apus e Tachymarptis. Espécies amplamente distribuídas foram poli- ou parafiléticas: Cypseloides cryptus, Streptoprocne zonaris, Rhaphidura sabini, Chaetura cinereiventris, Chaetura spinicaudus, Chaetura egregia, Apus affinis, Apus berliozi, Tachymarptis aequatorialis e Aerodramus salanganus. Um novo tratamento taxonômico para a família é recomendado.

O processo evolutivo compreende complexas mudanças na variabilidade genética das populações ao longo do tempo e do espaço. Estes padrões de diversidade genética espaço-temporais podem refletir processos abióticos que variam com o clima, barreiras geográficas e gradientes ambientais, bem como processos bióticos de traços ecológicos e de história de vida. Na Bacia Amazônica, a maior rede fluvial do mundo, a variação da carga sedimentar dos rios produz ambientes extensos, heterogêneos e dinâmicos ao longo de suas planícies de inundação. A grande variedade de ambientes criados pelos rios nas planícies de inundação amazônicas abriga uma rica avifauna, cuja distribuição é determinada por suas preferências de habitat, tanto regional como localmente. No entanto, os processos responsáveis pela condução da diversificação biológica nessas planícies aluviais continuam sub estudados. Isto pois, designar ligações causais diretas entre traços ecológicos e a estruturação da variação genética dos respectivos táxons constituintes das planícies alagadas é um desafio devido à complicada dinâmica geológica da bacia amazônica. Nesta tese, o principal objetivo foi caracterizar e interpretar da estrutura genômica da comunidade de aves das planícies alagadas da Amazônia. Em cada capítulo, testamos hipóteses específicas de diferenciação genômica baseada em fatores abióticos (e.g., mudança histórica da paisagem na Bacia Amazônica), abrangendo uma perspectiva biótica das afinidades ecológicas das espécies. No Capítulo I, resolvemos com detalhes o contexto espaço-temporal da estrutura genética intraespecífica do arapaçu-riscado (Xiphorhynchus obsoletus) e avaliamos as expectativas de cenários distintos para a evolução das planícies de inundação da Amazônia. No Capítulo II, usamos uma abordagem filogeográfica comparativa para investigar a conectividade histórica entre populações de três espécies de aves associadas a distintos habitats de planícies alagadas de águas brancas, distribuídas em diferentes rios na bacia amazônica. No Capítulo III, usamos uma abordagem filogeográfica baseada em atributos das espécies para avaliar quais destes atributos associadas à dispersão efetiva são determinantes de padrões de variação genética espacial através da comunidade de aves das planícies alagáveis da Amazônia. Como conclusão geral, os padrões evolutivos revelados suportaram a hipótese de que as mudanças na conectividade do habitat das planícies alagadas durante o Quaternário Final tiveram forte influência na diferenciação genômica dentro das espécies estudadas. Entretanto, o modo como a diferenciação ocorre parece ser dependente dos atributos ecológicos das espécies, o que determina como os padrões de variação genética são acomodados espacialmente em um ambiente sazonalmente dinâmico. 

A biodiversidade abrange desde aspectos taxonômicos, diversidade intraespecífica e do ambiente natural, até processos ecológicos responsáveis pelo funcionamento e manutenção dos ecossistemas. Vários esforços têm sido realizados no sentido de restaurar a biodiversidade em áreas degradadas. Porém, poucos estudos focam no monitoramento de mecanismos dos ecossistemas associados à fauna e suas interações com a flora, como as interações entre plantas e seus polinizadores. Esta tese teve como objetivo compreender o processo de restauração de áreas pós mineração na Amazônia oriental a partir do conhecimento histórico da biodiversidade de polinizadores local e de índices de interação planta-polinizador. A partir do conhecimento sobre os padrões de restauração de interações planta-polinizador foi desenvolvido uma abordagem integrativa para selecionar espécies visando a restauração de interações e dar suporte a tomadores de decisão durante o planejamento de atividades de restauração. O estudo foi realizado na Floresta Nacional de Carajás. Para conhecer as espécies de polinizadores foi construído um banco de dados com as 222 espécies de abelhas previamente amostradas (dados de coleções) e seus traços funcionais. Para compreender os padrões de interação planta-polinizador durante o processo de restauração foram utilizadas análises de composição de espécies, métricas de redes de interações planta-polinizador e características das espécies para comparar áreas em diferentes estágios de recuperação pós mineração de areia e de minério de ferro e estabelecer critérios para a seleção de espécies de plantas e polinizadores visando a restauração de interações. O tipo de mineração influenciou a composição de espécies de áreas em recuperação, em áreas pós mineração de areia foi encontrada uma rápida recuperação de interações e foram selecionadas dez espécies de plantas e dez espécies de abelhas para serem manejadas durante o processo de restauração, visando a restauração de interações. Este trabalho foi o primeiro a consolidar uma lista de polinizadores presentes em áreas de mineração no Brazil, a avaliar a restauração de interações e propor uma estratégia de seleção de espécies para restauração a partir de redes de interação planta-polinizador amostradas na Amazonia brasileira.

A Amazônia é detentora de uma grande biodiversidade, porém boa parte dela ainda é desconhecida pela ciência e muito sobreposta com áreas de grande interesse econômico e de atividades antrópicas. Esse desconhecimento é ainda mais acentuado para organismos pequenos, como os insetos aquáticos da ordem Ephemeroptera, mesmo eles sendo relevantes para os processos ecológicos do bioma, sensíveis às alterações ambientais e uma excelente ferramenta para analisar a qualidade ambiental. A ordem apresenta muitas lacunas Linneanas, Hutchinsonianas e Wallaceanas, e conhecer a sua distribuição buscando preencher os déficits de informação são fundamentais para traçar estratégias eficientes de conservação. Nesse contexto, esta tese teve como objetivo geral apontar aonde estão os déficits de esforço amostral de Ephemeroptera na Amazônia e evidenciar como os impactos antrópicos e mudanças climáticas podem afetar ou estruturar suas comunidades. Com esse propósito, essa tese foi composta por três capítulos. No primeiro descrevemos a riqueza potencial de Ephemeroptera na Amazônia e a partir de um índice de esforço amostral indicamos onde estão as áreas de lacunas de informação, áreas potencialmente mais diversas, e áreas desprotegidas que são prioritárias para a conservação. Apontamos que somente 5% do bioma possui alguma informação sobre a ordem, e que existe 46.225 km 2 de lacunas potencialmente ricas, porém desprotegidas no bioma, sendo a zona de transição entre Amazônia e Cerrado prioritárias para futuros estudos, devido a intensificação do desmatamento nessa região. No segundo capítulo, descrevemos a distribuição potencial atual e futura de Cloeon smaeleni Lestage, 1924 nos continentes sul americano e africano. A espécie afrotropical foi introduzida no Brasil, e nossos resultados indicaram que os dois continentes possuem áreas extensas de adequabilidade para a espécie, localizadas em áreas “rich-spots”, mas que sua distribuição é previsivelmente limitada e deslocada pelas mudanças climáticas nos cenários futuros, mesmo sendo uma espécie tropical, tolerante e com características invasoras. No terceiro capítulo, investigamos se o gradiente de cobertura vegetal e usos do solo afetam a riqueza, abundância e composição das comunidades de Ephemeroptera e avaliamos se existem gêneros associados a cada um deles. Encontramos que o pasto reduz a abundância de Ephemeroptera e que sua composição em áreas de floresta difere dos outros tipos de uso da terra. Apesar da diversidade de Ephemeroptera não ter respondido à porcentagem da cobertura vegetal, táxons como Farrodes e Ulmeritoides tiveram a sua frequência afetada. A partir do desenvolvimento dessa tese, concluímos que ainda existem muitas lacunas de informação a serem preenchidas na Amazônia, principalmente na parte Norte e Nordeste do bioma. Inventários e pesquisas são necessárias principalmente em áreas intensamente ameaçadas por ações antrópicas, como o “Arco do desmatamento” para que não haja perda de informação e até mesmo de espécies que podem ainda nem ser conhecidas. Ainda não existe um consenso entre a agropecuária e o ambiente que alcance um desenvolvimento sustentável adequado, o que é preocupante devido a velocidade das alterações ambientais, que afetam principalmente os ecossistemas aquáticos. Essa preocupação se agrava quando inferimos no nosso trabalho que mesmo uma espécie considerada tolerante, com características invasoras, pode ser afetada severamente por mudanças climáticas em cenários futuros, tendo a sua distribuição consideravelmente restringida.

Conhecer a biodiversidade é fundamental para a conservação e manejo das espécies. Dentre as espécies de abelhas, os meliponíneos ou abelhas sem ferrão, são considerados como os principais polinizadores das matas nativas e formam um grupo bastante diversificado com mais de 240 espécies já descritas no Brasil. No entanto, muitas espécies de abelhas sem ferrão ainda não são conhecidas e não muito bem estudadas, um problema que precisa ser urgentemente resolvido, pois os serviços de polinização estão cada vez mais ameaçados pela perda e modificação de habitats. A falta de uma identificação mais precisa, de uma caracterização mais acurada das populações e do conhecimento das áreas de ocorrência da espécie dificultam a averiguação de impactos e ameaças e o delineamento de medidas efetivas de conservação, manejo e uso sustentável. Aqui, objetivamos avaliar a variabilidade de Plebeia flavocincta em termos morfológicos, genéticos, e de habitats. Para isso, organizamos a tese em três capítulos: (i) no primeiro, estimamos a distribuição geográfica potencial da espécie e identificamos áreas prioritárias para conservação; (ii) no segundo capítulo, avaliamos a variabilidade das populações através da morfometria geométrica das asas e do DNA mitocondrial; (iii) finalmente, no terceiro capítulo analisamos a estrutura dos ninhos e caracterizamos a espécie.

A Amazônia é a maior e mais diversa floresta tropical do planeta. Apesar de sua reconhecida biodiversidade, cientistas concordam que estamos longe de conhecer a real diversidade desse extenso e complexo bioma. A diversidade críptica e a falta de amostragem são particularmente fatores que levam à subestimativa de espécies na
região. Aqui mostramos como a diversidade estava altamente subestimada no complexo de espécies Engystomops petersi, um grupo de sapo com diversidade críptica amplamente distribuído na Amazônia. Através de uma abordagem filogenética e de delimitação de espécies baseados em distância e coalescência inferimos a existência de seis a 16 linhagens evolutivas distintas, dependendo do método de delimitação. Por consenso de maioria delimitamos 11 espécies candidatas, além de notar a existência de dois complexos de espécies menores no grupo (Sudoeste Amazônico e Oeste do Pará). Sugerimos a revalidação de E. paraensis e reconhecemos três espécies válidas no complexo: E. petersi, E. freibergi e E. paraensis e oito espécies candidatas ainda não descritas. Também revelamos que as populações da Guiana Francesa não pertencem a E. petersi como se pensava anteriormente, sendo uma espécie distinta de todas as demais do complexo. Este novo cenário demonstra que a diversidade do leste da Amazônia pode ser tão rica quanto do oeste. Incentivamos a avaliação de caracteres adicionais morfológicos e ecológicos sob uma abordagem integrativa para a descrição das espécies candidatas apontadas neste estudo, assim como uma abordagem biogeográfica para investigar os processos que geraram essa alta diversidade. Adicionalmente, pontuamos que o uso de métodos de delimitação empregados em conjunto podem dar luz ao conhecimento faltante da diversidade que temos de espécies amplamente distribuídas, como na Amazônia, sendo um ótimo ponto de partida para revelar a diversidade críptica.

Para compreender os padrões geográficos e temporais de diversificação, a estrutura populacional e os limites das espécies do complexo de espécies Xiphorhynchus guttatus/susurrans, reunimos uma amostra geograficamente bem distribuída de dados genéticos, plumagem e caracteres morfométricos para revisar os resultados e responder às lacunas deixadas pela última revisão taxonômica para este complexo. Analisamos dois marcadores mitocondriais e um nuclear de 107 espécimes. Realizamos filogenias multilocus coalescentes concatenadas e temporalmente calibradas, juntamente com redes de haplótipos, delimitação de espécies por inferência bayesiana e análise da estrutura populacional. Observamos os padrões morfométricos e de plumagem de espécimes da Floresta Amazônica e da Mata Atlântica. Estimamos as áreas ancestrais do complexo de espécies com o BioGeoBEARS. De acordo com nossos resultados, existem quatro clados principais reciprocamente monofiléticos dentro do complexo, o que suporta a separação de Xiphorhynchus guttatoides para resolver a parafilia entre Xiphorhynchus guttatus e Xiphorhynchus susurrans, como sugerido pela última revisão taxonômica, e a revalidação de Xiphorhynchus eytoni como espécie. A estimativas de tempo de divergência sugerem que o ancestral comum mais recente provavelmente se originou no Plioceno, com a maioria das linhagens dentro do grupo aparecendo no Plio-Pleistoceno, um período de intensas mudanças na paisagem Neotropical. Nossos dados mostram que a diversidade genética existente no gênero é subestimada pela taxonomia atual, fornecendo outro exemplo de endemismo críptico difundido para aves na região Neotropical. Além disso, corrobora a influência do soerguimento dos Andes e a influência do estabelecimento do atual sistema de drenagem da bacia Amazônica no Plio-Pleistoceno como responsáveis pela diversificação dentro do complexo.

Os números de descrições de novas espécies de anuros na região neotropical tem se intensificado a partir do final dos anos 90, sobretudo devido o emprego de técnicas moleculares, como o DNA Barcoding. Dada a urgência do estudo de grupos negligenciados de anfíbios na Amazônia, no presente trabalho exploramos a possível diversidade críptica de duas espécies de anuros amplamente distribuídos pelas terras baixas amazônicas: Ctenophryne geayi e Hamptophryne boliviana. Conduzimos duas metodologias de delimitação de espécies baseados em ampla amostragem geográfica e utilizando dois genes mitocondriais empregados em barcoding de anfíbios, 16S e COI: (1) MPTP, análise de delimitação baseada em árvores filogenéticas e; (2) ABGD, análise baseada em distancias genéticas. O MPTP demonstrou a existência de diversidade críptica nas duas espécies, com a identificação de duas linhagens mitocondriais ainda não reconhecidas na literatura prévia, separadas por uma distância genética considerável, 1% para C. geayi e 3,3% para H. boliviana. Já o ABGD apresentou resultados distintos para ambas as espécies. Para C. geayi falhou em demonstrar um “barcoding gap” claro para o gene 16S e delimitou para o COI três linhagens principais. Para H. boliviana o ABGD demonstrou um claro “barcoding gap” para ambos os genes e delimitou de maneira convergente as mesmas duas linhagens que os ABGD. Nossos resultados apontam para existência de ao menos duas espécies candidatas em cada um dos táxons analisados. Os resultados reafirmam ainda a utilidade e funcionalidade do uso massificado do DNA barcoding, sobretudo em uma região vasta como é a Amazônia e em grupos poucos estudados como Microhylidae Sul Americanos.

Helicobia Coquillett, 1985 é um gênero de moscas predominantemente neotropical pertencente à família Sarcophagidae. Apresentam variações de tamanho de 4 a 9 mm e são identificadas pela combinação das seguintes características: nervura R1 com cerdas na superfície dorsal geralmente restritas a metade proximal; cerdas ocelares e verticais espessas; parafaciália com cerdas espessas, machos sem ctenídio no fêmur médio e parede pós-alar com cerdas. Além disso, as espécies desse gênero também podem ser caracterizadas por apresentar terminalia masculina comlimites bem distintos entre basifalo e parafalo, este último com harpes muito desenvolvida, predominantemente membranosa, e acrofalo com estilos laterais e capitis. A identificação das espécies de Helicobia, assim como em outros gêneros de Sarcophagidae, é possível somente pela análise das terminálias masculinas. Apesar dos trabalhos taxonômicos sobre Helicobia conterem ilustrações das terminalias, grande parte das espécies válidas permanecem mal caracterizadas, sem descrições ou ilustrações da terminália, dificultando a identificação específica. Além disso, ainda não há chave de identificação para todas as espécies válidas. A ausência de imagens e de chave de identificação é um dos maiores empecilhos para o avanço do conhecimento taxonômicosobre Helicobia. Portanto, este trabalho teve como objetivo redescrever os machos adultos das espécies válidas, produzir ilustrações detalhadas das terminálias e fornecer chave dicotômica de identificação. A revisão taxonômica de Helicobia resultou em 32 espécies válidas e duas novas sinonímias: Helicobia giovannolii é sinônimo júnior de Helicobia lagunicula e Helicobia haydeni é sinônimo júnior de Helicobia morionella. As ilustrações de 26 espécies são apresentadas, contendo estruturas da terminália masculina como basifalo, parafalo, harpes, vesica, acrofalo, juxta e placa lateral da juxta. A bainha, uma estrutura encontrada em 13 espécies, também foi descrita. Portanto, o presente trabalho fornece a caracterização padronizada e detalhada das espécies, além de uma chave para identificação dos machos adultos.

Os elapídeos do Novo Mundo são distribuídos em três gêneros, sendo Micruroides (1 espécie), Leptomicrurus (4 espécies) e Micrurus (≅ 80 espécies). Micrurus Wagler (1824) é o gênero mais diverso entre as cobras-corais, compreendendo cerca de 80 espécies e mais de 130 subespécies. As espécies de Micrurus são distribuídas desde o sudeste dos Estados Unidos até o sul da América do Sul, apresentam hábitos semi- fossoriais, terrestres e aquáticos, exibindo uma grande diversidade de padrões cromáticos, e podendo ser encontradas em ambientes bastante heterogêneos. O monofiletismo do gênero foi proposto por alguns autores, apesar de já ter sido recuperado como parafilético em relação à Leptomicrurus. Atualmente, as propostas filogenéticas mais recentes têm recuperado Micrurus como monifilético, após a sinonímia de Leptomicrurus em Micrurus, a partir da combinação de caracteres morfológicos e moleculares. Apresentam caracteres morfológicos conservativos, sendo comumente identificadas a partir dos padrões de coloração, número e tamanho dos anéis do corpo e da cauda, morfologia hemipeniana, e a partir da sua distribuição geográfica. Com base na distribuição geográfica, padrão de coloração e forma do hemipênis, as espécies de Micrurus tem sido organizadas em 4 grupos morfológicos: 1) grupo sul-americano (com 44 espécies), que apresenta padrão em mônades, cauda bicolor e hemipênis delgado fortemente bilobado; 2) grupo centro-americano (com 2 espécies), com coloração em tríades, com hemipênis delgado e fortemente bilobado; 3) grupo sul-americano (com 21 espécies), que apresenta padrão em tríades, com hemipênis curto e bilobado, podendo ou não ser capitado; e 4) grupo sul-americano (com 5 espécies) com padrão bicolor, hemipênis delgado fortemente bilobado e lobos distintos da base. O grupo sul-americano com padrão bicolor é formado por cinco espécies e sete subespécies (Micrurus camilae; M. mipartitus anomalus, M. m. decussatus, M. m. mipartitus, M. m. popayanensis e M. m. rozei; M. multiscutatus; M. multifasciatus multifasciatus, M. m. hertwigi e M. spurrelli), e apresenta variações no padrão de coloração e na distribuição geográfica, raramente discutidas na literatura. Estas espécies estão presentes desde a Nicarágua, ocupando Costa Rica, Panamá e toda a costa oeste da América do Sul, até o Estado de Rondônia, Brasil. As hipóteses filogenéticas envolvendo os elapídeos do Novo Mundo tem considerado grupos mais amostrados dentre as espécies de Micrurus e geralmente as espécies do grupo bicolor são representadas apenas pelo terminal Micrurus mipartitus, o que não reflete, portanto, toda a diversidade morfológica presente entre as espécies do gruopo. O presente estudo tem como objetivo propor uma revisão taxonômica e uma hipótese filogenética para o grupo bicolor, considerando exclusivamente caracteres morfológicos em uma abordagem inédita. Apresentamos as informações em dois capítulos: 1) Revisão taxonômica do grupo bicolor, propondo um novo arranjo para o grupo; e 2) Filogenia de Micrurus do grupo bicolor com base em caracteres morfológicos.

As áreas de vegetação aberta da Amazônia (Campina, Campinaras e savanas), são pequenas machas isoladas, cercadas por formações florestais. Abrigam muitas espécies raras, além de apresentarem processos ecológicos únicos no bioma. As altas emissões de dióxido de carbono nos últimos anos, produto dos diferentes impactos antropogênicos, estão acelerando o processo natural de mudanças climáticas, gerando grandes alterações no bioma Amazônico como eventos de “Savanização” em larga escala e causando modificações na composição das comunidades, deslocamentos atitudinais e redução das populações. Portanto, nosso trabalho tem como objetivo avaliar os efeitos das mudanças climáticas em aves de campinas, campinaranas e savanas na Amazônia. Geramos modelos de distribuição de espécies (SDM) para 27 espécies de aves distribuídas nas áreas abertas da Amazônia. Foram usados cinco algoritmos e considerados os cenários climáticos atuais e futuros (RCP 4.5 e RCP 8.5), além de gerar cinco cenários de dispersão, considerando assim, diferentes alcances de
dispersão das espécies. Também, verificamos a representatividade das espécies nas áreas de proteção na Amazônia usando os Species Representativiness Index (SRI). Nossos resultados mostram que cerca de 92% das espécies de aves enfrentarão um declínio em suas áreas adequadas, em todas os cinco cenários de dispersão dentro dos cenários climáticos, nos diferentes habitats. Além, sua baixa capacidade de dispersão os torna ainda mais vulneráveis as fortes mudanças climáticas. Também mostramos que a atual rede de APs, tem pouca eficiência na proteção das espécies, e a ampliação das áreas poderia ajudar na manutenção das populações dessas espécies no futuro. Nossos resultados, ajudaram a entender que os eventos de savanização podem estar mais alinhados com eventos de antropização do que com extensões naturais. Por tanto, é necessário promover e desenvolver mais áreas de proteção de tal forma que possa ser mantida a dinâmica natural das áreas abertas. 

A extração de minérios, como a bauxita, causa danos aos ecossistemas nativos da região Amazônica e a restauração das áreas mineradas está prevista nas leis brasileiras. A restauração é o processo de assistência da recuperação de um ecossistema que tem sido degradado, danificado ou destruído, com o objetivo de reestabelecer a integridade e resiliência do mesmo. Durante esse processo, a recolonização da fauna local é um fator fundamental no reestabelecimento e manutenção dos processos ecológicos do ecossistema. Os pequenos mamíferos não voadores constituem um grupo da fauna que pode ser bastante importante no processo de recuperação florestal, especialmente nas primeiras fases da sucessão, mas também na manutenção ecossistêmica por possuírem diversificados papéis ecológicos, tais como dispersão e predação de sementes, herbivoria, polinização, ciclagem de nutrientes, controle da população de invertebrados e dispersão de esporos micorrízicos. Este trabalho de pesquisa teve como objetivo avaliar o uso de habitats por comunidades de pequenos mamíferos amazônicos, em resposta à processos de restauração florestal após a mineração de bauxita, em áreas de sucessão intermediária inicial. Para isso mensuramos os parâmetros básicos da comunidade (riqueza, composição e abundância de espécies), atributos funcionais das espécies e suas relações com variáveis ambientais extraídas de cada habitat amostrado. Verificamos que no estágio sucessional estudado a riqueza e abundância total de espécies de pequenos mamíferos não voadores se assemelha aos habitats originais da área, entretanto, a composição de espécies é diferente. Quanto a riqueza de grupos funcionais e os parâmetros funcionais gerais destas comunidades, também não diferem entre os habitas, apesar de algumas espécies serem substituídas por outras dentro dos grupos funcionais. No entanto, a média ponderada pela comunidade (CWM) destacou o comprimento de cabeça e corpo e o comprimento da cauda como traços funcionais importantes na diferença de composição de espécies entre os dois habitats. As variáveis ambientais de altura de serrapilheira e porcentagem de cobertura florestal influenciaram os valores de CWM do comprimento de cabeça e corpo e do comprimento da cauda, respectivamente. Concluímos que somente os parâmetros básicos de riqueza e abundância de espécies não devem ser exclusivos para avaliação e monitoramento de recuperação de áreas degradadas, uma vez que podem ser recuperados mais rapidamente. Enquanto que a composição de espécies, que pode ter influências na funcionalidade dos grupos taxonômicos, pode variar entre os habitats em recuperação e as áreas de florestas semelhantes às originais. 

