Dissertações/Teses

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2024
Descrição
  • JOÃO RAFAEL MARQUES PADILHA
  •  

    SESAMOL ATENUA ALTERAÇÕES COMPORTAMENTAIS E DÉFICITS DE MEMÓRIA EM MODELO MURINO DE MALÁRIA CEREBRAL INDUZIDA POR PLASMODIUM BERGHEI ANKA.

     

  • Orientador : KAREN RENATA HERCULANO MATOS OLIVEIRA
  • Data: 15/07/2024
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  • A malária cerebral (MC) é a manifestação infecciosa mais severa provocada pelo protozoário Plasmodium falciparum, apresentando mecanismos imunopatogênicos complexos que incluem inflamação, produção de espécies reativas de oxigênio (EROs) e obstrução da microvasculatura cerebral; ocasionando encefalopatia, disfunções neurocognitivas e coma, podendo evoluir a óbito. A limitação das possibilidades de acompanhamento dos processos patológicos da doença em humanos tornou necessário o desenvolvimento de modelos experimentais, utilizando linhagens de roedores suscetíveis à infecção por diferentes espécies de plasmodium, contribuindo para o entendimento e desenvolvimento de novas terapias. Este estudo avaliou o efeito do composto antioxidante Sesamol em condição de malária cerebral experimental (MCE) induzida por Plasmodium Berghei ANKA (PbA) em murinos, por meio da avaliação de aspectos comportamentais, parasitemia e curva de sobrevivência. O tratamento dos animais infectados em terapia com 20mg/kg de Sesamol promoveu um aumento significativo na sobrevida e proporcionou resultados favoráveis durante a aplicação dos testes comportamentais de campo aberto, SHIRPA, labirinto em Y e reconhecimento de objetos, determinantes do comprometimento cognitivo, em que os indivíduos não tratados apresentaram sinais clínicos frequentemente observados no contexto da malária cerebral e rapidamente evoluíram a óbito na fase aguda da infecção; enquanto os animais submetidos à terapia com Sesamol exibiram sintomas atenuados, demonstrando maior período de sobrevivência pós-infecção e preservação das memorias de trabalho e de curto prazo, bem como desempenho motor, tônus muscular e reflexos. A porcentagem de parasitemia manteve-se a mesma entre os grupos infectados, reforçando a melhora conferida pelo composto.

  • JOSÉ CLEYTON NASCIMENTO GLINS
  • INVESTIGAÇÃO DO MODO DE LIGAÇÃO DA ENZIMA PLA2CB SOBRE O
    COMPLEXO E3-E2-E1 EM CHIKV ATRAVÉS DE TÉCNICAS DE BIOINFORMÁTICA
  • Orientador : ANDERSON HENRIQUE LIMA E LIMA
  • Data: 04/04/2024
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  • A doença do chikungunya é uma infecção causada pelo vírus Chikungunya (CHIKV)
    pertencente à família Togaviridae. A transmissão tem como seus principais vetores a
    picada dos mosquitos do gênero Aedes, sendo os mais evidenciados o Aedes aegypti e
    Aedes albopictus. Segundo dados fornecidos pela organização mundial da saúde, a
    febre chikungunya, como é conhecida, apesentou um avanço em seus índices de
    infecção em cerca de 60%, dentre estes dados está incluso o Brasil, em especial a região
    amazônica, graças ao seu clima chuvoso que proporciona potencial de avanço para o
    principal vetor da doença, o A. aegypt. Um dos principais empecilhos no combate dessa
    virulência, no Brasil, é a ausência de fármacos específicos aprovados; à luz disso, o
    CHIKV apresenta um importante complexo glicoproteico conhecido como E3-E2-E1
    (PDB: 3N42), que é responsável pela acepção viral à célula do hospedeiro, assim,
    apresenta-se como um alvo promissor para o planejamento de novos inibidores, vacinas
    e demais métodos profiláticos. Ademais, em 2021, novas pesquisas apresentaram o
    potencial de inibição deste complexo de proteínas através de uma enzima, a fosfolipase
    (PLA2CB) (PDB:3R0L), encontrada na peçonha de uma serpente ocorrente em território
    brasileiro, Crotallus durissus terrifus, popularmente conhecida como cascavel. Com o
    objetivo de compreender a forma de interação entre a fosfolipase e o complexo,
    aplicamos técnicas de docking proteína-proteína com o auxílio do servidor LZerD, que
    apresenta um eficiente algoritmo de busca baseado em 4 funções de pontuação. Com a
    obtenção da melhor pose do complexo formado, foram geradas as topologias dos
    sistemas (com o inibidor e sem o inibidor) com o auxílio do módulo TLeap (Amber 18).
    Doravante, submetemos os sistemas a cálculos de dinâmica molecular acelerada
    utilizando o pacote de programas Amber 18, assim avaliamos a estabilidade do sistema
    através de cálculos de RMSD e RMSF e descrevemos os estados mínimos através de
    PCA e FEL. Em seguida, discutimos a viabilidade do sistema com cálculos de energia
    livre de ligação MM/GBSA em 3 réplicas de dinâmica molecular clássica. Em nossas
    análises, percebemos que a PLACB se liga a regiões importantes do complexo
    glicoproteico, principalmente na cadeia E1, principal responsável pela acepção. Nossos
    resultados de energia livre também se mostraram promissores, apresentando valores em
    torno de -50kcal/mol, demonstrando boa relação de viabilidade do sistema
  • JULIANA PIRES DOS SANTOS NASCIMENTO
  • "Nanopartículas de L-triptofano: Síntese e Caracterização Físico-Química em Hidróxido Duplo Lamelar

  • Orientador : CLAUDIO NAHUM ALVES
  • Data: 14/03/2024
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  • O Mundo se encontra em estado de epidemia de ansiedade segundo a Organização Mundial de Saúde (OMS), onde o Brasil se destaca, atualmente os transtornos mentais como Depressão e Ansiedade são a principal causa de incapacidade em que pessoas, com condições graves de saúde mental, morrem prematuramente comparadas a população em geral. O aminoácido L-triptofano (TRP) tem sido amplamente utilizado por indivíduos acometidos por transtornos como depressão e ansiedade. Sendo o TRP, precursor do neurotransmissor serotonina, é um aminoácido essencial, ou seja, sua absorção é obtida somente através da alimentação ou suplementação diária, em concentrações elevadas e aproveitamento baixo, no que se trata da síntese de serotonina. Por essa razão, o TRP foi intercalado em hidróxidos duplos lamelares(HDL/MgAl) via método de coprecipitação, onde o HDL/ MgAl sendo utilizado como nanocarreador, visando o melhor aproveitamento do aminoácido na síntese do neurotransmissor. Esta pesquisa investigou o melhoramento da biodisponibilidade do aminoácido na produção de Serotonina, a fim de potencializar seu efeito ansiolítico e antidepressivo na suplementação alimentar.  Todas as amostras obtidas foram caracterizadas por meio de difração de raio-x (DRX), onde os padrões demonstram se o HDL puro e o composto híbrido (HDL-TRP) exibem alto grau de cristalinidade, o que confere uma liberação mais controlada e contínua, Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV) e Espectroscopia por Dispersão de Raios- X (EDS) os quais podem predizer o arranjo morfológico dos cristais gerados e sua composição específica e quantificação no Espectrofotômetro de Ultravioleta- Visível(UV-Vis). Os padrões de DRX puderam demonstrar que o HDL puro e o composto híbrido (HDL-TRP) exibiram alto grau de cristalinidade, com tamanhos desejáveis do padrão de partícula. Já a quantificação do TRP na matriz de HDL foi realizada através da espectroscopia no ultravioleta visível (UV-vis), apresentando como valor quantificado a média de 45,88% de TRP intercalado nas lamelas de HDL, essa concentração demonstra uma molécula promissora quanto ao aumento da sua biodisponibilidade.

  • DANIELE CARVALHO MILLER
  • ESTRUTURA-PROPRIEDADE E AVALIAÇÃO EM MODELOS DE NOCICEPÇÃO E GASTROPROTEÇÃO DE UM DERIVADO DA ASSOCIAÇÃO MOLECULAR ENTRE SALICILATOS E OXICANS 

  • Data: 29/02/2024
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  • Introdução: A dor ou algia afeta a qualidade de vida de muitas pessoas no mundo. Muitos fármacos são usados para o tratamento da dor. O Piroxicam é um fármaco pertencente do grupo dos oxicans, derivado de ácidos fenólicos, fazendo parte da classe dos AINEs. Apesar de não ser o medicamento de primeira escolha em alguns tratamentos, o fármaco é indicado no tratamento de distúrbios musculoesqueléticos agudos, dor pós-traumática outras algesias. Contudo os AINEs tendem a ocasionar uma série de efeitos adversos a nível hepático, cardiovascular e principalmente gastrointestinal. Objetivo: Avaliar a relação estrutura, estabilidade química,atividadeantinociceptiva e gastroprotetora de um derivado do piroxicam (DPCAM)..Metodologia: Foram utilizados 65 camundongos da linhagem Swiss pertencentes à espécie Mus musculus, machos, adultos (aproximadamente 40 dias de idade), pesando entre 30 e 40 g provenientes do Biotério do Instituto Evandro Chagas (IEC), o projeto foi aprovado com o número 28/17. Os camundongos foram tratados por via oral para avaliar atividade gastroprotetora, em grupos PCAM (200mg/kg), DPCAM (20 mg/kg) e grupo controle o qual foi dado o equivalente em volume de solução salina 0,9%. Na verificação de potencial antinociceptivo realizou-se testes de: contorções abdominais induzidas por ácido acético a 0,6%; teste de placa quente e teste de formalina. Resultados/Discussão: O aumento da nucleofilicidade contribuiu para a redução da gastrotoxidade, uma vez que os cálculos moleculares indicaram que o derivado do Piroxicam apresentou o maior valor de HOMO (-6.13 eV) quando comparado ao ácido salicílico (-6.66 eV) e piroxicam (-6.61 eV). O DPCAM demonstrou seu efeito analgésico reduzindo em 71,66 %, o número de contorções abdominais quando comparado ao controle; O DPCAM não apresentou aumento no tempo de latência em nenhum dos intervalos analisados quando comparado ao grupo controle; Na primeira fase da formalina, a dose de 20 mg/kg do DPCAM diminuiu o tempo de lambendura de pata, com inibição de 7,82% quando comparado ao grupo controle. Na segunda fase, o DPCAM apresentou diminuição no tempo lambedura de pata na do se 20mg/kg quando comparada ao controle, com inibição de 88.65%.Na indução das lesões gástricas agudas, o DPCAM (0,08 ± 0.01%) apresentou diferenças em relação ao grupo PCAM (0,40 ± 0,09 %) quando analisado o aspecto macroscópico da mucosa gástrica. O que indica que a droga possui um efeito adverso mínimo de lesionar essa estrutura. Conclusão: O DPCAM apresentou efeitos positivos em relação a estrutura e atividade indicando um efeito gastroprotetor  ação antinociceptiva. 

2023
Descrição
  • ANA CAROLINA SANTOS DA PONTE SOUZA
  • PLANEJAMENTO MOLECULAR E CAPACIDADE ANTIOXIDADE DE CICLODERIVADOS DO DICLOFENACO E RELAÇÃO
    BIOISOSTÉRICA ENTRE OS SISTEMAS PIRAZOLONA E INDOLONA
  • Data: 20/11/2023
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  • O diclofenaco (DCF) é um anti-inflamatório da classe não esteroide (AINE) que possui as atividades de analgesia, com propriedades antipiréticas e anti inflamatórias, sendo um dos medicamentos desta classe terapêutica mais consumido e prescrito no mundo, para o tratamento de doenças como artrite, reumatismo, espondilite anquilosante e dores musculares agudas. Entretanto este medicamento possui alto índice no desenvolvimento de hepatotoxicidade, mesmo em doses terapêuticas, por algumas ocasiões levando ao óbito do paciente, assemelhando-se a quadros de hepatites virais. A classe de derivados propostos objetivou a modificação do núcleo do DCF, levando a análogos dos fármacos neuroprotetores edaravona (EDV) e Riluzol (RLZ), amplamente utilizado em terapias medicamentosas, concomitantemente com outros fármacos pró-oxidantes produtores de espécies reativas de radicais livres. Nossos resultados preliminares mostraram que os derivados propostos do ácido diclofenaco apresentaram melhores valores para as propriedades relacionadas a doação de elétrons, indicando que estes possuem maior estabilidade química. Além disso, demostraram a mesma tendência que os orbitais de fronteira HOMO e LUMO, apresentando uma performance superior a EDV e RLZ, com propriedades de SET, HAT e EDLC-H semelhantes à da edaravona, tornando-o uma nova alternativa promissora para o tratamento de doenças
    neurodegenerativas.
  • LUCIANE BARROS SILVA
  • “Identificação de potenciais entidades químicas com atividade quimioterápica antimicrobiana frente a Cepas de Staphylococcus aureus: uma abordagem no ensino de bioinformática”.

  • Data: 19/10/2023
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  •  

    As substâncias antimicrobianas são componentes químicos capazes de inibir o
    crescimento ou eliminar microorganismos, como bactérias. Essas substâncias
    desempenham um papel vital na prevenção e tratamento de infecções causadas
    por esses agentes patogênicos, contribuindo significativamente para a saúde
    humana e animal. A atividade antibacteriana é frequentemente direcionada a
    alvos moleculares específicos nas células microbianas que desempenham
    funções vitais para sua sobrevivência. Isso gerou um interesse clínico no
    desenvolvimento de atividade antibacteriana e seriam potenciais medicamentos
    contra esses danos, pois a vancomicina é um antibiótico usado principalmente
    para tratar infecções causadas por bactérias gram-positivas, incluindo cepas
    resistentes de Staphylococcus aureus (MRSA). O alvo molecular da vancomicina
    é a parede celular bacteriana. Assim, neste trabalho serão planejados potenciais
    compostos com atividade antimicrobiana na enzima essencial na síntese de DNA
    bacteriano, com o auxílio de ferramentas computacionais, utilizados para
    otimizar o processo de síntese de compostos. A atividade antibacteriana será
    avaliada via Triagem Virtual baseado em alvo e ligante, bem como na
    determinação das propriedades farmacocinéticas e toxicológicas (ADME/TOX).
    Por fim, o método de análise de adme/tox, afinidade e energia de ligação
    mostraram resultados satisfatórios para a predição atividade antibacteriana nos
    compostos obtidos via triagem virtual baseado em alvo e ligante.

  • DANDARA DE AGUIAR BOTELHO
  • RELAÇÃO ESTRUTURA E ATIVIDADE DE FÁRMACOS APLICADOS NO TRATAMENTO DA ESCLEROSE LATERAL AMIOTRÓFICA (ELA)

  • Data: 09/10/2023
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  • A Esclerose Lateral Amiotrófica (ELA) também conhecida como Doença de Lou Gherig, é uma doença neurodegenerativa fatal. Caracterizada pela morte celular seletiva de neurônios motores superiores (NMS) e neurônios motores inferiores (NMI) levando a sintomas não motores como depressão e ansiedade e sintomas motores como paralisia irreversível. Pode ser classificada em dois grandes grupos: esporádica e familiar, onde a esporádica é a forma mais comum sendo responsável por 90% dos casos. Sua causa não está totalmente esclarecida, as primeiras hipóteses etiológicas relacionadas a ELA foram a mutação da SOD1 (superóxido dismutase-1) e a neurotoxicidade do glutamato. O diagnóstico é clínico e baseado na história e no exame físico. A morte ocorre por volta de 3 a 5 anos após o início dos sintomas. Atualmente não há cura para a doença e o tratamento medicamentoso é feito com o uso do Riluzol ou Edaravona. Por esse motivo, neste trabalho foi realizado um estudo teórico relacionando a estrutura e atividade antioxidante do riluzol e edaravona. Um estudo teórico comparativo da estrutura e capacidade antioxidante entre edaravona e riluzol foi realizado usando o método TFD (Teoria do Funcional de Densidade) com o conjunto de base B3LYP/6-31+G (d, p). Os cálculos foram realizados em fase gasosa e o método PCM em solventes apolares (clorofórmio e heptano) e solventes polares (água e etanol). Uma análise conformacional mostrou que o amino-exocíclico é o tautômero preferencial do riluzol quando comparado ao amino-endocíclico. Não há diferença entre a fase gasosa e o meio solvente usando o modelo contínuo polarizável (PCM). As propriedades antioxidantes foram calculadas com base nos valores de HOMO, potencial de ionização (PI) e energia de dissociação da ligação (EDL). Os valores de HOMO e PI mostraram que ambos os compostos têm desempenho comparável como nucleófilo e antioxidante por transferência de elétrons e os valores de EDL mostraram que a edaravona possui uma maior capacidade antioxidante por transferência de hidrogênio. As contribuições da densidade de spin explicam a melhor estabilidade química do radical livre catiônico do riluzol em comparação com a edaravona. Por fim, foram avaliados dois derivados de benzotiazol com suas capacidades antioxidantes comparadas com a edaravona. Existe uma forte relação estrutural entre riluzol e edaravona quando comparados com outros análogos de anel relacionados.

