O estudo de docagem e dinâmica molecular de nanoesferas para adsorção de vírus SAR-CoV-2
Nanoesferas de carbono(CNS); Covid-19; Nanotecnologia; Dinâmica Molecular; Docagem Molecular.
O coronavírus é causado pelo vírus SARS-CoV-2, denominado 2019-nCoV, tem demonstrado rápida proliferação e escassez de tratamentos com eficácia comprovada. Desta forma, pesquisas com nanomateriais têm sido amplamente sugeridas, podem fornecer uma alternativa viável para inativação de virus, nanoesferas de carbono, agem diretamente em estruturas biológicas por apresentarem estrutura tipo matriz com componentes ativos que podem ser adsorvidos na superfície. Desta forma, diferentes partes do vírus SARS-CoV-2(M-Pro, S-Gly e E-Pro), podem ser inativadas ou serem detectadas com nanotecnologia. Os procedimentos computacionais, realizados neste trabalho foram desenvolvidos com o servidor SwissDock e o software GROMACS, possibilitando extrair dados relevantes sobre energia de afinidade, distância entre moléculas, energia de Gibbs livre e desvio quadrático médio de posições atômicas, área superficial acessível a solventes. DOC mostra que todos os ligantes têm afinidade pelos sítios ativos do receptor. As nanoesferas interagem favoravelmente com todas as proteínas, apresentando resultados promissores, principalmente a C60, que apresentou os melhores valores de energia de afinidade e RMSD para praticamente todas as macromoléculas proteicas investigadas. Portanto, C60 apresentou a melhor estabilidade durante o processo DOC e no processo de Dinâmica Molecular, enquanto as análises das outras estruturas, apresentou resultados promissores que podem ser utilizados para outras proteases.