Os padrões de consumo das populações naturais da Amazônia estão sendo alterados pelo avanço da urbanização e dos meios de transporte e pela construção de grandes projetos, intensificando a extração de recursos naturais. Avaliamos a influência do grau de isolamento na diversidade e na composição da fauna cinegética e do pescado consumido nas RESEX’s Rio Iriri e Riozinho do Anfrísio localizadas na Amazônia Oriental. Também procuramos avaliar a influênciada variação temporal e da vazão do rio sobre o consumo desses itens. Os dados utilizados foram provenientes do Programa de Monitoramento Participativo da Biodiversidade, coordenado pelo Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade, em curso desde 2014. Foram aplicados questionários por monitores treinados da própria população com perguntas relacionadas à sua alimentação no dia anterior, incluindo a origem, a espécie e o peso do animal consumido, bem como a presença de outros itens alimentares além da proteína animal. Foi calculada a frequência de consumo, a riqueza e a diversidade dos alimentos consumidos, sendo aplicadas em modelos lineares generalizados. Encontramos uma forte presença de itens industrializados na dieta das populações próximas ao centro comercial, e uma presença mais forte dos itens de pesca e de caça em populações mais distantes. Houve um padrão de depleção no uso das espécies, aumentando as espécies usadas próximo ao centro comercial. O consumo dos itens de pesca e de caça estão diminuindo com os anos, não sendo substituídos por industrializados, podendo representar um caso de insegurança alimentar para estas populações.

Hemiodontidae carece de estudos taxonômicos com dados moleculares e hipóteses filogenéticas em nível de espécie para toda a família. No intuito de preencher essas lacunas, aqui foram realizadas delimitações moleculares de espécies para os cinco gêneros da família com base em sequências do gene COI, e a primeira hipótese filogenética (e molecular) em nível de espécie para Hemiodontidae, por meio de análises de máxima verossimilhança e inferência Bayesiana de centenas de loci dos elementos ultraconservados (UCEs) do genoma. Além disso, o exame dos vouchers para esses estudos permitiram a descrição de duas novas espécies de Hemiodus. As duas novas espécies são Hemiodus bimaculatus, das drenagens do Alto Tapajós, e Hemiodus tucupi, da bacia do rio Xingu. A delimitação molecular do gênero Hemiodus analisou 19 das suas 23 espécies válidas e obteve de 28 a 32 linhagens mitocondriais ou MOTUs, com 24 delas igualmente delimitadas por todos os métodos. Nove espécies foram correspondidas por uma única linhagem cada e as 10 restantes ou foram separadas em mais de um MOTU ou foram colocadas juntos em um só. Esses resultados evidenciam a existência de uma diversidade, antes desconhecida, de linhagens mitocondriais em Hemiodus, que representam espécies crípticas ou pouco estudadas. As delimitações em Anodus, Argonectes, Bivibranchia e Micromischodus amostraram todas as 10 espécies presente neles e revelaram monofilia para todas as espécies e gêneros, exceto para Anodus. Sete espécies corresponderam a uma única linhagem cada em todos os métodos, e as outras três tiveram resultados discordantes entre alguns métodos, correspondendo a mais de um MOTU por espécie em alguns deles. Esses achados sinalizam para uma biodiversidade oculta dentro destes táxons, que pode significar tanto populações estruturadas como espécies crípticas. Na reconstrução filogenética com os UCEs, Hemiodontidae, contendo todos os gêneros e 26 das 33 espécies, foi monofilético em todas as análises com suporte máximo, assim como os gêneros Argonectes e Bivibranchia. Anodus e Hemiodus não foram monofiléticos porque Micromischodus foi irmão de uma espécie de Anodus e H. immaculatus foi a única espécie do gênero que não se juntou ao clado formado por todas as outras congêneres, mas foi mais relacionada a Anodus e Micromischodus. A origem e evolução de alguns traços morfológicos da família e uma solução para os gêneros não monofiléticos são discutidas com base nessa hipótese filogenética.

O gênero Chthonos Coddington, 1986 pertence à família Theridiosomatidae e é composto por pequenas aranhas com apresentam as pernas I-II com fileiras laterais de espinhos, esterno expandido ventralmente e abdomen com tubérculos. Neste estudo foi realizada a revisão taxonômica de Chthonos. Foram examinados espécimes de coleções científicas brasileiras e estrangeiras e todas as espécies foram documentadas através de fotografias coloridas de automontagem e imagens de microscopia eletrônica de varredura.  A diversidade do gênero foi elevada de cinco a 21 espécies, das quais 16 estão sendo descritas pela primeira vez. É apresentada uma detalhada descrição do gênero com informações inéditas sobre cutícula, cerdas e genitália. A diagnose é atualizada com novos caracteres e é apresentada uma chave de identificação para as espécies do gênero. O abdomen foi corroborado como um bom caráter diagnóstico a nível de espécie, uma vez que existe um formato especifico de genitália associado a um formato específico de abdomen. As fêmeas de C. pectorosa O. Pickard-Cambridge, 1882 e C. peruana Keyserling, 1886 são redescritas e os machos são descritos pela primeira vez. C. kuyllur Duperré & Tápia, 2017, C. tuberosa Keyserling, 1886 e C. quinquemucronata Simon, 1893 são rediagnosticadas em comparação com as espécies novas. São propostos quatro novos grupos e 16 espécies novas: grupo pectorosa com C. pectorosa, C. wonka sp. nov., C. wombat sp. nov., C. coddingtoni sp. nov. e C. antelata sp. nov.; grupo peruana com C. peruana, C. kuyllur, C. triacuta sp. nov., C. lokum sp. nov., C. ankeri sp. nov., C. borg sp. nov., C. orellanai sp. nov., C. yanayacu sp. nov. e C. garfield sp. nov.; grupo onca com C. onca sp. nov., C. claudiae sp. nov., C. parvulla sp. nov. e C. nulla sp. nov. e grupo coco com C. coco sp. nov., C. tuberosa e C. quinquemucronata. A distribuição geográfica do gênero é ampliada, com espécies ocorrendo desde o Sul do Mexico ao Sul do Brasil.

A conversão de florestas tropicais em paisagens agrícolas é uma das principais causas do desmatamento e degradação de habitats em todo o planeta. Dentre as atividades agrícolas responsáveis por esse processo de conversão, o plantio da palmeira de dendê é o cultivo em maior expansão no mundo. Em países do sudeste asiático, estudos mostram que essa atividade gera perdas expressivas na riqueza de espécie, diversidade funcional e filogenética. Medidas de manejo da paisagem podem minimizar os ricos à biodiversidade, em especial a preservação de reservas ripárias e fragmentos florestais em áreas de produção pode atuar como refúgio para espécies florestais e ainda promover o aumento da diversidade na matriz agrícola através do processo de spillover. O presente estudo foi dividido em dois capítulos, o primeiro capítulo busca compreender o papel das reservas ripárias para a conservação da diversidade filogenética de aves, bem como o papel da configuração da paisagem para as comunidades presentes nessas reservas. O segundo capítulo desta tese busca entender o papel da manutenção de fragmentos florestais em áreas agrícolas para a diversidade funcional e filogenética de aves em áreas de produção, bem como quais os fatores espaciais que influenciam essas comunidades. Neste estudo, observamos que reservas ripárias são capazes de suportar alta diversidade filogenética, especialmente quando conectadas à fragmentos florestais. Também fornecemos evidências de que a manutenção de grandes fragmentos florestais em áreas de produção é importante para a conservação da diversidade funcional e filogenética, e que a comunidade de aves em áreas de plantio próximas a estes fragmentos pode ser beneficiada através do processo de spillover.

Oonopidae é uma família rica em espécies, distribuída em todos os continentes, possuindo atualmente 114 gêneros e 1.872 espécies válidas. A classificação interna de Oonopidae tem mudado significativamente nos últimos anos, especialmente após a implantação do PBI-Oonopidae em 2006, com o reconhecimento de grandes linhagens consideradas monofiléticas. Uma destas linhagens é o grupo Zyngoonops, que atualmente é formado por seis gêneros (Triaeris Simon, Zyngoonops Benoit, Antoonops Fannes & Jocqué, Coxapopha Platnick, Hexapopha Platnick, Berniker & Víquez, e Kijabe Berland) e 47 espécies, distribuídas nas regiões Neotropical e Etiópica. Entre as muitas características que definem o grupo Zyngoonops, as mais evidentes são o lábio e os enditos dos machos fortemente modificados, o êmbolo em forma de tubo e, nas fêmeas, o receptáculo é ausente e o ducto genital estreito. O gênero Hexapopha possui seis espécies válidas descritas. Quatro delas são conhecidas para a Costa Rica, H. one, H. jimenez, H. osa e a espécie tipo H. reimoseri. As outras duas espécies, H. m-scripta e H. brasiliana, foram transferidas recentemente do gênero Gamasomorpha Karsch e são conhecidas para a Argentina e Brasil, respectivamente. De acordo Platnick et al. (2014), Hexapopha pode estar mais relacionado filogeneticamente a um complexo de táxons zyngoonóides de seis olhos altamente especioso encontrado da Venezuela ao sul da Argentina do que aos gêneros citados acima. Esses táxons são abundantemente representados em coleções brasileiras e ainda não dispõem de designação genérica formal. Desse modo, este projeto está dividido em dois capítulos. O primeiro propõe a revisão taxonômica de Hexapopha. O segundo propõe a realização de uma análise cladística que inclua representantes de todos os gêneros atualmente válidos para o grupo Zyngoonops. O objetivo da análise é guiar decisões taxonômicas, testando o monofiletismo deste grupo com base em caracteres morfológicos e determinando se os zyngoonóides neotropicais ainda não formalmente descritos pertencem à Hexapopha ou representam linhagens ainda não descritas do complexo. Além disso, o trabalho resultará em hipóteses inéditas de relacionamento entre as linhagens Neotropicais e Africanas do complexo Zyngoonops. A matriz de caracteres contou com 89 terminais pertencentes a 29 gêneros e 8 morfogêneros africanos pertencentes ao grupo Zyngoonops representados no banco de dados do PBI-Oonopidae e 256 caracteres. A árvore final corrobora as hipóteses de relacionamento propostas anteriormente para o grupo Zyngoonops e gera conclusões importantes para o entendimento da história evolutiva dos táxons analisados. Os resultados da análise também indicam que todas as espécies analisadas durante este trabalho pertencem a Hexapopha. Aproximadamente dois mil exemplares adultos foram analisados, resultando na identificação de 35 espécies novas e possibilitando a redescrição de H. m-scripta e H. brasiliana, além da descrição inédita do macho de H. brasiliana. Além disso, os resultados revelam o aumento considerável na distribuição conhecida do gênero.

Dichotomiini (Coleoptera: Scarabaeinae) é uma tribo de besouros rola-bosta tuneladores (em oposição aos roladores) que apresentam uma diversidade ecológica e morfológica significativa. Com atualmente 206 espécies, Dichotomiini incluiu o gênero mais rico em espécies entre os Scarabaeinae Neotropicais. O gênero Dichotomius concentra 90% das espécies da tribo. A ausência de estudos filogenéticos abrangentes testando a monofilia de taxa de Dichotomiini resultou em instabilidade nomenclatural em nível subgenérico. Aliado a isso, o rápido aumento da diversidade taxonômica da tribo nos últimos 90 anos tem dificultado sua sistematização em subgêneros e grupos de espécies. Com o objetivo de contribuir para a Sistemática de Dichotomiini, realizamos um estudo filogenético abrangente compreendendo 68 dos 206 táxons de Dichotomiini e 108 caracteres morfológicos e revisões taxonômicas de três grupos de espécies de Dichotomius, a saber, os grupos batesi, globulus e inachus. Nestas revisão são fornecidos novos caracteres diagnósticos para os 3 grupos (incluindo os da genitália masculina), redescrições para 21 espécies, descrição de seis novas espécies, quatro novos sinônimos, sete designações de tipo, chaves de identificação para cada grupo e distribuição geográfica para todas as espécies. A filogenia resultante apoiou a monofilia da tribo como sugerido anteriormente, no entanto, a monofilia de Dicotomius, Chalcocopris e Isocopris, ou dos mais diversos subgêneros de Dichotomius não foram apoiados. A maioria dos caracteres tradicionalmente usados para definir esses taxóns provaram ser plesiomórficos ou altamente homoplásticos. Internamente, a tribo foi dividida em dois grupos monofiléticos bem sustentados, aqui denominados “Clado Dichotomius” e “Clado Holocephalus”, por incluir as espécies-tipo de Dichotomius e Holocephalus, respectivamente. Nossa hipótese de que os grupos amazônicos de D. (Selenocopris) estão intimamente relacionados foi apoiada pela presente análise. O grupo batesi (conforme definido por Luederwaldt, 1929) não é monofilético, sustentando nossa hipótese taxonômica de que D. globulus e suas espécies intimamente relacionadas deveriam compor um grupo distinto. Nenhum arranjo radical na classificação é proposto, uma vez que os ramos intermediários da topologia têm baixos valores de suporte. Em vez disso, apontamos as inconsistências filogenéticas da classificação atual de Dichotomiini, e a necessidade de que estudos taxonômicos devem ser aprimorados para fornecer mais informações filogenéticas das espécies.

A espécie Rhinella major (Müller & Helmich, 1936) é um sapo que pertence ao grupo R. granulosa, sendo sua ocorrência abrangendo a ecorregião dos Chacos, e se estende até a Região Amazônica. Devido à sua extensa distribuição, abre-se a possibilidade de ocorrência de estruturação populacional, assim como a possibilidade de potenciais diversidade críptica. Sendo assim, o objetivo deste trabalho é analisar diferentes populações de R. major, através de uma abordagem multidisciplinar. Para isso, foi utilizado sequencias do gene mitocondrial Citocromo B (Citb) de amostras coletadas na Região Amazônica e de dados do GenBank, assim como foi observada a modelagem de distribuição, a similaridade de nicho e análises de bioacústicas. Foram encontradas duas linhagens mitocondriais dentro de R. major, um grupo corresponde aos indivíduos da Amazônia e o segundo aos indivíduos do Chaco. O grupo da Amazônia apresenta uma diversidade genética bem inferior aos observado no grupo Chaco. Observou-se uma grande similaridade de nicho entre R. bergi e R. major (grupo Chaco), maior do que entre as duas linhagens de R. major. Essa similaridade de nicho entre R. major (Chaco) e R. bergi pode favorecer o contato entre as duas espécies, assim como a competição ecológica entre elas. Por outro lado, a diferença de nicho dentro de R. major pode ter causado essa diferenciação observada dentro da espécie. Este trabalho, apesar do número de amostras e de marcador limitados, fornece importantes conclusões acerca da dinâmica populacional de R. major, o que faz com que seja necessário criar subsídios para a questão da conservação de habitats naturais da espécies, e deixa um espaço para futuros trabalhos que possam ser desenvolvidos futuramente.

Drosophilidae é uma família de moscas acaliptradas com 4.542 espécies descritas, divididas em 74 gêneros que ocorrem em todas as regiões biogeográficas. Para o Brasil, já foram descritas 305 espécies em 16 gêneros. No entanto, este valor é subestimado, já que muitos dos gêneros mais numerosos ainda não foram devidamente estudados, principalmente em regiões com grande biodiversidade, tais como a Amazônia. Dentre esses, o gênero Cladochaeta, o qual possui 136 espécies descritas restritas ao Hemisferio Ocidental, com predominância na região neotropical. Apenas 12 ocorrem na região amazonica, mas segundo as estimativas Cladochaeta pode conter cerca de 1700 espécies apenas para a América Latina. As moscas deste gênero são pequenas (1 a 2 mm de comprimento), amarronzadas ou amareladas, com morfologia externa uniforme, mas as genitálias dos espécimes machos são bastante complexas. As larvas possuem comportamento incomum, pois estão associadas com ninfas de cigarrinhas (Cercopoidea) que vivem em ninhos de espumas. No entanto, algumas espécies já foram obtidas de flores e predando ovos de aranhas. Neste trabalho, foi realizado um estudo taxonômico sobre as espécies de Cladochaeta encontradas na Amazônia. Também foram apresentadas novas informações a respeito da história natural de Cladochaeta. Oito novas espécies foram descritas C. arikeme nov. sp., Cladochaeta chicomendes nov. sp., C. chromosoma nov. sp., C. johnmayeri nov. sp., C. smilodon nov. sp., C. altobenia nov. sp., C. neobomplandi nov. sp. e C. vampyrae nov. sp. Além disso, C. bomplandi foi registrada pela primeira vez para a Amazônia brasileira e C. dolichofrons, C. carinata e C. dicrophallus para a Guiana Francesa. A espécie C. johnmayeri nov. sp. foi coletada em flores de Psychotria colorata (Rubiaceae) e Heliconia acuminata (Heliconiacea). Cladochaeta bomplandi foi obtida a partir de pupas encontradas na espuma produzida
pelas ninfas de Cephisus siccifolia (Hemiptera: Aphrophoridae) em um galho de Caesalpinia ferrea.

A família Potamotrygonidae compreende um grupo de peixes cartilaginosos classificados atualmente em duas subfamílias, Styracurinae e Potamotrygoninae, e quatro gêneros que contam com uma diversidade conhecida de 38 espécies. Ocorrem em diferentes ambientes, sendo Styracura uma linhagem marinha e os demais gêneros exclusivamente dulcícolas das bacias hidrográficas da América do Sul: Heliotrygon, Paratrygon, Plesiotrygon e Potamotrygon. As relações filogenéticas em Potamotrygonidae permanecem mal compreendidas, especialmente a validação do grupo marinho como subfamília em Potamotrygonidae, assim como quando ocorreu a origem de suas linhagens. Desta forma, o presente trabalho buscou apresentar uma hipótese acerca da filogenia do grupo, com datação molecular, a partir de uma abordagem multilocus, com regiões genômicas mitocondriais (COI, Cytb e Região controle) e nucleares (RAG1 e ECN1), utilizando os métodos de Máxima verossimilhança – ML e Inferência Bayesiana – IB. As árvores filogenéticas baseadas em 2,4 kb confirmaram a monofilia da família, assim como a classificação da subfamília Styracurinae em Potamotrygonidae. Heliotrygon mostrou ser o gênero menos derivado entre a subfamília Potamotrygoninae, que está proximamente relacionado a Paratrygon. Nossos resultados recuperaram parafilia entre Plesiotrygon e Potamotrygon, desta forma também podemos sugerir possível sinonímia entre estes taxa. A datação molecular recuperou a origem da família no Eoceno (44-38 Ma), concordando com registros fósseis recentes. Os potamotrygonídeos marinhos mostraram ter se originado em um período precedente à formação do Istmo do Panamá, já as linhagens dulcícolas indicam ter se diversificado a partir de um evento vicariante, como as incursões marinhas do Eoceno (35-28 Ma). Possivelmente, o estabelecimento do Sistema Pebas tenha favorecido a diversificação dos gêneros Heliotrygon e Paratrygon, já o gênero Plesiotrygon mostrou que se diversificou entre 28-25 Ma, ambos no Oligoceno. Potamotrygon mostrou ter se diversificado a partir do Mioceno (~23 Ma), que coincide com a formação do deságue do rio Amazonas em direção ao Oceano Atlântico. Assim, a disponibilidade de ambientes a partir deste período poderia explicar a ampla radiação em Potamotrygon, assim como as politomias entre as espécies do gênero. Este trabalho apresenta uma análise molecular que esclareceu algumas lacunas acerca das relações filogenéticas e padrões de diversificação da família Potamotrygonidae.

O gênero Willisornis é composto por seguidores regulares de formigas de correição. Eles habitam o sub-bosque da floresta e são distribuídos principalmente em florestas de terra-firme e cujos limites interespecíficos e verdadeira diversidade ainda são incertos. Enquanto a maioria das fontes atuais reconhece duas espécies do gênero (W. poecilinotus, com cinco subespécies reconhecidas, e W. vidua, com duas subespécies), uma terceira espécie foi recentemente dividida com base em evidências morfológicas e vocais combinadas (W. nigrigula). Devido a essas incertezas, os principais objetivos deste estudo foram: 1) estabelecer as relações filogenéticas entre os táxons de Willisornis, relacionando-os aos padrões historicamente conhecidos de variações de plumagem no gênero; 2) inferir um cenário espaço-temporal de diversificação de linhagem; e 3) avaliar a existência de possíveis zonas de hibridização entre populações diferentes daquelas já conhecidas. Foram estudados 1.133 espécimes, dos quais 155 foram incluídas nas análises moleculares e 1.107 nas análises de plumagem. Dois genes mitocondriais e dois nucleares foram sequenciados para análises filogenéticas, de genética de populações, árvores de espécies coalescentes, delimitação de espécies e análises biogeográficas. Nosso estudo indica que a diversidade de espécies no complexo Willisornis é muito maior do que se conhece atualmente, com pelo menos 7 linhagens coalescentes que também são diagnosticadas consistentemente por caracteres de plumagem qualificados para serem considerados como taxa de espécies. A história filogeográfica desses grupos sugere que a formação e reorganização da drenagem do rio Amazonas atuou como um forte fator de diversificação neste grupo. Além disso, encontramos uma nova zona de contato nas cabeceiras do rio Juruá entre duas linhagens de Willisornis não relacionadas e profundamente coalescidas, que ainda assim se integram tanto nos níveis molecular quanto morfológico, o que reforça a visão de que o isolamento reprodutivo evoluiu lentamente no gênero em comparação com outras linhagens de aves da zona temperada.

A família Vespidae de Hymenoptera é composta por seis subfamílias viventes, das quais Polistinae é uma das mais diversificadas com 25 gêneros descritos. Mischocyttarus é essencialmente Neotropical, com algumas espécies alcançando o oeste do Canadá, e é reconhecido principalmente por possuir terceiro e quarto segmentos dos tarsos mediano e posterior assimétricos, sendo o lobo interno mais comprido que o externo. Este gênero é monofilético e agrupa onze subgêneros igualmente monofiléticos. O grupo de espécies de Mischocyttarus heliconius agrupa espécies com ausência de sulco na base do fêmur anterior, margem da coxa anterior elevada e reflexa, presença de fóvea na lateral do pronoto, margem anterior do pronoto com lamela alargada e reflexa (sem margem secundária), carena pronotal contínua e frequentemente mais elevada no centro, ápice do clípeo arredondado e margem hipostomal frequentemente com lamela elevada. Inicialmente este grupo foi alocado no subgênero Kappa e, posteriormente em Clypeopolybia. Entretanto, trabalhos recentes o tratam como incertae sedis devido à imprecisão da relação de parentesco do grupo com os subgêneros de Mischocyttarus. O objetivo deste trabalho foi realizar uma revisão taxonômica do grupo de espécies de Mischocyttarus heliconius, da qual resultou o reconhecimento de oito espécies, sendo três novas. Os espécimes tipo das espécies formalmente conhecidas foram examinados. Uma chave de identificação das espécies é apresentada com base em caracteres morfológicos da fêmea, além de um mapa de distribuição geográfica com novas áreas de ocorrência.

Charinus Simon, 1892 é o gênero mais diverso da ordem Amblypygi e destaca-se pela ampla distribuição em áreas tropicais. Apesar do recente acréscimo no número de espécies conhecidas no gênero, o conhecimento do comportamento destes ainda é escasso. A única informação disponível na literatura sobre a espécie amazônica Charinus guto Miranda e Giupponi 2016, por exemplo, é sobre o micro-habitat que vivem. Neste contexto de carência de dados sobre o comportamento e levando-se em conta a importância de trabalhos etológicos, este trabalho teve como objetivo descrever o repertório comportamental individual e de interações intraespecíficas de C. guto, em condições laboratoriais. Foram utilizadas trinta fêmeas adultas, coletadas em Belém, estado do Pará, Brasil. O etograma individual foi realizado em 24 horas de observação por 24 dias consecutivos, sendo uma hora por dia e dois minutos por indivíduo. O etograma de interações intraespecíficas foi realizado com 12 pares de fêmeas adultas, cada par era observado por uma hora, nesta um espécime (chamado de invasor) era retirado de seu viveiro e colocado no de seu par (chamado de residente), após 24 horas o oposto era feito. O comportamento individual mais frequente em C. guto foi “dentro do abrigo” em todos os horários. Em 67% das vezes que foram colocados juntos, os espécimes não interagiram. Quando a interação ocorria, o comportamento mais frequente foi “Recuar”. No encontro, o comportamento mais comum foi “Contato mútuo” e “Permanecer parado” nos invasores e nos residentes “Primeiro contato” e “Aproximação”. Essse estudo demonstra que C. guto é partenogenética, apresenta cuidado maternal, tolerância a coespecíficos e é habita locais antropizados próximos de fragmentos de florestas secundarias.