  • CARLOS OLIVEIRA MIRANDA
  • SELEÇÃO DE NOVOS DERIVADOS PIRAZÓLICOS ALQUILADOS DA EDARAVONA E ESTUDO DE SEUS MECANISMOS ANTIOXIDANTES

  • Data: 11/09/2023
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  • Um estudo de Química Quântica no nível da teoria DFT/B3LYP/6-31+G(d,p) foi empregado para a seleção de novos derivados pirazólicos alquilados  relacionados à edaravona e seus mecanismos antioxidantes. A partir da determinação das propriedades físico-químicas - HOMO, LUMO, Gap, Potencial de Ionização (PI) e Energia de Dissociação de Ligação (EDL) - para derivados de pirazol substituídos por grupos metil nas posições 3, 4 ou 5, identificou-se que a presença de duas ou três metilações aumentam a capacidade de transferência de elétrons e hidrogênio quando um dos grupos metil está na posição 5. De acordo com as contribuições de densidade de spin, o radical livre catiônico do derivado trimetilado apresentou as melhores estruturas de ressonância, mostrando-se o mais estável entre eles. Nossos resultados identificaram pelo menos quatro derivados do pirazol como potenciais antioxidantes relacionados à edaravona, dentre os quais o trimetilado se mostrou o mais potente.

  • HEMILLIN BRENDA TEIXEIRA SANTOS
  • ABORDAGEM COMPUTACIONAL DOS EFEITOS DA MUTAÇÃO NA ATIVIDADE ENZIMÁTICA DA LOVASTATINA ESTERASE (PcEST)

  • Data: 23/08/2023
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  • A enzima PcEST, do fungo Penicillium chrysogenum, apresenta um enorme potencial na indústria farmacêutica, pois atua na conversão da catálise da lovastatina em monacolina J, principal precursora na produção de sinvastatina, droga redutora do colesterol. Neste trabalho, buscamos avaliar os impactos de mutações na estabilidade da enzima PcEST, por meio de métodos computacionais de dinâmica molecular, a fim de obter as análises estruturais e energéticas da enzima PcEST nativa e mutantes. Segundo os resultados, a enzima PcEST nativa e a mutação D106A apresentaram um complexo enzima-ligante (Δ𝐺𝑏𝑖𝑛𝑑) com maior afinidade. Ademais, os estudos de dinâmica molecular (DM) também revelaram que a enzima PcEST e a mutação D106A são mais ativas devido às múltiplas interações efetivas com os resíduos Ser57, Phe129, Tyr170, Ile236, Gly240, Gly241, His253 e Phe309, que desempenham um papel fundamental na estabilidade do substrato. As mutações W344K e Y127A, por outro lado, exibiram perda de interações de hidrogênio durante a simulação de dinâmica molecular entre os principais resíduos presentes no sítio ativo da enzima PcEST. Já os mutantes W344F e Y127F apresentaram um aumento no 𝐾𝑚, deste modo provocando a redução em sua atividade catalítica. Portanto, discutimos as principais interações entre a enzima PcEST nativa e as mutações D106A, D131A, S57A, W344K, W344F, Y127A e Y127F em complexo com o substrato lovastatina, com o intuito de agregar informações para aumentar a sua resistência e contribuir para a produção de Monacolina J e, consequentemente, para a síntese de sinvastatina. As informações obtidas a partir de sua análise serão de suma importância para a conjectura de novas variantes da enzima PcEST propostas para a futura síntese e ensaios biológicos.

  • JOANA JULIA DOS SANTOS MORAES
  • Simulação Computacional de 1,2,3-Triazóis Análogos de Ácido Kójico como Inibidores da Enzima Tirosinase.

  • Data: 26/05/2023
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  • A enzima Tirosinase (TYR) constituinte das etapas biosintéticas da melanogênese, está ligada à várias disfunções de caráter cutânea nos indivíduos. Particularmente, destaca-se a hiperpigmentação, melasma e o câncer de pele na forma não-melanômica e melanoma maligno como algumas discromias causadas pelo desequilíbrio no complexo da TYR . A grande maioria das doenças de pele são tratadas com substâncias com agentes despigmentantes, os quais demonstraram ações adversas nos melanócitos da pele, como é ácido kójico (AK) que apesar de apesar de seus efeitos colaterais, vem ganhando destaque em pesquisas para inibidores da TRY. Com isso, a TYR tornou-se um importante alvo biológico para o desenvolvimento de novos fármacos. Neste trabalho, pretende-se estudar os inibidores tirosinase, tendo como via os análogos do ácido kójico, neste caso, os 1,2,3-triazóis análogos ao ácido (6a-p), utilizando as abordagens computacionais  Ancoragem molecular, Dinâmica molecular e o Método LIE (Linear Interaction Energy), utilizado para calcular Energia livre de ligação nos complexos. Os cálculos de ancoragem molecular mostraram concordâncias com os dados experimentais, com distâncias (Å) próximas da cristalografia e conformações mais estáveis. Essas técnicas computacionais irão possibilitar uma análise mais cirúrgica dos sistemas a serem investigados.

  • TAMARA ALICE MARINHO COELHO
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    ESTUDOS COMPUTACIONAIS COM VISTAS AO PLANEJAMENTO DE INIBIDORES SELETIVOS PARA A ENZIMA MPRO E A PROTEÍNA SPIKE DO VÍRUS SARS COV-2, COM INTERESSE A FUTURO TRATAMENTO ALTERNATIVO PARA A COVID-19.

     

  • Data: 16/03/2023
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  • Final de 2019 surgiu em Wuhan na China uma nova espécie de coronavírus definido pela OMS no ano seguinte como SARS-CoV-2, causador da síndrome respiratória aguda grave (COVID-19), com milhares de mortes pelo mundo. O novo coronavírus apresenta duas proteínas fundamentais para a sua sobrevivência, a Spike, responsável pela entrada do vírus na célula a partir da interação com a ACE2 (enzima conversora de angiotensina 2) e a proteína Mpro que promove a clivagem proteolítica formando proteínas virais funcionais que participam da replicação e transcrição viral. Devido ao cenário pandêmico, o planejamento de fármacos auxiliado por computador foi fundamental para a descoberta e reposicionamento de fármacos para possíveis tratamentos alternativos contra a infecção viral. Este estudo objetiva investigar as proteínas Mpro e Spike, todas a nível molecular, com base em estruturas depositadas no Protein Data Bank (PDB), em complexo ou não com ligantes/inibidores para realizar triagem virtual baseada em forma, similaridade e farmacóforo, utilizando bases de dados de compostos. Após diferentes experimentos de triagem virtual, foram aplicados filtros de propriedades farmacocinéticas e toxicológicas de cada potencial inibidor em seu sítio de ação molecular mais provável, seguido de inspeção visual e, por fim, foram selecionados 27 potenciais novos inibidores/ligantes para as proteínas Mpro e Spike, dos quais 9 foram classificados como os mais promissores e poderão ser utilizados em pesquisas futuras para o desenvolvimento do tratamento alternativo para a COVID-19
  • MELK ROBERTO DA CUNHA PALHETA
  • DERIVADO DO MUSCIMOL PREVINE O COMPORTAMENTO TIPO-ANSIEDADE INDUZIDO PELO ESTRESSE AGUDO DE CONTENÇÃO EM Danio rerio (ZEBRAFISH)

  • Data: 20/02/2023
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    O estresse é uma reação cotidiana observada em grande parte dos seres vivos, estando relacionado a situações de perigo ou alerta. Entretanto ele pode ser prejudicial, ocorrendo a longo prazo ou fora de uma situação que justifique tal reação, estando relacionado com doenças como a ansiedade, causando desequilíbrios homeostáticos ao organismo. Nesse viés, o sistema GABAérgico tem um papel de destaque relacionado a ansiedade e estresse, pois ele tem a capacidade de modular a atividade de diversas estruturas cerebrais, inibindo as vias neuroquímicas. Dessa forma, podendo atuar sobre estruturas que estão diretamente relacionadas com a ansiedade e o estresse, como o eixo hipotálamo-pituitária-adrenal (HPA), que é o principal envolvido na dinâmica da reação do organismo na resposta a estímulos estressores, resultando em alterações fisiológicas e comportamentais que preparam o organismo para reagir a uma nova situação, estando diretamente relacionado ao comportamento tipo ansiedade. Desse modo, o sistema GABAérgico é visto como a principal via para mitigação de tais efeitos, pois o estímulo aos receptores GABA inibe vias neuroquímicas no sistema nervoso central de mamíferos adultos, podendo combater os efeitos dos estímulos estressores. Nesse contexto, tais estudos são de máxima importância, pois muitos medicamentos atualmente utilizados no tratamento de ansiedade, como os benzodiazepínicos, estão relacionados com efeitos iatrogênicos, havendo a necessidade  de mais pesquisas que visem melhorar o arsenal medicamentoso frente a ansiedade. Dessa forma, o estudo irá avaliar os efeitos de um derivado do muscimol, o MK-0605, um potente agonista seletivo dos receptores GABAA, em modelo animal Danio rerio (zebrafish) que serão submetidos ao protocolo de estresse agudo de contenção (EAC), com o objetivo de gerar efeito ansiolítico, mitigando o  comportamento tipo ansiedade em zebrafish

     

2022
Descrição
  • BEATRIZ CASTRO BORGES QUEIROZ
  • ATIVIDADE CITOTÓXICA DO ÁCIDO 3-HIDROXI-1,2-DIMETIL-4(1) -PIRIDONA (ANÁLOGO DO ÁCIDO KÓJICO) EM MODELO IN VITRO DE MELANOMA MURINO

  • Data: 29/11/2022
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  • O melanoma é o tipo mais agressivo de câncer de pele, sendo responsável por mais de 60% das mortes por este tipo de câncer. Um dos principais fatores de risco é a alta exposição à radiação UV, e tem origem nas células de defesa, melanócitos, que são células produtoras de melanina, o pigmento castanho que tem como principal função a proteção do genoma celular contra os efeitos danosos da radiação UV. A enzima tirosinase é de grande importância no processo de síntese de melanina. Devido a hiperpigmentação presente no melanoma, fármacos inibidores da tirosinase são promissores na terapia desta neoplasia. Nesse contexto, o objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito citotóxico da Deferiprona (S-04) em modelo in vitro de melanoma murino. A S-04 possui potencial efeito citotóxico em células B16F10 de melanoma após tratamento em diferentes concentrações, sendo esse efeito observado a partir da concentração de 25µM, além de demostrar alto grau de segurança em diferentes concentrações testadas, através da viabilidade de fibroblastos murinos pelo ensaio de MTT.  Em relação ao mecanismo de morte, o tratamento com S-04 mostrou aumento na marcação de anexina, indicativo de morte por apoptose, sendo assim S-04 mostrou ser capaz de induzir apoptose. Drogas com perfil de inibidores de tirosinase, podem ser candidatas no tratamento de desordens de pigmentação.

  • FERNANDA PAULA ANDRADE MELO
  • ANÁLISE ESTRUTURAL EMPÍRICA NA IDENTIFICAÇÃO DE MODIFICAÇÕES ESTRUTURAIS EM PRODUTOS BIOATIVOS E SELEÇÃO DE NOVOS DERIVADOS HIPOGLICEMIANTES.
  • Data: 18/05/2022
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  • A medicina popular foi amplamente utilizada pelos povos antigos, indígenas e hoje por populações de baixa renda. A flora amazônica sempre foi cobiçada por países estrangeiros devido ao seu potencial químico, farmacêutica e medicinal, e pela sua diversidade molecular, sendo comuns os casos de biopirataria. Apesar de todo seu potencial em compostos bioativos, não há fármacos registrados desenvolvidos na própria região, especialmente devido a falta de industrias e recursos humanos qualificados para as áreas de planejamento e desenvolvimento de fármacos por modificação molecular de produtos naturais bioativos. O objetivo deste estudo
    foi demonstrar que os métodos de análise empírica podem ser empregados para o desenvolvimento de fármacos, utilizando como exemplo a classe dos hipoglicemiantes. Os métodos de modelagem e simulação computacional usando os métodos semiempírico PM3 e DFT/B3LYP/6-31G(d,p) foram apenas aplicados para explicar as diferenças na atividade hipoglicemiante no modelo de diabetes induzido pela aloxana de um possível fragmento natural na estrutura química da glibenclamida. A análise da relação entre estrutura e atividade empírica dividiu os compostos hipoglicemiantes em diferentes classes. Os resultados mostraram uma relação estrutural entre riparinas, meglitinidas e outros hipoglicemiantes, indicando que a presença de um grupo ácido carboxílico é imprescindível para a atividade biológica. Os parâmetros de solubilidade e eletrônicos mostraram que a análise estrutural aliada aos métodos de modificação molecularforam mais importantes que os cálculos computacionais tanto para a elucidação do mecanismo de ação, quanto para a seleção de compostos mais
    promissores. Devido a sua maior nucleofilia e menor eletrofilia comparável com as meglitinidas, os derivados propostospodem ser uma alternativa para o tratamento da diabetes. O exame dos valores de CLogP e EH indicaram que as propriedades de solubilidade dos novos compostos são similares aos hipoglicemiantes de primeira e segunda geração. A estrutura básica dos hipoglicemiantes foi mantida entre os grupos aromáticos e alifáticos, com redução dos valores de potencial de ionização e energia de estabilização, aumentando a capacidade antioxidante dos novos derivados quando comparado aos valores médios das diferentes classes
    avaliadas neste trabalho. A capacidade antioxidante pode estar associada com a atividade anti inflamatória,que poderia explicar o impacto da riparina como porção hipoglicêmica e a adição de grupos funcionais ácidos poderia incrementar suas propriedades hipoglecemicas. As propostas de síntese dos novos compostos foram adicionadas.
  • RUAN SOUSA BASTOS
  • PLANEJAMENTO E IDENTIFICAÇÃO DE INIBIDORES PARA O ALVO SPIKEACE2 DO SARS-COV-2

  • Data: 18/01/2022
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  • O Coronavírus pertencente à família Coronaviridae e à ordem Nidovirales, é um vírus não segmentado que atua nas fitas simples de RNA. Um novo vírus foi descoberto em dezembro de 2019 quando começou uma epidemia na cidade de Wuhan na China. Conhecido oficialmente por síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2). As infecções ocorrem através da interação da proteína S com a enzima conversora da angiotensina 2. Estudos de triagem virtual vem sendo explorados para determinar candidatos potenciais para o tratamento de várias doenças. Mesmo com a descoberta de vacinas para a COVID-19, o vírus ainda continua sendo disseminado. A hidroxicloroquina apresentou estudos que mostram a eficácia para SARS-CoV2 em ensaios in vitro. Nesse estudo, foi realizado o planejamento e identificação de ligantes com potencial atividade contra proteína spike do SARS-CoV-2. As estruturas de diferentes antiparasitários foram utilizadas para construção do modelo farmacofórico. Inicialmente, determinou-se a região ativa da estrutura cristalina da proteína spike ligada a ACE2 (PDB ID: 6M0J). Em seguida, realizou-se a triagem virtual e obtiveram 2000 mil moléculas que passaram por diversas etapas de filtragem das suas características farmacocinéticas e toxicológicas. Os dados obtidos de características farmacocinética, farmacológicas e toxicológicas foram utilizados para separar somente aquelas com melhor perfil para fármaco. Os candidatos aprovados no perfil de fármaco passaram para o estudo de afinidade de ligação. O docking molecular apresentou cinco estruturas com afinidade de ligação melhores que a hidroxicloroquina. O ligand_003 apresentou uma afinidade de ligação de -8.645 kcal.mol-1 sendo considerado um valor ótimo para o estudo. Os ligantes Ligand_003, ligand_033, ligand_013, ligand_044 e ligand_080 apresentam valores favoráveis e que se enquadram no perfil de novos fármacos. Estudos de acessibilidade sintética e análise de similaridade, foram realizados para selecionar moléculas com potencial favorável de síntese. Os valores de IC50 teóricos demonstram que os candidatos são promissores para testes in vitro. Os descritores químicos demonstraram uma boa estabilidade molecular para os candidatos. Os estudos teóricos aqui apresentados demonstram que essas estruturas têm potencial para serem estudados como antivirais para SARS-CoV-2.

