Banca de QUALIFICAÇÃO: CAMILA TAVARES UCHOA GUIMARAES

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: CAMILA TAVARES UCHOA GUIMARAES
DATA: 29/04/2021
HORA: 09:00
LOCAL: PLATAFORMA ON LINE GOOGLE MEET
TÍTULO:

CARACTERIZAÇÃO DO PROGRAMA GENÉTIO UTILIZADO NA REGENERAÇÃO DE NADADEIRA PAREADAS EM Polypterus Senegalus

PALAVRAS-CHAVES:

regeneração; nadadeiras, Polypterus, transcriptoma

PÁGINAS: 73
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
SUBÁREA: Genética Animal
RESUMO:

A capacidade de regenerar partes corpóreas danificadas ou perdidas é uma característica distribuída variavelmente entre os filos do reino animal, principalmente nos grupos de vertebrados. Entre os vertebrados, os peixes da espécie Polypterus senegalus representam um modelo promissor para estudos dos mecanismos de regeneração de apêndices dos vertebrados por regenerarem eficientemente suas nadadeiras pareadas. Contudo, poucos estudos têm explorado compreender os eventos moleculares compartilhados e distintos da regeneração das nadadeiras em Polypterus. Além disso, estudos recentes têm demonstrado que a via de sinalização de ROS pode atuar como candidato na ativação dos eventos iniciais da regeneração a partir da modulação vias de sinalização downstream em modelos de regeneração de cauda.  Portanto, este estudo tem por objetivo identificar o programa genético utilizado na regeneração de nadadeiras pareadas em Polypterus. O sequenciamento do RNA foi realizado pela plataforma Nextseq 500/550 (Illumina) a partir de triplicatas biológicas (n=6) dos raios de nadadeiras peitorais.  A montagem do transcriptoma de novo foi realizada pelo software Trinity e a qualidade da montagem analisadas pela ferramenta assembly-stats e BUSCO.  A análise de expressão diferencial foi realizada pelo CLC Bio Genomics Workbench (Qiagen) com p-value ajustado (FDR) < 0.05 e FC > 2 ou FC < -2. O sequenciamento das bibliotecas resultou aproximadamente 48 milhões de reads por biblioteca com 78% de aproveitamento dos dados brutos. A montagem gerou 157.198 contigs com tamanho médio 413 pb e 20.208 contigs N50 com 1.907 pb. Foram identificados 652 genes upregulated e 1119 genes downregulated na regeneração dos raios do grupo de Polypterus juvenil. Apesar de 90.9% dos transcritos encontrados na regeneração dos raios e endoesqueleto no grupo juvenil, o perfil de expressão gênica tem variado consideravelmente entre os programas de regeneração. Os dados sugerem que a regeneração dos raios e endoesqueleto apresentam aspectos únicos com programas genéticos distintos que permitem o sucesso da regeneração entre os compartimentos da nadadeira. Já no estudo da via de sinalização de ROS, foi possível observar efeito somente em alguns animais tratados com DPI, sugerindo que via de ROS pode desempenhar um papel importante na regeneração em Polypterus. Por outro lado, são necessários mais estudos que confirme o seu papel na regeneração.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1900757 - IGOR SCHNEIDER
Externo ao Programa - 1900573 - PATRICIA NEIVA COELHO SCHNEIDER
Interno - 1627551 - SYLVAIN HENRI DARNET