A urbanização pode gerar mudanças na estrutura do ambiente afetando também processos físico-químicos. Essas mudanças ao longo do tempo têm provocado a perda de habitats e com elas a redução de populações de abelhas sem ferrão, que são um grupo de insetos importantes para a manutenção dos ecossistemas. As populações de abelhas sem ferrão, a diferença do gênero Apis, correm o risco de reduzir a sua população por serem pouco flexíveis às mudanças e sua possibilidade de adaptação a áreas urbanizadas é muito baixa. Por isso o nosso estudo teve por objetivo conhecer a ecologia urbana da espécie de abelha sem ferrão Melipona flavolineata, medindo a suas respostas no comportamento de forrageio e de postura aos parâmetros climatológicos em ambientes com diferentes graus de urbanização (agroflorestal- semi-urbano e urbano). Observamos 12 colônias de M. flavolineata durante cinco meses. As observações foram semanais intercalando atividade interna e atividade externa. A taxa de forrageio (média semanal), foi avaliada de 07h00 as 11h00 (horário de maior forrageio) e se contabilizavam as abelhas voltando à colônia, paralelo a esse processo se registraram dados de temperatura, umidade relativa, luminosidade e pressão barométrica. A taxa de postura (média semanal), foi avaliada durante quatro dias consecutivos na semana correspondente. Os resultados mostraram que os parâmetros climatológicos tiveram uma alta variação nos três pontos de coleta, afetando a performance das abelhas. A pressão barométrica e a umidade relativa do ar tiveram um efeito positivo e significativo sobre a coleta de pólen. Umidade relativa e a temperatura tiveram um efeito positivo e significativo com o forrageio de néctar; a pressão barométrica teve um efeito negativo, não significativo. A taxa de postura foi maior à medida que a umidade relativa do ar se acrescentava, mostrando uma relação positiva; a pressão barométrica teve um efeito positivo, mas não significativo. As relações entre a taxa de forrageio e a taxa de postura; assim como a relação entre a taxa de forrageio de pólen e a taxa de forrageio de néctar, foram positivas e significativas e não se diferenciaram entre os ambientes, apenas pela amplitude dos dados. Assim concluímos que a abelha sem ferrão M. flavolineata é uma espécie pouco tolerante a áreas completamente urbanizadas, e a sua capacidade de adaptar a ambientes com condições ambientais desfavoráveis é muito limitada, pois suas atividades estão restringidas pelas altas variações climáticas e provavelmente pela escassez de recursos alimentares. Nesse sentido seria bom implementar estudos da ecologia urbana de espécies menores, e adicionar nos estudos de respostas aos fatores climáticos o parâmetro da pressão barométrica que, ao parecer, segundo nossos resultados afetam o comportamento das abelhas sem ferrão.

O biomonitoramento biológico eficaz depende também da seleção de indicadores que nos possibilita identificar as mudanças que ocorrem em um sistema. A ordem Odonata tem mostrado ser  um bom grupo indicador das condições ambientais em habitats aquáticos e terrestres, indicando mudanças nas proporções das medidas da diversidade (abundância, riqueza e composição de espécies) entre Anisoptera e Zygoptera diante das alterações ambientais. No entanto encontrar resoluções taxonômicas mais elevadas dentro de um táxon, por exemplo a nível de famílias, que representem as mesmas respostas do táxon com resolução para espécie, pode reduzir o tempo e os custos destinados ao monitoramento. Nós avaliamos a resposta das famílias em Odonata como substitutos (surrogates) para as subordens, testando sua eficácia como uma ferramenta diagnóstica na avaliação do impacto ambiental em igarapés amazônicos. Adultos de Odonata foram coletados em 98 igarapés da Amazônia oriental, nos municípios de Paragominas e Santarém-Belterra (estado do Pará), Brasil, usando rede
entomológica. As caraterísticas físicas de cada igarapé foram mensuradas usando o Índice de Integridade do Habitat (IIH). No total, foram coletados 3584 espécimes de Odonata, distribuídos em 11 famílias e 130 espécies. Encontramos que as famílias mais diversas são substitutos efetivos para representar padrões das subordens, sendo a abundância a variável com melhor sensibilidade para capturar o efeito do IIH. Além disso, as medidas de diversidade das famílias respondem de maneira diferenciada às mudanças na integridade ambiental dos igarapés, mostrando respostas positivas em Zygoptera e negativas em Anisoptera ao longo do gradiente e sugerindo que as famílias menos diversas apresentam uma faixa de resposta comum diante da perda de integridade ambiental. Por tanto, nossos resultados confirmam a utilidade dos adultos de Odonata como bons indicadores na avaliação de riachos amazônicos e ressalta a importância de usar as famílias Libellulidae (Anisoptera), Calopterygidae e Coenagrionidae (Zygoptera) como substitutos das subordens em locais com diferentes condições de integridade ambiental, devido a suas respostas especificas as características físicas dos
igarapés.

O presente trabalho objetivou avaliar o efeito dos diferentes usos da terra e das características do habitat na ecologia trófica do peixe tetra flag Hyphessobrycon heterorhabdus em riachos da Amazônia Oriental. Foram amostrados 29 riachos entre os anos de 2012 e 2014, com diferentes intensidades de usos e ocupação da terra, pertencentes à bacia do Rio Capim, Amazônia Oriental. Um total de 600 espécimes foi analisado quanto à dieta por meio da identificação do conteúdo estomacal. Os riachos foram caracterizados quanto a estrutura do hábitat local e a porcentagens de usos da terra na paisagem. Tais características ambientais foram posteriormente relacionadas com a dieta da espécie por meio de uma RDA e Modelos de Regressão Múltipla. A dieta de H. heterorhabdus foi composta por 79 itens agrupados em 22 categorias, os quais foram avaliados quanto a sua importância. A espécie também foi avaliada quanto a sua intensidade alimentar e quanto sua amplitude do nicho trófico. Tais parâmetros foram posteriormente relacionados com as características ambientais em escala local e da paisagem. A espécie foi considerada generalista, oportunista insetívora, com predomínio de consumo de Blattodea, Hymenoptera e fragmentos de exoesqueleto. Não houve influência dos usos da terra e variáveis locais em sua intensidade alimentar nem na amplitude do nicho trófico do H. heterorhabdus. De forma geral, as variáveis ambientais avaliadas, tanto em escala local quanto em escala de paisagem não influenciaram os aspectos da ecologia trófica do H. heterorhabdus. Acreditamos que por pertencer a um grupo de espécie insetívora, nectônica, de pequeno porte e devido ao fato de os insetos constituírem um grupo abundante mesmo em condições adversas, ocorra um oportunismo trófico por parte do H. heterorhabdus, fazendo com que características da sua ecologia trófica sejam mantidas, mesmo em condições adversas.

A anotação funcional de transcriptomas é um processo que envolve consultas em diversos bancos de dados com a finalidade de inferir funções gênicas, utilizando para isso a comparação de genes homólogos com funções conhecidas, depositadas em bancos de dados públicos. Essa metodologia gera uma enorme quantidade de dados, tornando o processo de anotação inviável sem procedimentos de mineração em bioinformática. Muitas ferramentas utilizam linhas de comandos para a comparação de sequências em diferentes bancos de dados, o mais conhecido é o BLAST, o qual necessita a informação prévia de diversos parâmetros de entrada. Uma das soluções adequadas para a fácil utilização dessa ferramenta seria uma interface gráfica para o usuário (GUI), e para esta finalidade existem várias ferramentas livres e de código aberto baseada em linguagens web. Tais ferramentas são uma ótima alternativa para usuários com pouca prática em informática e análises de dados, pois permitem ao usuário explorar os dados de maneira interativa. Apesar de existirem diversas ferramentas baseadas em linguagem web para anotação de transcriptomas, alguns destas apresentam certas limitações, seja pela sua disponibilidade, pela sua instalação complexa, entre outros. Diante disto, apresentamos o sGOat, uma ferramenta gratuita e multiplataforma para anotação e posterior filtragem de sequências específicas. Este é baseado em linguagem web e pode ser executado localmente para a anotação de transcriptomas, além de fornecer ao usuário a opção de exportar
arquivos para posterior comparação de transcriptomas.

Os riachos de cabeceira são ecossistemas heterotróficos que apresentam forte ligação com a vegetação ripária, que além de fornecer um sistema de proteção e regulação das condições físicas e químicas, é responsável pela entrada da matéria orgânica alóctone, a principal fonte de energia das redes tróficas nesses sistemas. Os efeitos das espécies vegetais exóticas na decomposição de detritos foliares em riachos são variáveis, principalmente porque a qualidade do detrito foliar tende a diminuir com a latitude e com o aumento da elevação altitudinal. Deste modo, esse trabalho tem como objetivo avaliar o papel dos macroinvertebrados aquáticos na decomposição de folhas exóticas e nativas em riachos amazônicos, tentando controlar um possível efeito da variação temporal. Para tanto, testaremos duas hipóteses: (i) esperamos que os macroinvertebrados aquáticos apresentem forte efeito sob a decomposição de detritos foliares sendo afetados pela qualidade do detrito foliar, assim detritos foliares com menores concentrações de compostos estruturantes (p.e. lignina, celulose e fibras) terão maior colonização por macroinvertebrados e apresentaram menor massa remanescente; (ii) a proporção dos grupos tróficos funcionais é afetada pela variação temporal, deste modo esperamos que no período chuvoso haja menor proporção de grupos tróficos funcionais como fragmentador, devido à redução de micro-habitat com o carreamento do substrato pela a força da água. Nossa primeira hipótese foi corroborada, o detrito foliar nativo Theobroma cacao apresentou menor massa remanescente e foi mais colonizado. Tal achado pode estar relacionado primeiramente, à qualidade química desse detrito (p.e. baixas concentrações de lignina, celulose e fibras). A hipótese de que os GTF são afetados pela a variação temporal foi corroborada, o período de recolhimento dos detritos foliares afetaram fortemente a proporção dos grupos funcionais fragmentador, predador e coletor-catador estando ausentes no período chuvoso. Tal variação pode evidenciar a adaptação dos táxons para resistir ao aumento da velocidade da corrente e vazão durante as cheias e/ou para avançarem em direção à hábitats refúgios. Em geral, nossos resultados indicam que mudanças na composição de espécies arbóreas da vegetação ripária, tais como substituição de espécies nativas por exóticas podem impactar as taxas de decomposição e colonização por macroinvertebrados aquáticos com implicações para o funcionamento ecossistêmico e fluxo de energia nos riachos. Contudo, se faz necessário mais estudos abordando outros atributos dos detritos foliares e amostragem em diferentes períodos sazonais, a fim de fazer predições mais gerais sobre o funcionamento de riachos Amazônicos. Além disso, como as alterações ambientais na Amazônia tem sido cada vez mais constante é muito importante avaliar se elas influenciam no processamento da matéria orgânica.

O gênero neotropical Ceriomura Simon, 1901 é revisado e cinco espécies são reconhecidas. Ceriomura damborskyae Rubio & Baigorria, 2016 = Ceriomura cruenta (Peckham & Peckham, 1894) (espécie-tipo) syn. nov. = Maevia gracilipes Taczanowski, 1878 syn. nov. = Ceriomura gracilipes (Taczanowski, 1878) comb. nov. A fêmea de C. casanare Galvis, 2017 é descrita pela primeira vez. As seguintes espécies são transferidas para o gênero: Cotinusa bryantae Chickering, 1946 (macho e fêmea conhecidos) = Ceriomura bryantae (Chickering, 1946) comb. nov.; Cotinusa simoni Chickering, 1946 (somente macho conhecido) = Ceriomura simoni (Chickering, 1946) comb. nov. Novos registros de C. gracilipes e C. casanare são fornecidos. Ceriomura rubioi sp. nov. (somente macho conhecido) é descrita. Novas ilustrações de corpo e órgãos copuladores, bem como diagnoses, são fornecidas para comparação entre as espécies. Ceriomura perita (Peckham & Peckham, 1894) é transferida para Cotinusa Simon, 1900. O gênero neotropical Cotinusa Simon, 1900 também é revisado. As seguintes novas sinonímias genéricas são estabelecidas: Banksetosa Chickering, 1946 = Carabella Chickering, 1946 = Proctonemesia Bauab & Soares, 1978 = Cotinusa Simon, 1900 syn. nov. As seguintes espécies são transferidas para o gênero: Banksetosa dubia Chickering, 1946 = Cotinusa dubia (Chickering, 1946) comb. nov.; Banksetosa notata Chickering, 1946 = Cotinusa notata (Chickering, 1946) comb. nov.; Paramarpissa insignis Banks, 1929 (atualmente em Carabella) = Cotinusa insignis (Banks, 1929) comb. nov.; Carabella banksi Chickering, 1946 = Cotinusa banksi (Chickering, 1946) comb. nov.; Simprulla secunda Soares & Camargo, 1948 (atualmente em Proctonemesia) = Cotinusa secunda (Soares & Camargo, 1948) comb. nov.; Proctonemesia multicaudata Bauab & Soares, 1978 = Cotinusa multicaudata (Bauab & Soares, 1978) comb. nov.; Attus tenuis Taczanowski, 1871 = Cotinusa tenuis (Taczanowski, 1871) comb. nov.; Attus lethierryi Taczanowski, 1871 (atualmente em Lurio Simon, 1901) = Cotinusa lethierryi (Taczanowski, 1871) comb. nov.; Maevia susiformis Taczanowski, 1878 = Cotinusa susiformis (Taczanowski, 1878) comb. nov.; Maevia trilineata Taczanowski, 1878 = Cotinusa trilineata (Taczanowski, 1878) comb. nov. As seguintes novas sinonímias específicas são estabelecidas: C. adelae Mello-Leitão, 1944 = C. trifasciata Mello-Leitão, 1943 syn. nov.; C. albescens Mello Leitão, 1945 = C. irregularis Mello-Leitão, 1945 = C. vittata Simon, 1900 syn. nov.; C. leucoprocta (Mello-Leitão, 1947) = C. gertschi (Mello-Leitão, 1947) = C. cancellata (Mello-Leitão, 1943) = C. deserta (Peckham & Peckham, 1894) syn. nov.; C. soesilae Makhan, 2009 = C. dimidiata Simon, 1900 = C. tenuis (Taczanowski, 1871) syn. nov.; C. gemmea (Peckham & Peckham, 1894) = C. susiformis (Taczanowski, 1878) syn. nov.; C. trimaculata Mello-Leitão, 1922 = C. horatia (Peckham & Peckham, 1894) = C. lethierryi (Taczanowski, 1871) syn. nov.; C. multicaudata (Bauab & Soares, 1978) = C. secunda (Soares & Camargo, 1948) syn. nov.; Cotinusa rubriceps (Mello-Leitão, 1947) = Druzia flavostriata (Simon, 1901) syn. nov. As seguintes espécies novas são descritas: ambos os sexos de C. kunumi sp. nov. e o macho de C. floripa sp. nov. A fêmea de C. susiformis, e os machos de C. perita e C. puella são descritos pela primeira vez. As seguintes três espécies são consideradas inquirendae: C. mathematica (Mello-Leitão, 1917), C. pulchra (Mello-Leitão, 1917) e C. setosa (Mello-Leitão, 1947). No total, 25 espécies de Cotinusa são consideradas válidas, redescritas e ilustradas. Mapas com registros de distribuição são apresentados. Cotinusa splendida (Dyal, 1935) do Paquistão é considerada incertae sedis.

A família Sarcophagidae (Diptera) tem distribuição cosmopolita e compreende cerca de 3.000
espécies e 355 gêneros descritos. Dentre suas subfamílias, Sarcophaginae é a mais diversa e
ambundante no novo mundo. Há poucos estudos sobre a família para a região Neotropical, sobretudo
para a região Amazônica onde há uma carência de taxonomistas no grupo. Sendo assim, o trabalho
levantou as espécies da subfamília Sarcophaginae registradas para a Amazônia Brasileira e ampliou
o conhecimento da fauna, através de descrição e redescrição de espécies e confecção de chave
dicotômica para as espécies da região. O trabalho foi realizado com base na bibliografia atual e nos
exemplares de quatro coleções entomológicas do Brasil. Foram feitas análises morfológicas,
medições e ilustrações de espécimes machos. Foram encontrados 131 espécies e 30 gêneros de
Sarcophagidae para a Amazônia Brasileira. Foram descritas duas espécies novas do gênero
Dexosarcophaga e uma do gênero Rettenmeyerina. Foi feita uma redescrição da espécie Promayoa
Dodge, 1966, com novas ilustrações. Foi confeccionado uma chave dicotômica para as espécies
ocorrente na região, com exceção das espécies do gênero Lepidodexia, no qual não foram incluídas
na chave pelo grande número de espécies neotropicais não descritas e a falta de revisão que este
gênero precisa, tornando qualquer esforço prematuro.

Os macacos-de-cheiro (gênero Saimiri Voigt, 1831) são primatas neotropicais de pequeno porte (650-
1200g), amplamente distribuídos na Bacia Amazônica, além de dois taxa que ocorrem na América
Central. Existe grande divergência em relação ao número de espécies reconhecidas, podendo variar
de 2 a 12 taxa. Recentemente diversos trabalhos foram publicados utilizando DNA mitocondrial
visando entender a origem e diversificação de Saimiri, bem como o relacionamento entre as espécies.
Entretanto, mesmo após estas publicações a diversidade e o relacionamento intra genérico ainda
apresenta divergências, não havendo cogruência entre os dados morfológicos e genéticos. O presente
estudo teve como objetivo propor uma hipótese filogenética para Saimiri através de parte do genoma
(double digest restriction-site associated DNA sequencing - ddRADseq), assim como revisar
taxonomia do genêro e sua distribuição. Esta tese está dividida em três capítulos. No primeiro,
“Phylogenomics of Amazon squirrel monkeys (Saimiri; Primates; Cebidae)”, foram analisadas 44
amostras de tecido e seis de sangue para obtenção de uma filogenia molecular de parte do genoma
(ddRADseq) através da análise de Máxima Verossimilhança e de uma árvore datada através do
BEAST. Verificou-se a estrutura entre as populações estudadas através do STRUCTURE. Recuperouse
a monofilia recíproca entre o grupo Gótico e Romano. Além disso, as árvores recuperaram dez
linhagens dentro de Saimiri da Bacia Amazônica, confirmando que a diversificação intra-genérica é
recente, tendo ocorrido no Pleistoceno. No segundo capítulo, “How many squirrel monkey (Saimiri
Voigt, 1831) species are there? A morphological diagnosis and refined mapping of geographical
distribution”, foram analisados 887 espécimes de todas as espécies atualmente reconhecidas,
incluindo 18 espécimes tipos. Foi verificada a congruência entre os resultados de análises
morfológicas com a filogenia obtida no primeiro capítulo. Os resultados apoiam a existência de dois
grupos morfológicos (Romano e Gótico) e o reconhecimento de 13 espécies, sendo uma espécie nova.
Para cada uma delas são apresentados sinonímia, material tipo, localidade tipo, diagnose, variação,
comparação com outras espécies, distribuição, comentários, status de conservação e material
examinado. No terceiro capítulo, “New records of Saimiri collinsi Osgood, 1916 (Cebidae, Primates),
with comments on habitat use and conservation”, a distribuição geográfica da espécie Saimiri collinsi,
foi ampliada para uma área de transição entre Amazônia e Cerrado, indicando também a necessidade
de monitoramento dessas populações devido à intensa ação antrópica na região que reduziu o habitat
da espécie na maior parte do Maranhão e no norte do Tocantins.

O conhecimento biogeográfico atual dos Neotrópicos se concentra em sua maioria nas florestas tropicais úmidas, por outro lado outro tipo de floresta não tem recebido tanta atenção em trabalhos evolutivos e biogeográficos, são as Florestas Tropicais Sazonalmente Secas (FTSSs). As FTSSs ocorrem de forma disjunta pela América do Sul, sendo a Caatinga o maior bloco isolado delas que historicamente foi tratada como uma região pobre e de poucos endemismos, mas o que estudos recentes com abordagem filogeográfica tem mostrado é que a diversidade da Caatinga vinha sendo subestimada e altos níveis de diversidade críptica e endemismo são encontrados em plantas, répteis, peixes, mamíferos e insetos. Diante disso propomos um estudo sistemático e filogeográfico utilizando como modelo de estudos aves endêmicas para se testar o grau de estruturação populacional/linhagens entre as margens do Rio São Francisco (RSF), uma barreira vicariante nesta região para vários organismos assim como ocorre para grandes rios na Amazônia, e também testar os efeitos das oscilações climáticas do Pleistoceno na dinâmica populacional destas espécies, para isso usamos uma abordagem integrativa, com dados genéticos, morfológicos, vocais e ecológicos. Os resultados obtidos nos dois capítulos/artigos mostram uma forte estruturação de linhagens congruente com o curso atual do RSF e com tempos de divergência relacionado com uma primeira mudança no curso do rio para a direção leste do Brasil, ainda detectamos assinaturas genéticas e fenotípicas de uma segunda mudança mais recente no curso deste rio com efeitos de contato secundário passivo no baixo rio, além disso não detectamos fluxo gênico significativo entre as populações de margens opostas desse rio. As oscilações climáticas do final do Pleistoceno também tiveram forte influência nas distribuições e tamanhos populacionais destas espécies, mas aparentemente não relacionadas à eventos de diversificação. Eventos de glaciações parecem ter influenciado apenas em um evento de separação de populações na margem esquerda do RSF e outra em um relicto de vegetação savanica/florestal nos limites da Amazônia, mas não associado com a última delas durante o LGM mas durante uma glaciação anterior a esta e de mesma intensidade. Assim destacamos que complexos eventos estiveram envolvidos na diversificação de aves da Caatinga e esperamos que este padrão se repita em outras espécies de aves endêmicas, ainda descrevemos aqui uma nova espécie de ave endêmica desta região.

Hymenoptera é uma ordem de insetos megadiversa, tem cerca de 115 mil espécies com distribuição cosmopolita. Possui grande diversidade de hábitos e complexidade de comportamentos inclusive a organização social de vespas, abelhas e formigas. A família Vespidae é composta por seis subfamílias viventes, dentre as quais está Polistinae, exclusivamente eusocial. Esta subfamília é uma das mais diversas, com cerca de 950 espécies, 25 gêneros e quatro tribos, das quais, três ocorrem no novo mundo: Polistini, Mischocyttarini e Epiponini. Mischocyttarus é o maior gênero de Polistinae, com cerca de 250 espécies. É o único gênero da tribo Mischocyttarini e tem distribuição predominantemente neotropical. Desde a descrição, Mischocyttarus passou por várias modificações, com realocações de espécies de outros gêneros e entre os seus subgêneros. Atualmente, o gênero tem onze subgêneros, segundo a hipótese filogenética aceita mais recente, a qual utilizou dados morfológicos. Este trabalho teve como objetivo realizar uma filogenia do gênero Mischocyttarus utilizando dados morfológicos e moleculares. Além disso, foi feita uma revisão taxonômica do subgênero Megacanthopus Ducke de Mischocyttarus. Os procedimentos de extração, amplificação e sequenciamento foram realizados no Laboratório de Biologia Molecular do Museu Paraense Emílio Goeldi, de acordo com os protocolos estipulados. Além das sequências obtidas com a extração, também foram utilizadas sequências de DNA de espécies do gênero Mischocyttarus disponíveis no GenBank. Foram isolados, por meio de PCR, fragmentos de seis genes mitocondriais e nucleares: Citocromo Oxidase, subunidade I (COI), subunidades 16S e 28S do RNA ribossomal. As reconstruções filogenéticas foram realizadas por meio dos métodos de máxima parcimônia (TNT), máxima verossimilhança (RAxML) e Inferência Bayesiana (MrBayes). A definição de partições e escolha dos modelos evolutivos se deram por meio do programa PartitionFinder. O suporte para os clados dentro das árvores foi feito utilizando Symmetric Resample e probabilidade posterior. A monofilia de Mischocyttarus foi corroborada por todas as árvores geradas. Dos nove subgêneros representados por mais de uma espécie, quatro tiveram sua monofilia recuperada por todas as análises e na maioria delas, são recuperados seis subgêneros (Clypeopolybia, Mischocyttarus s. str., Monogynoecus, Kappa, Megacanthopus e Phy. Os subgêneros Artifex, Haplometrobius e Omega tiveram sua monofilia refutada em todas as árvores. O subgênero Megacanthopus foi recuperado em todas as hipóteses gerdadas, tanto aquelas utilizando somente dados moleculares quando aquelas utilizando dados combinados. E a relação entre as espécies deste subgênero foi surpreendente, uma vez que não teve um compartilhamento de caracteres morfológicos evidente entre os grupos formados. Foram feiras redescrições e diagnoses das dez espécies de Megacanthopus, Além da descrição de cinco novas espécies, sendo quatro delas provenientes da Amazônia. Também foi feita uma chave de identificação dicotômica e mapa de distribuição para todas essas espécies.