2021
Descrição
  • LÚCIO ROCHA DE LIMA
  • Identificação de potenciais compostos bioativos com atividade inseticida contra o Aedes aegypti (Linnaeus, 1762) a partir de derivados n-acilpiperidina: uma abordagem de Bioinformática.
  • Data: 20/08/2021
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  • O Aedes aegypti é o transmissor de variados patógenos humanos que temcausado a morte de milhões de pessoas no mundo todo, principalmente naAmérica Latina. O uso exacerbado dos principais inseticidas comercializadostem proporcionado resistência do vetor à ação desses compostos. Derivados den-acilpiperidina têm mostrado dados robustos de atividade larvicida contra oAedes aegypti. A partir desses dados experimentais e dos avanços na área da química computacional e modelagem molecular, o planejamento de compostos bioativos transformou-se em uma estratégia viável e eficiente. Dentre várias estratégias no planejamento e desenvolvimento de compostos bioativos, os métodos computacionais de triagem virtual baseado em ligante e estrutura são técnicas que tem facilitado a busca de novos compostos bioativos. Neste estudo, foi realizada a triagem virtual de compostos potenciais a partir de derivados de n-acilpiperidina afim de obter compostos com potencial atividade inseticida contra o Ae. aegypti, por meio de métodos in silico afim de construir e avaliar
    hipóteses farmacofóricas (PharmaGist), realizar a triagem virtual baseado em farmacóforos (Pharmit), predizer as propriedades ADME/Tox dos compostos estudados (Preadmet/Derek 10.0), predizer a probabilidade de atividade biológica dos novos compostos (PASS), realizar simulações de Docking Molecular (AutoDock 1.5.6) das melhores estruturas com os alvos biológicos cristalográficos catalogados no Proteín Data Bank: PDB ID’s: 1QON, 4M0E, 6ARY e 5V13. Além dessas etapas, foram feitas predições de Lipofilicidade e Solubilidade em água, bem como a elaboração da Rota Sintética Terórica tendo em vista futuros ensaios biológicos. O modelo farmacofórico abrangeu compostos que mostraram bons resultados de predições ADME/Tox e predições de atividade em alvos biológicos relevantes. As moléculas MP-416 e MP-073 exibiram os melhores resultados de afinidade de ligação aos alvos, além de apresentarem interações significativas com resíduos de aminoácidos. Finalmente, as moléculas MP-416 e MP-073 provaram ser potenciais candidatas a inseticidas contra o mosquito Aedes aegypti.
  • ERIKA VASCONCELOS DE OLIVEIRA
  • EFEITOS NEUROPROTETORES DA MANGIFERINA EM MODELO EXPERIMENTAL DE ISQUEMIA FOCAL IN VIVO

  • Data: 30/06/2021
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  • O acidente vascular encefálico é uma desordem neural que acomete milhões de pessoas no mundo inteiro, sendo a segunda causa de morte, dentre todas as demais doenças globais. Após lesão isquêmica, ocasionada pela interrupção do fluxo de sanguíneo nos vasos que irrigam o encéfalo (AVEi), os déficits funcionais são geralmente incapacitantes e permanentes ao paciente.  E com exceção do uso de trombolíticos, inexistem outros tratamentos farmacológicos ou terapia celular disponível a esta condição patológica. Devido a sua relevância epidemiológica, clínica e econômica-social, torna-se imprescindível à busca de novos tratamentos, tais como o desenvolvimento de agentes neuroprotetores. Existem diversos produtos naturais com ação antioxidante, porém suas ações terapêuticas para doenças do sistema nervoso central (SNC) são pouco investigadas. No presente trabalho, utilizamos um modelo experimental de AVEi focal para avaliar as ações neuroprotetoras do composto bioativo presente na mangueira, a Mangiferina (Mng). Ratos Wistar adultos foram submetidos à lesão isquêmica focal, através de microinjeções (40pMol/µl) de endotelina-1 (ET-1) no córtex sensoriomotor primário (S1/M1) e tratados com injeções intraperitoniais de Mangiferina (30 mg/kg). Os animais foram perfundidos 4 dias após a lesão. A análise histológica foi realizada pela coloração com violeta de Cresila. Os resultados obtidos indicam que a mangiferina possui atividade protetora para células nervosas, contra os danos causados pela lesão isquêmica.

  • EMILY CHRISTIE MAIA FONSECA
  • INVESTIGAÇÃO DO MECANISMO DE RESISTÊNCIA AO GLIFOSATO EM EPSPS SINTASE (5-enOLPIRUVILCHIQUIMATO-3-FOSFATO) DE CLASSE I

      

  • Data: 29/06/2021
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  • A enzima 5-enolpiruvilchiquimato-3-fosfato Sintase conhecida como EPSPS está presente na via do chiquimato e catalisa a reação envolvida na produção de aminoácidos essenciais para a sobrevivência das plantas e microrganismos. A enzima EPSPS é o principal alvo de herbicidas e antibióticos, uma vez que essa
    enzima não está presente em mamíferos. O herbicida mais utilizado no mundo há mais de 40 anos, glifosato, tem como alvo a enzima EPSPS, entretanto, algumas mutações na enzima a tornam resistente ao glifosato. Existem dois mecanismos de resistência da enzima EPSPS, e são descritos como TSR (do inglês, Target site
    resistance) e mecanismo NTSR (do inglês, Non-target site resistance) sendo o primeiro mecanismo, (TSR) relacionado a mudanças na estrutura tridimensional da enzima, assim como mutações dentro do sítio alvo. O segundo mecanismo, NTSR são outros mecanismos que não envolve mudança conformacional da enzima. Duas
    espécies de EPSPS de ervas daninhas foram objetos de estudo para essa pesquisa, cada uma delas na sua forma nativa e mutante sendo elas, Conyza sumatrensis, que desenvolveu mutação no resíduo P106T, Eleusine indica, com a dupla mutação nos resíduos T102I e P106S. A fim de comparar, teoricamente, como essas
    mutações influenciam na resistência dessas espécies foram realizados cálculos de Dinâmica Molecular (DM) por 100ns (nanossegundos) para todos os sistemas, nativos e mutantes e após os cálculos de DM, foram feitas análises de energia livre de ligação por três métodos: MMPBSA; MMGBSA e SIE para a determinação da
    estabilidade energética dos complexos. Foram obtidas energias correspondentes, onde, as espécies sensíveis ao glifosato correspondem aos complexos mais estáveis energeticamente e as espécies resistentes ao glifosato apresentam estabilidade menor, bem como a perda de interações importantes a catálise
    enzimática da EPSPS.
2020
Descrição
  • ANA CLAUDIA DE SOUSA ARAUJO
  • Intercalação do Ácido Ferúlico em Hidróxidos Duplos Lamelares Suportados por Quitosana: síntese e caracterização físico-química

     


  • Data: 04/08/2020
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  • O ácido ferúlico (AF) é um dos ácidos fenólicos mais abundantes natureza – presente em plantas e em alimentos constituintes da alimentação dos brasileiros – apresenta certas propriedades, tais como: de parar cadeias de reações radicalares por ressonância, seguida de sua polimerização e, por conta disso, oferece uma excelente proteção contra a radiação ultravioleta, porém a instabilidade que leva a oxidação dessa molécula, ainda, é um desafio. O presente trabalho, portanto, buscou sintetizar, caracterizar e avaliar a liberação controlada do ácido ferúlico, intercalado em hidróxidos duplos lamelares (HDL) e complexado em quitosana (QUI). Neste trabalho, o AF foi intercalado em ZnAl-HDL (razão molar 2:1) através do método de coprecipitação, e complexado em QUI. Desta forma, os nanohibridos sintetizados foram caracterizados por difração de raios-X (DRX), espectroscopia de absorção ultravioleta visível (UV-vis), espectroscopia por infravermelho (IV), análise termogravimétrica (TGA), análise térmica diferencial (DTA), e, por fim, microscopia eletrônica de varredura (MEV); já a quantificação e a cinética do AF na matriz foi determinada por espectroscopia de absorção UV-Vis. A confirmação de síntese foi demostrada por análise de DRX com os planos basais do tipo (003), (006), (110), característicos do HDL e o pico (100) típico da QUI encontrados nos híbridos. No IV as regiões considerada a “impressão digital” do HDL, em 604 e 425 cm -1 estavam presentes nos híbridos. Nas leituras no MEV foi possível observar as estruturas do HDL e dos híbridos com as alterações evidentes, assim o hibrido (HDL-AF-QUI). No TG foi possível observar no HDL-AF e HDL-AF-QUI a estabilidade térmica que os hidróxidos duplos lamelares e a quitosana proporcionam.  No UV-vis foi realizada a leitura da cinética de liberação, provando que os híbridos possuem de fato uma liberação controlada. A principal conclusão que os nanohíbridos apresentaram a presença de HDL e da quitosana na sua estrutura por meio do DRX, comprovando estabilidade térmica através do TG, biocompatibilidade, proteção a fotosensibilidade; e por fim, através do UV-Vis foi possível acompanhar a liberação controlada, até o presente momento é que por intermédio sugere ter excelente potencial fármaco.

     

  • RAFAELA MARTINS REIS
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    CURSO TEMPORAL DA DEGRADAÇÃO E RESTAURAÇÃO DE REDES PERINEURONAIS APÓS A AÇÃO DA ENZIMA ChABC ENTREGUE VIA IMPLANTE DE BIOMEMBRANA NO CÓRTEX CEREBRAL DE RATOS

  • Data: 18/03/2020
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  • Os proteoglicanos de sulfato de condroitina (PSGs) são componentes especializados da matriz extracelular (MEC) do tecido nervoso relacionados à restrição da neuroplasticidade, à estabilização sináptica e a concentração de fatores de essenciais à fisiologia cellular. Quando condensados, formam as redes perineuronais (RPNs) e seu surgimento coincide com o fim do período crítico de plasticidade e redução do potencial de reorganização sináptica no sistema nervoso central (SNC). A degradação das RPNs, pela enzima condroitinase ABC (ChABC), vem sendo usada como ferramenta para ―reabertura‖ da neuroplasticidade no SNC adulto. Neste trabalho, analisamos a dinâmica temporal de degradação e ressurgimento das RPNs no córtex somestésico primário (S1) após degradação pela enzima ChABC em modelo experimental in vivo usando um veículo para entrega focal e sem lesionar o tecido nervoso. Deste modo, utilizamos Rattus novergicus da linhagem Wistar
    adultos que foram submetidos ao implante da biomembrana feita com etilenovinil-acetato saturada com a enzima ChABC no hemisfério cerebral esquerdo (HE). Os tempos de vida pós-implante foram 1, 3 e 7 dias, utlizando hemisfério cerebral não implantado (hemisfério direito – HD) como controle. Nossos resultados demonstraram que a degradação das RPNs via implante da biomembrana saturada com ChABC aconteceu a partir do dia 1 pós-implante com redução do número total de células com RPNs maduras no hemisfério implantado (HE). Também houve aumento significativo no número total de células com RPNs imaturas no HD 7 dias após o implante. Não houve processo neuroinflamatório ou ativação glial, mas a retirada de componentes da MEC alterou a imunomarcação das células nervosas 7 dias após o implante da biomembrana com a ChABC. Portanto, a biomembrana de polímero de etileno-vinil-acetato foi eficiente para entrega focal da enzima ChABC e promoveu degradação das RPNs na área S1 de ratos adultos, não provocou lesão mecânica no tecido nervoso, nem ativou reatividade glial e a área de degradação enzimática diminui com o passar do tempo (de 1 para 7 dias).

  • VITOR HUGO DA SILVA SANCHES
  • DESENVOLVIMENTO DE CANDIDATOS A FÁRMACOS PARA TRATAMENTO DELEUCEMIA MIELÓIDE CRÔNICA A PARTIR DO IMATINIBE.

  • Data: 28/02/2020
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  • A Leucemia Mielóide Crônica (LMC) é uma doença mieloproliferativa crônica clonal, caracterizada por leucocitose com desvio à esquerda, esplenomegalia e pela presença do cromossomo Philadelphia (Ph), que resulta da translocação recíproca eequilibrada entre os braços longos dos cromossomos 9q34 e 22q11, gerando aproteína híbrida BCR-ABL, com atividade aumentada de tirosina quinase. Assim,realizou-se um estudo de triagem virtual baseado no ligante Imatinibe, com posecristalográfica definida, depositada sob código PDB ID 1IEP. Foram utilizadas seis basesde dados comercias para seleção de moléculas, por meio do software ROCS (similaridade por forma) e EON (similaridade eletrostática), seguidas de predição farmacocinéticas e toxicológicas in silico, resultando em 9 estruturas com valoressatisfatórios, comparados com o Imatinibe, que foram submetidas a estudo de predição de atividade biológica via servidor online PASS Prediction, resultando em duas estruturas com valores de Probabilidade de ser “ativo” (Pa) para atividade de inibição a proteína quinase, sendo as moléculas LMQC01 (Pa= 0,457) e LMQC04 (Pa= 0,658), selecionadas para estudo de docking molecular. Utilizou-se a interface gráfica Pyrx 0.8, para avaliar as prováveis interações com os resíduos de aminoácidos e a afinidade de ligação as estruturas com o sítio ativo BCR-ABL, resultando em -8.6Kcal/mol-1 para a estrutura LMQC01 e -12.2Kcal/mol-1 para LMQC04, sendo que a estrutura LMQC04 alcançou valor superior a afinidade de ligação experimental do imatinibe (-11.18Kcal/mol-1), sendo este selecionado como fármaco promissor para estudos posteriores.

  • ROZIRES PEREIRA LEÃO
  • PLANEJAMENTO DE POTENCIAIS BIOATIVOS COM ATIVIDADE ANTIINFLAMATÓRIA A PARTIR DO ROFECOXIBE NO RECEPTOR CICLOOXIGENASE 2

  • Data: 27/02/2020
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    O receptor ciclo-oxigenase-2 é um alvo terapêutico para planejamento de potenciais fármacos com atividade anti-inflamatória. O Rofecoxibe inibidor seletivo da COX-2, foi selecionado como composto pivô para realizar a triagem virtual baseada em ligante e buscar estruturas com similaridade de forma (ROCS) e eletrostática (EON), usando seis bases de dados comerciais. Esse método, utilizou como filtro as propriedades farmacocinéticas e toxicológicas, determinadas por meio dos softwares QikProp e Derek. As moléculas LMQC72, LMQC50 e LMQC36 selecionadas mostram resultados farmacocinéticos satisfatórios relacionados a absorção e distribuição. As predições toxicológicas dessas estruturas não exibiram alertas para possíveis grupos tóxicos e consideradas biologicamente ativas. Em seguida, avançaram para o estudo de ancoragem molecular, estas estruturas apresentaram resultados de afinidade de ligação com o receptor COX-2 de: LMQC72 (∆G= -11.0 kcal/mol), LMQC36 (∆G= -10.6 kcal/mol) e LMQC50 (∆G= -10.2 kcal/mol). Avaliados com maior afinidade de ligação alcançada, em comparação com o Rofecoxibe (∆G= -10.4 kcal/mol), indicando que se ligam ao receptor COX-2. E por fim, as simulações de Dinâmica Molecular (DM) foram usadas para avaliar a interação de compostos com Cox-2 durante 150 ns. Em todas as trajetórias das simulações de DM, os ligantes permaneceram interagindo com a proteína até o final da simulação. Os aglutinantes também foram capazes de complexar com Cox-2 favoravelmente. Os compostos obtiveram os seguintes valores de energia de afinidade: Rofecoxibe, composto de referência, ΔGbind = -45,31 kcal / mol; LMQC1: ΔGbind = -38,58 kcal / mol; LMQC2: ΔGbind = -36,10 kcal / mol; e LMQC3: ΔGbind = -39,40 kcal / mol. Portanto, são necessários estudos futuros in vitro e in vivo para confirmar o potencial anti-inflamatório dos compostos selecionados aqui com abordagens de bioinformática.

