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Banca de QUALIFICAÇÃO: CARLOS LEONARDO DE ARAGAO ARAUJO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: CARLOS LEONARDO DE ARAGAO ARAUJO
DATA: 23/09/2019
HORA: 09:00
LOCAL: Centro de Genômica e Biologia de Sistemas da UFPA
TÍTULO:

ANÁLISE DO PERFIL DE EXPRESSÃO GÊNICA DA INTERAÇÃO ENTRE MACRÓFAGOS DERIVADOS DE THP-1 INFECTADOS POR Corynebacterium pseudotuberculosis


PALAVRAS-CHAVES:

Infecção in vitro, Corynebacterium pseudotuberculosis, células THP-1, Dual RNA-seq.


PÁGINAS: 79
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
SUBÁREA: Genética Molecular e de Microorganismos
RESUMO:

A dinâmica de interação entre patógeno e hospedeiro no decorrer do processo infeccioso é responsável por uma complexa cascata de eventos celulares que envolvem a expressão de genes para a ativação de vias modulatórias em ambos os organismos. Corynebacterium pseudotuberculosis é uma bactéria Gram-positiva, intracelular facultativa e agente etiológico de patologias que afetam uma vasta gama de hospedeiros, dentre elas a linfadenite caseosa, que somam prejuízos ao agronegócio mundial. Este patógeno é capaz de subverter a resposta imunológica do indivíduo infectado, se instala no interior de macrófagos e pode migrar para diferentes tecidos causando infecções sistêmicas. Atualmente, devido ao avanço nas tecnologias de sequenciamento de material genético e bioinformática, é possível monitorar a expressão de genes de patógeno e hospedeiro simultaneamente, o que pode fornecer percepções acerca dos eventos envolvidos na infecção e traçar estratégias para novas terapias contra doenças infecciosas. Desta forma, este trabalho propõe aplicar a técnica de Dual RNA-seq para avaliar a interação entre C. pseudotuberculosis e macrófagos humanos derivados da linhagem monocítica THP-1, mediante ensaios de infecção in vitro. A cepa C. pseudotuberculosis OI3 será obtida a partir de material caseoso e identificada por métodos moleculares, analisada quanto ao seu perfil de crescimento e seu genoma será sequenciado pela plataforma MiSeq. Os monócitos THP-1 serão cultivados e diferenciados em macrófagos por meio de PMA. A infecção in vitro ocorrerá perante MOI 1:50. Após a extração do RNA total e depleção do rRNA, o sequenciamento do transcriptoma ocorrerá na plataforma NextSeq. A análise in silico para a identificação dos transcritos contra seus genomas de referência será realizada pelo TopHat2 e o Cufflinks será adotado para a determinação da expressão diferencial dos genes envolvidos na infecção.


MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2012979 - ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO FOLADOR
Interno - 1220143 - EDIVALDO HERCULANO CORREA DE OLIVEIRA
Interno - 1913763 - ROMMEL THIAGO JUCÁ RAMOS
Externo ao Programa - 2189846 - EDILENE OLIVEIRA DA SILVA
Notícia cadastrada em: 12/09/2019 16:10
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