O gênero neotropical Tupirinna Bonaldo, 2000 é revisado, incluindo 20 espécies. Todas as três espécies previamente descritas atualmente no gênero são rediagnosticadas e novos registros de T. rosae (Bonaldo, 2000) do Pará, Brasil são fornecidos. T. albofasciata (Mello-Leitão, 1943) é aqui redescrita com base no lectótipo fêmea, aqui designado. As seguintes 17 novas espécies são descritas, diagnosticadas e ilustradas: T. evanesca sp. nov. (macho e fêmea do Pará, Brasil); T. zebra sp. nov. (macho e fêmea do Amazonas e Mato Grosso, Brasil); T. caraca sp. nov. (macho e fêmea do Sul e Sudeste do Brasil); T. urucu sp. nov. (macho do Amazonas, Brasil); T. coari sp. nov. (macho e fêmea do Amazonas, Brasil); T. lata sp. nov. (macho e fêmea dos estados da Bahia, Espirito Santo, Minas Gerais, São Paulo e Santa Catarina, Brasil); T. regiae sp. nov. (macho e fêmea do Amazonas e Pará, Brasil); T. mutum sp. nov. (macho e fêmea do Pará e Mato Grosso, Brasil); T. cruzes sp. nov. (macho e fêmea do Rio de Janeiro, São Paulo e Santa Catarina, Brasil); T. palmares sp. nov. (macho e fêmea do Nordeste do Brasil); T. una sp. nov. (macho e fêmea da Bahia, Brasil); T. gigantea sp. nov. (macho e fêmea de Vaupés, Colômbia e Huanuco, Peru); T. oba sp. nov. (fêmea da Bahia, Brasil); T. goeldi sp. nov. (fêmea do Pará, Brasil); T. ibiapaba sp. nov. (macho e fêmea do Ceará, Brasil); T. luctuosa sp. nov. (fêmea de Minas Gerais, Brasil) e T. araguaia sp. nov. (macho e fêmea do Pará, Brasil). Além disso, mapas de distribuição e uma chave de identificação para machos e fêmeas de todas as espécies de Tupirinna são fornecidos.

A família Chrysididae possui mais de 3.000 espécies descritas divididas em quatro subfamílias, definidas por modificações do metassoma: Cleptinae, Amiseginae, Chrysidinae e Loboscelidiinae. Essas vespas são conhecidas por seu brilho metálico e por seu comportamento parasítico, em que pode ou não levar seu hospedeiro a morte. Estudos mais detalhados sobre estruturas corporais dos crisidídeos são mais comumente encontradas relatando as modificações do metassoma. Com isso, outros caracteres são estudados de forma mais superficiais e acarreta em informações escassas ou inexistentes. Com o intuito de contribuir com futuros estudos de relações filogenéticas do grupo, o objetivo principal do trabalho é comparar as mandíbulas de fêmeas em vespas de Chrysididae, refinando o conhecimento da morfologia funcional do grupo através de uma abordagem sistemática. Foram analisadas mandíbulas de 38 espécies de Chrysididae, sendo estas das subfamílias: Amiseginae, Cleptinae e Chrysidinae (30 espécies neotropicais e 8 paleárticas); e duas espécies de Bethylidae como grupo externo. Para isso a mandíbula foi retirada da cápsula cefálica e acondicionadas em álcool 70%. Foram realizadas medidas nas peças, produção dos desenhos através da câmara clara acoplada a estereomicroscópio, e as descrições das mesmas para a construção de uma lista de caracteres e matriz de dados morfológicos. Foi realizada a inferência filogenética através da otimização dos caracteres obtidos, pelo método de parcimônia, na filogenia com topologia modificada para incluir apenas os táxons de estudo. Análises morfométricas indicam que a mandíbula tem uma orrelação positiva relativamente forte em relação ao tamanho do corpo. Através da otimização dos caracteres mandibulares foi possível inferir os estados ancestrais em cada clado e avaliar a evolução dos mesmos. Analisando a frequência dos índices de consistência dos caracteres morfológicos mandibulares na árvore adotada, constatou-se que os caracteres são pouco informativos. E através de uma busca, utilizando apenas os caracteres morfológicos mandibulares, foi obtida uma árvore de consenso de 5.686 árvores, e, comparada com a árvore de estudo, apenas Amiseginae foi recuperada como grupo monofilético, sugerindo que apenas os caracteres mandibulares não são suficientes para propor hipóteses de relacionamento. Algumas considerações sobre a relação morfológica e hábitos biológicos dos crisídideos puderam ser observados.

O gênero Microcharacidium Buckup 1993 inclui atualmente três espécies consideradas miniaturas (senso Weitzman & Vari, 1988): Microcharacidium eleotrioides Géry, M. gnomus Buckup; e M. weitzmani Buckup. O gênero é amplamente distribuído na região Norte cis-andina da América do Sul, com grande representatividade na parte superior do Rio Orinoco, na grande bacia do Rio Amazonas, e nas bacias costeiras adjacentes que drenam os escudos da Guiana e do Brasil. O presente estudo objetivou revisar o gênero fazendo uso de 1.179 exemplares provenientes de coleções ictiológicas nacionais e internacionais. As três espécies validas para o gênero são redescritas e ilustradas. Oito espécies novas são descritas aumentando consideravelmente a diversidade antes subestimada em Microcharacidium.

Chironius fuscus é um Colubrídeo com distribuição relativamente ampla, podendo ser encontrada na maioria dos países da América do Sul. No Brasil habita toda a região amazônica e os estados da Bahia, Espírito Santo, Rio de Janeiro e São Paulo. Sua dieta é basicamente composta por anuros, principalmente e, também, de lagartos. Sua biologia reprodutiva é pouco conhecida, exceto por alguns trabalhos que abordam a fecundidade e o dimorfismo sexual. Para realização deste estudo analisamos espécimes machos provenientes de diversas localidades da Amazônia Oriental brasileira. Nossos resultados mostram que machos de Chironius fuscus apresentam um ciclo reprodutivo assazonal, ou seja, apresentam atividade testicular (espermatogênese) ao longo do ano, não se restringindo a uma determinada época. Verificamos estocagem de espermatozoides ao longo do ano, com o diâmetro do ducto deferente sendo constante durante todos meses do ano. Comprimento do rim, largura do rim e segmento sexual renal não apresentaram diferenças significativas. Os resultados aqui obtidos poderão servir como ferramenta para elucidar alguns aspectos reprodutivos de serpentes neotropicais, além de servirem como fonte de informações de caracteres histológicos e reprodutivos desse grupo de vertebrados.

Os distúrbios causados por atividades de uso da terra têm provocado uma série de efeitos negativos sobre a biodiversidade de riachos. Por isso, essa tese foi desenvolvida com o objetivo de contribuir com informações sobre os efeitos dessas práticas na biodiversidade de riachos na Amazônia. A tese está organizada em três capítulos. O primeiro consiste em uma revisão de trabalhos que estudaram os efeitos dos usos da terra sobre a fauna de riachos amazônicos nos últimos 25 anos, a fim de mostrar o atual cenário da pesquisa científica na região sobre o tema e mostrar como as assembleias desses ambientes têm respondido aos impactos. O segundo capítulo teve como objetivo avaliar os efeitos de três práticas de uso da terra (exploração madeireira manejada, exploração madeireira convencional e pastagem) em assembleias de peixes de riachos, considerando os impactos sobre a estruturação da comunidade e a especialização de habitat das espécies. Por fim, o objetivo do terceito capítulo foi avaliar a singularidade ecológica de assembleias de peixes nessas áreas, a fim de identificar os usos e espécies que mais contribuem para a diversidade beta da região. Como resultados gerais, foram encontrados 42 artigos na literatura avaliando os efeitos do uso da terra em comunidades de fauna de riachos na Amazônia, principalmente em áreas de exploração madeireira. Isso mostra que o conhecimento dos efeitos dessas práticas sobre comunidades de riachos na região ainda é bastante limitado. Além disso, foi possível observar que áreas exploradas por técnicas de impacto reduzido não causam efeitos significativos sobre os grupos taxonômicos avaliados. No segundo capítulo, foi encontrado maior impacto dos efeitos do uso da terra em riachos localizados em áreas de exploração convencional e pastagem, e nenhum efeito foi observado em áreas de exploração manejada. Além disso, especialistas e generalistas de habitat foram observadas em áreas de pastagem, mostrando que a resposta de ambas depende do nível de associação que elas têm com as características do ambiente alterado. Por fim, no terceiro capítulo, foi encontrada maior contribuição das áreas de pastagem para a diversidade beta, devido principalmente à grande variação observada em seus níveis de distúrbio. Além disso, tanto especialistas quanto generalistas contribuíram para os padrões de diversidade beta da área estudada. Concluindo, os resultados dessa tese mostraram que áreas alteradas podem causar efeitos particulares, fazendo com que comunidades de riachos apresentem respostas específicas aos distúrbios causados pelo uso da terra.

A diversidade beta tem sido utilizada para avaliar os padrões das comunidades de organismos aquáticos e é influenciada principalmente pela diminuição na heterogeneidade ambiental entre os riachos decorrente das atividades antrópicas. A variação total da comunidade (BD Total) pode ser particionada em contribuição dos locais (LCBD) e das espécies (SCBD) que são importantes para compreender os padrões e fatores que influenciam a BD Total em ambientes naturais e modificados por atividades antrópicas. Nesse contexto, nosso objetivo foi avaliar o efeito do gradiente antrópico na heterogeneidade ambiental entre os riachos e na diversidade β de Ephemeroptera, Plecoptera e Trichoptera (EPT), testando as seguintes hipóteses: i) maior intensidade antrópica diminui a heterogeneidade ambiental entre os riachos; ii) a LCBD de EPT é menor nos riachos com maior intensidade antrópica e, iii) os gêneros de EPT mais tolerantes estão relacionados a riachos com maior intensidade antrópica. Para testar nossas hipóteses, nós amostramos 48 riachos inseridos em uma paisagem modificada por distintas atividades antrópicas que foram quantificadas por meio da classificação do Uso e Cobertura do solo na drenagem do riacho e das características ambientais mensuradas em cada riacho. Encontramos que os riachos com maior intensidade antrópica tiveram maior heterogeneidade ambiental e diversidade beta (LCBD) de EPT. Além disso, os gêneros mais tolerantes de EPT ocorreram em vários habitats, desde locais sem alteração ambiental até locais mais modificados por atividades antrópicas. A maior heterogeneidade ambiental em riachos mais modificados por atividades antrópicas pode ser oriunda das distintas formas com que os recursos naturais foram explorados na paisagem ao entorno dos riachos, pois cada paisagem foi modificada de maneira distinta pelos proprietários, o que pode ter acarretado na variação ambiental entre os riachos. Por outro lado, esse acréscimo na heterogeneidade em riachos mais modificados por atividades antrópicas pode ter propiciado maior diversidade beta (LCBD) de EPT nesses locais, sendo essa constituída principalmente por gêneros mais tolerantes. Os gêneros tolerantes de EPT encontrados nesse estudo estão amplamente distribuídos nos riachos, sugerindo que estes indivíduos apresentam requisitos e adaptações variados para persistirem nesses locais. Nossos resultados demonstram que a intensidade de atividades antrópicas modifica as características ambientais dos riachos e influenciam as comunidades de EPT. Dessa forma, enfatizamos a necessidade de instaurar estratégias que conservem a estrutura do riacho (ex. vegetação ripária) e dessa forma a diversidade de insetos aquáticos na Amazônia. Além disso, também ressaltamos a importância em se utilizar a LCBD e SCBD, como medidas complementares para o monitoramento biológico nos riachos, pois estas contribuem para uma melhor compreensão acerca da estruturação das comunidades de insetos aquáticos.

O cultivo de oil palm (Elaeis guineensis Jacq) na região amazônica foi expandido nas últimas décadas. Assim, tornam-se cada vez mais necessárias pesquisas que avaliem o efeito que esta monocultura pode provocar na diversidade e dinâmica das espécies. Para avaliar tal afirmação, a tese foi dividida em três capítulos com o intuito de verificar as seguintes hipóteses: 1) O plantio de oil palm pode provocar alterações das variáveis abióticas em áreas de plantio de oil palm e influenciar a diversidade alfa e beta de larvas de Odonata. 2) Alterações dos fatores abióticos em áreas de oil palm podem acarretar na perda de diversidade morfológica de larvas de Odonata. 3) Os táxons Campylocia anceps (Ordem: Ephemeroptera), Cylindrostethus palmaris (Ordem: Hemiptera) e Mnesarete aenea (Ordem: Odonata), são capazes de induzir maiores respostas de detoxificação através da análise da atividade da Glutationa S-transferase (GST) em áreas de oil palm. Para corroborar tais hipóteses, foram amostrados 29 riachos, situados entre áreas de plantio de oil palm e floresta. Os riachos amostrados estão localizados em uma das regiões mais afetadas pelo desmatamento na Amazônia, no Nordeste do Estado do Pará, na região biogeográfica denominada Centro de Endemismo Belém. De acordo com os resultados, a diversidade alfa de larvas de Odonata foi maior em áreas de oil palm e a beta diversidade foi estruturada principalmente por turnover para Zygoptera, enquanto o mesmo efeito não foi observado para Anisoptera. As assembleias de larvas de Odonata são influenciadas pelo habitat físico, e mudanças na paisagem também podem afetar a diversidade beta através de maiores limitações de dispersão. Verificamos que através do uso das medidas morfológicas de larvas de Odonata, torna-se possível gerar índices que expressem a dinâmica das larvas de Odonata com o ambiente aquático. Por exemplo, nossos resultados indicaram que a porcentagem de trechos de piscinas formadas por fluxo lêntico influencia positivamente organismos com maiores comprimentos de fêmur. Verificamos que a espécie M. aenea desempenhou maiores atividades de GST em áreas de oil palm, onde ambientes de palma demonstraram ter uma maior variação da temperatura em relação aos ambientes de floresta. Os outros táxons não demonstraram diferença em suas atividades de GST entre as áreas de oil palm e floresta. Entretanto, o resultado da indução de GST obtido para M. aenea demonstra a sensibilidade deste organismo a alterações antrópicas, podendo ser utilizado como um bom biomonitor de alterações no ambiente. Este estudo possibilitou verificar os efeitos gerados pelo plantio de oil palm sobre a diversidade de larvas de Odonata principalmente para a subordem Zygoptera, e maiores níveis de indução da GST nos adultos de M. aenea presentes nos ambientes de plantio de oil palm.

O gênero Edessa possui muitos problemas taxonômicos e de nomenclatura, contudo fazer a revisão do gênero de uma vez só se torna inviável por conta do grande número de espécies (<600 espécies), por isso foi proposto fazer a revisão em pequenos grupos de espécies. O subgênero Hypoxys é um grupo monofilético, segundo a única análise filogenética existente, sendo apoiado por quatro sinapomorfias. Esse subgênero de Edessa possui 17 espécies descritas e mais de 40 espécies novas para a ciência, segundo uma revisão ainda não publicada. Assim, este trabalho tem como objetivo propor um grupo de espécies dentro de Hypoxys, descrever 15 espécies novas, e fazer uma chave de identificação para elas, bem como, refazer a análise cladística de Hypoxys. Com isso, pretende-se reavaliar a monofilia de Hypoxys e suas relações internas com a inclusão de mais espécies e de novos caracteres. Foram analisados 35 exemplares provenientes de instituições nacionais e estrangeiras, e coleções particulares. Estes exemplares foram descritos, medidos e fotografados. Para a análise cladística foi feita uma matriz de dados com 35 táxons e 39 caracteres no programa Mesquite, a matriz foi rodada no programa TNT e o cladograma foi editado no programa WinClada. A máxima parcimônia foi usada para rodar a análise cladística. Foi utilizado à pesagem implícita
(k=2 à k=6) para diminuir o número de árvores finais. Para verificar os valores dos índices de suporte dos clados foi utilizado o suporte de bremer relativo, e o método symmetric resampling. A análise sem pesagem implícita resultou em 73 árvores com 78 passos, índice de consistência 57 e índice de retenção 89. Para a análise com pesagem implícita (k=2 à k=6) foram encontradas 37 árvores com 76 passos, índice de consistência 59 e retenção 90. A topologia das árvores com e sem pesagem foi semelhante. Essas árvores mostraram suporte alto para Hypoxys e o grupo-alvo, tanto no bremer relativo, quanto no symmetric resampling. Os resultados corroboram o clado Hypoxys como monofilético, este sendo formado por três grandes grupos, que compartilham três sinapomorfias. O grupo-alvo deste trabalho também é monofilético, sendo suportado por 7 sinapomorfias e 3 homoplasias sinapomórficas. Esse grupo é facilmente diagnosticado por: faixa na região posterior do pronoto hialina, marrom, se estendendo até a margem posterior do pronoto. Conexivo sem mancha. Dois pares de manchas circulares e escuras na parte ventral do tórax envoltas por um anel esverdeado. Região ventral uniformente verde com uma coloração amarelada central no abdômen. Manchas escuras e circulares junto às pseudosuturas. Presença de uma aba na região ventro-lateral do proctiger. Expansões do bordo ventral túmidas. Margem posterior dos gonocoxitos 8 projetada posteriormente.

Contexto: O avanço das atividades antrópicas sobre a fronteira amazônica tem provocado um intenso processo de fragmentação florestal que reduz a biodiversidade e submete as espécies a uma situação de alta vulnerabilidade. Objetivos: Testar em múltiplas escalas espaciais a relação do tamanho do fragmento, isolamento e caracterização da matriz de fragmentos florestais, sobre a riqueza de anfíbios da ordem Anura, répteis da ordem Squamata e mamíferos de pequeno, médio e grande porte. Métodos: O estudo foi realizado em 12 fragmentos no nordeste da Amazônia. O tamanho do fragmento foi calculado em hectares, o isolamento em ENN_MN (média da distância euclidiana dos vizinhos mais próximos) e a matriz foi organizada em categorias. Essas métricas de paisagem foram consideradas como variáveis explicativas e calculadas em três escalas espaciais: 1, 2 e 3 km. Avaliamos a relação das métricas com a riqueza de vertebrados terrestres através de regressões múltiplas com seleção de modelos. Resultados: Registramos 130 espécies de vertebrados terrestres. Não houve efeito significativo do tamanho do fragmento nas escalas espaciais para nenhum grupo de espécies. O isolamento se mostrou significativo apenas na escala de 3 Km para o grupo de espécies de anfíbios e serpentes. A categoria de áreas abertas na matriz foi significativa nas três escalas espaciais para o grupo de espécies de lagartos e de mamíferos de médio e grande porte. Conclusões: A configuração da paisagem é extremamente importante no contexto de fragmentação, houve respostas diferentes dos grupos taxonômicos, possivelmente devido às diferenças quanto ao uso do habitat.

O estado do Maranhão localiza-se entre o leste da Amazônia e o norte do Cerrado, apresentando uma grande variedade de ambientes em sua área ecotonal. Devido a esta heterogeneidade ambiental, o Maranhão possui uma das mais ricas avifauna do Brasil. Contudo toda esta riqueza também está situada entre as províncias biogeográficas mais ameaçadas do mundo. Com o intuito de contribuir para o conhecimento e conservação da avifauna nesta região, este estudo teve como principais objetivos nos seguintes capítulos: 1) a revisão e atualização da lista de espécies de aves do maranhão, buscando identificar lacunas ainda existentes no Maranhão; 2) testar a efetividade do sistema de Áreas protegidas (APs) e Terras Indígenas (TIs) do Estado na proteção de espécies de aves ameaçadas e endêmicas, utilizando SDMs e; 3) avaliar os potenciais impactos das alterações climáticas na distribuição e conservação de 24 táxons de aves ameaçados que ocorrem no Estado, comparando as distribuições atuais e futuras previstas (2070) com o atual sistema de reservas, buscando identificar áreas potencialmente mais estáveis que podem servir como corredores de dispersão das espécies. No capítulo 1) registramos a ocorrência de 750 espécies de aves, distribuídas em 88 famílias e 30 ordens. Assim, adicionamos 114 espécies novas (95 residentes, 13 migratórias e 6 vagantes) à lista reportada 27 anos para a mesma região. No capítulo 2) observamos que táxons com distribuições mais amplos são potencialmente tão protegidos quanto os táxons com distribuições menores e APs maiores são mais eficientes que APs menores. No entanto, as APs do Cerrado são na sua maioria mal alocadas. Sugerimos seis áreas prioritárias para conservação de aves neotropicais e  destacamos a importância das terras indígenas na conservação da biodiversidade neotropical. No capítulo 3) nossos resultados indicaram que, embora os táxons ameaçados da Amazônia e do Cerrado estejam potencialmente protegidos, em ambos os cenários presente e futuro, a maioria dos táxons provavelmente apresentará declínios drásticos em seu tamanho e até mesmo a previsão de extinção global no futuro próximo. Destacamos a possibilidade de criação de um sistema de corredores de dispersão que interliguem APs nesta região, bem como a implementação de políticas públicas para manutenção e mitigação das áreas adjacentes a esses corredores, visando a conservação da riqueza e diversidade de espécies nessa região.

O táxon Oniscidea (ordem Isopoda) foi criado por Latreille em 1802. A partir de Schmalfuss
(1989), o monofiletismo de Oniscidea foi aceito, com base nos caracteres comuns a todos os
Oniscidea. A família Dubioniscidae foi instituída por Schultz para incluir os gêneros
Dubioniscus Vandel, 1963, Calycuoniscus Collinge, 1915 e Phalloniscus Budde-Lund, 1908,
anteriormente alocados na família Bathytropidae, além do gênero Novamundoniscus Schultz,
1995, criado para abrigar as espécies das Américas previamente incluídas em Phalloniscus.
Schultz (1995) argumenta que as espécies pertencentes ao gênero Phalloniscus do novo mundo
são, em muitos aspectos, diferentes da espécie-tipo e demais membros do gênero, encontradas,
sobretudo, na Nova-Zelândia. Assim, baseado em caracteres compartilhados pelas espécies
americanas, Schultz (1995) definiu Novamundoniscus. Seis espécies anteriormente
classificadas em Phalloniscus foram transferidas para o novo gênero e N. vandeli (Lemos de
Castro 1959) foi definida como a espécie-tipo. Mas, Schultz não transferiu todas as espécies
de Phalloniscus do novo mundo para Novamundoniscus. Outras duas espécies foram descritas,
N. gracilis Lopes & Araujo, 2003 e N. altamiranesis Campos-Filho, Araujo & Taiti, 2014.
Lopes & Araujo (2003) também transferiram P. meridionalis para Novamundoniscus,
totalizando nove espécies. No entanto, alguns Phalloniscus do novo mundo não foram
realocados e precisam ser revisados. O presente estudo teve, por objetivo, testar a hipótese de
monofiletismo do gênero, estabelecendo relações de parentesco entre seus integrantes, com
base em dados morfológicos. Elaborar uma hipótese de relacionamento filogenético entre
Novamundoniscus e os demais gêneros de Dubioniscidae. Revisar Novamundoniscus,
redescrevendo espécies conhecidas e descrevendo eventuais espécies novas. Ao todo, 18
espécies de Dubioniscus, Novamundoniscus e Phalloniscus foram analisadas e uma matriz com
73 caracteres foi gerada. A árvore final revelou o monofiletismo de Dubioniscidae, mas a
inclusão de terminais adicionais torna-se necessária para confirmar as relações entre as
espécies que compõem Novamundoniscus, que se revelou um clado parafilético no presente
estudo. Os resultados da analise filogenética aqui apresentada são considerados provisórios, e
como tal, as implicações taxonômicas da topologia discutida não foram adotadas na revisão de
Novamundoniscus. Contudo, as otimizações dos caracteres nesta topologia fornecem
conclusões importantes para o entendimento da história evolutiva dos táxons analisados e a
matriz de caracteres proporciona uma base sólida para a continuidade desta linha de pesquisa.