2019
Descrição
  • FERNANDA JARDIM DA SILVA
  • ESTABELECIMENTO E CARACTERIZAÇÃO CITOGENÉTICA DE LINHAGEM CELULAR DE CARCINOMA ADENOIDE CÍSTICO

  • Data: 16/12/2019
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  • O Carcinoma adenoide cístico (CAC) é uma neoplasia rara que acomete principalmente regiões de cabeça e pescoço, especialmente glândulas salivares. O crescimento é considerado lento, mas com grande capacidade de invasão perineural, recorrência pós-cirúrgica local e metástases. As características moleculares do CAC são pouco conhecidas e a raridade do tumor dificulta a obtenção de modelos in vitro e in vivo para que auxilie na investigação da patogênese e tratamentos mais eficientes e precisos. No presente estudo, buscou-se estabelecer e caracterizar uma linhagem de CAC para a avaliação de moléculas anticâncer. Para isso, foram obtidas amostras teciduais de CAC do subtipo histológico tubular advinda do trígono retromolar e uma amostra de sangue de uma paciente do sexo feminino de 59 anos de idade. A caracterização citogenética molecular foi realizada por Hibridização Genômica Comparativa em array (aCGH) no tecido tumoral e na linhagem celular. Além disso, foi realizada a genotipagem da paciente. A cultura de células estabelecida a partir do tecido tumoral coletado apresentou rápido crescimento de colônias tumorais a partir da passagem 18, estabilizando-se na passagem 30. A genotipagem no sangue revelou uma contribuição ancestral de 19% ameríndios, 31,5% de europeus e 49,5% de negros. Na análise citogenética foram observados ganhos em lócus que abrigam importantes genes, como EGFR (7p22.1-p11.2), BRAF (7q32.3q34), HER2 (17q12-q21.2) e SMARCA1 (xq25-q27.1). Ainda na linhagem, foram observadas perda (6q23.3-q25.1, lócus do gene PLAGL1) e deleção (9p21.3p21.1, lócus do gene CDKN2A/B); No tecido, foram observados apenas ganhos (9q34.3, lócus do gene NOTCH1 e 5q32, lócus do gene PDGFRβ). A perda em 19p13.3-p12, lócus do gene CDKN2D, destaca-se como evento em comum nas duas amostras. Estes achados corroboram outros estudos da literatura e faz da linhagem estabelecida um bom modelo in vitro que pode auxiliar na investigação da patogênese do CAC e na pesquisa básica para novas modalidades terapêuticas.

  • THAYANNE MACEDO PINHEIRO
  • AVALIAÇÃO DO EFEITO DO OTSSP167 EM LINHAGENS DE ADENOCARCINOMA GÁSTRICO COM AMPLIFICAÇÃO DO GENE MELK.

  • Data: 09/12/2019
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  • O câncer gástrico é considerado o quinto tipo tumoral mais frequente no mundo, e devido a sua heterogeneidade faz-se necessário a utilização de terapias individualizadas que apresentam menor toxicidade e maior eficácia durante o tratamento. Em um estudo prévio, nosso grupo relatou o aumento do número de cópias do gene MELK em aproximadamente 55,9% dos tumores de pacientes com adenocarcinoma gástrico e nas linhagens de célula desse tipo tumoral. Esse gene codifica a proteína maternal embryonic leucine zipper kinase (MELK), membro da família serina/treonina cinase, que participa de múltiplos processos celulares, incluindo a progressão do ciclo celular, proliferação celular, apoptose, migração celular e outros. O aumento da sua expressão foi observado em diferentes tipos de câncer, incluindo o câncer gástrico. Com isso, o presente estudo avaliou por meio de análises in silico, as propriedades farmacocinéticas e farmacodinâmicas do OTSSP167, sua atividade antineoplásica em linhagens de células de câncer gástrico, ACP03 e AGP01, analisando a viabilidade celular, a interferência desse inibidor na expressão proteica de MELK nas linhagens, a capacidade de invasão e migração das células. Nas análises in silico, o OTSSP167 apresentou alta probabilidade de absorção intestinal, toxicidade de grau III e maior escore de atividade para a inibição de cinase. Nos experimentos in vitro, o OTSSP167 apresentou atividade citotóxica nas linhagens gástricas, com maior atividade citotóxica contra a ACP03 (CI50=8,5nM). Além disso, esse inibidor conseguiu reduzir a expressão de MELK nas linhagens ACP03 e AGP01 gradativamente de acordo com a concentração do composto. Em relação à capacidade de migração, o OTSSP167 foi capaz de inibir significativamente a migração de células ACP03 tratadas por 12 horas com três diferentes concentrações do composto (4,25nM, 8,5nM e 17nM), mas nas análises de 24 horas houve apenas significância estatística nas concentrações 8,5nM e 17nM do OTSSP167. No entanto, a avaliação de capacidade de invasão das células após o tratamento com OTSSP167 por 48 horas não apresentou resultados estatísticos significantes. Desse modo, os resultados sugerem que OTSSP167 possui atividade antineoplasica em linhagens com amplificação do gene MELK e inibi a capacidade de migração celular. Portanto, OTSSP167 apresenta potencial aplicabilidade em futuras terapias, sendo necessário a realização de testes adicionais para delimitar o mecanismo de ação do composto.

  • ALANNA CRYSTINE LIMA FARIAS DE SOUSA
  • PLANEJAMENTO E DESENVOLVIMENTO DE DERIVADOS DO MUSCIMOL PARA TRATAMENTO DA ANSIEDADE E DEPRESSÃO COM PROPRIEDADES ANTIOXIDANTES.

  • Data: 09/12/2019
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    O Muscimol é um composto izoxazol psicoativo extraído de cogumelos do gênero Amanita muscaria tem sido estudado como inibidor GABA por possuir efeitos comportamentais, já que sua fórmula estrutural se assemelha aos neurotransmissores dos mamíferos GABA e o ácido glutâmico. Por sua alta seletividade e potente propriedade de inibir atividade neural possui capacidade de atuar como fármaco, já que possui maior afinidade com o receptor GABAA que o GABA, podendo agir no metabolismo da serotonina, assim como o GABA. Desde a década de 80 há estudos que sugerem que o GABA e o muscimol estão relacionados com a concentração de serotonina, onde se houver aumento na concentração de GABA ou injeção de muscimol, há aumento da concentração de serotonina e diminuição de seu produto inativo após sua oxidação, 5-HIAA. Por esta razão este trabalho objetivou planejar e desenvolver derivados do muscimol como alternativa para o aumento de serotonina através da atividade antioxidante. Para isso, foi-se utilizado o método de planejamento de fármacos conhecido como bioisosterismo, o qual é caracterizado por ser compostos ou subunidades de substâncias bioativas com características estruturais semelhantes, além de propriedades físicas e químicas semelhantes com a capacidade de apresentar propriedades biológicas análogas, podendo ser agonistas ou antagonistas. Primeiramente foi feito um estudo dos grupos que são responsáveis pela atividade biológica através do farmacóforo do muscimol, onde os grupos que fazem interação com o receptor GABAA são o grupamentos -NH2, o anel isoxazol, bem como o oxigênio presente a carbonila. Depois foi-se feito modelagem molecular, a qual foi realizada usando a mecânica molecular através do método de PM3 para otimização das estruturas, o método DFT/B3LYP/6-311G (2d,2p) para verificação dos valores de HOMO, LUMO, GAP, potencial de ionização teórico, energia de dissociação de ligação, energia de transferência de hidrogênio e energia de transferência de elétrons, onde verificou-se que o derivado S1 apresentou valores iguais a -7.61 eV, -1.36 eV, -6.25 eV, 205.87.85 kcal/mol, 80.81 kcal/mol, -15.45 kcal/mol e 6.99 kcal/mol, respectivamente. Já o derivado S2 apresentou valores de -6.80 eV, -1.08 eV, 5.72 eV, 198.41 kcal/mol, 77.73 kcal/mol, -18.53 kcal/mol e -0.47 kcal/mol, respectivamente. Ao serem comparados com o GABA, verificou-se que os mesmos são reativos, entre os quais o derivado S2 é mais reativo, apresentando menor valor de GAP, se comparado com o S1, e com os valores de PI, verificou-se que o derivado S1 apresenta menor capacidade doadora de elétrons que o derivado S2, onde a melhor via é pelo mecanismo de doação de hidrogênio. Depois foi realizado a síntese dos derivados regioisômeros com um rendimento para S1 e S2 de 74,08% e 60,42%, respectivamente, além de passarem por caracterização através do ponto de fusão, onde o derivado S1 apresentou ponto de fusão igual a 114,5°C – 115°C e o S2, 182,5°C, mostrando que as moléculas sintetizadas estão puras, já que foram comparados com os dados na literatura. Com esses dados é possível dizer que os derivados do muscimol possuem boa atividade antioxidante por transferência de hidrogênio.

  • SIRLENE SAYURI BARROS OTA
  •  Planejamento e síntese de novos derivados relacionados ao piroxicam

  • Data: 09/12/2019
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  • O piroxicam é um fármaco pertencente do grupo dos oxicams, derivado de ácidos fenólicos, fazendo parte da classe dos AINEs. Apesar de não ser o medicamento de primeira escolha em alguns tratamentos, o fármaco é indicado no tratamento de distúrbios musculoesqueléticos agudos, dor pós-traumática e pós-operatória, artrite reumatoide e osteoartrite, dismenorreia primária, endometriose e cisto hemorrágico. Assim como os anti-inflamatórios não esteroides o piroxicam é capaz de inibir a síntese de prostaglandinas a partir do ácido araquidônico por inibição reversível competitiva da atividade das COXs, com certa predominância para inibir a atividade da COX-2. A fotosensibilidade é um dos efeitos adversos causados pelo fármaco, sendo observada em cerca de 1% dos pacientes. Além disso, várias técnicas têm sido usadas para melhorar a estabilidade do piroxicam sem diminuir o seu potencial. Dessa forma, o objetivo deste presente trabalho é planejar, sintetizar e avaliar derivados mais estáveis relacionados com a fototoxicidade do fármaco de estudo. Os cálculos de propriedades eletrônicas tais como orbital molecular ocupado de maior energia (HOMO), orbital molecular desocupado de menor energia (LUMO) e potencial de ionização (PI), assim como os cálculos dos índices de reatividade (Mulliken, CHELPG e Fukui) foram realizados usando os pacotes Gaussview e Gaussian 2009. Os derivados propostos foram sintetizados através de reações clássicas, tais como esterificação e substituição nucleofílica e estão em processo de purificação. Os resultados dos valores de HOMO e LUMO mostraram que a molécula D4 apresenta uma melhor distribuição eletrônica, com o segundo menor valor de HOMO e o maior valor de LUMO, podendo ser considerada a mais estável. A molécula D6 mostrou ser o derivado mais reativo e isso pode ser explicado pela presença de duas hidroxilas no anel naftaleno do derivado, influenciando na reatividade da molécula. Com base nos valores de GAP, o derivado nitrado (D2) apresentou menor valor (3,36 eV), indicando alta reatividade. Já a molécula D4 foi a que apresentou maior valor de GAP, confirmando sua estabilidade. Na análise das cargas de Mulliken, CHELPG e Fukui do piroxicam, observou-se diferenças na orientação de substituição, e isso ocorreu, provavelmente, pela diferença de cálculos realizados para cada índice. Nos resultados teóricos do estudo de reatividade química usando UV-Vis, o piroxicam e seu derivado naftalênico mostraram perfis completamente diferentes, referentes ao seus três principais picos, sendo o mais expressivo no sistema C=C, indicando que no sistema benzothiazine ele funciona como um alceno reativo, após absorção de energia. Dessa forma, a modificação molecular pelo sistema naftaleno apresentou um composto com maior estabilidade química e menor reatividade.

  • ELIZANGELA RODRIGUES DA SILVA MOTA
  • AVALIAÇÃO DA ATIVIDADE CITOTÓXICA E ANTI-INVASIVA DA BIFLORINA EM LINHAGENS DE CÂNCER GÁSTRICO DO TIPO INTESTINAL.

  • Data: 03/12/2019
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    Os produtos naturais são fontes de metabólitos secundários com ampla aplicabilidade farmacológica, incluindo anticâncer. A biflorina, uma orto-naftoquinona prenilada que foi isolada das raízes da planta Capraria biflora L., tem se destacado como potente protótipo a fármaco antitumoral. Entretanto, apesar do potencial promissor, sua capacidade antineoplásica é incipientemente aplicada para o câncer gástrico, um dos tipos de câncer mais incidentes, agressivos e letais, nos âmbitos nacional e global. Neste contexto, este trabalho objetivou analisar a relação estrutura-toxicidade da biflorina pelo mecanismo redox in silico, bem como o potencial citotóxico e anti-invasivo in vitro, utilizando como modelo linhagens de adenocarcinoma gástrico do tipo intestinal, metastática (AGP01) e isolada do tumor primário (ACP03). As análises in silico demonstraram que a biflorina possui característica diferenciada de reatividade, podendo atuar como doadora ou aceptora de elétrons em reações nucleofílicas e eletrofílicas, respectivamente. Além disso, quando comparada a outras naftoquinonas naturais como a β-lapachona e ao lapachol, apresentou melhores propriedades redox e condições de reatividade, porém, com menor efeito tóxico devido a sua capacidade de formar intermediários mais estáveis. A simplificação molecular da biflorina também permitiu inferir que o grupo funcional orto-naftoquinona provavelmente é o mais relacionado à toxicidade das naftoquinonas. Adicionalmente, a biflorina apresentou atividade citotóxica em concentrações consideravelmente baixas para ambas as linhagens, contudo, a citotoxicidade foi mais pronunciada para a AGP01 (CI50 3,1 μM) quando comparada a ACP03 (CI50 4,5 μM) em 48h de tratamento. Em relação à atividade antimetastática, a biflorina reduziu a capacidade de invasão celular somente da linhagem AGP01 (p<0,0001). Os resultados obtidos indicam que a biflorina possui atividade citotóxica para ambas as linhagens de câncer gástrico AGP01 e ACP03, bem como anti-invasiva especificamente para as células metastáticas AGP01. Além disso, foi possível esclarecer a provável citotoxicidade seletiva da biflorina baseada em sua reatividade estrutural. 

  • GUELBER CARDOSO GOMES
  • ESTUDO TEÓRICO DA REAÇÃO DE METILAÇÃO DA PROTEÍNA LISINA METILTRANSFERASE (PKMT)

  • Data: 12/09/2019
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  • O câncer é um dos principais alvos na pesquisa acadêmica e seu entendimento está relacionado à regulação genica através da metilação das histonas. A proteína G9a é a responsável pela metilação da Lisina 9 da histona 3 (H3K9), a qual pode realizar uma ou duas metilações neste resíduo específico. Desta forma, foi utilizado técnicas computacionais para descrever esta reação através de simulação QM/MM usando as técnicas de SEP, PMF no programa Dynamo e o mecanismo no programa AMBER com os métodos AM1, AM1D, PM3, PM6 e RM1 determinando o melhor método e os parâmetros para descrever a reação. Os resultados mostram que a reação para a desprotonação da Lisina 9 apresentou melhores valores no programa Amber18, ficando próximo do esperado através de uma transferência direta da Lisina 9 para a Tirosina 1154 com o método RM1 e barreira de energia de 27,15 kJ/mol. A transferência do grupo metil da molécula de SAM para a Lisina 9 mostrou que o método PM6 utilizando a técnica de PMF do programa Dynamo apresentou uma barreira de energia de 72,80 kJ/mol o qual é próximo ao obtido através dos dados experimentais.

