O Programa de Pós-Graduação em Ecologia Aquática e Pesca (PPGEAP) foi criado em junho de 2006; o seu principal objetivo é formar profissionais especializados em ecologia aquática e pesca, voltados para a pesquisa científica dos processos que controlam e interferem no funcionamento dos ecossistemas aquáticos. O programa vem funcionando desde março de 2007 e está avaliado com o conceito 5 CAPES na área de Biodiversidade.
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