Os ecossistemas lóticos amazônicos são sistemas complexos e dinâmicos, com uma extensa variação espacial e ambiental entre eles. Entender como as espécies aquáticas estão distribuídas é essencial para pensar em planos ou projetos de conservação desse bioma, fazendo-se necessária a tentativa de elucidar como tais condições afetam a distribuição dos organismos em resposta à especificidade de habitat e dispersão das espécies sob diferentes escalas. Diante desse cenário, esta tese teve o objetivo geral de avaliar como os fatores ambientais e espaciais estruturam as comunidades de percevejos semiaquáticos (Hemiptera) em riachos amazônicos. Para isso, dividimos a tese em três capítulos. No primeiro, avaliamos os fatores determinantes da estruturação das metacomunidades, considerando fatores ambientais, estrutura espacial linear e fluvial dentro de uma bacia de drenagem. Observamos que o efeito do ambiente teve maior influência sobre a estrutura da metacomunidade e somente fatores relacionados a dispersão via fluvial foram importantes para esses organismos. Assim, em escala de bacia hidrográfica, a estrutura da metacomunidade foi estruturada principalmente por species sorting sendo que mass effects pode atuar sobre a dispersão em escalas menores dentro da rede hidrográfica. No segundo capítulo analisamos os padrões de metacomunidades de percevejos semiaquáticos entre diferentes áreas biogeográficas da região amazônica. Em escala biogeográfica, encontramos que a limitação da variação das comunidades através do espaço foi determinante na estruturação da diversidade das comunidades. Esses resultados mostraram que ocorre alto turnover dentro das eco-regiões avaliadas devido à heterogeneidade ambiental. Além disso, a diversidade beta entre diferentes áreas biogeográficas da região amazônica evidenciou um padrão geral de decaimento da similaridade em decorrência das distâncias ambientais e espaciais. No terceiro capítulo, desconstruímos as comunidades de percevejos em assembleias de organismos ápteros e alados para avaliação da alteração do ambiente em áreas com alteração antrópica. Demonstramos que a composição das assembleias com espécies aladas difere da composição total da comunidade de percevejos, contudo, assembleias de ápteros e alados mostraram respostas associadas à perda de diversidade causada por atividade antrópica. Entretanto, as variáveis ambientais que estruturam essas assembleias foram diferentes, indicando que ocorre um trade-off entre reprodução (ápteros) e dispersão (alados) para o alcance do fitness dessas populações. Destacamos que características do habitat aquático em escala local, e a conectividade fluvial entre habitats são os principais determinantes na estruturação das comunidades desses organismos em escala de bacia hidrográfica. Considerando escalas biogeográficas, a limitação da dispersão através do espaço foi o principal fator na estrutura das comunidades, contudo, a diversidade beta entre regiões mostrou também ser dependente de fatores locais. Consideramos que a especificidade desses organismos em viver na superfície da água, além de mostrar forte relação com esse habitat, também evidencia que a locomoção sobre a superfície da água é o principal mecanismo a dispersão desses organismos na rede hidrográfica. Além disso, processos que determinaram os padrões de diversidade das comunidades atua em escalas locais até biogeográficas. Contudo, destacamos que avanços dos impactos de atividades antrópicas na Amazônia podem também interferir nesses processos e atuar sobre a distribuição das espécies entre os ecossistemas lóticos da região.

Polistinae é uma das mais diversas subfamílias de Vespidae com cerca de 950 espécies, 25 gêneros e quatro tribos. Seus representantes são reconhecidos por apresentarem garras tarsais simples e ausência de paratégula. Ducke (1905) descreveu dois novos gêneros para Polistinae: Protopolybia e Pseudochartergus. Bequaert (1938) revisou Pseudochartergus reconhecendo somente duas espécies. Bequaert (1944a) realizou a primeira revisão de Protopolybia, na qual descreveu quatro espécies novas, considerou P. minutissima e P. sedula como formas de uma única espécie e definiu P. bella como espécie tipo do gênero. Richards (1978) fez a segunda revisão de Protopolybia e o gênero passou a compreender 23 espécies e duas subespécies. Por considerar inconsistentes os caracteres diagnósticos de Pseudochartergus e Protopolybia, Carpenter e Wenzel (1989) propuseram sua sinonímia, reconhecendo como caráter diagnóstico a presença de um processo posterior medial no metanoto. Carpenter (2011) propôs a sinonímia de quatro espécies do gênero. Santos-Junior et al. (2015) revisaram o grupo de Protopolybia exigua e usando caracteres morfológicos propuseram a primeira filogenia para Protopolybia sensu Carpenter & Wenzel (1989). Contudo, ainda existe um razoável número de espécies cuja identificação é imprecisa. Assim, esse projeto buscou ampliar o conhecimento sobre a taxonomia e o relacionamento filogenético das espécies de Protopolybia através de uma revisão e elaboração de uma filogenia usando caracteres morfológicos e moleculares. Para análise molecular foram isolados os fragmentos do genoma nuclear e mitocondrial - citocromo subunidade I (COI), 28s, 12s e 16s, contudo apenas o primeiro e ultimo foram utilizados. Como resultados têm-se notas adicionais para o grupo de Protopolybia exigua, assim como a descrição de uma nova espécie. Para o grupo de espécies P. sedula, todas as espécies são redescritas, uma nova chave de identificação é apresentada e as genitálias de P. weyrauchi e P. sedula são descritas. No grupo de espécies de P. picteti-emortualis, duas novas espécies são descritas. No grupo de espécies de P. chartergoides, propõe-se a sinonimização de uma subespécie, e redescreve-se as quatro espécies válidas, bem como a genitália masculina de P. chartergoides, P. fuscatus e P. pallidibalteatus. Quanto à filogenia de Protopolybia, a hipótese de monofilia do grupo de espécies de P. chartergoides é corroborada. A sua posição relativa dentro de Protopolybia é resolvida, com indicação de uma relação mais estreita com o grupo de P. sedula. Por outro lado, na presente análise o grupo de P. exigua resulta parafilético.

O cultivo de palma de dendê na Amazônia vem crescendo exponencialmente nos últimos anos, alterando as características naturais da paisagem e constituindo uma possível ameaça à biodiversidade. As alterações provocadas se estendem aos ecossistemas aquáticos, que por serem altamente relacionados com a vegetação adjacente, também sofrem os impactos decorrente dessa prática agrícola, como alterações na estrutura do habitat, afetando a distribuição das espécies e afetando os processos ecossistêmicos. Com isso, estudos que avaliam o impacto dessa monocultura na Amazônia são fundamentais para subsidiar estratégias mais eficientes para a redução dos impactos e manutenção da biodiversidade. Sendo assim, esta tese busca responder as seguintes perguntas: 1) Quais as diferenças entre riachos que drenam plantações de palma de dendê e fragmentos florestais quanto as estruturas do hábitat e das assembleias de peixes? 2) Quais os efeitos da substituição da floresta primária na paisagem por palma de dendê na estrutura física do habitat, bem como na diversidade taxonômica de peixes de riachos neotropicais? 3) Como os padrões de diversidade, taxonômico e funcional, das assembleias de peixes de riachos amazônicos respondem às alterações ambientais, do habitat e da paisagem, provocadas pela monoculttua de palma de dendê? Para responder essas questões foram amostrados e analisados 39 riachos na Amazônia Oriental. Para a caracterização do habitat foi aplicado um extenso protocolo da avaliação, gerando 238 variáveis ambientais do habitat, além da utilização de características da paisagem baseada na porcentagem de usos de solo adjacente aos riachos. Para a coleta dos peixes utilizou-se rede de mão pelo período de seis horas em cada riacho. Foram tomadas medidas morfológicas e informações ecológicas das espécies coletadas para posterior cálculo dos atributos funcionais referentes ao terceiro capítulo. Com os resultados obtidos, verificou-se que as monoculturas de palma de dendê afeta a estrutura do habitat de riachos, modificando principalmente a morfologia do canal, a estrutura do substrato e a oferta de micro-habitat, como presença de madeiras e raízes, para a ictiofuana. Consequentemente, a distribuição das espécies de peixes foi afetada, resultando em mudanças na estrutura das assembleias de peixes. Por outro lado, não foram registradas alterações na estrutura funcional dessas assembleias. Por fim, evidenciamos que a palma de dendê modifica as características naturais do habitat de riachos, bem como a distribuição das espécies, no entanto a estrutura funcional das assembleias de peixes nos riachos é mantida.

Phylloscartes virescens é uma ave de pequeno porte, com plumagem olivácea, que habita dosséis e bordas de mata. É uma espécie pouco estudada, pouco coletada devido à sua raridade e cujas relações de parentesco são bastante incertas. Até bem recentemente era tida como endêmica do escudo das Guianas, no norte da Amazônia, mas novos registros atribuídos à espécie foram realizados no centro de endemismo Belém (situado ao sul do rio Amazonas). O presente estudo utilizou o gene mitocondrial NADH dehidrogenase subunidade 2 (ND2) e os genes nucleares do receptor muscular específico de tirosina-kinase íntron 3 (MUSK) e do beta-fibrinogênio íntron 5 (βf5), possibilitando não só a Inferência Bayesiana das relações filogeográficas em P. virescens, mas também entre algumas espécies do gênero Phylloscartes (representado por P. ventralis, P. roquettei e P. ceciliae), que também é pouco estudado e pouco compreendido. Além disso, foram feitas análises morfológicas, quantificada a diferença genética e analisada a diversidade genética existente nas populações de P. virescens dos centros de endemismo Guiana e Belém. A filogenia estimada obteve um bom apoio para o monofiletismo de P. virescens e indicou a formação de dois clados distintos, condizentes com os centros de endemismo Guiana e Belém. As redes de haplótipos demonstraram a ausência de compartilhamento de haplótipos entre as diferentes populações da espécie, o que corrobora com a filogenia, mas destoa dos resultados obtidos em relação à distância genética p não-corrigida e análises morfológicas, onde não foram encontradas diferenças significativas entre as populações. Os resultados obtidos indicam uma ausência de caracteres morfológicos diagnósticos entre as populações de P. virescens dos centros de endemismo Guiana e Belém, que são separadas por uma baixa distância genética relativa àquela que separa outras espécies próximas do gênero - como, por exemplo Phylloscartes roquettei e Phylloscartes ceciliae, recuperadas como irmãs na filogenia. Esses resultados em conjunto indicam uma divergência bem recente entre as populações de P. virescens separadas pelo Rio Amazonas, o que contrasta com outros estudos com aves que recuperaram distâncias genéticas bem maiores separando populações em margens opostas deste rio.

As interações biológicas têm um papel importante na regulação e manutenção das populações naturais. Assim como a maioria destas interações, o parasitismo pode ser influenciado pelo ambiente, com as mudanças causadas pelas atividades antrópicas podem afetar profundamente o equilíbrio das assembleias dos organismos hospedeiros. Diante disto, nosso trabalho procurou descrever, verificar a composição e riqueza dos hemoparasitos de anuros presentes em dois ambientes, inseridos no Bioma Amazônico, no leste do Pará, Brasil. Caracterizamos os grupos de hemoparasitos mais frequentes, e se o tipo de infecção hemoparasitária está relacionada com hábitat do anuro (arborícola ou terrestre). Coletamos 128 anuros nos dois ambientes, em duas expedições realizadas nos períodos de abril de 2016 e 2017, que correspondem a estação de chuva na região. No laboratório foram realizados esfregaços sanguíneos e imprint do fígado para identificação do parasito. No total foram registrados sete táxons distintos de hemoparasitos em 55 indivíduos (43%). Nas áreas de plantação haviam mais espécimes infectados e com infecções mistas que em áreas de floresta. Tripanossoma foi o parasito mais frequente, ocorrendo em 67% dos anuros infectados nos dois ambientes, com a identificação de seis grupos morfológicos distintos, encontrados principalmente em anuros terrestres. Foram identificados dois grupos distintos de Hemogregarinas em seis espécimes de anuros mais parasitados, encontradas principalmente nos de habito terrestre. Registramos a presença de um parasito do Filo Apicomplexa não identificado em espécimes de Trachycephalus typhonius, que provavelmente se trata de um táxon novo e será estudado a posteriori.

Alopoglossidae é uma família de lagartos neotropicais composta por 22 espécies alocadas em dois gêneros (Alopoglossus e Ptychoglossus). Existe um vácuo no conhecimento sobre as relações filogenéticas e a sistemática desta família. As filogenias publicadas que incluem espécies de alopoglossídeos tiveram o objetivo de gerar uma hipótese das relações em grupos maiores (i. e., Gymnophthalmoidea), por isso têm uma amostragem taxonómica baixa dentro da família e geralmente são baseadas em amostragem limitada de caracteres. Considerando estas limitações, esta tese tem como objetivo inferir a relação filogenética de Alopoglossida—incluindo todas as espécies da família—com uma análise combinada de sequências de DNA e caracteres morfológicos. Os genes utilizados foram mitocondriais (12S, 16S e ND4), o nucleares (C-mos) e uma matriz de 143 caracteres fenotípicos da escamação, morfologia da língua, morfologia dos hemipênis e osteologia. Os dados foram analisados seguindo critérios de otimização de Máxima Parcimónia, executando três esquemas de pesagem alternativos Ponderação Implícita Extendida e uma busca com pesos iguais. As topologias geradas foram comparadas em uma análise de sensibilidade. A topologia preferida mostra a parafilia do gênero Ptychoglossus. Ptychoglossus vallensis e Ptychoglossus billineatus estão relacionados com Alopoglossus, as espécies centro- americanas Ptychoglossus plicatus e Ptychoglossus myersi formam o clado irmão de Ptychoglossus e Alopoglossus e finalmente Ptychoglossus danieli e Ptychoglossus kugleri foram recuperados como o grupo irmão de todos os outros alopoglossídeos. Em consequência, consideramos que Ptychoglossus é um sinônimo de Alopoglossus. Além disso, descrevemos uma espécie de Alopoglossus, da região do Pacífico da Colômbia. Este artigo foi publicado na revista South American Journal of Herpetology.

Os efeitos da degradação ambiental resultantes dos diferentes usos da terra, como a conversão das florestas em monoculturas, pastagem, mineração e extração madeireira, são as principais causas do declínio da fauna na região Neotropical. Neste sentido, no presente estudo investigamos a resposta da anurofauna frente a degradação ambiental a luz da diversidade funcional. Um banco de dados foi utilizado de pesquisa realizada em um mosaico de paisagens antropogênicas em área de ecótono Amazônia-Cerrado, incluindo uma grande matriz de monocultura de soja.Foi estimada a diversidade funcional para cada unidade amostral de cinco fitofisionomias diferentes, com o auxílio do índice Mean Pairwise Distance, e testada entre as fitofisionomias através de uma Análise de Variância. Utilizamos os Modelos Nulos para avaliar se as assembléias de anuros em cada fitofisionomia foram estruturadas por filtros bióticos ou abióticos (SES- MPD). A distribuição das fitofisionomias em relação às variáveis ambientais foi amostrada através de uma PCA. A diversidade funcional diferiu entre as cinco fitofisionomias amostradas, com maiores valores nas áreas de floresta de galeria preservada. Em áreas preservadas os valores de diversidade funcional foram maiores que o esperado ao acaso, indicando dispersão funcional. Áreas degradadas em conjunto apresentaram diversidade funcional igual ao que se esperaria ao acaso. Os traços funcionais em ambientes preservados e degradados foram mais relacionados às características reprodutivas das espécies do que ao período de atividade e microhábitat principal dos anurosadultos. A diversidade funcional registrada nos ambientes degradados foi associada a simplificação dos hábitats, quando comparados aos ambientes florestais, mostrando que a substituição das áreas de floresta para monocultura e as áreas próximas pode alterar a diversidade de funcional das espécies e consequentemente as funções ecossistêmicas.

Uma das hipóteses mais discutidas para explicar a origem de uma biota amazônica tão rica, é a hipótese dos "rios como barreira", referindo-se à atuação dos principais rios amazônicos como barreira promotora do isolamento e diversificação das espécies. Utilizamos abordagem de filogeografia estatística para estudar a espécie de Myrmoderus ferrugineus, espécie amazônica endêmica de florestas terra-firme com duas subespécies morfologicamente pouco diferenciadas e separadas pelo rio Amazonas (M. f. ferrugineus e M f. elutus). Usamos dados filogeográficos para abordar os cenários de diversificação em M. ferrugineus: 1) o rio Amazonas não coincide com as grandes rupturas filogeográficas que separaram as populações de M. ferrugineus; 2) o rio Amazonas está correlacionado com a antiga estruturação filogeográfica dentro de M. ferrugineus, provavelmente resultante do estabelecimento do rio durante o Plio-Pleistoceno ou antes disso; e 3) o rio Amazonas correlaciona-se com uma divergência recente entre as populações de M. ferrugineus, provavelmente devido à dispersão e isolamento recente após o estabelecimento do rio durante o Plio-Pleistoceno. Sequenciamos dois genes mitocondriais e dois genes nucleares de 13 indivíduos de M. f. ferrugineus e 15 indivíduos de M. f. elutus para estimar filogenias concatenadas e multilocus coalescentes temporalmente calibradas. Testamos a ocorrência de bottlenecks na população passada, fluxo gênico e flutuações no tamanho efetivo populacional em M. f. ferrugineus e M. f. elutus. Nossos resultados recuperaram com um forte apoio estatístico para monofilia entre M. f. ferrugineus e M. f. elutus, seguido de forte estruturação populacional e ausência de fluxo gênico as subespécies. Porém, segundo os dois métodos independentes de datação coalescente, M. f. ferrugineus e M. f. elutus divergiram entre 2,5 e 75.000 anos atrás, bem depois do estabelecimento moderno para o rio Amazonas. Nossos resultados demonstraram que até mesmo táxons de florestas de terra firme com baixas habilidades de dispersão, como os Papa-formigas, foram capazes de estabelecer populações através do rio Amazonas depois de seu curso moderno ter se estabelecido. Se esse evento foi causado por dispersão ativa ou passiva mediada por eventos de captura de drenagem permanecem por incertos, embora o segundo cenário seja mais provável, considerando os atributos ecológicos da espécie. Antecipamos que eventos importantes de captura de drenagem envolvendo o curso médio do rio Amazonas poderiam ter ocorrido entre o Pleistoceno tardio até o Holoceno recente, favorecendo o cruzamento de várias linhagens previamente isoladas em bancos de rios opostos.

As modificações estruturais e a perda de complexidade ambiental sofridas pelos habitats nativos, a partir das atividades antrópicas que assolam a Floresta Amazônica, têm alterado a dinâmica dos ecossistemas e impactado fortemente a biodiversidade da região. Os mamíferos tem sido alvo dos impactos antrópicos na Amazônia e como consequência, muitas espécies estão incluídas em listas de espécies ameaçadas nacionais ou internacionais, sob algum tipo de ameaça. Trabalhamos com mamíferos terrestres ameaçados, Myrmecophaga tridactyla (Tamanduá bandeira), Priodontes maximus (Tatu canastra), Tapirus terrestres (Anta) e Tayassu Pecari (Queixada), classificadas como “Vulneráveis” nas listas de espécies ameaçadas nacional e internacional. Através do uso de armadilhas fotográficas avaliamos como as espécies respondem às variações nos habitats e impactos humanos, em uma paisagem composta por um mosaico de áreas degradadas. Variáveis que caracterizam e podem dar informação da qualidade do habitat tiveram influência sobre as espécies avaliadas, assim como variáveis de influência antrópica. Nosso estudo claramente reforça a importância de Florestas Primárias degradadas para a conservação de espécies ameaçadas, principalmente em contextos de alta pressão antrópica.

Na região amazônica, embora extensas áreas ainda permaneçam intactas, as taxas de perda de cobertura florestal têm sido bastante elevadas nos últimos 50 anos. O desmatamento se concentra principalmente na Amazônia oriental onde se encontra o chamado “arco do desmatamento”. Junto ao cenário de alto desmatamento, as projeções de mudanças climáticas indicam graves efeitos das ações antrópicas sobre a biodiversidade, principalmente sobre as espécies que dependem da cobertura florestal como os primatas. Quando se trata das espécies endêmicas, a extinção local pode significa a extinção total dessas espécies. Assim, determinar quais áreas são indispensáveis para persistência dos primatas endêmicos da região amazônica mais ameaçada atualmente, é fundamental para evitar a futura extinção de espécies. Dentro deste contexto, ferramentas como modelos de distribuição de espécies e priorização espacial, tem sido adotadas como importantes aliadas nas tomadas de decisões para conservação das espécies. Neste trabalho de pesquisa nos identificamos áreas prioritárias para conservação de primatas da Amazônia oriental, região de alta pressão antrópica que compreende grande parte do “arco do desmatamento amazônico”, apresentando áreas que são importantes atualmente, permanecendo eficientes em um futuro próximo (Ano de 2050). Para isso, geramos modelos de adequabilidade climática das espécies alvo nos cenários presente e futuro (ano de 2050). Destes modelos, foram filtradas as áreas que possuem cobertura florestal em ambos os cenários, visto que os primatas analisados são espécies estritamente florestais. A análise de priorização espacial levou em consideração a adequabilidade climática no cenário futuro, de forma que as regiões mais importantes foram as que permaneceram adequadas a ocorrência das espécies no futuro. Encontramos que grande parte da Amazônia oriental perderá adequabilidade ambiental para a ocorrência das espécies no futuro, sendo o nordeste a região que apresentou maior adequabilidade em todos os cenários. As áreas prioritárias se concentram em regiões de floresta secundária altamente fragmentada ao nordeste da Amazônia oriental.

O sistema de órgãos mecanoreceptores da linha lateral é tipicamente composto por uma série de neuromastos contidos em canais que se conectam via poros e percorrem ossos dérmicos da cabeça. Este sistema é uma modalidade sensorial importante na maioria dos estágios da história de vida dos peixes, pois permite aos organismos detectarem trocas em locais de fluxo de água e campos elétricos fracos. O sistema de canais da linha lateral pode variar significativamente em diferentes espécies de peixes, mesmo em espécies proximamente relacionadas. Tal variabilidade inclui a presença ou ausência de poros e canais, além do número, localização, ramificação e largura dos canais, bem como o número, tamanho e localização dos poros no canal. Callichthyidae é a terceria família mais diversa dentro de Loricarioidea (Siluriformes), alocando 219 espécies válidas, sendo facilmente reconhecidas por possuírem o corpo quase completamente protegido por placas ósseas, basicamente dispostas em duas séries longitudinais. Atualmente, está subdividida em duas subfamílias: Callichthyinae e Corydoradinae e vem sendo utilizados em estudos do sistema da linha lateral desde o século XIX, bem como caracteres referentes a este sistema são utilizados como diagnose entre espécies recentemente descritas. Entretanto, o grupo carece de definições de homologias dos canais e poros do sistema laterossensorial cefálico. O presente trabalho teve como objetivo investigar os caracteres relacionados ao sistema laterossensorial cefálico de Callichthyidae, através da descrição, anatomia comparada entre os táxons e postulações acerca da homologia deste sistema, a fim de reconstruir os caracteres dentro do grupo em uma análise de matriz combinada de dados morfológicos e moleculares. Além disto, foi realizada uma revisão e redefinição da nomenclatura anatômica utilizada referente aos canais e poros laterossensorais na família. Neste estudo, foram avaliados 31 caracteres e 4 sinapomorfias foram propostas para Callichthyidae, bem como outras sinapomorfias foram encontradas para suas respectivas linhagens, evidenciando a importância da investigação de caracteres de complexos morfológicos. O presente estudo mostra também que uma vez combinados com demais conjuntos morfológicos, estes trazem maior consistência e resolução tanto em um contexto filogenético quanto taxonômico.

A retirada ou morte da rainha fisogástrica (ou poedeira) pode implicar na desorganização comportamental das operárias de abelhas eusociais, que podem assumir diversas estratégias reprodutivas e comportamentais. Para as operárias a longevidade está relacionada ao esforço fisiológico desempenhado durante sua vida, mas as condições internas da colônia também afetam a longevidade, como a presença ou ausência de rainha. Nesse sentido, o objetivo do trabalho foi estudar o comportamento e a longevidade da população de operárias de abelhas sem ferrão em colônias órfãs, comparando-as com colônias com rainha poedeira presente. Para isso, foram utilizadas oito colônias de Scaptotrigona aff. postica, sendo quatro colônias com rainha e quatro sem rainha. Cada colônia teve o total de 1.200 operárias marcadas com cores diferentes por dia de nascimento (idade zero), obtendo assim grupos de idade. Durante 100 dias observamos a taxa de forrageio colonial, a idade das operárias que participavam da construção de células de cria, a idade de forrageio e a longevidade em todas as colônias. Ao longo do tempo de orfandade, em ambas as condições das colônias (com rainha e sem rainha), a taxa de forrageio foi decrescente; entretanto, as colônias sem rainha apresentaram uma maior redução na taxa de forrageamento (Qui-quadrado: x 2 = 48.874; Gl = 1; p &lt; 0.001). Em colônias órfãs observamos que ao longo do tempo, além das operárias jovens, as operárias mais velhas também constroem células de cria; já em colônias com rainha a idade das operárias que participam da construção de células de cria é constantemente jovem (Qui-quadrado: x 2 = 116.11; Gl = 1; p &lt; 0.001). Em colônias com rainha a idade das forrageiras é constante ao longo do tempo, já em colônias sem rainha observamos forrageiras com idades muito avançadas (Qui- quadrado: x 2 = 66.546; Gl = 1; p &lt; 0.001). A longevidade máxima encontrada para operárias de colônias com rainha foi de 54 dias de idade e para as operárias órfãs foi de 79 dias de idade. As curvas de sobrevivência de Kaplan-Meier indicaram diferenças significativas entre colônias com rainha e sem rainha (teste log-rank; p &lt; 0.001). Dessa forma, concluímos que (1) operárias de Scaptotrigona aff. postica em colônias sem rainha realmente diminuem a atividade externa ao longo do tempo; (2) as operárias órfãs de idade avançada continuam realizando trabalho de construção de célula de cria, provavelmente, para tentar reproduzir machos; (3) é possível que as operárias de ninhos sem rainha passem a evitar o trabalho arriscado e realizem apenas forrageio eventualmente ou elas tendem a transitar para essa fase mais tarde; (4) o comportamento egoísta de se reproduzir, evitando o forrageamento e seus riscos e, assim, permanecendo mais tempo dentro da colônia pode prolongar a longevidade das operárias de S. aff. postica em colônias órfãs.