    Palavras-Chave: QM/MM, Histonas, Mecanismo,

  • JESSICA DE OLIVEIRA ARAUJO
  • Planejamento de inibidores da enzima 3-desoxi-D-mano-octulosonato 8-fosfato Sintase (KDO8PS): um novo alvo para tratamento de infecção bacteriana.

  • Data: 23/07/2019
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  • As bactérias podem ser distintas em dois grupos através da técnica de Gram, onde pode-se diferenciar bactérias Gram positivas e Gram negativas, as principais diferenças entre esses organismos se dão pela estrutura da parede celular, seus componentes e suas funções. O caso de bactérias Gram-negativas é mais preocupante devido ao surgimento de cepas resistentes a vários antibióticos.  lipopolissacarídeo (LPS) é um componente da membrana externa de bactérias Gramnegativas responsável pelas manifestações tóxicas como inflamações. O 3-deoxy-Dmanno-octulosonato (KDO) é um componente do sítio do núcleo interno de LPS essencial para sua formação. A reação para produção de KDO requer dois substratos, o fosfoenolpiruvato (PEP) e D-arabinose 5-fosfato (A5P), catalisada pela 3-Deoxy-Dmanno-octulosonato de 8-fosfato sintase (KDO8PS). Essa reação é importante pois desempenha um papel crucial na montagem de LPS. Esta enzima encontra-se em duas formas distintas quanto a dependência da presença ou ausência de íon metálico divalente no sítio ativo. Dentre os vários inibidores da KDO8P sintase, foram selecionados dois com base em suas constantes de inibição (Ki). O mais ativo entre eles tem valor de 0,37 µM em KDO8P sintase de E. coli independente de metal e de7,9±1,6 µM para KDO8P sintase independente de metal em N. meningitidis. esses valores de Ki são aproximadamente de 2 a 3 vezes maiores do que os valores de Km para o PEP que também foram utilizados neste trabalho, além de um terceiro inibidor hipotético que combina as principais características dos inibidores já descritos pela literatura. Nesta pesquisa, foram utilizadas técnicas de modelagem por homologia, Docking molecular, Dinâmica Molecular e Energia Livre de ligação com os métodos MMGBA, MMPBSA, SIE e Decomposição de energia por resíduo para analisar o modo de acoplamento desses ligantes e do substrato PEP. Com os resultados obtidos foram analisadas as principais interações que esses ligantes realizam e o comportamento molecular, tanto dos ligantes como da proteína. Portanto, foram obtidos valores de energias livre de ligação mais favoráveis para os complexos formados com o ligante BPH1 com os três métodos -96.07 Kcal/mol com MMGBSA, -107,09 Kcal/mol com MMPBSA e -13,53 com SIE e observou-se que estes complexos realizam um número maior de interações efetivas. Assim, sugere-se que o ligante BPH1 tem um excelente potencial de inibição da atividade catalítica da enzima KDO8P sintase responsável pela produção de KDO, componente essencial de LPS para formação da membrana externa de bactérias Gram-negativas.

  • LEON CLÁUDIO PINHEIRO LEAL
  • MODELO EXPERIMENTAL PARA INDUÇÃO DE HEMIPARKINSONISMO POR 6-HIDROXIDOPAMINA EM PRIMATAS SAPAJUS APELLA E AVALIAÇÃO DAS ALTERAÇÕES MOTORAS

  • Data: 09/07/2019
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  • A doença de Parkinson é atualmente a segunda doença neurodegenerativa mais comum no mundo, possuindo uma alta incidência nas Américas do Norte e do Sul e na Europa, há mais de 50 anos não vislumbramos nenhum tratamento revolucionário para a doença e ainda a diversos aspectos da sua neuropatologia que ainda permanecem sem um esclarecimento concreto, nesse sentindo o modelo experimental em primatas se aproxima da realidade humana apresentam valor inestimável para o desenvolvimento de novas terapias e elucidação sobre mecanismos relacionados à doença. O modelo de 6hidroxidopamina em primatas figura um modelo que mimetiza alguns sintomas motores característicos da DP. O presente estudo objetivou desenvolver um protocolo de indução de HemiParkinsonismo em primatas Sapajus apella. Foram utilizados três macacos Sapajus apella, todos machos adultos, foram submetidos a sessões de condicionamento diário utilizando a técnica do “clicker” de reforçamento positivo para posicionamento em cadeira para primatas. Concomitantemente, os testes motores staircase test e tabuleiro de Brinkman foram realizados para determinação da lateralidade pelos atributos de preferência e dominância manuais. Após esse período foram realizados dois protocolos de indução por 6-OHDA, o primeiro protocolo foi injetado em 10 sítios no núcleo estriado e o segundo protocolo foi injetado em 10 sítios nas vias nigro estriatais, uma semana após as injeções foram realizadas doze semanas de análises clínicas. Todos os animais aprenderam os comportamentos de entrada e posicionamento na cadeira em um período mínimo de 30 sessões utilizando reforçamento positivo puro. Os resultados do staircase test demostraram que os animais apresentaram lateralidade consistentes com nas atribuições de preferência e dominância manuais. O teste do tabuleiro de Brinkman, especificamente apresentou menor sensibilidade para determinação dos mesmos atributos, apesar de ser o teste mais comumente utilizado. As análises clínicas revelaram que o segundo protocolo de indução apresentou mais sintomas motores característicos da DP. A indução por 6-OHDA nas vias nigroestriatais demonstraram ser um bom método de indução para estudos de tratamentos e para um melhor entendimento da doença.

  • FABRINE SILVA ALVES
  • ESTUDO QUÍMICO E ATIVIDADE BIOLÓGICA DE EXTRATOS E PIPERINA OBTIDOS DE PIMENTA DO REINO.

  • Data: 27/05/2019
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  • A pimenta do reino (Piper nigrum L.), família Piperaceae, apresenta o alcalóide piperina tradicionalmente utilizado como antidepressivo, neuroprotetor, antiinflamatório, antioxidante, antibacteriano, antifúngico e larvicida e biodisponibilidade de vários medicamentos com o uso concomitante. Esta amida natural tem motivado vários estudos científicos devido a sua composição química. Deste modo, foram desenvolvidos os procedimentos de extração, isolamento e caracterização do componente piperina a partir da espécie Piper nigrum L. A extração foi realizada em soxhlet (40 g de pimenta do reino triturada, 250 ml de álcool etílico absoluto) para obtenção de piperina sólida, seguido de procedimentos analíticos para a caracterização da substância, tais como: termogravimetria (TG), microscopia eletrônica de varredura (MEV), calorimetria diferencial exploratória (DSC), difração de raio X de pó (DRX), espectroscopia de infravermelho (IV), Raman e ressonância magnética nuclear (RMN) de 13C e 1H. Assim como, o uso combinado de técnicas de modelagem molecular na identificação espectral via RMN, Raman e infravermelho da molécula de piperina para corroborar com dados experimentais obtidos. Um segundo método de extração via maceração (200g de pimenta do reino triturada/1L de álcool etílico absoluto) foi aplicado durante 30 dias. Os componentes presentes no extrato macerado (EEPM), extratos de pimenta do reino proveniente do soxhlet (EEPS) e das etapas de purificação (RP e SR) foram avaliados através de prospecção fitoquímica. Amostras dos extratos de pimenta do reino proveniente do soxhlet (EEPS) e das etapas de purificação (RP e SR) também foram avaliadas. Testes biológicos foram realizados com as amostras (EEPM, EEPS, RP, CP e SR) para a verificação das bioatividades antimicrobiana, fúngica e larvicida. Todas as análises de caracterização dos cristais de piperina (MEV, DSC, DRX, IR-ATR, Raman e RMN) foram eficazes na confirmação do componente. Com o uso da modelagem molecular os dados teóricos (IV, Raman e RMN 13C e 1H) obtidos, revelaram promissora correspondência na comparação com dados experimentais, via Regressão Linear Simples, com resultados estatisticamente satisfatórios (R2, Q2), superiores a 94%. Na prospecção fitoquímica das amostras (EEPM, EEPS, RP e SR) foram detectados Alcalóides, Catequinas, Antocianinas e Antocianidinas, Leucoantocianidinas, Taninos catéquicos, Flavononas e Fenóis. Nas análises microbiológicas a amostra EEPM mostrou alta eficiência do extrato na inibição da bactéria Salmonella sp. (CIM) < 100 μg/mL). Já a amostra EEPS apresentou promissora atividade inibitória para quase todos os microorganismos, sem inibição relevante para Pseudomonas aeruginosa. Também foram evidenciados coeficientes de inibição potentes contra Estafilococos aureus e Salmonella sp. (CIM) < 100 μg/mL) para a amostra RP. A amostra CP demonstrou ótimo coeficiente de inibição na maioria dos microorganismos ocorrendo inatividade em Pseudomonas aeruginosa. Na análise da atividade larvicida o percentual de mortalidade larval não atingiu 50% em nenhuma das amostras submetidas a 24 horas de exposição e à 48 horas a concentração de 100 µg.mL-1 da amostra EEPM foi a mais significativa com uma taxa de mortalidade de 85,7%.

  • KAROLINE LEITE CUNHA
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    USANDO A DINÂMICA MOLECULAR PARAAVALIAR O IMPACTO QUE AS MUTAÇÕES NA PROTEASE DO HIV-1 PRODUZEM NA INTERAÇÃO DAPROTEÍNA COM O ANTIRRETROVIRAL DARUNAVIR.

  • Data: 29/03/2019
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  • O surgimento de cepas resistentes aos fármacos utilizados na terapia antirretroviral cresce de forma alarmante em escala global. Os antirretrovirais utilizados no tratamento de primeira e segunda linha do HIV são os que mais possuem relatos de casos de cepas resistentes. Os inibidores da protease são uma classe de drogas antirretrovirais que possui participação fundamental nos esquemas de tratamento da AIDS. Além do surgimento da resistência aos IPs utilizados nos esquemas usuais de tratamento, já existem relatos de resistência o Darunavir, um inibidor da protease usado no tratamento de resgate terapêutico em casos de pacientes que já apresentam falha no tratamento inicial e resistência comprovada. Portanto, este trabalho tem por objetivoavaliar, identificar e quantificar as mutações na protease do HIV-1 3UCB, bem como avaliar, por meio de simulações de dinâmica molecular, o impacto que as mutações produzem na interação a 3UCB e o seu ligante darunavir quando comparados com a protease do HIV-1 nativa 4LL3 complexada ao mesmo ligante. Os resultados obtidos neste estudo mostraram que a protease do HIV-1 mutante 3UCB apresentou um perfil de ligação ligeiramente mais estável que complexo da protease do HIV-1 nativa 4LL3, com resultados de energia livre de ligação -68,77 e -64,62kcal/mol, respectivamente.

2018
Descrição
  • ROBERTO BARBOSA DE MORAIS
  • PLANEJAMENTO, SÍNTESE, AVALIAÇÃO DAS PROPRIEDADES TEÓRICAS DE ORTO-REGIOISÔMEROS SUBSTITUÍDOS DO PARACETAMOL

  • Data: 28/12/2018
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    O paracetamol é um analgésico e antitérmico clinicamente comprovado, que promove analgesia
    pela elevação do limiar da dor e antipirese através de ação no centro hipotalâmico que regula a
    temperatura. Atualmente, o paracetamol é um dos medicamentos que está disponível em todos
    os países do mundo e pode ser adquirido sem prescrição médica. Além disso, é considerado um
    dos fármacos mais utilizado no mundo, pois, é de baixo custo e de fácil acesso, e pode ser usado
    a partir do nascimento a idade adulta. Tal como os anti-inflamatórios não esteroides (AINEs) o
    paracetamol é capaz de inibir a síntese de prostaglandinas a partir do ácido araquidônico sob
    condições específicas por inibição da ciclooxigenase (COX). Mesmo sendo considerado seguro
    em doses terapêuticas, o paracetamol tem uma toxicidade atribuída à um de seus intermediários
    metabólico chamado N-acetil-p imina-benzoquinona (NAPQI), produzido através de enzimas
    presentes no citocromo P450 (CYPE21). Dessa forma o objetivo deste presente trabalho é
    planejar, sintetizar e avaliar possíveis atividades antinociceptiva e antipirética de análogos do
    paracetamol, ortacetamol e seus derivados visando obter um derivado menos tóxico. Os
    cálculos de propriedades eletrônicas tais como orbital molecular ocupado de maior energia
    (HOMO), orbital molecular desocupado de menor energia (LUMO), potencial de ionização
    (PI), energia de dissociação da ligação fenólica (EDLOH) e densidades de spin, foram realizados
    usando os pacotes Gaussview e Gaussian 2009. Os resultados dos valores de EDLOH e os
    respectivos valores de energia de dissociação da ligação amídica (EDLNH), entre outros
    parâmetros eletrônicos observados mostraram que a mudança da hidroxila para a posição orto
    aumenta a estabilidade da molécula possivelmente por uma quelação definida por uma ligação
    de hidrogênio da amida com o radical fenoxil. Diante desses resultados é possível que os
    compostos de menores energia de EDLNH possa ser menos tóxico já que pode dificultar a ação
    da CYP na oxidação para formar intermediários tóxicos. Um derivado clorado foi proposto e
    sintetizado e está em fase de avaliação biológica. O ortacetamol teve ação antioxidante mais
    potente que o paracetamol e suas propriedades experimentais estão de acordo com os valores
    teóricos. Concluimos então que, o ortcetamol pode ser um potencial candidato bioativo mais
    seguro que o paracetamol.

