Banca de DEFESA: SEBASTIAO RODRIGUES DA COSTA NETO

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: SEBASTIAO RODRIGUES DA COSTA NETO
DATA: 07/02/2022
HORA: 14:00
LOCAL: https://meet.google.com/uve-vbbx-egu
TÍTULO:

Ferramenta de Alto Desempenho para Identificação e Remoção de Adaptadores de Dados NGS

PALAVRAS-CHAVES:

Remoção de Adaptadores, Sequenciamento de Alto Rendimento, Bit-paralelismo, Programação Dinâmica

PÁGINAS: 58
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Ciência da Computação
SUBÁREA: Sistemas de Computação
RESUMO:

A remoção de adaptadores e regiões de baixa qualidade vindas de leituras brutas de dados gerados por plataformas NGS, é a etapa inicial dos pipelines de montagem de genomas. A remoção dessas sequências visa melhorar a qualidade dos dados na fase de montagem, permitindo melhor alinhamento entre as sequências. Além disso, desempenho em processamento é uma característica importante já que a quantidade de dados gerados pelas plataformas de alto rendimento é muito superior à quantidade real, por conta da busca por alta cobertura de regiões genômicas. Para isso, desenvolvemos o FAIR, uma ferramenta de corte de adaptadores para dados de extremidade única e emparelhada, que utiliza dois algoritmos de casamento de cadeias que se aproveitam do paralelismo intrínseco das operações sobre bits a fim, de encontrar regiões contaminantes com eficiência em processamento.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1913763 - ROMMEL THIAGO JUCÁ RAMOS
Interno - 2659210 - NELSON CRUZ SAMPAIO NETO
Externo ao Programa - 3210306 - FABRICIO ALMEIDA ARAUJO