A família Teiidae está dividida em duas subfamílias: Teiinae e Tupinambinae. A subfamília Tupinambinae inclui cinco gêneros: Callopistes, Crocodilurus, Dracaena, Salvator e Tupinambis, com distribuição na América do Sul. O monofiletismo de Tupinambinae é sustentando por caracteres morfológicos e moleculares, porém as relações entre seus membros ainda necessitam ser esclarecidas. Tupinambis é o gênero mais diversificado da subfamília, e sua taxonomia tem sofrido alterações, sendo que na última revisão realizada com Teiidae, Tupinambis foi dividido em dois: Tupinambis (T. teguixin, T. longilineus, T. quadrilineatus, T. palustris) e Salvator (S. merianae, S. rufescens e S. duseni). Recentemente, quatro clados distintos foram identificados em T. teguixin, ocasionando a descrição de três novas espécies. Assim, Tupinambis inclui atualmente sete espécies: T. cryptus, T. cuzcoensis, T. longilineus, T. palustris, T. quadrilineatus, T. teguixin e T. zuliensis. O presente estudo teve como objetivo propor uma hipótese filogenética para Tupinambinae com base em caracteres morfológicos e moleculares, assim como revisar Tupinambis, definindo as espécies que compõem o gênero. Esta tese está dividida em quatro capítulos. No primeiro, “A New Species of Tupinambis Daudin, 1802 (Squamata: Teiidae) from Central South America”, foram analisados 745 espécimes, incluindo os tipos de todas as espécies atualmente reconhecidas. O padrão de coloração, dados de morfologia externa, morfologia do hemipênis e língua separam a nova espécie de seus congêneres. No segundo capítulo, “Morphology of the tongue and hemipenis of the lizard subfamily Tupinambinae (Squamata, Teiidae)”, fornecemos a descrição comparada da morfologia do hemipênis (n=33) e da língua (n=14) de nove espécies de Tupinambinae: C. amazonicus, D. guianensis, S. duseni, S. merianae, Tupinambis cuzcoensis, T. longilineus, T. quadrilineatus, T. palustris e T. teguixin. Espécies de Teiinae e de Gymnophtalmidae também foram examinados para comparações. Em geral, os hemipênis de Tupinambinae são alongados e clavados, com lóbulos curtos, com uma pequena crista na bifurcação do sulco. A face sulcada é lisa, com uma placa de expansão separando o sulco das lâminas proximais, distais e laterais. Há uma placa de expansão na face não sulcada, separando medialmente as lâminas distais e proximais. Já a língua é alongada e profundamente bifurcada, coberta dorsalmente e lateralmente por papilas, semelhantes a escamas. Uma área triangular espessa no centro da placa de expansão da face não sulcada do hemipênis pode representar uma característica única de Tupinambinae, assim como um maior número de plicas infralinguais, e os gêneros diferem principalmente na forma e ornamentação desses órgãos. No terceiro capítulo, “Taxonomy of Tupinambis Daudin, 1802 (Squamata, Teiidae, Tupinambinae)”, analisamos 462 espécimes de todas as espécies atualmente reconhecidas para o gênero, representando quase toda sua distribuição geográfica. Nossos resultados apoiam o reconhecimento de oito espécies, e para cada uma delas foi feita uma diagnose, análise da variação dos caracteres morfológicos, mapas de distribuição e uma lista sinonímica detalhada com base no exame extensivo da literatura e dos tipos examinados. Apresentamos também uma chave dicotômica para a identificação das espécies. No quarto capítulo, “A combined morphological and molecular phylogeny of the subfamily Tupinambinae (Squamata, Teiidae)”, foram realizadas análises filogenéticas de parcimônia, baseada em 198 caracteres morfológicos (morfologia externa, padrão de cor, crânio, hemipênis e língua) e quatro genes mitocondriais (Citocromo b, ND4, 12S and 16S). Tanto a análise com dados morfológicos, quanto a análise com dados combinados, resultou cada um em uma única árvore mais parcimoniosa. Recuperamos o monofiletismo de Tupinambinae, assim como dos gêneros Salvator e Tupinambis. Callopistes aparece como grupo irmão dos demais gêneros que compõem a subfamília. Apesar de encontrarmos uma relação de grupo irmão entre Dracaena e Salvator, os valores de suporte foram baixos.

Nos últimos anos, o desenvolvimento econômico crescente tem promovido altas taxas de
desmatamento e mudanças no uso da terra, que impactam negativamente os ecossistemas terrestres
e aquáticos ao redor do mundo. Visando isto, este trabalho teve como objetivo avaliar como a
diversidade taxonômica e funcional das assembleias de peixes responde aos impactos causados
pelas áreas de pastagem em riachos na Amazônia Oriental. Buscou-se responder as seguintes
perguntas: (i) Qual o efeito da pastagem sobre as características ambientais dos riachos? (ii) Como
elas afetam a riqueza e a composição taxonômica e funcional da ictiofauna? e (iii) Quais atributos
funcionais específicos estarão relacionados às variáveis ambientais que caracterizam os riachos
que drenam áreas de pastagem e floresta? As coletas foram realizadas entre os anos de 2012 e
2015, no período de seca, com 13 riachos em áreas florestadas e 13 riachos em áreas de pastagem.
As variáveis ambientais positivamente correlacionadas às áreas de pastagem foram, abrigos
formados por estruturas artificiais e corredeiras. Já em riachos de floresta, a cobertura de dossel
(árvores grandes) foi a única variável ambiental positivamente correlacionada com essas áreas. Foi
constatado que a pastagem afeta a diversidade taxonômica e funcional da ictiofauna e que quanto
maior a cobertura de dossel formada por árvores grandes, maior a ocorrência de espécies
bentônicas, ou seja, que apresentam associação ao fundo. O avanço econômico tem promovido
altas taxas de desmatamento para instauração de pastagens e isso está ocasionando modificações
no hábitat e, por consequência, está alterando a estrutura taxonômica e funcional das comunidades
de peixes.

O Brasil continua no posto de país detentor das maiores taxas anuais de conversão de ambientes naturais do globo terrestre, refletindo em consequencias nefastas na distribuição e abundância de suas espécies florestais. A bacia amazônica detém parcela significativa destes indicadores de conversão florestal, acumulando em suas paisagens o fenômeno conhecido como Alterações da Paisagem. Do ponto de vista das comunidades naturais, alterações na paisagem costumam resultar na redução da área e no isolamento de machas de habitat adequados para sua existência, inseridos em uma matriz não-favorável de cobertura antrópica. O paradigma atual da conservação entende que é neste tipo de paisagem que reside o futuro da conservação da biodiversidade, e o caminho para este fim envolve a descrição de padrões que nos ajudem a elucidar os mecanismos de sua manutenção. O grupo dos morcegos (ordem Chiroptera) são interessantes modelos para este tipo de estudo, representam um grupo de organismos extramente diverso e abundante, além de prestarem inúmeros servições ecológicos aos ecossistemas onde estão inseridos, e assim, foram escolhidos como organismos modelos neste estudo. O objetivo geral deste estudo foi explorar a diversidade ecológica de morcegos da família Phyllostomidae no espaço e no tempo, testando algumas hipóteses sobre como esta diversidade responde às alterações decorrentes de ações antrópicas em paisagens da Amazônia oriental. A região adotada como área de estudo foi o interflúvio de ocupação mais antiga na Amazônia brasileira, conhecida como Área de Endemismo Belém. Nesta região, monitoramos assembleias de morcegos por um período superior a cinco anos, replicando paisagens ao longo de sua extensão. A presentre tese está organizada na forma de manuscritos independentes, que buscaram, responder questões específicas dentro do tema geral. Foram abordados os temas i) padronização metodológica para o estudo de morcegos Neotropicais, ii) ocupação de florestas primárias e secundárias por grupos ecológicos de morcegos e iii) Paralelismos entre a diversidade ecológica e a diversidade genética. De forma geral, os resultados obtidos nestes estudos ajudam a uma maior regionalização e padronização do conhecimento acumulado sobre a manutenção da biodiversidade em pasiagens alteradas.

A revisão taxonômica de Ituglanis Costa & Bockmann, bem como a análise sistemática, em um paradigma filogenético, foram feitas e são apresentadas. Seis espécies foram redescritas: Ituglanis amazonicus, I. paraguassuensis, I. parahybae, I. parkoi, I. passensis e I. proops. Quinze espécies foram sinonimizadas: I. agreste é sinônimo júnior de I. paraguassuensis. Ituglanis bambui, I. boticario, I. epikarsticus, I. goya, I. mambai e I. ramiroi são sinônimos júnior de I. passensis. Ituglanis cahyensis é sinônimo júnior de I. parahybae. Ituglanis eichorniarum, I. gracilior, I. guayaberensis, I. herberti, I. metae, I. nebulosus e Trichomycterus gabrieli são sinônimos júnior de I. amazonicus. Seis espécies recém descritas tiveram apenas a diagnose e/ou a distribuição atualizadas: Ituglanis apteryx, I. australis, I. boitata, I. compactus, I. ina e I. macunaima. Trichomycterus payaya foi realocada em Ituglanis (Ituglanis payaya). E Trichomycterus laticeps foi considerada como species inquirenda. Uma filogenia com base 155 caracteres morfológicos (31 contínuos e 124 discretos) apresentou uma topologia de consenso estrito de três árvores mais parcimoniosas. Após a inclusão de Trichomycterus payaya, Ituglanis foi recuperado como monofilético suportado por 12 sinapomorfias, sendo uma delas exclusiva. Uma proposta de relacionamento entre as espécies de Ituglanis é apresentada, (Ituglanis australis((((I. proops (I. boitata (Trichomycterus payaya + I. paraguassuensis)))((I. sp. “Aripuanã” + I. passensis) (I. parkoi (I. sp. “Ribeira”(I. parahybae (I. amazonicus + I. ina + I. compactus (I. macunaima + I. apteryx))))))), onde os terminais mais próximos à base são relacionados às drenagens mais ao Sul da América do Sul, e as espécies mais inclusivas estão distribuídas nas drenagens do Centroeste e Norte da América do Sul

A perturbação e redução de áreas florestadas ocasionam a perda de hábitat de vários organismos, com efeitos que variam de acordo com o grupo ecológico, papel funcional, exigências eco-fisiológicas e capacidade das espécies de utilizar o hábitat. Anfíbios são particularmente sensíveis a perturbações ambientais, especialmente a alterações no microclima (temperatura e umidade do ar) e na disponibilidade de recursos (microhábitats reprodutivos e presas). Os modos reprodutivos de anfíbios variam desde os mais generalistas, com oviposição diretamente na água, até modos reprodutivos mais especializados, em ocos de árvores ou serrapilheira. Do mesmo modo, a dieta varia bastante, tendo espécies que se alimentam de uma grande variedade de invertebrados e espécies que se alimentam de um determinado grupo de presas. No entanto, poucos estudos testaram diferenças na diversidade dos modos reprodutivos e o tipo de dieta das espécies entre ambientes de floresta e paisagens que sofreram algum tipo de alteração. Assim, serão analisados os efeitos da plantação de palmas de dendê sobre: a) a diversidade e abundância de anfíbios anuros em uma área de floresta tropical úmida; b) os efeitos de diferenças microclimáticas e da cobertura de dossel sobre a diversidade de anuros; c) a quantidade e complexidade de modos reprodutivos de anuros; e d) o consumo de presas pelas assembleias de anuros. No município de Tailândia-PA, serão delimitadas 40 parcelas de 2100 m², sendo 20 em áreas de floresta e 20 em áreas de plantação de palmas. Em cada parcela será medida a cobertura de dossel, a temperatura e umidade do ar. Serão feitas procuras visuais e auditivas de anfíbios anuros durante as estações de maior e menor pluviosidade da região. Os modos reprodutivos de cada espécie serão baseados na literatura e/ou identificação em campo, e o grau de complexidade da reprodução será medido através de um índice que irá variar de 0 a 1, onde valores mais próximos de 0 representam reprodução mais simples e valores mais próximos a 1 representam reprodução mais complexa. Para a dieta, será retirado o conteúdo estomacal de cada indivíduo coletado, identificando-se ao menor nível taxonômico possível. É esperado que se encontre nas áreas de floresta maior diversidade de espécies de anfíbios; maior influência das variáveis ambientais sobre a assembleia de anuros na área de plantação de palma; maior variedade de modos reprodutivos, assim como maior amplitude do grau de complexidade reprodutiva; e maior variedade de presas consumidas pelas assembleias nas áreas de floresta.

A família Agromyzidae é composta por mosca fitófagas de grande semelhança morfológica. A terminália masculina é a principal estrutura que auxilia na identificação das espécies. No entanto, a terminália feminina tem sido negligenciada por muitos trabalhos até agora. Neste estudo, foram descritas as terminálias femininas de 27 espécies em 9 gêneros de Agromyzidae (Japanagromyza Sasakawa, Melanagromyza Hendel, Calycomyza Hendel, Galiomyza Spencer, Liriomyza Mik, Nemorimyza Frey, Phytoliriomyza Hendel, Phytomyza Fallén, Pseudonapomyza Hendel) depositados no Museu de Zoologia da Universidade Federal do Pará (UFPA) e na Coleção Entomológica do Museu Paraense Emílio Goeldi (MPEG). Os abdomens das fêmeas foram clareados em KOH 10%, dissecados e a terminália feminina foi desenhada utilizando um microscópio acoplado a uma câmara lucida. O formato do nono esternito abdominal, das espermatecas e o número de setas marginais foram importantes características para a identificação das espécies. O formato e comprimento do guia de ovos foi importante na identificação das subfamílias de Agromyzidae (Agromyzinae e Phytomyzinae). Algumas considerações sobre as características similares foram baseadas nas hipóteses de relacionamento filogenético entre os gêneros da família Agromyzidae. Espera-se que os resultados obtidos neste estudo possam auxiliar na identificação de espécimes fêmeas de agora em diante.

O gênero Hylexetastes é endêmico da floresta Amazônica. Atualmente, duas espécies são aceitas no gênero (H. perrotti e H. stresemannii), cada uma dividida em três subespécies. No entanto, alguns autores defendem que as subespécies de H. perrotti devem ser consideradas como espécies plenas. Em particular, H. p. brigidai é um táxon endêmico do Pará e Mato Grosso e parece ter a menor área de distribuição. Esta região corresponde à área mais desmatada dentro do bioma e assim o status taxonômico desta linhagem é de particular preocupação para conservação. Até agora, somente caracteres morfológicos foram avaliados para definição taxonômica deste gênero. Portanto, neste estudo apresentamos uma hipótese filogenética molecular para ajudar a resolver as incertezas taxonômicas dentro do gênero. Foram sequenciados fragmentos de dois marcadores mitocondriais (Cytb e ND2) e três marcadores nucleares (BF5, G3PDH e MUSK) em 58 espécimes de Hylexetastes. Além disso, foram elaboradas modelagens de nicho ecológico para cada uma das linhagens identificadas, para avaliar sua potencial área de distribuição, requerimentos climáticos e sua a vulnerabilidade ao desmatamento. As análises filogenéticas sustentam a designação de H. perrotti, H. uniformis e H. brigidai como espécies plenas, sendo que H. perrotti parece ser espécie irmã de H. stresemanni e não dos demais táxons considerados co-específicos. Além disso, foi possível distinguir a presença de duas Unidades Evolutivas Significativas dentro de H. uniformis. Cada um destes táxons está distribuído em diferentes interflúvios / áreas de endemismo da bacia Amazônica. Em particular, confirma-se o status de espécie plena para H. brigidai, endêmica da região amazônica com maior desmatamento. Assim, sugerimos a continuada avaliação aprofundada do seu status de conservação para promover sua preservação.

A família Corinnidae Karsch, 1880 é constituída por aproximadamente 735 espécies alocados em 67 gêneros, os quais estão distribuídos em zonas temperadas e tropicais (WSC, 2015). Este grupo passou por diversas modificações em seu status taxonômico até ser elevada ao status de família a partir do trabalho de Lehtinen (1967).
A princípio, Karsch (1880) ao propor Corinninae, a classificou como uma subfamília de Drassoidae. Simon (1897), no entanto, a reconheceu como subfamília de Clubionidae, com base em caracteres diagnósticos da família, como a morfologia do esterno. Lehtinen (1967) ao contestar o posicionamento filogenético de Corinninae, evidenciou a artificialidade de Clubionidae, uma vez que este agrupamento era caracterizado por uma combinação de simplesiomorfias.
Até recentemente, Corinnidae incluía as subfamílias Corinninae Karsch, Castianeirinae Reiskind, Trachelinae Simon e Phrurolithinae Banks. Castianeirinae foi primeiramente reconhecida por Reiskind (1969) como subfamília de Clubionidae. Phrurolithinae foi por muito tempo considerado um táxon relacionado à Liocranidae. No entanto, este grupo foi formalmente transferido de Liocranidae para Corinnidae por Bosselaers & Jocqué (2002), os quais também argumentaram contra o monofiletismo de Corinnidae, sugerindo que Castianeirinae seria mais proximamente relacionada a gêneros pertencentes a Liocranidae do que a outros táxons de Corinnidae. Ramírez (2014) restringiu a composição da família a apenas duas subfamílias, Corinninae e Castianeirinae, e elevou Trachelidae e Phrurolithidae ao status de família.
O monofiletismo de Corinnidae ainda é discutido (Bonaldo, 2000; Ramírez, 2014). Bonaldo (1997) indicou gêneros de posicionamento incerto em Corinnidae (Ianduba Bonaldo, 1997, Mandaneta Strand,1932, Procopius Thorell, 1899 e Pseudocorinna Simon, 1910) que apresentavam apófise média, uma estrutura ausente em Corinídeos típicos como Corinna Koch, 1842 e Castianeira Keyserling, 1879. A maioria destes gêneros foi incluída por Ramírez (2014) em um grupo informal (o grupo Pronophaea), porém este resultado foi considerado insuficientemente suportado para ser refletido em uma classificação formal. Assim, os gêneros do grupo Pronophaea permanecem formalmente incluídos em Corinnidae, sem afiliação sub-familiar (Corinnidae insertae sedis).
Desta forma, atualmente a família é constituída pelas subfamílias Corinninae e Castianeirinae, além de um agrupamento de táxons com posição filogenética incerta, considerados como Incertae sedis. Contudo, a recente inclusão de representantes do gênero Ianduba Bonaldo, 1997 na matriz de Ramírez (2014) por Magalhães et al. (no prelo) indica que este gênero não é um representante do grupo Pronophaea, sendo possivelmente o grupo irmão de Corinninae, hipótese levantada pela primeira vez por Bonaldo (2000). Apesar da composição da família ainda ser objeto de discussão, as duas subfamílias formalmente reconhecidas em Corinnidae são diferenciadas com facilidade através da morfologia do palpo do macho. Corinninae apresenta o reservatório ou duto espermático com percurso helicoidal (Bonaldo 2000), enquanto Castianeirinae o bulbo do palpo exibe forma de pêra (Reiskind, 1969).
Bonaldo (2000) caracterizou os gêneros de Corinninae, reconhecendo 17 gêneros para a subfamília, sendo seis descritos como novos na ocasião: Abapeba, Erendira, Septentrinna, Simonestus, Tapixaua e Tupirinna. Além disso, foram redescritos também os gêneros Corinna C. L. Koch, 1842, Methesis Simon, 1896, Megalostrata Karsch, 1880, Stethorragus Simon, 1896, Parachemmis Chickering, 1937, e Xeropigo O. Pickard-Cambridge, 1882 e descritas 30 espécies novas.
O gênero Parachemmis foi proposto por Chickering (1937) afim de abrigar, em Micariinae (Clubionidae), duas espécies encontradas no Panamá, Parachemmis fuscus (espécie-tipo por designação original) e Parachemmis trilineatus Chickering. Ao separar os representantes de Castianeirinae dos de Micariinae (Gnaphosidae), Reiskind (1969) considerou Parachemmis como um representante de Clubionidae, Liocraninae. Após a proposta de fragmentação de Clubionidae promovida por Lehtinen (1967) ter sido amplamente aceita, o gênero foi listado em Liocranidae até Bonaldo & Brescovit (1994) o transferirem para Corinninae (Corinnidae). Neste mesmo trabalho foi transferida para o gênero Parachemmis uma espécie descrita por Gertsch (1942), Stethorrhagus hassleri, bem como uma de Mello-Leitão (1948), Stethorrhagus mastigostylus, esta última considerada um sinônimo júnior da primeira. Bonaldo (2000) descreveu a espécie Parachemmis manauara e transferiu P. trilineatus para o gênero Tupirinna Bonaldo. Dessa forma, até o momento são reconhecidas três espécies em Parachemmis: P. fuscus, P. hassleri e P. manauara. Bonaldo & Brescovit (1994) reconheceram um grupo putativamente monofilético em Corinninae, composto por Stethorrhagus e Parachemmis, caracterizado pela presença de escavações esternais e de uma apófise apical ventral articulada na tíbia do palpo dos machos. Bonaldo (2000) indicou que o gênero Tupirinna apresenta as mesmas características, incluindo-o neste grupo de gêneros. As espécies incluídas em Parachemmis são aranhas de médio porte (de 5,3 mm a 7,6 mm de comprimento total), normalmente encontradas em troncos de árvores (Hofer & Brescovit, 2001; Nogueira et al., 2014) e são diferenciadas de outros gêneros pela morfologia da genitália, caracterizada pelo condutor hialino, reservatório longo exibindo uma forma de hélice e êmbolo longo e filiforme, com extremidade simples, diferenciando-se dos gêneros Sthethorragus que apresenta a extremidade do êmbolo bífida e Tupirinna, onde as espécies possuem o êmbolo curto. Além dessas diferenças, o epígino das fêmeas de Parachemmis apresentam ductos de copulação separados, abrindo-se em cavidades diferentes. Os gêneros Stethorrhagus e Tupirinna, por sua vez, exibem apenas uma abertura de copulação e único ducto, com exceção de Stethorrhagus limbatus Simon 1896, onde ductos separados abrem-se em uma escavação comum (Bonaldo & Brescovit, 1994; Bonaldo 2000). Embora sejam reconhecidas somente três espécies para o gênero, um número considerável de espécies a serem descritas estão disponíveis em coleções zoológicas científicas. Neste sentido, é proposto no presente estudo, uma revisão taxonômica de Parachemmis, com o intuito de ampliar o conhecimento das espécies pertencentes a este táxon, bem como sua distribuição. Assim, ao final deste trabalho, o elenco do gênero será ampliado para 12 espécies: Parachemmis fuscus e P. manauara serão rediagnosticados, P. hassleri e P. mastigostylus (revalidado) serão redescritas e oito espécies serão descritas como novas para a ciência.

O gênero Grammedessa (Correia & Fernandes, 2016) possui doze espécies e foi proposto com base em um conjunto de características, mas sem uma análise cladística. A principal característica diagnóstica para Grammedessa são as faixas pretas na região dorsal da cabeça, estas faixas também estão presentes em espécimes que não foram consideradas inicialmente parte do gênero devido à ausência das demais características diagnósticas do grupo. Assim o objetivo do presente trabalho foi analisar Grammedessa utilizando a metodologia cladística e testar se as espécies excluídas inicialmente fariam ou não parte deste gênero. Foram analisados 45 exemplares. As descrições seguiram modelos pré-estabelecidos para descrições em Edessinae. A análise cladística foi realizada exclusivamente com caracteres morfológicos polarizados através do método de grupo externo, a matriz era composta por trinta e seis táxons terminais, sendo quinze no grupo externo, e vinte e um no grupo interno, e quarenta e quatro caracteres, em sua maioria, binários. Para a inferência filogenética foi utilizado o método de máxima parcimônia utilizando algoritmos de busca heurística, para isso foi utilizado o software T.N.T. Ao final da análise sem pesagem, foram obtidas oito árvores igualmente parcimoniosas (L=116, IC= 46 e IR=78); utilizando pesagem implícita (n=6), foram obtidas três árvores mais parcimoniosas (L=112, IC= 48 IR=80), onde a árvore de consenso foi apresentada e discutida. A hipótese de que Grammedessa é monofilético foi testada e corroborada por três sinapomorfias: a região dorsal da cabeça com faixas longitudinais formadas por manchas e pontuação, a face posterior do proctíger larga com a metade inferior apresentando uma quilha elevada; foram descritas oito espécies novas para o gênero; Edessa botocudo Kirkaldy, 1909 foi transferida para Grammedessa.