  • LUCAS DE SOUSA MARTINS
  • MODELAGEM MOLECULAR DE INIBIDORES DA ENZIMA TIROSINASE

  • Data: 21/12/2018
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  • A enzima Tirosinase (TYR), responsável pela catálise das etapas iniciais da melanogênese em vários organismos, está relacionada a diversos problemas de saúde de ordem cutânea em seres humanos. Dentre os quais destacam-se: a hiperpigmentação, melasma e o câncer de pele, nas formas não melanômica e melanoma maligno. Em geral, estas disfunções são tratadas com substâncias despigmentantes cutâneas, baseadas na inibição da enzima TYR. Porém, muitas destas substâncias onde destaca-se o ácido kójico (AK), apresentam efeitos colaterais acentuados. Tais fatores tornam a TYR um interessante alvo biológico no planejamento e desenvolvimento de protótipos à fármacos. Neste estudo, investigou-se alguns potenciais inibidores da enzima TYR, em particular o AK e moléculas análogas, assim como, a Tropolona e alguns derivados de benzaldeído, relacionados estruturalmente aos substratos naturais da TYR (L-Tirosina e L-Dopa), utilizando as técnicas de Docagem Molecular, Dinâmica Molecular (DM) e o método LIE (Linear Interaction Energy), usado para calcular a energia livre de ligação dos sistemas. Especificamente aplicação da Docagem Molecular definiu o modo de ligação dos inibidores no sítio da TYR, sendo possível quantificar as interações ocorrentes nos sistemas. As simulações por DM, exibiram o comportamento da enzima com diferentes inibidores e a forma como esses agem quando complexados com a enzima TYR, utilizando-se na simulação um modelo dummy atom de cobre. Sendo assim, os resultados do LIE mostraram concordância com os resultados experimentais, obtendo um R2 de 0,91 em uma regressão linear LIE vs Experimental, e isso possibilitou analisar as estimativas energéticas por resíduo da enzima em relação aos inibidores, onde percebeu-se que a Tropolona, AK, MOL2 e MOL3 fazem interações diretas com resíduos importantes para o sítio ativo da TYR. Assim sendo, os resultados alcançados neste trabalho contribuem de maneira significativa para a ciência a cerca a inibição da enzima TYR, ajudando no combate aos males provenientes de irregularidades no ciclo de produção de melanina nos organismos

  • FERNANDA MENEZES COSTA
  • PLANEJAMENTO E SÍNTESE DE NOVOS DERIVADOS DA ASSOCIAÇÃO MOLECULAR BENZONIDAZOL E METRONIDAZOL

  • Data: 25/09/2018
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  • A Doença de Chagas, causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi, ainda possui altos
    índices de contágio nos dias atuais, sobretudo, na região Amazônica, sendo por via oral o
    tipo de transmissão mais comum. Após o contágio, a doença possui duas fases: aguda e
    crônica. A fase aguda é, na maioria dos casos, assintomática e tratada com maior eficiência,
    a fase crônica, apesar de ser sintomática, não possui tratamento eficiente. Para tratar a
    doença, existe apenas um medicamento disponível, o benzonidazol ou Rochagan®,
    distribuído gratuitamente, que deve ser administrado durante, aproximadamente, 60 dias.
    Entretanto, o benzonidazol possui baixa eficiência, conseguindo ser eficaz apenas na fase
    aguda (assintomática). Além disso, o medicamento costuma causar efeitos colaterais graves
    nos pacientes em tratamento, ocasionando muitas vezes o abandono desse tratamento. A
    modelagem molecular tem se tornado uma importante ferramenta no planejamento de novos
    fármacos, utilizando estudos teóricos para avaliar o potencial dessas novas moléculas.
    Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi planejar novos derivados a partir de
    modificações moleculares do benzonidazol e metronidazol para a alteração de sua
    capacidade redox. Com essa finalidade, foi realizado um estudo teórico de dois derivados
    do benzonidazol, utilizando associação molecular e metilação. A associação molecular foi
    realizada com a união das moléculas do benzonidazol e metronidazol, outro medicamento
    que possui atividade antiprotozoária, porém com toxicidade inferior à do benzonidazol. Os
    dois derivados planejados foram sintetizados em laboratório utilizando as metodologias
    clássicas de substituição eletrofílica e nucleofílica, esterificação, alquilação e nitração. A
    partir do estudo teórico, foi possível observar que os compostos nibendazol 1 e nibendazol 2
    têm capacidade redox inferior ao benzonidazol, de acordo com seus resultados de HOMO,
    LUMO, potencial de ionização e afinidade eletrônica. Os valores de GAP mostraram os
    derivados são menos reativos que o benzonidazol. Com os gráficos de HOMO e LUMO,
    mostram que os anéis nitroimidazólicos possuem alta capacidade para doar elétrons, assim
    como o radical benzila possui alta capacidade de acepção de elétrons, no benzonidazol e nos
    compostos derivados.

  • LANALICE RODRIGUES FERREIRA
  • Planejamento e desenvolvimento de análogos da nitazoxanida

  • Data: 25/09/2018
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  • A nitazoxanida é uma molécula aplicada na terapêutica como anti-helmíntico,
    antiparasitário de amplo espectro. Estudos biológicos com esta molécula buscam novos
    alvos terapêuticos e obtém bons resultados. O objetivo do trabalho foi o planejamento e
    desenvolvimento de novos derivados estáveis de nitazoxanida. Os cálculos de
    propriedades eletrônicas – orbitais de fronteira (HOMO e LUMO), potencial de ionização
    (PI) e afinidade eletrônica (AE), mapa do potencial eletrostático (MPE) – foram
    realizados usando os pacotes Gaussview e Gaussian. O estudo teórico de nove derivados
    amino-nitro-azólicos, grupamento, farmacóforo da nitazoxanida, foi realizado usando o
    método DFT/ B3LYP/6-31G(d,p) e indicaram que modificações no anel tiofeno podem
    reduzir o potencial redox do composto alterando reatividade e a toxicidade. Nossos
    resultados confirmam que estes derivados se comportam como melhores eletrófilos,
    destacando a presença do grupo nitro. Estes resultados são visualizados nos mapas de
    potenciais eletrostáticos demonstrando regiões que indicam prováveis ataques
    eletrofílicos. Parâmetros físico-químicos de análogos da nitazoxanida também foram
    avaliado usando o método DFT/ B3LYP/6-31+G(d,p). Os resultados indicam um
    aumento significativo na capacidade doadora de elétrons dessas novas moléculas a partir
    dos valores de HOMO, LUMO e GAP. A adição de mais um grupo nitro nos derivados
    indicaram maiores estabilidades e maior capacidade de acepção de elétrons, o que é
    essencial para atividade biológica de nitrocompostos. Os mapas de potenciais
    eletrostáticos da nitazoxanida e seus análogos evidenciam a densidade de carga negativa
    sobre a região que apresenta o grupo nitro de forma significativa, a qual se relaciona com
    as moléculas derivadas do amino-nitro-azólicos. Além disso, foi realizada uma análise
    conformacional da nitazoxanida, tizoxanida e um derivado nitazoxamida, obtendo as
    menores conformações de energia em Kcal/mol obtidas por DFT/B3LYP/6-31G (d, p). O
    confômero de menor energia da nitazoxanida estar de acordo com a estrutura
    experimental cristalográfica. As estrutura mais estáveis dos derivados são compátiveis
    em termos de similaridade conformacional. A molécula nitazoxanida e mais três
    derivados foram sintetizados e são capazes de serem disponibilizados para avaliação
    biológica para futuros trabalhos.

  • WANESSA CASTILHO AIRES
  • PLANEJAMENTO, SÍNTESE E AVALIAÇÃO DOS DERIVADOS DA EDARAVONA QUANTO À ATIVIDADE ANTIOXIDANTE

  • Data: 28/03/2018
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  • A edaravona é um fármaco liberado no mercado japonês, indicado no tratamento e prevenção de acidente vascular cerebral, relacionados a isquemia. Sua ação decorre de sua capacidade sequestradora dos radicais livres liberados no evento isquêmico. No entanto, seu uso acarreta efeitos toxicológicos renais. Portanto, neste presente trabalho, um novo derivado bioisostérico da edaravona foi proposto, pela mudança do anel pirazolona para indolona. A capacidade antioxidante foi determinada através de métodos computacionais. Os cálculos foram realizados no programa Gaussian, através do método B3LYP, com conjunto de bases 631G(d,p), implementado no programa Gaussian. A atividade antioxidante foi prevista a partir do HOMO, LUMO, Gap, potencial de ionização (PI) e energia da dissociação de ligação (EDL). Os cálculos indicaram que os compostos análogos apresentaram maiores valores de ClogP comparados à edaravona, indicando maior facilidade em ultrapassar as barreiras biológicas com maior caráter lipossolúvel. Também foi constatado que derivado, denominado imidazona, apresentou maior potencial como antioxidante que a edaravona. A presença da metila na posição 2 do anel heterocíclico foi determinante para a formação de estruturas de ressonância mais estáveis para a forma semiquinona. Todos os novos derivados propostos se mostraram extremamente promissores com capacidade antioxidante superior a edaravona.

  • JEOVAN DO ESPIRITO SANTO VALENTE
  • INTERCALAÇÃO DE ÁCIDO CAFÉICO EM HIDRÓXIDO DUPLO
    LAMELAR PELO MÉTODO DE TROCA IÔNICA: NOVAS FORMULAÇÕES LESHIMANICIDA.

  • Data: 28/03/2018
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  • Os sistemas de liberação controlada de fármacos exibem inúmeras vantagens em relação aos deliberação tradicionais, como permitir o uso do fármaco em menores concentrações, maioreficiência e a minimização de efeitos colaterais. A melhora no desenvolvimento de liberaçãocontrolada de fármacos depende principalmente da escolha de um suporte adequado capaz decontrolar a liberação da droga de forma eficaz. Desta forma, o uso de determinados materiais híbridos inorgânicos, tal como os hidróxidos duplos lamelares (HDL), são de grande interesse devido às suas propriedades. O Ácido caféico (AC), proveniente de diversas fontes naturais, apresenta diferentes atividades biológicas, dentre as quais, destaca-se a leishmanicida. No entanto, o AC apresenta baixa estabilidade física e química, e seu efeito biológico estárelacionado a altas concentrações, por isso, torna-se um promissor candidato para sistemas de liberação controlada de fármacos. Neste trabalho, a metodologia de troca iônica foi utilizada para a intercalação de moléculas de ácido caféico (AC) entre as camadas de HDL/MgAl. Isto,
    objetivando a obtenção de formulações de AC mais estáveis em relação ao fármaco livre. Caracterizações físico-químicas foram usadas para análise da estrutura e morfologia dos compostos híbridos obtidos, tais como DRX, FT-IV e MEV.

  • BRUNA AMANDA SILVA DE SOUZA
  • ANÁLISE DE MÉTODOS DE EXTRAÇÃO E PARÂMETROS PARA AVALIAÇÃO IN VITRO: ATIVIDADE FOTOPROTETORA, ATIVIDADE ANTIOXIDANTE E DOSEAMENTO DE FLAVONOIDES TOTAIS PARA ELABORAÇÃO DE FOTOPROTETOR A PARTIR DE EXTRATOS DE SPONDIAS MOMBIN L.


  • Data: 28/03/2018
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  • É uma planta popularmente encontrada no Norte e Nordeste do Brasil, sendo chamada de taperebazeiro ou cajazeiro, pertence à família das Anarcadiaceae, cujo nome científico é Spondias Mombin L., é considerada uma planta alta, podendo chegar até 15 metros de altura, suas folhas são considerada glabro e desiguais na base, sua casca apresenta uma coloração esbranquiçada e áspera. Além disso, apresenta em sua composição química alcaloides, resina, taninos e saponinas. Possui vários efeitos biológicos, tais como: efeito antimicrobiano, anti-inflamatório e antipsicótico. A Amazônia possui uma das maiores reservas mundiais de biodiversidade, no entanto, são escassas as pesquisas de espécies vegetais com potencial para serem utilizadas como filtros solares naturais.  Nos últimos anos os casos de câncer de pele tem crescido, em 2016, o Instituto Nacional de Câncer estimava que 175.760 pessoas contrairiam a doença. No mercado cosmético existe uma grande procura por produtos de origem     natural, principalmente os que possuem estudos científicos comprovados. Por conta disso, o objeto deste trabalho foi analisar os métodos de extração e parâmetros para avaliação em In Vitro: Atividade Fotoprotetora, Atividade Antioxidante e Doseamento de Flavonóides Totais para elaboração de fotoprotetor a partir de extratos de Spondias Mombin L. 

  • MIONY CAROLINA CARDOSO COSTA
  • NVESTIGAÇÃO TEÓRICA DA SÍNTESE DE MDMA A PARTIR DO SAFROL E ESTUDO DA ATIVIDADE DE ANFETAMINAS VIA QSAR.

  • Data: 28/03/2018
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      As anfetaminas são fármacos que estimulam o sistema nervoso central, elas provocam o aumento das capacidades físicas e psíquicas e são substâncias simpatomiméticas que têm a estrutura química básica de beta-fenetilamina. É uma droga que pode ser produzido a partir de reagentes de fácil acesso. Sua síntese é feita na maioria das vezes em laboratórios clandestinos de baixo custo e seu consumo é um problema de saúde pública. No presente trabalho foi investigada a reação de síntese de metanfetamina (MDMA), a partir do Safrol. Esta reação ocorre em duas etapas: primeiro uma adição via halogenidreto, seguido de uma substituição nucleofílica. As propriedades termodinâmicas da reação do Safrol foram investigadas, e os espectros de ressonância magnética nuclear (RMN), UV-vísivel, IR do reagente, intermediário e produto são apresentados. Além de ser também sugerida uma rota alternativa de síntese de maior rendimento. Para os cálculos de estrutura eletrônica foi utilizado o método teoria do funcional de densidade (DFT) com diferentes funcionais e conjuntos de bases a fim de se obter resultados com precisão química (CBS-QB3) ou com o mínimo de desvio numérico com relação aos valores experimentais. Por fim, foi realizado o estudo do QSAR de 30 derivados da anfetamina e da molécula do MDMA, pois de acordo com a literatura apresenta atividade biológica, sendo que o coeficiente de determinação de ajuste R2, próximo de 0,9 e Q2 (coeficiente de determinação da validação cruzada) próximo de 0,74, esses dois valores, confirmam a alta variabilidade e previsibilidade do modelo.

     

     

     

     

2017
Descrição
  • TED WILSON BICHARA JUNIOR
  • ANÁLISE CONFORMACIONAL DA FORMA apo E holo DA ENZIMA GLICOSSOMAL GLICEROL 3-FOSFATO DESIDROGENASE DE Leishmania mexicana ATRAVÉS DE DINÂMICA MOLECULAR E PCA.

  • Data: 18/12/2017
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  • As leishmanioses são protozooses causadas por diferentes espécies do parasita do gênero Leishmania que se apresentam na forma promastigota, quando estão infectando o inseto vetor ou amatisgota, quando estão infectando um hospedeiro vertebrado. O tratamento quimioterápico ainda é o principal meio de combate à doença, entretanto devido ao elevado custo e alguns efeitos colaterais indesejados, faz com que dificulte o tratamento. Diversas proteínas com funções enzimáticas e estruturais têm sido apontadas como possíveis alvos farmacológicos contra espécies do parasita em questão devido suas funções específicas, localização celular e considerável distância filogenética. Proteínas glicossomais são alvos farmacológicos que preenchem esses requisitos e tem sido alvos de diferentes estudos. A enzima glicossomal Glicerol 3-fosfato desidrogenase (GPDH) de Leishmania mexicana tem sua estrutura cristalográfica ligada ao bissubstrato NAD+-DHAP (NDE), disponível no Protein Data Bank (PDB). Nota-se 10 resíduos no sítio ativo que são altamente conservadas e mudanças conformacionais na sua estrutura. A partir disso, no presente estudo realizou-se simulações de dinâmica molecular (DM) combinados com Análise dos Componentes Principais (PCA) a fim de verificar a atividade conformacional na forma não ligada (apo) e na forma ligada (holo). Um total de 100 ns de DM para cada sistema foram gerados, assim como cálculos de energia livre que estimaram o mecanismo estrutural sendo observado que o domínio C-terminal moveu-se consideravelmente enquanto que o N-terminal se manteve conservado e estável. Os resultados mostram também que o estado fechado após a formação do NDE é favorável para o processo de ação enzimática.

  • AMARILIS ARAGAO DIAS
  • SÍNTESE, INTERCALAÇÃO, CARACTERIZAÇÃO ESTRUTURAL E
    ANÁLISE BIOLÓGICA DE NANOPARTÍCULA CARREADORA DE ÁCIDO KÓJICO

  • Data: 30/11/2017
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  • A intercalação de espécies com atividade farmacológica em Hidróxidos Duplos
    Lamelares (HDLs) é um crescente campo na pesquisa acadêmica e industrial, estes
    compostos são capazes de promover a liberação controlada de fármacos. Neste
    trabalho buscamos intercalar o ácido kójico em nanopartículas de HDL de Mg2+/Al3+
    pelo método de coprecipitação. Esta substância possui diversas aplicações nos mais
    variados campos de pesquisa, entretanto apresenta a foto-oxidação o que ocasiona
    modificações organolépticas e químicas de sua estrutura. Recentemente o ácido
    kójico foi apresentado como um potente inibidor em culturas de leishmania,
    acreditamos que as propriedades particulares do HDL, como por exemplo a
    fotoproteção,e a estabilização do intercalado favoreçam a produção de um material
    resistente com possíveis aplicações para a saúde. Todas as amostras foram
    preparadas pelo método de coprecipitação, posteriormente foram caracterizadas por
    difração de raio-X, Raman, Infravermelho, Espectroscopia de UV-vis e
    Termogravimetria, além de avaliações biológicas sobre culturas de leishmania.
    Nossos resultados demonstram que o HDL-AK possui 53,018% de ácido kójico
    intercalado e é capaz de resistir a altas temperaturas, além de possuir um potencial
    anti-leishmania.

  • FABIO JORGE DE NAZARE FERREIRA
  • INVESTIGAÇÃO COMPUTACIONAL DE BROMO-ARILOXI-2-ACETAMIDAETIL-BENZIMIDAZÓLICOS
    COMO INIBIDORES NÃO-PEPTÍDICOS DA PROTEINASE CRUZAÍNA DE TRYPANOSOMA CRUZI.

