Banca de DEFESA: ADONIS DE MELO LIMA

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: ADONIS DE MELO LIMA
DATA: 25/08/2017
HORA: 14:00
LOCAL: SALA SAT - 06 PRÉDIO ANEXO AO ICB
TÍTULO:

OTIMIZAÇÃO IN SILICO DA INTERAÇÃO DA LECTINA CIANOBACTERIANA MICROVIRINA EM COMPLEXO COM SEU LIGANTE O CARBOIDRATO MANΑ(1-2)MAN

PALAVRAS-CHAVES:

Modelagem comparativa. Dinâmica molecular. Cianobactérias. Lectina. Microvirina

PÁGINAS: 100
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Biologia Geral
RESUMO:

Dado os impactos decorrentes da infecção humana pelo vírus da imunodeficiência adquirida (VIH), uma parcela da comunidade científica tem se dedicado ao desenvolvimento de fármacos capazes de prevenir a entrada do vírus na célula hospedeira, impedindo assim a infecção de novos indivíduos. Este estudo, objetivou realizar análise in silico da microvirina (MVN), uma lectina produzida pela cianobactéria Microcystis aeruginosa, visando a otimização de sua afinidade de ligação à proteína gp120 viral, a proteína que intermedia a entrada do vírus nas células T CD4+. A sequência nucleotídica alvo deste trabalho foi obtida a partir de uma análise genômica da cianobactéria Microcystis aeruginosa CACIAM 03, isolada de uma amostra de água superficial do reservatório da usina de Tucuruí. O modelo foi construído por modelagem comparativa através do programa Modeller 9.16, tendo como molde a MVN de Microcystis aeruginosa de código PDB 2YHH (108 aa). Realizou-se o atracamento molecular da MVN com o seu ligante através do Molegro Virtual Docker (versão 5.5). A validação do alvo modelado foi feita através da análise da qualidade estereoquímica, da energia livre do sistema e do mapeamento do potencial eletrostático molecular. Além disso, foram feitas, com uso do Amber16, três dinâmicas moleculares (DM) de 210 ns para refinamento do alvo. A ferramenta de mutagênese pontual através de varredura por alanina (Alanine Scanning), foi usada para estudar a importância dos resíduos da proteína com o seu ligante. Várias informações adquiridas através destas simulações computacionais, foram usadas para a obtenção de um mutante. Como resultados, o alvo construído da MVN_CACIAM 03 apresentou 95% de identidade sequencial em comparação ao molde 2YHH.  Na MVN_CACIAM 03 gerada, 97% dos resíduos foram encontrados em regiões favoráveis, de acordo com o gráfico de Ramachandran. O atracamento molecular diminuiu o estado energético do complexo, as interações descritas na literatura também foram confirmadas no alvo gerado, os valores de RMSD da manose e do sítio de interação apresentaram-se bem estáveis durante as três trajetórias de 210 ns. Os cálculos do tempo de ocupação das ligações de hidrogênio foram feitos para os resíduos que mostraram interação no complexo MVN_CACIAM03 e di-manose. E o mutante gerado (Thr82Arg), após os estudos computacionais, mostrou se mais eficiente durante o processo de interação receptor-ligante.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - 1902138 - AGENOR VALADARES SANTOS
Externo à Instituição - ANDERSON HENRIQUE LIMA E LIMA
Interno - 2278489 - CLAUDIO NAHUM ALVES
Presidente - 1372427 - EVONNILDO COSTA GONCALVES
Externo à Instituição - NELSON ALBERTO NASCIMENTO DE ALENCAR