ESTUDO COMPUTACIONAL DE INIBIDORES NAS ESTRUTURAS NATIVA E MUTANTE V600E DA ENZIMA QUINASE BRAF
Melanoma, inibidores BRAF; mutante BRAFV600E; Dinâmica Molecular.
A enzima denominada BRAF quinase tem sido identificada como um potencial alvo biológico relacionada ao melanoma, um tipo grave de câncer de pele causado pela formação anormal dos melanócitos. Particularmente, destaca-se a mutação V600E desta proteína, que apresenta resistência a fármacos com atividade antimetastática em relação à forma nativa da BRAF. Esta mutação, por sua vez, leva a irregularidades na melanogenese e foi encontrada em mais de 60% dos casos da doença. Atualmente, muitos estudos buscam compreender o mecanismo de ativação da via das proteínas quinases ativadas por mitógenos (do inglês, Mitogen-activated Protein kinases - MAPK), em especial, o modo inibição e da BRAFV600E. Neste contexto, este estudo abordou, a partir de métodos de química computacional, inibidores dos tipos I, I1⁄2 e II da BRAF, complexados a sua forma nativa e sua principal mutante (V600E). Mais especificamente, avaliaram-se as interações dos inibidores com a BRAF em simulações por DM, além de estimarem-se as afinidades dos complexos simulados através de cálculos de energia livre de ligação, aplicando métodos de MM PB/GB(SA) e SIE. Portanto, encontraram-se padrões no modo de inibição das moléculas estudadas quando complexadas às formas nativa e mutante da enzima, onde uma importante interação foi revelada, para os 10 inibidores com o nitrogênio da cadeia principal da Cys532, além de resíduos-chaves como Asp594, Gly595, Glu501 e Gln530, que auxiliam na estabilização dos complexos formados. As contribuições de energia livre de ligação (ELL) corroboram com os valores de atividade experimentais. Portanto, os resultados obtidos podem contribuir significativamente para a pontuação de inibidores seletivos e potencialmente ativos da BRAF.