  • Data: 17/11/2017
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  • A doença de Chagas é uma infecção causada pelo protozoário flageladoTrypanosoma cruzi,transmitida por insetos conhecidos no Brasil como barbeiros. Na região amazônica, estudostêm mostrado que a contaminação por via oral tem sido frequente. Os únicos fármacosdisponíveis para o tratamento da doença de Chagas - o Benzonidazol (RochaganR, Roche)e o Nifurtimox (LampitR, Bayer) - têm demonstrado uma eficiência limitada e severosefeitos colaterais.Acruzaína é uma enzima presente em todos os estágios do ciclo devida do T. cruzi e é a mais abundante da família da papaína de cisteíno proteasesencontradas no parasito, sendo um alvo enzimático promissor para o planejamento e desenvolvimento de inibidores contra a doença.Inibidores não-peptídicos que ligam nãocovalentemente à enzima foram sintetizados e avaliados biologicamente in vitro e invivo por Ferreira e colaboradores (2014) análogos do composto líder (cristalografado)8D (ou B95), obtendo uma série de compostos ativos, dos quais os mais potentes são:8K, 8L e 8R. Este trabalho investigou as potenciais interações e energias da cruzaína(código PDB: 3KKU) complexadas com estes quatro ligantes por meio de ferramentascomputacionais, a fim de ajudar a elucidar sua potencial atividade na inibição nestaenzima. O protocolo computacional (parâmetros, topologias, coordenadas, minimizações,termalizações e produções) foi o mesmo para cada sistema. Na etapa final de produção dedinâmica molecular (DM), cada sistema foi simulado por um período de 100 ns, aos quaisforam analisados os valores de estabilidade do desvio da raiz média quadrática (RMSD)da enzima e a mudança acentuada na conformação do ligante 8L. Também foi avaliada aqualidade da simulação por meio de gráficos de energia potencial, cinética e total, volume e temperatura. Foram analisadas interações de ligações de hidrogênio dos ligantes comalguns resíduos de aminoácidos pertencentes ao sítio catalítico. Tem como destaque, a interação entre o ASP161 e o ligante 8R, sendo ratificado pela decomposição de energia porresíduo mostrando que o ASP161 tem a melhor contribuição. Em termos de energia livrede ligação, o ∆Gtotal segue a tendência experimental, apontando o ligante 8R como o mais favorável à reação apresentando valor teórico de -30,04 kcal.mol−1. Esta espontaneidade da reação é ratificada por meio dos valores obtidos com o método SIE, cujo valor teóricofoi de -7,54 kcal.mol−1. Os resultados deste trabalho devem favorecer a otimização docomposto 8R ou desenvolvimento de uma série de análogos desta molécula a fim de se utilizar como possível fármaco para o tratamento da doença de Chagas.

  • ALINE DA SILVA BARBOSA DOS SANTOS
  •  AVALIAÇÃO FARMACOLÓGICA DA FRAÇÃO ÁCIDA DO ÓLEO DE COPAÍBA INTERCALADA EM HIDRÓXIDOS DUPLOS LAMELARES

  • Data: 03/10/2017
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  •  

    NÃO DIVULGADO POR MOTIVO DE PATENTE

     

  • JEANN RICARDO DA COSTA BAHIA
  • ESTUDO TEÓRICO DAS INTERAÇÕES ENTRE INIBIDORES DA INHA, ENOILACP REDUTASE DO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS.

  • Data: 29/09/2017
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  •  A Isoniazida é o profármaco sintético mais antigo, barato e efetivo da primeira linha detratamento daTuberculose. Ela deve ser ativada pela catalase-peroxidase do Mycobacteriumtuberculosis, KatG, que produzum aduto isonicotinoil-NADH, INNADH, o qual se dirige aproteína Enoil-ACP redutase do M. tuberculosis, InhA, a fim de interromper a cadeia desíntese de ácidos micólicos. A resistência a isoniazida, isolada oucombinada a outras drogas éuma das formas mais comuns de tuberculose resistente e representa uma ameaça ao controledessa doença. Nesse contexto, o triclosan (TCL) surge como uma alternativa de inibidores da síntese de ácidos micólicos, já que ele também é específico da InhA. Este estudo visa avaliaras interações de inibidores da InhA através da Simulação de Dinâmica Molecular (DM) epropor possíveis novos inibidores para essa enzima. O sistema utilizado neste trabalho foicaptado a partir do banco de dados PDB, código 4TRO. Foram avaliados 8 ligantes, NADH, INNADH, e os derivados do TCL, P31, P41, P52, P61, P72 e P80. Na região inferior do sítio ativo da InhA foram mais frequentes empilhamentos de carga π feitos por PHE41 e PHE97com os ligantes NADH, INADH, P80, P31, P72, entretanto P41 fez uma ligação dehidrogênio (LH) com a PHE41. Na região central do sítio ativo, resíduos como A GLY96,SER20 e ILE21 fizeram LH com NADH, INNADH, P31, P41 e P80. Em relação a regiãosuperior do sítio da InhA. A PHE149 realizou EC-π com o INNADH e P41. Já no P31 foi uma LH com este resíduo e no P80 as energias são favoráveis para interação. As energiaslivres de cada sistema apresentadas por ordem decrescente, são INNADH (-72,038 kcal/mol),P80 (-45,841 kcal/mol), NADH (-41,463 kcal/mol), P41 (-40,178 kcal/mol), P31 (-31,807kcal/mol), P72 (-30,614 kcal/mol), p52 (-19,475 kcal/mol) e P61 (-12,297 kcal/mol). Estesresultados destacam P80 e P41 como candidatos promissores a inibidores da síntese de ácidos micólicos de M. tuberculosis, já que ser perfil energético é competitivo aos valores mostrados pelo NADH.

  • GRACIMERY NEPOMUCENO REIS
  • Intercalação de Ácido Cafeico em Hidróxidos Duplos Lamelares (HDL) de Zn/Al pelo método de Coprecipitação. 

  • Data: 28/09/2017
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  • O ácido cafeico (AC) é um composto fenólico de ocorrência natural em frutas e vegetais que atua como importante antioxidante, antimicrobiana, antivírus e apresenta diversas aplicações terapêuticas potenciais no tratamento de doenças como câncer de pele, do cólon, doenças imunorreguladoras, cardiovasculares e leishmaniose. Os hidróxidos duplos lamelares (HDL) são matrizes inorgânicas caracterizadas por uma estrutura em lamela que apresenta biocompatibilidade e pode ser utilizada como sistema de liberação controlada de fármacos.  Neste estudo, o ácido cafeico (AC) foi intercalado em Zn/Al-HDL, através do método de co-precipitação a pH 6. O material híbrido obtido foi caracterizado por difração de raios-X em pó, espectroscopia infravermelho, espectroscopia Raman e microscópia eletrônica de varredura. Além disso, o teor de AC no material obtido foi determinado por espectroscopia UV-vis tendo um rendimento de 61%. O espaçamento basal de 11 Ǻ demonstrou a intercalação dos ânions AC nas lamelas do HDL. Os resultados de infravermelho confirmaram a presença de ânions de AC intercalados na estrutura da HDL através de duas bandas a 1406 e 1332 cm-1 (assimétricas e simétricas de alongamento COO-, respectivamente), o Raman complementa o resultado infravermelho apresentando o alongamento das bandas. As micrografias do HDL exibem uma morfologia com formatos hexagonal, no entanto, após o processo de intercalação, observou-se uma alteração considerável na estrutura do material, normalmente observada devido a incorporação do ácido orgânico entre as camadas do HDL. De um modo geral, os resultados sugerem que o material sintetizado nano-híbrido apresenta-se de forma cristalina e as moléculas do fármaco interagem com as camadas do HDL.

     

  • VANEZA RODRIGUES VIEIRA
  • Atividade Citoprotetora e Cicatrizante da Espécie Conocarpus erectus L em Lesões Gástricas Induzidas em Ratos Wistar Adultos.

  • Data: 06/09/2017
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  • A pesquisa farmacológica têm se voltado ao conhecimento da medicina popular, a fim de estabelecer as bases científicas dos seus efeitos farmacológicos. Entre as diversas fontes naturais utilizadas em nossa região destaca-se a espécie Conocarpus erectus L, popularmente conhecida como “mangue botão” pertencente à família Combretaceae. Diferentes partes da planta como folhas, caule, frutos e flores têm descrito sua atividade biológica, dentre estas anticancerígena e antimicrobiana. Relatos etnofarmacológicos obtidos na região de Salinópolis - PA descreveram potencial utilização em desordens digestivas. Apesar do grande avanço na terapêutica medicamentosa utilizada nos quadros de úlceração gástrica se faz importante a realização de estudos que possam comprovar sua validação. Este trabalho tem como objetivo verificar a atividade citoprotetora e cicatrizante do liofilizado do chá das cascas obtido por decocto da espécie Conocarpus erectus L (LCE) em lesões gástricas agudas e crônicas. Como metodologias para avaliação do efeito citoprotetor foram utilizados indução de lesões agudas por indometacina e etanol, enquanto o efeito cicatrizante foi avaliado por lesões crônicas induzidas cirurgicamente por ácido acético em ratos wistar adultos. A variação do pH intragástrico foi aferida pelo ensaio de ligamento de piloro. Foi avaliada atividade antioxidante do LCE pelo ensaio de DPPH, bem como os níveis de peroxidação lipídica pelo método de TBA-RS em lesões crônicas induzida por ácido acético à 5% e 10%. Os resultados revelaram atividade citoprotetora do LCE no modelo de indução por indometacina reduzindo o índice de ulceração (IU) nos grupos tratado LCE em 51,49%, omeprazol em 51,33% e  sucralfato em 71,28% quando comparados ao grupo controle, já no modelo de indução por etanol o grupo tratado LCE reduziu a área lesionada em 90,94% e o grupo sucralfato em 75,88% quando comparados ao grupo controle. Já na atividade cicatrizante o grupo tratado LCE reduziu as lesões gástrica à 5% em 80,11%, o grupo omeprazol em 52,75% e o grupo sucralfato em 66,33%, já as lesões gástricas à 10% o grupo tratado LCE reduziu 72,11%, o grupo omeprazol 57,47% e o grupo sucralfato 43,77% (p>0,05 Anova, pos test *Dunnett's e #Turkey’s). O tratamento com o LCE revelou um aumento de 39% sobre o pH intragástrico quanto comparado ao controle (p>0,05 Anova, pos test *Dunnett's e #Turkey’s) e não apresentou-se estatisticamente diferente do grupo que recebeu omeprazol no modelo de  ligadura de piloro. A atividade antioxidante do LCE foi comprovada no ensaio de DPPH, pois o mesmo foi diluído em 10x, 50x e 100x apresentando um percentual de 67,65 % ± 0,52 , 73,22 % ±0,17 e 72,70% ±1,39, respectivamente, quando comparado ao antioxidante ácido ascórbico (AA) usado como padrão que apresentou 33,74%  já a concentração remanescente de DPPH encontrada no AA foi de 92,84 ±1,20 e nas diluições do LCE em 10x foi de 53,84 ±0,60, 50x foi 47,44 ±0,20 e 100x foi 48,04 ± 1,60 ambos (p<0,05 Anova, post test  #Turkey’s).  A peroxidação lipídica avaliada nas lesões induzidas no modelo de indução por ácido acético a 5% demonstrou que a média dos níveis de MDA nos grupos nave, controle e    tratado LCE foi de 0,492±0,0849, 1,579±0,219 e 0,399±0,092, respectivamente, demonstrando que o grupo tratado LCE  foi  capaz de reduzir a peroxidação lipídica  em 74,73% em relação ao grupo controle (p<0,05 Anova, post test *Dunnett's) e não apresentou-se diferente estatisticamente do grupo nave. Já no modelo de indução por ácido acético a 10% a média dos níveis de MDA nos grupos nave, controle e tratado LCE foi de 0,628 ± 0,042, 1,567± 0,234 e 0,441±0,12 respectivamente. O grupo tratado LCE conseguiu reduzir em 71,85 % a peroxidação lipídica  quando comparado ao grupo controle (p<0,05 Anova, post test *Dunnett's). Estes resultados confirmam os efeito citoprotetor e cicatrizante do LCE e sugerindo possíveis mecanismos de ação associados a seu potencial antioxidante bem como uma possível inibição da secreção ácida.

    .

  • CLEISON CARVALHO LOBATO
  • Planejamento de candidatos a fármacos com atividade antileucêmica (k562) baseado na estrutura do 6α-hidroxivouacapan-7β,17β-lactona e 16-(N,N-dietilamino)metileno-6α-hidroxivouacapan-7β,17β-lactona

  • Data: 31/08/2017
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  • A leucemia é uma neoplasia do tecido hematopoiético originário da medula óssea e pode ser classificada, segundo a linhagem celular envolvida, como mielóide e linfóide. Assim, temos leucemia mielóide aguda (LMA), leucemia mielóide crônica (LMC), leucemia linfóide aguda (LLA) e leucemia linfoide crônica (LLC). Estudos têm evidenciado o papel essencial do controle da atividade da tirosino quinase ABL para o tratamento da LMC. Neste estudo o principal objetivo é o planejamento de compostos que atuem como inibidores da atividade tirosino-quinase ABL, responsável pela proliferação dessas células tumorais. Dentre os compostos de origem natural que apresentam atividade em células tumorais K562 de Leucemia mielóide crônica estão o ácido 6α,7β-Diidroxivoucapan-17β-óico (ADV) e 14 derivados que foram submetidos a estudos químico-quânticos com a finalidade de selecionar o melhor conjunto de base nível de teoria para ser utilizado em modelagem molecular futuras para estes compostos. O método que apresentou os melhores resultados foi o DFT/B3LYP 631-G**. Realizou-se ainda, triagem virtual com a finalidade de obter estruturas semelhantes ao ADV e derivados com potencial atividade nas células estudadas. As estruturas obtidas pela triagem virtual foram submetidas a estudos de predições de propriedades farmacocinéticas e toxicológicas (ADME/Tox) bem como o estudo de docking molecular para predizer a afinidade de ligação entre os complexos proteína-ligante. O composto que apresentou melhor afinidade de ligação foi o ZINC38664626, apresentou também parâmetros farmacocinéticos e toxicológicos adequados, mostrando-se ser um composto promissor para ser usado como fármaco.

  • KELTON LUIS BELÉM DOS SANTOS
  • PLANEJAMENTO RACIONAL DE FÁRMACOS COM ATIVIDADE ANTI-INFLAMATÓRIA NO RECEPTOR ADENOSINA TIPO 2 (A2AR)

  • Data: 31/08/2017
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  • A inflamação é um mecanismo homeostático abstruso gerado para proteger a integridade do organismo contra agentes nocivos endógenos ou exógenos. As doenças inflamatórias constituem um grupo complexo e heterogêneo de doenças, sendo causa importante de morbidade e mortalidade. O receptor de adenosina do tipo 2 (A2AR) é um receptor que protege o corpo contra os danos causados por várias doenças, como a asma, inflamação, pneumonia, aterosclerose, derrame cerebral, infarto do coração, doenças nos rins induzidas pelo diabetes, entre várias outras doenças. Isso gerou um grande interesse clínico no desenvolvimento de agonistas de A2AR e seriam potenciais medicamentos contra esses danos, em especial no processo anti-inflamatória, pois o composto de maior potencial (UK-432097) se mostrou cancerígeno nos testes clínicos. Assim, neste trabalho serão planejados potenciais compostos com atividade anti-inflamatória no receptor de adenosina tipo 2, com o auxílio do planejamento de fármacos (utilizado para otimizar o processo de síntese de compostos), o efeito será avaliado via análise SAR, QSAR, Triagem Virtual baseado em farmacóforo e ligante e determinação das propriedades farmacocinéticas e toxicológicas (ADME/TOX). Os resultados preliminares mostraram que para a construção dos modelos por Regressão Linear Múltipla (RLM) foi utilizada a correlação de Pearson, a matriz de correlação foi obtida usando o pEc50 como variável dependente de todos os fatores físico-químicos obtidos no farmacóforo e QSAR. Os descritores que apresentaram melhor correlação com o pEc50 foram respectivamente: Característica Hidrofóbica (Hidr) r = -0,638106, Características Farmacofóricas (Cf) r = -0,580424, Número de Átomos (At) r = -0,523004, Polarizabilidade Molar (Pol) r = -0,521870, Característica Aromática (Ar) r = -0,515494, Volume Molar (Vol) r = -0,509396, permitindo a construção de 63 modelos mono-, bi-, tri-, tetra-, penta- e hexaparamétrico. Por fim, o método de análise de RLM mostrou resultados satisfatórios para a predição anti-inflamatória no A2AR, onde estes modelos serão aplicados nos compostos obtidos via triagem virtual baseado em farmacóforo e ligante.