Dez espécies novas de Amphidraus Simon, 1900 provenientes do Brasil são descritas: A. belzonte sp. nov., A. bifidus sp. nov., A. caxiuanan sp. nov., A. draconicaudatus sp. nov., A. janauri sp. nov., A. loxodontillus sp. nov., A. mysticetus sp. nov., A. nigrigenu sp. nov., A. pulvinus sp. nov. e A. simplex sp. nov. Uma nova diagnose é proposta para o gênero e três novas combinações são estabelecidas: Nebridia parva Mello-Leitão, 1945 = Titanattus parvus (Mello-Leitão, 1945) comb. nov., Nebridia manni Bryant, 1943 = Truncattus manni (Bryant, 1943) comb. nov. e Nebridia mendica Bryant, 1943 = Truncattus mendicus (Bryant, 1943) comb. nov. Novos registros de A. santanae Galiano, 1967 são apresentados, permitindo um breve comentário sobre a variação morfológica encontrada.

Estudos sobre padrões de distribuição e coexistência das espécies em comunidades naturais estão ganhando destaque na área de ecologia de comunidades, pois servem como base para outros estudos, como os de conservação, de ecologia teórica e outros. Neste estudo, utilizamos os insetos aquáticos da Subordem Heteroptera (Infraordem Gerromorpha), para avaliar a relação entre similaridade morfológica e padrões de coexistência de Gerromorpha. Duas hipóteses foram testadas: (i) a existência de divergência morfológica entre as espécies coexistentes; (ii) o ambiente exerce baixa influência sobre o padrão de coocorrência das espécies. O estudo foi realizado em 32 riachos (igarapés) dentro e no entorno de uma unidade de conservação na Amazônia Oriental. A hipótese sobre divergência morfológica entre as espécies de insetos semiaquáticos e de ausência de um efeito ambiental nas assembleias foram corroboradas. As espécies da comunidade de Gerromorpha apresentaram um padrão de coocorrência não aleatório. A divergência morfológica entre espécies pode ser o resultado de intensa competição interespecífica. Nas assembleias de Gerromorpha estudadas, as relações de competição foram mais importantes que o ambiente, resultando no deslocamento de caracteres morfológicos, com espécies coexistentes mais distantes entre si morfologicamente do que o esperado para os modelos avaliados.

Os ecossistemas aquáticos são ambientes altamente complexos, pois os seus componentes bióticos e abióticos são dependentes da variação na estrutura física e das características limnológicas, que em geral, são fatores que atuam de forma específica em diferentes escalas espaciais e temporais. Assim, considerando essa complexidade dos habitats encontrados em ecossistemas lóticos amazônicos esta tese tem como objetivo geral avaliar quais são os fatores determinantes dos padrões de distribuição dascomunidades de insetos aquáticos em riachos e suas relações com a variação ambiental desses ecossistemas e os efeitos da escala geográfica (variação espacial). Para responder a este objetivo a tese foi dividida em quatro capítulos. No primeiro através de uma análise cienciométrica foi realizada uma avaliação em escala mundial do uso de insetos da família Chironomidae (Diptera) em ecossistemas aquáticos e suas respostas como bioindicadores nesses ambientes. Encontramos que as principais questões apresentadas nos estudos foram relacionadas aos impactos antrópicos causados pelas atividades humanas sobre os ecossistemas aquáticos e as dificuldades taxonômicas sobre a utilização das espécies em biomonitoramentos. No segundo foram analisados os padrões de distribuição e diversidade de comunidades de Chironomidae, sob as predições da Teoria de Metacomunidades, para avaliar as relações das assembleias com a variação da escala espacial e do ambiente. Como principais resultados, encontramos que as assembleias são afetadas principalmente por componentes da estrutura física do habitat e parcialmente limitadas pela dispersão entre os riachos quando consideradas em larga escala na região hidrográfica. No terceiro capítulo, foi avaliada a composição de traços morfológicos e funcionais das comunidades de insetos aquáticos (Coleoptera, Diptera, Ephemeroptera, Hemiptera, Lepidoptera, Megaloptera, Odonata, Plecoptera, Trichoptera) e as suas respostas à variação na estrutura do habitat consideradas sob as premissas da Teoria de Habitat Templet. Assim, encontramos como resultados deste capítulo, relações entre a distribuição dos traços morfológicos e funcionais com as variáveis da estrutura do habitat e a características limnológicas dos riachos. No quarto capítulo foram avaliados os efeitos da variação espacial e ambiental sobre a similaridade de composição das comunidades de insetos das ordens Ephemeroptera, Plecoptera e Trichoptera em riachos de duas regiões hidrográficas distintas. Neste último capítulo, encontramos diferenças na composição das comunidades como resultado da distância geográfica e das características ambientais locais de cada região. Demonstramos como a estrutura do habitat dos riachos pode afetar as comunidades de insetos aquáticos em diferentes contextos de escala geográfica. Também, as características dos hábitats foram importantes para a seleção de atributos ecológicos e funcionais das comunidades de insetos aquáticos. Com isso, a partir dos resultados encontrados, concluímos que as variáveis que compõem a estrutura física dos riachos são fatores determinantes na estruturação das comunidades de insetos aquáticos em escalas geográficas em contextos regionais e locais específicos. Além disso, foi destacada a importância dos fatores locais (proporção da vegetação ripária/composição dos substratos/características limnológicas) em relação a composição de características morfológicas e funcionais das assembleias, enquanto que os fatores regionais (distância geográfica/limitação de dispersão) foram os componentes determinantes da similaridade da estrutura das comunidades.

É previsto que o aquecimento global leve a Terra a um aumento da temperatura de até 4.8°C até o final do século XXI, o que pode afetar negativamente distribuição das espécies de lagartos, considerando que são animais ectotérmicos e dependem diretamente da temperatura do ambiente para regularem a temperatura corporal (Tc). Estes animais geralmente apresentam como resposta compensatória ao estresse térmico a restrição do tempo de atividade em refúgios, para minimizar o risco de morte por superaquecimento. Acredita-se que a vulnerabilidade das espécies seja portanto inversamente proporcional à Tc e ao número de horas de restrição nos refúgios (Hr), e diretamente associada à temperatura máxima do ambiente (TMA), o que significa que qualquer lagarto, seja ele termoconformador ou heliotérmico, pode ser vulnerável às mudanças climáticas. Há pouca informação disponível na literatura em relação a biologia dos lagartos da Amazônia, apesar de ser a região mais biodiversa do mundo e abrigar cerca de 210 espécies de lagartos ao longo de sua extensão. Com isso, o primeiro capítulo do presente trabalho teve como objetivo sintetizar o conhecimento acerca da fisiologia térmica destes animais e incorporar dados inéditos de preferência térmica de algumas espécies, além de caracterizar o seu modo de termorregulação e recuperar as relações entre os caracteres. O segundo capítulo, por sua vez, analisa o status de persistência/ausência de 29 espécies de lagartos amazônicos, com projeções para 2050 e 2070, verificando se a sua vulnerabilidade está de fato associada à Tc, Hr e TMA. Quarenta e cinco estudos reportando Tcs de 62 espécies foram encontrados, e dados adicionais de Tc, bem como dados inéditos de preferência térmica, foram coletados em 13 localidades na Amazônia, abrangendo diversas fitofisionomias do bioma. Foram obtidos dados de temperatura preferencial (Tpref), temperaturas voluntárias mínima (Vtmin) e máxima (Vtmax) e zona de tolerância (críticos térmicos, Ctmin e Ctmax) para 33 espécies, e dados de performance (Tot) para 10 espécies. Tc, Tpref e Vtmin apresentaram sinal filogenético fraco (K<1), e todas as variáveis se correlacionam, exceto por 1) Tot, que não apresenta correlação com Ctmax e 2) Ctmin, que só se correlaciona com Tot. Embora apresentem diferenças estatisticamente significativas, heliotérmicos e termoconformadores apresentam características térmicas intercaladas na escala de valores, demonstrando um continuum entre os extremos dos modos de termorregulação. A utilização de um modelo de distribuição que combina dados ambientais e de fisiologia para calcular a distribuição potencial atual e futura das espécies, considerando um cenário de emissão de gás carbônico realista, permitiu a verificação do status de persistência/ausência de 29 espécies de lagartos amazônicos. Três delas, todas heliotérmicas, apresentaram um projeção de expansão territorial até 2070. Para as demais, foi prevista uma redução de área de ocorrência, com heliotérmicos apresentando, em média, menores Hr e maiores Tc que os termoconformadores. Não foi verificado um padrão de vulnerabilidade relacionado ao modo de termorregulação, e a maioria das espécies apresentou baixas Tcs e/ou Hr, concordando com a hipótese que relaciona vulnerabilidade à Tc, Hr e TMA. Foi feita ainda a modelagem de outras oito espécies, porem estas apresentaram resultados controversos nos cálculos de distribuição potencial e portanto não foram incluídas nas análises de vulnerabilidade. Tais espécies estão sendo avaliadas pelos desenvolvedores do modelo para eventuais ajustes. Por fim, caso as previsões se concretizem, as altas restrições de área recuperadas pelo modelo podem refletir um elevado risco de extinção das espécies. O resultado é preocupante mesmo considerando eventuais limitações do método, e reforça a necessidade de políticas conservativas que levem em consideração os efeitos das mudanças climáticas sobre a fauna, além de mais estudos visando ampliar nosso entendimento acerca das consequências do aquecimento global.

O rio Xingu apresenta uma grande variedade de condições e ambientes possibilitando a existência
de, aproximadamente, 400 espécies de peixes, somente nos cursos médio e baixo do rio. De modo
geral, a ictiofauna exibe mudanças ao longo dos rios devido às diferenças nas estruturas dos
hábitats, na disponibilidade de recursos e até mesmo nos padrões biogeográficos. Dentre os
fatores responsáveis por essas mudanças destacam-se os pulsos de inundação que alteram
sazonalmente o ambiente e geram modificações na estrutura das assembleias. Porém, a construção
de uma usina hidrelétrica minimiza ou mesmo extingue esses pulsos de inundação afetando as
principais características biológicas e ecológicas das assembleias de peixes. Dessa forma, o
objetivo desta tese foi investigar os padrões estruturais das assembleias de peixes do rio Xingu
analisando a influência dos pulsos de inundação em aspectos populacionais e de comunidades,
além de criar subsídios para a futura avaliação de impactos pertinentes à construção de usinas
hidrelétricas. Para isso, este trabalho foi divido em três capítulos mais um capítulo complementar:
o primeiro aborda os efeitos das cachoeiras/corredeiras e do pulso de inundação sobre a estrutura
das assembleias; no segundo investigou-se a alimentação de quatro espécies piscívoras, já que
esta guilda é fortemente afetada pela construção de usinas hidrelétricas; o terceiro capítulo trata
da elaboração de índices de integridade biótica para a avaliação de impactos em hidrelétricas. O
capítulo complementar tratou da relação peso-comprimento das espécies de peixes mais
abundantes na área de estudo. A amostragem foi realizada trimestralmente de 2012 a 2015,
abrangendo todos os períodos hidrológicos da região. Para as coletas, foi utilizado um conjunto
sequencial de sete redes de emalhe com malhas de diferentes tamanhos. A unidade amostral
correspondeu a um conjunto de três baterias dispostas em cada sítio de coleta. As análises foram
baseadas em técnicas comumente utilizadas em trabalhos de estrutura de comunidades,
alimentação e avaliação de impactos. Com os resultados desta tese foi possível reconhecer os
processos responsáveis pela estruturação da comunidade de peixes, possibilitando a tomada futura
de medidas eficientes na conservação da ictiofauna e de seus hábitats.

O gênero Phaethornis é um dos representantes da família Trochilidae, a qual compreende os beija-flores. As espécies deste gênero distribuem-se pelo Neotrópico ocorrendo desde o México até a Argentina e sul do Brasil. Desde a sua descrição, Phaethornis Swainson, 1827 estudos foram realizados com o intuito de sanar eventuais problemas de classificação das suas espécies, ainda assim a taxonomia é considera controversa. Atualmente, são reconhecidos 58 táxons (31 espécies e 43 subespécies). Em relação à filogenia, com base em caracteres morfológicos foi sugerida a monofilia do gênero, com o reconhecimento de três clados e subgêneros: Pygmornis Bonaparte, 1854 agrupando as espécies de tamanho pequeno; Anisoterus Mulsant & Verreaux, 1874 agrupando as espécies que habitam áreas abertas, e Phaethornis agrupando as espécies de tamanho grande. Além disso, esses autores consideram o táxon gounellei como espécie irmã de todos os Phaethornis, sendo alocado num gênero à parte: Anopetia. Recentemente, foi prosposta uma filogenia para 284 espécies de toda a família Trochilidae e, apesar de também formar três clados, os resultados são diferentes do encontrado anteriormente, pois as espécies que os compõem não são as mesmas. Mesmo sendo a filogenia mais completa, até o momento, não utilizaram amostras de todas as espécies conhecidas em Phaethornis e a amostragem não compreende toda a distribuição dos táxons, o que pode resultar em uma interpretação equivocada das reais relações filogenéticas entre elas. Com isso, utilizamos cinco genes e análises moleculares para propor uma filogenia mais completa possível para o gênero Phaethornis. É possível observar que os dados moleculares revelaram certa incongruência entre as relações filogenéticas e a taxonomia atual do grupo. Além disso, realizamos estudos filogeográficos em dois complexos de espécies (Phaethornis superciliosus/malaris e Phaethornis ruber/atrimentalis). Em relação à Phaethornis superciliosus/malaris, nossos resultados mostraram a formação de seis clados bem apoiados que podem ser tratados como sendo cinco espécies plenas com origem durante o Plio-Pleistoceno, através de eventos de dispersão e tendo o rio Amazonas como um dos agentes vicariantes. É possível identificar também, a formação de oito clados em P. ruber/atrimentalis que podem ser tratados como sendo seis espécies plenas com sinais de intrigressão e origem durante o Pleistoceno.

As comunidades biológicas estão distribuídas de forma espacialmente estruturada nos
sistemas aquáticos, de modo que a perda de integridade do hábitat pelas ações antrópicas e as
restrições impostas pelas características morfológicas das espécies, contribuem para o padrão
existente da metacomunidade no ambiente. Os sistemas hídricos constituem bons modelos
para identificar os processos que participam da distribuição local dos organismos. Os
tributários desses sistemas, estão dispostos em uma rede dendrítica sob a restrição de
múltiplas condições ambientais e são muito sensíveis as modificações que ocorrem na bacia
de drenagem. Essas modificações são, principalmente, aquelas resultantes das atividades
humanas, que em geral, culminam na perda da biodiversidade residente. Na região amazônica
a exploração de madeira tem sido considerada uma das principais atividades que provoca altas
taxas de desmatamento. Para reduzir os efeitos drásticos no ambiente, algumas técnicas de
manejo florestal, como manejo de Impacto Reduzido (MIR), têm sido implementadas com o
intuito de extrair a matéria prima do ambiente natural e promover a conservação das espécies
e dos processos necessários ao funcionamento do ecossistema. Por outro lado, a exploração
sem controle, conhecida como exploração convencional, altera a morfologia do canal dos
ecossistemas aquáticos, reduz a cobertura vegetal e aumenta a entrada de sedimento fino,
ocorrendo geralmente a alteração dos parâmetros aceitáveis físicos-químicos-microbiológicos
água. Buscando avaliar os efeitos da extração madeireira na biodiversidade aquática,
utilizaremos a ordem Odonata como organismo modelo, em virtude da sua sensibilidade às
modificações no ambiente aquático, alta diversidade de espécies e serem associadas a diversos
tipos de ambientes aquáticos, bem como viver na interface com o ambiente terrestre. O
objetivo da tese é avaliar o padrão da distribuição das espécies de Odonata nos sistemas
hídricos que se encontram distribuídos em áreas submetidas à exploração de madeira
convencional ou de impacto reduzido na região Amazônia Oriental. Para responder a esse
objetivo a tese foi dividida em três capítulos, cujos objetivos são: (i) Avaliar se a diversidade
de Odonata diminui nas áreas com exploração convencional de madeira, e, identificar quais
são as variáveis abióticas que estruturam a composição de Odonata. (ii) Avaliar se os efeitos
ambientais e espaciais são determinantes na distribuição das espécies de Odonata nos igarapés
amostrados e verificar se ocorre um turnover taxonômico de espécies em áreas naturais
(íntegras). (iii) Avaliar quais são as estruturas morfológicas da ordem Odonata que estão
associadas com o gradiente ambiental nos três tratamentos (referência (REF), manejo de
impacto reduzido (MIR) e corte convencional (CC)).

Um novo gênero e espécie de Trichomycteridae, proveniente do rio Tocantins, foi detectado e é descrito no presente trabalho. O táxon estudado não apresenta caracteres diagnósticos de nenhum gênero conhecido para a família. Portanto, baseada em uma análise filogenética, incluindo representantes de todas as subfamílias de Trichomycteridae, propomos um gênero novo. Este novo gênero é grupo irmão de Ituglanis, com o qual compartilha cinco sinapomorfias não exclusivas. O novo gênero difere de toda as demais espécies de Trichomycteridae pela combinação de 10 caracteres que são apresentados e discutidos.

Em um estudo recente, utilizando dados moleculares, morfológicos e ecológicos, Cebus e Sapajus foram reconhecidos como gêneros distintos. Apesar de Sapajus ser um dos gêneros de primatas neotropicais com maior volume de informação acumulada na literatura, eles têm sido considerados como um dos primatas que possuem a taxonomia mais confusa entre os mamíferos neotropicais. Até pouco tempo atrás, havia poucas informações disponíveis na literatura acerca da origem e diversificação das espécies pertencentes ao gênero Sapajus. Apesar dos recentes trabalhos publicados ainda não há uma hipótese robusta sobre a origem e evolução desse grupo. No presente trabalho, nosso primeiro objetivo foi testar a diversificação dos macacos-prego usando o banco de dados moleculares e geográficos mais completo disponível até o momento. Nós reconstruímos uma filogenia molecular datada para esse grupo através de inferência Bayesiana de três genes mitocondriais (D-loop, Cytb e COI). Nossos resultados apoiam uma vicariância entre as populações ancestrais dos Andes e Amazônia versus da Mata Atlântica, e uma invasão na Amazônia durante o Pleistoceno pelos Sapajus para explicar a atual simpatria entre Cebus e Sapajus. Nosso segundo objetivo foi montar o primeiro banco de dados filogenômicos para o gênero Sapajus através de elementos ultraconservados do genoma (UCE) e reconstruir a primeira filogenia robusta para o gênero. Foram extraídos os SNPs do conjunto de dados UCE, e foram geradas filogenias por meio de inferência bayesiana e máxima verossimilhança. Nossas análises apoiam fortemente a monofilia recíproca entre Cebus e Sapajus. Dentro de Sapajus, nossas árvores de SNPs recuperam seis espécies: S. xanthosternos, S. robustus, S. nigritus, S. flavius, S. libidinosus, e S. apella (que inclui S. cay e S. macrocephalus). Como as subdivisões morfológicas e moleculares do grupo amazônico são discordantes, recomendamos colapsar todas as espécies de macaco-prego da Amazônia e savanas do sudeste da Amazônia como S. apella sem subespécies. 

Composta por vespas solitárias que apresentam morfologia e comportamento bem característicos, Pompilidae apresenta cerca de 230 gêneros e 5000 espécies para o mundo todo. Nesta família estão as vespas da tribo Ageniellini, com cerca de 177 espécies alocadas em sete gêneros para a fauna neotropical, que se destacam pelo comportamento de nidificação diferenciado dos outros membros de Pompilidae. Estudos anteriores afirmam que as especializações das peças bucais tem relação com a habilidade dos insetos de lidar com partículas e pelotas. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo principal analisar as mandíbulas de vespas fêmeas da família Pompilidae, com ênfase na tribo Ageniellini, refinando o conhecimento da morfologia funcional do grupo através de uma abordagem sistemática. O material analisado (58 espécimes de 29 gêneros) é proveniente do Museu Paraense Emilio Goeldi (MPEG), da Universidade Estadual de Utah – EUA e do Museu Americano de História Natural – EUA (AMNH). As mandíbulas foram destacadas da cápsula cefálicas e acondicionadas em álcool (70%). Seguiram-se então as medidas das peças e a produção de desenhos com auxílio de câmara clara e fotos com câmera acoplada a estereomicroscópio. Após a descrição das peças, foi feita uma matriz de dados incluindo caracteres morfológicos e biológicos. Para inferências filogenéticas, a matriz de dados foi otimizada por parcimônia em uma filogenia com topologia modificada para incluir apenas os táxons presentes no estudo. Considerando as diferenças encontradas entre as mandíbulas dos espécimes estudados, seguiu-se uma descrição geral, considerando quatro planos distintos. As análises morfométricas indicaram que a mandíbula tem fraca alometria positiva em relação ao tamanho do corpo. Também foi possível notar que as mandíbulas são longas e apenas ligeiramente curvadas, com graus de curvatura semelhantes. Como se observa nas descrições das peças, a forma geral da mandíbula e os elementos estruturais presentes na porção basal são mais conservativos do que os elementos distais. Através da otimização dos caracteres mandibulares foi possível inferir os estados ancestrais em cada clado e perceber a evolução dos caracteres em questão. Em comparação com Polistinae, os elementos das mandíbulas de Pompilidae ocupam uma mesma posição relativa. Analisando a frequência dos índices de consistência dos caracteres mandibulares morfológicos pode-se constatar que tais caracteres são muito pouco informativos. A partir de uma busca utilizando apenas caracteres morfológicos da mandíbula, foram retidas 706 árvores igualmente parcimoniosas, com 150 passos, apresentando IC=33 e IR =62. Analisando o consenso entre elas percebe-se a recuperação de pouquíssimos grupos, sugerindo que apenas os caracteres morfológicos mandibulares não são suficientes para propor hipóteses de relacionamento suficientemente resolvidas entre os gêneros. Comparando as reconstruções de estados ancestrais, relativamente poucos casos com evidência de coevolução entre forma e função puderam ser observados, entretanto, algumas considerações podem ser feitas sobre possíveis relações da morfologia da mandíbula com os hábitos de nidificação de Pompilidae. As espécies de Ageniellini estudadas tem a região mesial-distal diferenciada dos demais pompilídeos, sendo possível supor uma relação da morfologia da mandíbula com os hábitos de nidificação diferenciados desta tribo. 

A monocultura de Palmeira de Dendê tem sido considerada uma atividade promissora em regiões tropicais. Sua expansão proporcionou grande perda de habitats de floresta tropical, sendo considerada uma ameaça para a biodiversidade. Apesar da maioria das áreas de cultivo utilizar áreas anteriormente desmatadas, os efeitos desta monocultura sobre a biodiversidade da região amazônica ainda são pouco conhecidos. Neste estudo investigamos o efeito da plantação de palmeira de dendê sobre a fauna de carnívoros da região amazônica. Realizamos o levantamento e monitoramento deste grupo de mamíferos e relacionamos com algumas métricas ambientais que estariam relacionadas aos efeitos da monocultura sobre as espécies registradas. As métricas avaliadas neste estudo foram área basal de categorias DAP 5-10cm e DAP>10cm, distância perpendicular da matriz de palma ou floresta, distância de corpos d’água. Houve um efeito na composição e abundância de carnívoros, onde os habitats diferiram sobre o aspecto de área basal de categorias DAP 5-10cm, sendo que nas áreas de plantação essa métrica não possui evidência. Apesar da plantação não ser considerada uma matriz impermeável, a fauna de carnívoros não se apresenta distribuída de uma maneira homogenia na paisagem. As espécies mais afetadas foram carnívoros de grande porte e as espécies generalistas e oportunistas, como os mesopredadores, foram beneficiados pela plantação. Nossos resultados evidenciam que o monitoramento e estratégias voltadas para entender como os atributos da plantação influenciam na ocorrência desses animais é de fundamental importância para conservação.

