Banca de DEFESA: PAULO RICARDO MORAES PEREIRA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: PAULO RICARDO MORAES PEREIRA
DATA: 16/07/2020
HORA: 15:00
LOCAL: Plataforma Google Meeting
TÍTULO:

ESTUDO DO MECANISMO DE AÇÃO DE HALOGENASES NUCLEOFÍLICAS DEPENDENTES DE S-ADENOSIL-L-METIONINA

PALAVRAS-CHAVES:

Halogenases, Mecanismo catalítico, S-ADENOSIL-L-METIONINA

PÁGINAS: 73
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Química
SUBÁREA: Físico-Química
ESPECIALIDADE: Química Teórica
RESUMO:

As enzimas halogenases são muito promissoras no combate ao câncer e potenciais antibióticos. Isso ressalva sua importância do ponto de vista do planejamento de fármacos. Desta forma, neste trabalho foram empregadas técnicas de mecânica quântica/mecânica molecular (MQ/MM) e o método Umbrella Sampling, o WHAM-1D foi usado para analisar a densidade de probabilidade e obter o perfil de energia livre da coordenada de reação de duas enzimas a SalL-Clorinase e FlA-Fluorinase; estas enzimas catalisam uma reação de substituição nucleofílica entre S-adenosilmetionina (SAM) e o íon cloreto para gerar 5'-cloro-5'-desoxiadenosina (5'-ClDA) para clorinase e 5'-fluor-5'-desoxiadenosina (5'-FDA) fluorinase além de L-metionina. Para isso, a estrutura inicial das enzimas e substratos foram retiradas do Protein Data Bank (PDB) com o código 2Q6I-SalL e 1RQP-FlA. Foram simulados ataques nucleofílicos ao carbono C5’ das duas enzimas utilizando os nucleófilos cloreto e fluoreto. Foi observado que a substituição de cloreto por fluoreto na SalL leva a uma perda da atividade da halogenase, resultando no aumento no perfil de energia livre, mostrando uma barreira de 13,5 kcal/mol maior que a cloração. Foi verificado ainda a capacidade da SalL atuar como haleto metil transferase, no entanto a barreira de 41,95 kcal/mol, mostrou que essa rota é inviável cineticamente. A substituição de fluoreto por cloreto na FlA resultou em um aumento de 4,64 kcal/mol, mostrando a preferência da mesma pelo primeiro ânion. Também foi investigado a capacidade de alguns resíduos de aminoácidos estabilizarem o sistema; verificou-se que Trp129 tem um papel importante na estabilização do estado de transição para o sistema SalL-clorinase, e analisando o gráfico do tipo More O’ferrall-Jecks, verificamos que a reação é dissociativa para ambas as enzimas.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1316033 - ANDERSON HENRIQUE LIMA E LIMA
Interno - 1268476 - JOSE ROGERIO DE ARAUJO SILVA
Externo à Instituição - NELSON ALBERTO NASCIMENTO DE ALENCAR