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Banca de DEFESA: VITOR CIRILO ARAUJO SANTOS

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: VITOR CIRILO ARAUJO SANTOS
DATA: 04/05/2018
HORA: 10:00
LOCAL: ICEN, LABCOMP1
TÍTULO:

MGCOMP: Sistema computacional multiplataforma para análise comparativa de metagenoma


PALAVRAS-CHAVES:

Metagenômica, Clusterização, Visualização interativa de dados.


PÁGINAS: 85
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Ciência da Computação
SUBÁREA: Sistemas de Computação
ESPECIALIDADE: Software Básico
RESUMO:

A metagenômica estuda comunidades de microrganismos, não cultiváveis em laboratório, a partir da seleção de amostras do meio ambiente. As amostras ou metagenomas são submetidas a um sequenciamento em larga escala e posteriormente analisadas por pipelines de bioinformática. A análise das sequencias permite estimar o impacto da presença ou ausência desses microrganismos nos respectivos metagenomas. Assim, dados metagenômicos permitem a identificação das assinaturas taxonômicas e funcionais disponíveis em uma metagenoma. As assinaturas geralmente não são exploradas de forma integrada e a falta de metadados ambientais limitam inferências de contexto na análise de dados. Neste trabalho propomos uma ferramenta computacional (MGCOMP) que fornece um conjunto de funcionalidades para análise comparativa de metagenomas. Além disso, como proposta principal, oferecemos uma nova abordagem de comparação metagenômica baseada em uma metodologia integrada para identificar e comparar assinaturas metagenômicas, correlacionando-as com fatores ambientais (quando disponíveis). As assinaturas são apresentadas de forma hierárquica (estruturada em árvore), uma espécie de conjunto de clusters aninhados. Estes clusters são calculados através de uma estratégia computacional desenvolvida para avaliar de forma ótima as partições de clusterização. Foi desenvolvida também uma visualização em árvore de bolhas (por Javascript) para guiar a exploração interativa das assinaturas metagenômicas. No que nos diz respeito, a análise integrada das assinaturas ambientais e visualização interativa nunca foram explorados anteriormente.


MEMBROS DA BANCA:
Interno - 2325270 - BIANCHI SERIQUE MEIGUINS
Externo ao Programa - 2324982 - REGIANE SILVA KAWASAKI FRANCES
Notícia cadastrada em: 16/04/2018 11:51
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