Caracterização Molecular da Região Promotora do Gene do Receptor da Melatonina e Associações de Polimorfismos com Características de Fertilidade em Búfalas na Amazônia
Bufalas, Melatonina, PCR, SNP,
A produção de búfalos no Brasil tem crescido ao longo dos anos e paralelo, os desafios de associar os marcadores moleculares em búfalas para melhorar os índices produtivos e reprodutivos. Sendo assim, o objetivo deste estudo é Caracterizar a região Promotora do Gene Receptor da Melatonina 1A e associar os polimorfismos detectados com as concentrações de parto, intervalo entre partos e eficiência reprodutiva de búfalas criadas em sistemas intensivos e extensivos nos estados do Amapá e Pará. Será realizado o método do PCR e posterior sequenciamento desses produtos de PCR. As sequências serão editadas utilizando o programa computacional Finch TV Versão 1.4.0 (Geospiza Research Team, USA), sendo sempre comparadas com as sequências contidas no Genebank através do sistema BLAST e em seguida serão alinhadas para comparação das mesmas entre os animais para detectar os possíveis polimorfismos. Os domínios de ligação dos fatores de transcrição na região promotora serão identificados por comparação com diferentes espécies com auxílio do programa TRANSFAC 4.0 (WINGENDER et al., 2001) e caracterizar os possíveis domínios de ligação dos fatores de transcrição quanto aos possíveis polimorfismos detectados. As frequências alélicas e genotípicas serão estimadas utilizando o método de contagem direta. As proporções de possíveis desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg serão testadas por comparações das frequências genotípicas e será avaliado o desequilíbrio de ligação entre os pontos polimórficos. Todas essas análises serão realizadas com auxílio do programa computacional GENEPOP (RAYMOND; ROUSSET, 1995). Para as características de intervalo de parto, período de serviço e concentração de parto/mês, as análises serão realizadas utilizando modelos lineares através do aplicativo PROC MIXED do pacote estatístico do SAS 8.0 (SAS Institute, Inc. 2000), assumindo distribuição normal dos dados.