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Banca de DEFESA: JULIO CESAR MENDES LOBATO

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: JULIO CESAR MENDES LOBATO
DATA: 02/06/2023
HORA: 08:00
LOCAL: videoconferência
TÍTULO:

Interações de Nanotubos de Carbono e Pontos Quânticos de Óxido de Grafeno com estruturas externas do SARS-CoV-2 via Dinâmica e Docagem Molecular


PALAVRAS-CHAVES:

Nanotubos de carbono, óxido de grafeno, SARS-CoV-2, docking, dinâmica molecular e energia livre.


PÁGINAS: 116
GRANDE ÁREA: Engenharias
ÁREA: Engenharia Química
RESUMO:

Foram avaliados a capacidade de interação entre nano partículas com as proteinas do virus SAR-CoV 2. Em uma primeira simulação os ligantes utilizados foram os nanotubos de carbono de parede única (NTCPUs) e os receptores as principais estruturas do vírus: a proteína do envelope (E-pro), a principal protease (M-pro) e a glicoproteína Spike (S-gly). Para isso foram utilizadas modelagem molecular de docagem e dinâmica molecular. A dinâmica molecular forneceu informações sobre o desvio quadrático médio de posições atômicas entre 0,5Å e 3,0Å. A dinâmica molecular mostrou que o nanotubo zigzag obteve uma melhor energia de Gibbs (ΔG) que corresponde a energia livre de ligação entre as nanopartículas e os alvos proteicos apresentaram valores: - 9,48, - 9,98 e - 10,08 kcal/mol para E-pro, M-pro e S-gly respectivamente, os valores de desvio quadrado médio das posições atômicas permaneceram mais estáveis para esta espécie de nanotubos, indicando que ela possui alta probabilidade de se ligar aos resíduos do sítio ativo das macromoléculas. Acoplamentos moleculares e energia livre de ligação mostraram que os resíduos do sítio ativo S-gly interagiram fortemente com os NTCPUs, registrando valores de: -112,73, -94,38, -80,49 kcal/mol para os zigzag, quiral e armchair, respectivamente. Em uma segunda etapa fazendo-se uso de quase a mesma metodologia anterior para os ligantes, porém os modificando para cinco pontos quânticos de óxido de grafeno (OG) com dimensões inferiores a 20 nm e interagindo apenas com os receptores das spikes de três cepas diferentes: S-gly-Omicron, S-gly-Kappa e S-gly – Delta. Fazendo uma comparação entre os dois ligantes o que se evidência foi uma melhor afinidade da interação S-Gly-Omicron/GO-E comenergia livre de Gibbs = - 172,2510 KJ/mol, em comparação com a melhor afinidade dos nanotubos de carbono, S-gly/zig-zag com ΔG = - 112,73 KJ/mol. Os oito ligantes propostos tendem a se ligar ao sítio ativo das macroestruturas. Concluem-se que os nanotubos de carbono e os oxidos de grafenos possuem alta probabilidade de aplicação em produtos inibidores do SAR-CoV-2, por meio do desenvolvimento de materiais que sejam produzidos pra a fabricação de EPIs, Sprays e soluções impermeabilizantes em geral.


MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2152952 - ANTONIO MAIA DE JESUS CHAVES NETO
Externo ao Programa - 3445961 - CARLOS ALBERTO BRITO DA SILVA JUNIOR
Externo à Instituição - FABIO LUIZ PARANHOS COSTA
Externo à Instituição - MARCELO RICARDO SOUZA SIQUEIRA
Externo à Instituição - MOZANIEL SANTANA DE OLIVEIRA
Interno - 1549677 - RAUL NUNES DE CARVALHO JUNIOR
Notícia cadastrada em: 24/05/2023 11:35
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