     

  • RAÍ CAMPOS SILVA
  •       

    PLANEJAMENTO DE CANDIDATOS A NOVOS FÁRMACOS COM POTENCIAL ATIVIDADE ANTICÂNCER DE PRÓSTATA HUMANO PC-3.

  • Data: 30/08/2017
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  • O Câncer de próstata PC-3 é uma das principais causas de doença e morte no planeta. É caracterizada pelo aumento excessivo do tamanho da glândula, com consequente diminuição do volume e intensidade do jato urinário. Na próstata e em outros órgãos, a testosterona é um hormônio andrógeno, que é convertido em dihidrotestosterona pela enzima 5α-redutase (5αR) e se liga ao receptor de andrógeno (RA). Mutações nesses andrógenos provocam reprodução de células cancerígenas após formação do complexo Andrógeno – Receptor. A incidência varia em 25 vezes em todo o mundo, com números maiores registrados nos países desenvolvidos dos continentes oceania, europa e américa do norte. No Brasil é o mais prevalente entre os homens em todas as regiões, com 95,63/100 mil habitantes no sul, 67,59/100 mil no centro-oeste, 62,36/ 100 mil no sudeste, 51,84/100 mil no nordeste e 29,50/100 mil no norte. A espécie Pterodon Emarginatus Vogel, vulgarmente denominada “Sucupira branca” é um vegetal com frutos, que sob a forma de infusão alcoólica é usada na medicina popular para o tratamento de várias doenças. Os compostos vouacapan extraídos da espécie citada, mostraram-se promissores para o tratamento de agentes antiproliferativos potentes contra células do câncer humano, em especial para células do câncer prostático PC-3, no qual valores experimentais de atividade (GI50) descritos na literatura, foram significativos. Estudos in silico de compostos com potencial anticâncer de próstata no RA, foram empregados para obter a provável pose bioativa do derivado vouacapan, via método semi-empírico (PM3) e refinada com o conjunto de base 6-31+G (d, p), calculada no método DFT através do nível de teoria B3LYP com o programa gaussian03. A triagem virtual baseada em ligantes foi realizada em cinco bases de compostos comerciais com os programas ROCS e EON, predições das propriedades farmacocinéticas e toxicológicas usando Qikprop e Derek, avaliação do índice de sobreposição molecular por contribuição estérica/eletrostática com uso do Discovery studio, além dos estudos de docagem molecular entre o ligante complexado (código PDB: 2oz7) e as estruturas selecionadas, usando o programa Pyrx. Entre as 238.922 moléculas, oito apresentaram bons valores teóricos de farmacocinética, toxicidade, similaridade estérica/eletrostática e afinidade de ligação, foram os hits (7) 10,9kcal.mol-1 como melhor da série, (1) 8,1kcal.mol-1 como menos favorável. As demais figuram dentro deste intervalo (2.8 Kcal.mol-1) com os respectivos valores, (8) 8,2kcal.mol-1, (5) 8,2kcal.mol-1, (4) 8,3kcal.mol-1, (2) 8,5kcal.mol-1, (3) 8,6kcal.mol-1, (6) 8,8kcal.mol-1, indicando boa eficiência do método de triagem usado. Os resultados nas predições para 21 propriedades farmacocinéticas, ficaram dentro da faixa recomendada, semelhantes até 95% dos fármacos disponíveis no mercado e nenhum alerta de toxicidade. As estruturas apresentaram similaridade com o pivô vouacapan maior que 75%. Baseado na afinidade de ligação e predições, duas moléculas foram consideradas mais promissoras, podendo ser indicadas como candidatas a estudos in vitro e in vivo.

     

    ABSTRACT

  • VALERIA ARAUJO BARROS
  • PLANEJAMENTO, SÍNTESE E APLICAÇÕES DE DERIVADOS NAFTOSALICÍLICOS COMO ANTIOXIDANTES

  • Data: 30/08/2017
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  • Os derivados de salicilatos são aplicados com sucesso como analgésicos, antitérmicos, anti-inflamatórios e na prevenção do câncer, principalmente de colón retal. Reduzem os riscos de muitas doenças associadas com a idade avançada. No entanto, apresentam efeitos adversos principalmente os eventos gastrintestinais que estão relacionados com seu principal constituinte (AAS), assim como também os aspectos que abrangem sua estabilidade química e afinidade pelos receptores biológicos. O objetivo do trabalho é o planejamento, síntese e aplicações de derivados naftaleno-salicílicos como antioxidantes. Assim, foi realizado um estudo teórico dos doze compostos estudados. Os cálculos de propriedades eletrônicas tais como dos orbitais de fronteira HOMO e LUMO, potencial de ionização (PI), energia de dissociação de ligação fenólica (EDLOH) e contribuição das densidades de spin, foram realizados usando os pacotes Gaussview e Gaussian, usando teoria do funcional de densidade (DFT), no nível B3LYP/6-31G (d,p). Alguns destes compostos foram sintetizados usando métodos clássicos. Os resultados mostraram que tanto a presença de uma hidroxila adicional quanto a substituição do anel benzeno por naftaleno aumentam a capacidade antioxidante na mesma proporção, com pequenas variações entre derivados ácido, éster e amida. Um efeito sinérgico foi observado quando ambos estão presentes, produzindo as moléculas mais potentes. Além disso, os cálculos de densidade de spin indicaram que um caminho regioseletivo pode ser obtido a partir de derivados monohidroxilados, com alta possibilidade de gerar in vivo e in vitro derivados dihidroxilados preferencialmente na posição para relativa ao grupo fenólico, através de reações enzimáticas ou não enzimáticas. Finalmente, a presença do anel naftaleno em substituição ao anel benzeno aumenta tanto a reatividade quanto a estabilidade química de intermediários do tipo quinona, as quais podem explicar o modo como estes compostos podem atuar nos mecanismos preventivos e tratamento do câncer. As atividades anticancer e anti-inflamátoria estão sendo realizadas para alguns dos compostos sintetizados.

  • AMANDA RUSLANA SANTANA OLIVEIRA
  • Aspectos teóricos da interação entre compostos cefalosporínicos e
    a Proteína 5 de Ligação à Penicilina de Escherichia coli usando
    Dinâmica Molecular.

  • Data: 04/08/2017
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  •  

     

    A Escherichia coli é um bacilo Gram-negativo anaeróbico que naturalmente
    habita o intestino de mamíferos. As doenças surgem quando a bactéria alcança
    outros órgãos do nosso corpo, causando infecções, principalmente no trato urinário
    de mulheres, devido à proximidade da uretra feminina com o ânus. No tratamento
    destas infecções são usados antibióticos que combatem a bactéria, tais como
    antibióticos da classe de cefalosporinas, que constituem o grupo com o maior
    número de antibióticos β-lactâmicos em uso clínico. Estes compostos são capazes
    de inibir a função enzimática das Proteínas de Ligação à Penicilina (PBP, do inglês
    Penicillin-Binding Proteins), que é responsável pela etapa final de biossíntese do
    peptidoglicano, componente essencial para a sobrevivência das bactérias. Neste
    trabalho, os compostos antimicrobianos cefoxitina, cefuroxima, cefotaxima,
    cefalotina, cefixima, cefmetazole e ácido 7-aminocefalosporânico, foram escolhidos
    com base em estudos experimentais de atividade biológica no combate ao patógeno
    oportunista Gram-negativo Pseudomonas aeruginosa, para serem estudados
    teoricamente, por meio de simulações de Dinâmica Molecular (DM), cálculos de
    energia livre de ligação e energia de interação por resíduo, para a determinação de
    sua potencial atividade biológica na inibição da função enzimática da PBP específica
    de E. coli, a Proteína 5 de Ligação à Penicilina (PBP5), portanto, sua inibição leva à
    morte celular. Foram obtidas energias livres de ligação mais favoráveis para os
    ligantes cefoxitina, cefalotina e cefuroxima, -31,471 Kcal/mol, -34,225 Kcal/mol e 35,085
    Kcal/mol, respectivamente, e observou-se que os resíduos catalíticos Ser44
    e His216 apresentaram contribuições energéticas mais favoráveis para o sistema
    formado pelo ligante cefalotina. Assim, sugere-se que a cefalotina tem excelente
    potencial para a inibição da função enzimática da PBP5 de E. coli, responsável pela
    fase final de transpeptidação da camada de peptidoglicano.

  • CLAUBER HENRIQUE SOUZA DA COSTA
  • Estudo do mecanismo conformacional da proteína 3-hidroxi-3-
    metilglutaril Coenzima A Redutase (HMGR) com as estatinas e
    substrato através de Dinâmica Molecular, PCA e Energia Livre
     
  • Data: 03/08/2017
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  • O colesterol é uma substância de extrema importância para todos os animais. Entretanto, seu alto nível no corpo humano está ligado às duas principais doenças
    que mais matam no mundo: cardiopatia isquêmica e AVC. Um dos medicamentos sintéticos já utilizados no tratamento da hipercolesterolemia são as estatinas,
    inibidoras da 3-hidroxi-3-metilglutaril Coezima A redutase (HMGR), que agem principalmente no fígado inibindo a conversão do substrato HMG-CoA em ácido
    mevalônico, que é o metabólito precursor do colesterol. Realizou-se estudos de Dinâmica Molecular (DM) combinados com Análise de Componentes Principais
    (PCA) para verificar o mecanismo das mudanças conformacionais do domínio Flap no C-terminal (resíduos His861, Leu862, Val863, Lys864, Ser865 e His866) após a ligação do substrato e de estatinas eficientes na inibição da enzima HMGR. Um total de 500 ns de Tempo de simulação de DM foram realizados neste estudo. Empregou-se cálculos de Energias Livres de Ligação, que estimaram que o mecanismo estrutural do Flap está relacionado diretamente com a ação da proteína HMGR, uma vez que esse domínio controla o acesso ao sítio ativo da enzima. Os resultados mostram também que a modificação estrutural do Flap aumenta a contribuição
    energética do sistema ao envolver maiores interações com os resíduos catalíticos e, consequentemente, a capacidade de inibir a produção do colesterol, como foi
    observado para a His866 catalítica, que tem contribuição bastante favorável quando o Flap está no estado fechado, com energia de -14,802 Kcal/mol, e quando o Flap
    passa para o estado aberto a contribuição é menos favorável, com -1,022 Kcal/mol, para o inibidor 1, mostrando que no estado fechado o resíduo catalítico está envolvido diretamente e contribui de modo favorável para o sistema, nos levando a uma melhor compreensão das mudanças conformacionais de HMGR após a ligação

    dos ligantes estatínicos e substrato HMG-CoA

     

  • JOAO HENRIQUE VOGADO ABRAHAO
  •  Estudo por Modelagem Molecular das Interações da Protease Nativa e Duplo Mutante do HIV-1 Complexada ao Inibidor Atazanavir


  • Data: 27/04/2017
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  • A síndrome da imunodeficiência adquirida (AIDS) é uma doença pandêmica que tem como agente etiológico o vírus Humanimmunodeficiencyvirus (HIV). Segundo o Ministério da Saúde, no Brasil estima-se a existência de 654.422 pacientes infectados pelo HIV, até a última atualização (junho/2016) de seus dados. Os fármacos produzidos atualmente partem de um estudo teórico com base computacional de modelagem molecular, em que são avaliadas as interações entre droga-receptor. Cujos receptores são alvos terapêuticos em patologias humanas.  Neste trabalho propõe-se o estudo de modelagem molecular por Dinâmica Molecular (DM) e Energia Livre de Ligação para descrever as interações entre a Protease do HIV-1 tipo selvagem e mutantes (I50V/A71V e I50L/A71V) complexadas com o inibidor atazanavir. Durante 100 nanosegundos (ns) de dinâmica molecular o ligante (atazanavir) apresentou melhor equilíbrio em seu sitio de ligação na protease nativa, todavia, nos outros dois sistemas em estudo o atazanavir permaneceu ligado ao seu sitio, porém apresentando menor equilíbrio. As análises da energia livre de ligação demonstram que a protease nativa é o sistema mais favorável energeticamente possuindo valor de ΔG = -46,30 kcal/mol, enquanto que a protease mutante I50L/A71 é o sistema que possui a menor espontaneidade na reação tendo ΔG = -27,64 kcal/mol. Além disso, os resultados dos cálculos de MM-GBSA demonstraram que a diminuição das interações de Van der Waals está relacionada ao aumento da resistência da protease ao fármaco em estudo.  


  • LUCIANA MORAIS CANAVIEIRA
  • Modelagem de análogos do ácido Kójico sobre a linhagem B16F10 de melanoma.

  • Data: 02/03/2017
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  • O melanoma maligno é resistente à maioria dos medicamentos disponíveis. A mortalidade causada pelo melanoma vem crescendo durante as últimas décadas, chegando a aproximadamente 150.000 novos pacientes por ano no mundo. Assim, neste trabalho foram investigadas a ação antoproliferativa e citotóxica de três novas moléculas derivados do ácido kójico (AK) em linhagem celular de melanoma B16F10 in vitro. O efeito da citotoxicidade in vitro foi avaliado pela redução do MTT. Além do mais, o modo de ligação e os efeitos inibitórios, na enzima Tirosinase (TYR), foram analisados por simulação computacional através da técnica de docagem molecular. Os resultados mostraram que as moléculas Mol 01 e Mol 03 já possuem potencial efeito antiproliferativo contra as células B16F10 de melanoma após um tratamento de 24h, a partir da concentração de 10 µM, com uma queda na viabilidade de aproximadamente 75%. Já nas concentrações de 75 µM e 100 µM a viabilidade já era de 0% em relação ao controle, para ambos os compostos. No entanto observou-se que o grupo de células tratadas com a Mol 02 em todas as concentrações e em todos os tempos, não apresentaram diferenças significativas quando comparadas ao grupo controle de 100%.   Por fim, os resultados de docagem sugerem que os inibidores exibem comportamentos semelhantes aos inibidores TRO (tropolone) e AK, o que enfatiza seu modo competitivo de inibição, bem como suas interações como os íons Cu2+ presentes no sítio catalítico da enzima TYR.

  • EDSON LEANDRO DE ARAUJO SILVA
  • Simulação Computacional do Mecanismo Catalítico da Enzima Catecol-Metiltransferase.

  • Data: 16/02/2017
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  • Reações de transferência de metil são muito importantes em sistemas biológicos. A enzima catecol O-metiltranferase catalisa a reação de transferência de um grupo metil do co-substrato S-adenosilmetionina para dopamina. Esta enzima está relacionada com a doença de Parkinson que se trata de uma doença neurodegenerativa que afeta de 7 à 10 milhões de pessoas da população mundial, principalmente a parcela com mais de 60 anos. Devido a importância da reação catalisada por esta enzima, ferramentas computacionais em conjunto com métodos da mecânica quântica foram utilizadas para o estudo do mecanismo de reação da transferência de metil da S-adenosilmetionina para dopamina. Neste estudo, a presença ou não do íon Mg2+ na reação e mudanças na estrutura da dopamina para catecol e fenol foram levadas em consideração a fim de propor a região quântica mais adequada para futuros trabalhos de simulação no meio enzimático. Os métodos utilizados incluem o método semiempírico PM6, o ab initio DFT e o de correlação MP2. O modelo de solvatação PCM foi usado com o intuito de estudar a reação de referência na água do sistema enzimático e analisar  as barreiras de energia da reação na água e comparar com barreiras obtidas no gás.

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