Interações de ftalocianinas de Co, Cu e não metálicas com estruturas externas de SARS-CoV-2 utilizando docking e dinâmica molecular
COVID-19, SARS-CoV-2, Docagem Molecular, Dinâmica Molecular, Ftalocianina.
O novo coronavírus, SARS-CoV-2, provocou a pandemia do COVID-19, caracterizada pela elevada taxa de contaminação, capacidade de propagação e índice de letalidade. Neste trabalho abordamos a utilização de ftalocianinas como possível inibidor do SARS-CoV-2, por apresentar diversas propriedades interativas das ftalocianinas (Pc) de Cobalto (CoPc), Cobre (CuPc) e sem grupo metálico (NoPc) podem interagir com o SARS-CoV-2, apresentando potencial para serem utilizadas como filtragem por adsorção em tintas nas paredes, máscaras, roupas e filtros de ar condicionado. Foram utilizadas técnicas de modelagem molecular por meio de Docking Molecular e Dinâmica Molecular, onde o alvo foram as estruturas externas do vírus, mas especificamente as proteases envelope protein, main protease e Spike glycoprotein. Utilizando o módulo G_MMGBSA, e com isto os estudos de docagem molecular mostrando que os ligantes têm características de interação capaz de adsorver as estruturas. A dinâmica molecular forneceu informações do desvio da raiz quadrada média das posições atômicas forneceram valores entre 1 e 2.5 Â. Foram utilizados o modelo de solvatação implícita de Born generalizado, energia livre de Gibbs e abordagem da área de superfície acessível do solvente. Dentre os resultados obtidos por meio da dinâmica molecular, percebeu-se que as interações ocorrem, visto que as Pc foram capazes de se ligar aos resíduos do sítio ativo das macromoléculas, demonstrando boas interações; em particular com a CoPc. Os acoplamentos moleculares e energia livre mostraram que os resíduos do sítio ativo da S-gly, interagiram fortemente com as ftalocianinas com os valores -182.443 kJ/mol (CoPc), 158.954 kJ/mol (CuPc), e -129.963 kJ/mol(NoPc). As possíveis interações das Pc’s com o SARS-CoV-2, podem prever alguns candidatos promissores a antagonistas ao vírus, que se confirmados por meio de abordagens experimentais, podem contribuir para resolver a crise global da pandemia de COVID-19.