Os macroinvertebrados aquáticos são mais comumente utilizados para avaliar a saúde e
o funcionamento dos ecossistemas lóticos. Esses organismos são importantes na
estrutura dos riachos, sendo capazes de controlar a dinâmica trófica de toda uma
comunidade. Porém entender os mecanismos que estruturam essas comunidades ainda é
um desafio para os estudos ecológicos. A diversidade funcional é uma das abordagens
destinada a contribuir para o entendimento dos mecanismos que atuam sobre a
distribuição das espécies de uma comunidade. Neste sentido, buscamos por meio de
uma revisão na literatura, investigar as tendências e lacunas mundiais da diversidade
funcional de macroinvertebrados de sistemas lóticos. A abordagem para o grupo foi
recente e mostrou um rápido crescimento ao longo dos anos, porém tem sido pouco
aplicada em regiões neotropicais. Entre os artigos investigados encontramos variações
nos termos conceituais que podem ocasionar interpretações errôneas. Verificamos ainda
que as respostas funcionais de insetos aquáticos foram mais investigadas entre os
macroinvertebrados e, com maior frequência em estudos avaliando o efeito de impactos
ambientais antrópicos. Por fim testamos a aplicabilidade da abordagem de diversidade
funcional. Investigamos as respostas funcionais e taxonômicas de EPT de riachos
inseridos em regiões de plantio de dendê comparando-os com áreas florestais na
Amazônia Oriental. Verificamos que a abundância taxonômica diferiu entre as
comunidades sendo maior nas plantações, enquanto a riqueza de espécies foi maior na
floresta, houve perda de nove gêneros de EPT nos riachos de palma de dendê. Mesmo
com essa perda biológica, A diversidade funcional não diferiu entre as comunidades.
Porem quando analisamos as características do ambiente, houve diferenças no pH,
número de troncos e proximidade com estradas, e essas juntamente com temperatura
foram o suficiente para atuar na distribuição dos atributos funcionais da comunidade de
EPT.

Norops trachyderma é uma espécie pertencente à família de lagartos Dactyloidae que apresenta coloração acinzentada/marrom, hábito diurno e é encontrada em florestas bem preservadas ou pouco perturbadas. A espécie ocorre na Amazônia ocidental (Colômbia, Equador, Peru e estados do Amazonas e Acre, no Brasil), com uma distribuição disjunta (ausente no interflúvio Tapajós─Xingu, no Pará) que abrange, de um lado, as áreas de endemismo Imeri─Napo─Inambari, e de outro, a área de endemismo Tapajós. O objetivo do trabalho é compreender o padrão de diversificação e distribuição de Norops trachyderma na Floresta Amazônica. Utilizamos o gene mitocondrial ND2 e 4 genes nucleares: HMGCS, RAG1, DNAH3 e SNCAIP. Os resultados gerados tanto com o gene mitocondrial quanto com o banco de dados concatenados apontam uma clara diferenciação genética em duas linhagens (clados monofiléticos), sendo um deles pertencente ao interflúvio Tapajós/Xingú e o outro à Amazônia Ocidental.

Lepidothrix coronata é uma espécie amplamente distribuído pela região Neotropical, principalmente no bioma amazônico. Esta ave possui uma alta complexidade comportamental, onde estudos sugerem que se trata de mais de uma espécie. Atualmente possui oito subespécies descritas apenas com base morfológica e geográfica. Observa-se também variação de plumagem ao longo de sua distribuição, havendo uma lacuna no que se diz respeito a estudos moleculares com a espécie. O presente trabalho visa avaliar os padrões filogeográficos de L. coronata através de análise comparativa da coloração da plumagem e análises moleculares baseadas em sequências de genes mitocondriais e nucleares de exemplares provenientes de distintos pontos da área de ocorrência. A amostragem conta com 94 tecidos musculares, provenientes da Coleção Ornitológica do Museu Paraense Emílio Goeldi. Foram utilizados três marcadores mitocondriais (ND2, ND3 e COI) e três nucleares (I5BF, G3PDH e MYO). As análises filogenéticas de máxima verossimilhança e bayesiana, assim como as análises de estruturação populacional e delimitação de espécies, apontaram para a existência de três linhagens monofiléticas dentro da espécie, com altos valores de divergência (superiores a 3%), compatíveis com táxons válidos. Também foram encontrados espécimes de colorações similares em populações diferentes, e indivíduos de colorações distintas dentro da mesma linhagem, o que não está de acordo com a classificação das subespécies. Há evidências, assim como em estudos prévios, que grandes rios podem atuar como barreiras de diversificação para a espécie aqui estudada. Portanto, sugerimos que existam unidades evolutivas independentes dentro de L. coronata, podendo esta tratar-se de um complexo de espécies crípticas, não evidenciada pelo seu padrão de plumagem, mas congruente com a separação de suas áreas de ocorrência delimitada por rios do bioma Amazônico.

O gênero Micrurus é composto por serpentes venenosas de distribuição Neotropical com diversificados padrões de coloração apostemática sendo conhecidas popularmente como cobras corais verdadeiras. Abrangendo aproximadamente 80 táxons, Micrurus está organizado em quatro grupos de espécies diferenciáveis com base no padrão de color, comprimento da cauda e morfologia do hemipênis: (1) grupo monadal tricolor, hemipênis e longo fortemente bifurcado; (2) grupo bicolor, com hemipênis longo e fortemente bifurcado; (3) grupo com coloração em tríades e hemipênis moderadamente alongado (4) grupo com padrão em tríades, com hemipênis curto e bilobado, podendo ser capitado ou não capitado. Inserido no quarto grupo, Micrurus spixii atualmente constitui um complexo contendo quatro subespécies nominais: M. s. spixii presente do norte ao sul da Amazônia central; M. s. martiusi ocorrendo na Amazônia Oriental, Brasil; M. s. obscurus ocorrendo em regiões de floresta a leste dos Andes (noroeste da Bolívia, norte do Peru, leste do Equador e sudeste da Colômbia) e noroeste do Amazonas, no Brasil; e M. s. princeps com populações restritas ao nordeste da Bolívia. Por apresentar caracteres merísticos e morfométricos densamente sobrepostos junto às semelhanças no padrão de coloração e o forte melanismo presente em diversos espécimes, a identificação destas subespécies é imprecisa, tornando questionável a validade das mesmas desde suas primeiras revisões. Neste trabalho, revisamos a taxonomia do complexo explorando caracteres externos (coloração, variação merística e morfométrica) e internos (morfologia hemipeniana e craniana), definido, assim os limites de cada táxon ao longo da distribuição geográfica. A presente dissertação foi organizada em duas seções: 1) Introdução geral onde são apresentadas informações taxonômicas e sistemáticas acerca de Micrurus, com atenção direcionada ao complexo Micrurus spixii; 2) o manuscrito intitulado ―Revisão taxonômica das espécies do complexo Micrurus spixii (serpentes, elapidae)‖, cujo objetivo foi revisar a taxonomia do complexo, explorando a morfologia interna e externa incluindo novos caracteres e assim delimitando precisamente os limites de cada táxon de acordo com a distribuição geográfica.

 Os grandes rios da Amazônia têm sido considerados como barreiras geográficas para alguns táxons encontrados na região. Existem alguns trabalhos com a fauna de pequenos mamíferos não voadores da Amazônia testando esta teoria. Com objetivo de caracterizar as diferenças de riqueza, composição e abundância de espécies de pequenos mamíferos não voadores, verificou-se o potencial do rio Tapajós como barreira geográfica sobre estes animais. A área de estudo se localiza entre os municípios de Itaituba e Jacareacanga, no médio rio Tapajós, no estado do Pará. A amostragem foi realizada em 12 transectos de 4 km cada, distribuídos de forma perpendicular às margens do rio. Ao todo foram colocados seis transectos na margem direita e seis na margem esquerda, distantes por no mínimo 2 km um do outro. Em cada transecto foram distribuídas cinco estações amostrais distantes por 1 km entre eles. Para a coleta de animais foram utilizadas em cada estação 40 armadilhas de contenção de animal vivo, sendo 20 Shermans e 20 Tomahawk, além de um conjunto de três linhas de armadilhas de interceptação e queda (Pitfall trap driftfence), compostas por cinco baldes cada separados por cerca guia de 15 metros de comprimento. O levantamento foi realizado em quatro expedições nos anos de 2012 e 2013, incluindo a estação seca e chuvosa, totalizando 120 dias de amostragem. O esforço amostral total foi de 48.000 armadilhas/noite para o método de contenção de animal vivo e 18.040 armadilhas/noite para o método de armadilha de interceptação e queda. Foram realizadas medidas ambientais que refletem a estrutura do ambiente. Estas medidas foram feitas em todas as estações de coleta, nas quatro expedições. Foram mensuradas: a altura de serrapilheira, temperatura média, umidade média relativa do ar, abertura de dossel, declividade média, elevação, umidade e distância do rio. Foram amostrados 670 espécimes. Foram identificados um total de 63 espécies de pequenos mamíferos não voadores no médio rio Tapajós, sendo 41 espécies na margem esquerda e 47 espécies na margem direita. Destas 25 foram compartilhadas entre as duas margens. A composição de espécies foi diferente entre as duas margens do médio rio Tapajós, apesar alto compartilhamento de espécies entre as margens. A distância da margem não teve influencia sobre as comunidades de pequenos mamíferos em cada uma das margens separadamente, assim como em ambas as margens juntas. As variáveis ambientais não diferiram entre as margens e a variável mais relacionada as espécies foi a elevação. A comunidade de pequenos mamíferos não voadores da margem esquerda do Rio Tapajós é diferente da comunidade da margem direita, o que sugere que este Rio atue como potencial barreira geográfica para a dispersão das espécies deste grupo da mastofauna.

Edessinae é uma das subfamílias de Pentatomidae que mais apresenta problemas taxonômicos e nomenclaturais, sendo formada por oito gêneros Edessa Fabricius, 1803 (cerca de 280 espécies), Brachystethus Laporte, 1832 (10 espécies), Ascra Say 1832 (7 espécies), Peromatus Amyot & Serville, 1843 (7 espécies), Olbia Stål, 1862 (3 espécies), Pantochlora Stål, 1870 (1 espécie), Doesburgedessa Fernandes, 2010 (5 espécies) e Paraedessa Silva & Fernandes, 2013 (9 espécies). Edessa é o maior destes gêneros, e o que concentra a grande maioria dos problemas taxonômicos, devido a identificações incorretas, dificuldade em levantar a literatura e o grande número de espécies descritas. Este trabalho objetiva aprofundar o conhecimento sobre sistemática de edessíneos, especialmente do gênero Edessa, através da proposição de um novo gênero apoiado por uma análise cladística. Foram estudados 29 exemplares de instituições brasileiras e estrangeiras. As espécies foram descritas seguindo um roteiro tradicional para o estudo de pentatomidae, os espécimes forma medidos, fotografados, as estruturas com importância taxonômica como o processo metasternal e genitália de ambos os sexos foram desenhadas a lápis. Para análise cladística foram utilizados os programas TNT e Winclada, para a análise de parcimônia foi utilizada a busca heurística, com estratégia de busca multiple TBR, o grupo externo foi composto por 11 espécies. Como resultado da análise mais parcimoniosa, com pesagem implícita foi obtida uma árvore com 83 passos, Índice de Consistência (CI) de 53 e Índice de Retenção (IR) de 67. Como resultados mais expressivos da análise obtivemos que o gênero novo é relacionado com o subgênero Hypoxys de Edessa e o gênero Paraedessa; e que Edessa é um grupo polifilético.

A tribo Thiodinini é revisada ao nível de gênero. Propõem-se diagnoses para todos os
gêneros válidos baseadas nas espécies-tipo, e em alguns casos, nas novas espécies
descritas aqui. A tribo contém os seguintes gêneros considerados válidos: Thiodina
Simon, 1900; Cyllodania Simon, 1902; Hyetussa Simon, 1902; Atomosphyrus Simon,
1902; Arachnomura Mello-Leitão, 1917; Titanattus Peckham & Peckham, 1885 e
Tartamura gen. nov. Os seguintes gêneros são sinonimizados: Micalula Strand, 1932 e
Bredana Gertsch, 1936 com Hyetussa Simon, 1902; Agelista Simon, 1900 com
Titanattus Peckham & Peckham, 1885. Uma transferência é estabelecida: Thiodina
minuta (Galiano, 1977) comb. nov. (de Cyllodania). Designa-se um neótipo para
Hyetussa longithorax (Petrunkevitch, 1925) comb. nov. Doze espécies novas são
descritas: Cyllodania tica sp. nov.; Cyllodania trinidad sp. nov.; Cyllodania
zoobotanica sp. nov.; Hyetussa sergipe sp. nov.; Hyetussa sertaneja sp. nov.;
Tartamura agatelin sp. nov.; Tartamura huao sp. nov.; Tartamura metzneri sp. nov.;
Thiodina firme sp. nov.; Thiodina perian sp. nov.; Titanattus acagajuba sp. nov. e
Titanattus euryphaessa sp. nov. Alguns caracteres morfológicos e aspectos sobre
filogenia são discutidos.

Ituglanis sp. n. “amapá” é descrita de um igarapé do rio Jari, afluente próximo à foz do rio Amazonas, Amapá, Brasil. Distingue-se das demais congêneres pelo comprimento reduzido (máximo 25,6 mm CP); reduzido número de vértebras pós aparato Weberiano (36-37); dois pares de costelas; fontanelas frontal e parieto-supraoccipital alongadas; raios da nadadeira peitoral predominantemente i,5 e reduzido número de odontódios interoperculares (12-15). Embora não tenha sido observado espécimes sexualmente maduros, os indivíduos analisados são considerados adultos devido ao seu esqueleto completamente ossificado. Ituglanis sp. n. “amapá” não exibe um grande número de caracteres pedomórficos comparado às suas congêneres, representando uma espécie miniatura estruturalmente muito semelhante a adultos não-miniaturizados.

Três fatores essenciais compõe o nicho principal das espécies, dieta, uso do espaço e tempo. Em anuros o nicho trófico e espacial desempenham um importante papel para o sucesso reprodutivo das espécies que coabitam ambientes restritos, como as poças temporárias. Portanto, neste trabalho procuramos entender como três espécies de hilídeos, que utilizam as mesmas poças em fragmentos florestais amazônico, partilham os recursos alimentares e espaciais. Utilizamos frequência de ocorrência e índice de importância alimentar para determinar a dieta das espécies, além do índice de sobreposição de nicho e índice de amplitude para análises tróficas e espacias. Assim como, categorias de microhabitat, e medidas como altura de poleiro, profundidade de poça, além de algumas variáveis ambientais (temperatura e umidade do ar, precipitação, comprimento e largura das poças), procurando determinar similaridades e diferenças entre os nichos trófico e espacial dessas espécies. Nenhuma dessas dimensões foi limitante para a coexistência das espécies, uma vez que apesar da grande sobreposição trófica e espacial observada, a aplicação de diversas estratégias alimentares e de uso do espaço (uso de poleiros em diferentes alturas; poças com profundidades distintas; diferentes graus de importância alimentar para itens compartilhados pelas espécies; o uso de itens alimentares exclusivos de cada espécie), foram essenciais para diminuir a competição entre as espécies, permitindo sua coexistência.

Entender como as comunidades naturais estão estruturadas tem sido um dos principais objetivos em ecologia. Fatores locais e regionais, como o clima, o tipo de hábitat e as interações entre espécies, são os principais responsáveis pela estruturação das comunidades em ambientes naturais. Neste contexto, nosso objetivo é avaliar o efeito dos fatores ambientais (locais e regionais) e espaciais sobre a distribuição da comunidade de adultos de Odonata na Amazônia Oriental. Adicionalmente, avaliamos se existe um limite na similaridade morfológica para a coocorrência das espécies, buscando testar padrões na distribuição das espécies. Para responder a esses objetivos dividimos a tese em três capítulos: O primeiro capítulo avalia o efeito dos fatores ambientais e espaciais; o segundo o efeito dos fatores ambientais locais e regionais e o terceiro avalia se existe um limite na similaridade morfológica para a coocorrência de espécies de comunidade de adultos de Odonata na Amazônia. Foram amostrados Odonata adultos em 98 igarapés na Amazônia Oriental, Pará, Brasil. Os fatores ambientais locais foram avaliados com base em um índice de integridade ambiental e variáveis físicas quantitativas. Variáveis espaciais foram geradas através de filtros espaciais (PCNM). Foram considerados como fatores ambientais regionais o gradiente de altitude, variáveis bioclimáticas e percentuais de cobertura florestal. Foram selecionados 10 indivíduos machos de cada espécie para mensurar nove medidas morfométricas, com o uso de um paquímetro. Foram amostrados 3.588 espécimes de Odonata, distribuídos em 11 famílias, 49 gêneros e 134 espécies. Somente os fatores ambientais explicam a variação na comunidade de Odonata em todos os ambientes (R²_adj.= 0,223; p< 0,001), bem como separadamente (Preservados: R²_adj.= 0,225; p< 0,001; Alterados: R²_adj.= 0,258; p< 0,001), não houve efeito dos fatores espaciais (Todos os ambientes: R²_adj.= 0,001; p= 0,529; Preservados: R²_adj.= 0,007; p= 0,554; Alterados: R²_adj.= 0,009; p= 0,314). O mesmo foi observado para Zygoptera (Ambientais - Todos os ambientes: R²_adj.= 0,183; p< 0,001; Preservados: R²_adj.= 0,233; p< 0,001; Alterados: R²_adj.= 0,189; p< 0,001; Espaciais - Todos os ambientes: R²_adj.= 0,005; p= 0,741; Preservados: R²_adj.= 0,018; p= 0,628; Alterados: R²_adj.= 0,009; p= 0,632). Para Anisoptera, os fatores ambientais explicam a variação na comunidade apenas quando considerado todos os ambientes (R²_adj.= 0,155; p< 0,001) e alterados (R²_adj.= 0,222; p< 0,001). Em ambientes preservados nem fatores ambientais (R²_adj.= 0,023; p= 0,419) e espacias (R²_adj.= 0,114; p= 0,147) explicam a variação da comunidade. O particionamento de variação indicou contribuições distintas dos fatores ambientais locais e regionais sobre a variação na composição de espécies. O componente partilhado pelos dois fatores (locais e regionais) foi mais importante para explicar a variação tanto nas comunidades de Odonata (R²_adj.= 0,24) como de Anisoptera (R²_adj.= 0,15) e Zygoptera separadamente (R²_adj.= 0,24), seguido pelo componente ambiental local puro (Odonata: R²_adj.= 0,12; p< 0,001; Anisoptera: R²_adj.= 0,11; p= 0,001; Zygoptera: R²_adj.= 0,10; p< 0,001) e por último, pelo componente ambiental regional puro (R²_adj.= 0,07; p< 0,001; R²_adj.= 0,03; p= 0,036; R²_adj.= 0,08; p< 0,001). Porém além desses fatores, a competição mostrou-se um fator importante na distribuição das espécies. Padrões não aleatórios de coocorrência das espécies de Odonata ocorrem tanto nos igarapés presevados (C= 12,44; p= 0,000; Ck= 2524,00; p= 0,000) quanto nos alterados (C= 12,53; p= 0,000; Ck= 4499,00; p= 0,000). O mesmo foi observado quando avaliado separadamente para Zygoptera (preservados: C= 16,51; p= 0,000; Ck= 1009,00; p= 0,000; alterados: C= 13,95; p= 0,000; Ck= 991,00; p= 0,000). Já para Anisoptera foi encontrado um padrão aleatório de coocorrência das espécies tanto nos igarapés preservados (C= 4,87; p= 0,068; Ck= 308,00; p= 0,046) quanto nos alterados (C= 8,33; p= 0,849; Ck= 1130,00; p= 0,063). Em igarapés preservados foi observado que existe uma intensa competição interespecifica de Odonata ebaseada na morfologia (p< 0,001). O mesmo não foi observado em igarapés alterados (p= 0,411). Quando avaliado separadamente por subordem, para Zygoptera o mesmo padrão foi observado (Preservados: p< 0,001; Alterados p= 0,406). Para Anisoptera tanto em igarapés preservados (p= 0,431) quanto em alterados (p= 0,773) as sobreposições morfológicas não são diferentes de valores esperados em comunidades aleatórias. Demonstramos que os Odonata estão fortemente associados às condições ambientais dos ecossistemas aquáticos na Amazônia Oriental, corroborando nossa hipótese de que a estruturação das comunidades locais responde, majoritariamente, a fatores ambientais (e.g. estrutura da vegetação ripária, impactos humanos e variáveis físico-químicas). Um grande número de espécies de Odonata são estenotópicas, as tornando altamente dependentes de condições locais. Em geral as espécies de Zygoptera são sensíveis às variações ambientais por restrições ecofisiológicas, já os Anisoptera são mais tolerantes às diferentes condições ambientais. Para essas espécies mais especialistas, as condições locais do ambiente tendem a ser mais determinantes para a sua distribuição, o que leva a inferência de que uma seleção de espécies está atuando como processo determinante na estrutura e dinâmica destas comunidades. A relação da comunidade de Odonata com o hábitat identificado neste estudo têm algumas implicações importantes no uso desses organismos para monitoramento em pequenos igarapés. Adicionalmente os padrões de distribuição das espécies de Odonata são afetados pelos processos de similaridade limitante, em especial em ambientes preservados, e para os grupos mais especialistas, como a maioria dos Zygoptera. À luz das rápidas mudanças ambientais, uma questão importante nos estudos sobre estruturação de comunidades é a escala em que o hábitat é medido, uma vez que um hábitat adequado deve atender às necessidades ecológicas de todos os estágios de vida desses indivíduos. Portanto, futuros trabalhos podem usar os fatores ambientais e espacias conjuntamente com a similaridade limitante para melhor compreender a estruturação dessas comunidades.

Esta tese apresenta informações a respeito dos efeitos das variáveis ambientas sobre a ecologia populacional do hospedeiro Encope emarginata e o seu inquilino Dissodactylus crinitichelis e as interações entre estas duas populações no litoral nordestino brasileiro. Foram realizadas amostragem biótica e abiótica, ao longo de nove praias que compõem o litoral pernambucano, que faz parte do Atlântico Sul-ocidental. A granulometria foi a variável abióticas com maior influência sobre as duas espécies. As bolacha-da-praia tendem a ocupar, com maior densidade, a costa norte de Pernambuco, sendo as fêmeas adultas a maioria da população. O período de recrutamento foi descrito para agosto. Os indivíduos de bolacha-da-praia apresentaram maior densidade nas classes de comprimento intermediária, com destaque para os comprimentos 10 à 12 cm. As bolachas-da-praia apresentaram crescimento unifásico, com alometria negativa. Em relação aos parâmetros populacionais de D. crinitichelis, não foi observado variação ao longo dos meses do ano. Os caranguejos também apresentaram maior densidade nas praias do litoral norte. Houve um domínio de machos nos meses do período de estiagem, enquanto que as fêmeas no período chuvoso. Foi observado entradas de indivíduos juvenis ao longo de todo ano, com um pico de recrutamento no mês de agosto. A espécie apresentou crescimento polifásico, com isometria para os juvenis, alometria negativa para os machos adultos, e alometria positiva para os imaturos e as fêmeas adultas. Em relação da influência de E. emarginata sobre a população de D. crinitichelis, foi verificado que os caranguejos apresentam uma preferência de ocupação por bolachas-da-praia adultas, em suas classes intermediárias. No entanto, quando essas encontram-se ocupadas, as bolachas-da-praia imaturas podem ser ocupadas pelos caranguejos. Observou-se uma diminuição na densidade dos estágios subsequentes dos caranguejos, independente dos estágio de desenvolvimento da bolacha-da-praia. Foi observado um predomínio de caranguejos machos ao longo das fases de desenvolvimento bentônico da bolacha-dapraia. O caranguejo D. crinitichelis apresentou crescimento polifásico nos três estágios de desenvolvimento da bolacha-da-praia. Os caranguejos residentes nas bolachas-dapraia imaturas foi observado alometria negativa para os caranguejos juvenis, macho adulto e fêmea adulta, enquanto que os imaturos apresentaram alometria positiva. Os caranguejos residentes nas bolachas-da-praia adulta macho e fêmeas apresentaram alometria negativa para juvenil e macho adulto, enquanto que os imaturos e fêmeas adultas apresentaram alometria positiva. Desta forma, o presente trabalho contribui com informações sobre a biologia populacional de E. emarginata e D. crinitichelis, além de contribuir com papel que uma espécie exerce sobre a outra. Visto que, são espécies bioturvadoras da camada superficial do sedimento marinho.