Banca de DEFESA: RICARDO MORAIS DE MIRANDA
Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.DISCENTE: RICARDO MORAIS DE MIRANDA
DATA: 12/06/2017
HORA: 10:00
LOCAL: a confirmar
TÍTULO:
Estudos de Relação Quantitativa Estrutura Atividade (QSAR-3D)
combinados a Docking Molecular e Dinâmica Molecular de novos Inibidores da enzima
2-trans-Enoil-ACP (CoA) Redutase de Mycobacterium tuberculosis
PALAVRAS-CHAVES:
Inibidores InhA, Dock Molecular, Dinâmica Molecular e Energia Livre de Ligação.
PÁGINAS: 101
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Química
SUBÁREA: Físico-Química
ESPECIALIDADE: Química Teórica
RESUMO:
Neste trabalho, estudo combinando QSAR-3D, com dock molecular e dinâmica molecular foram realizados para 39 inibidores da enzima 2-trans-Enoil-ACP (CoA) Redutase de Mycobacterium tuberculosis. O modelo QSAR-3D preditivo destes compostos foi obtido com parâmetros estatísticos satisfatórios, utilizando ferramentas COMFA e CoMSIA. Os valores de Q2 e R2 CoMFA (q2 = 0,86, r2 = 0,99) e CoMSIA (q2 = 0,79, r2 = 0,94) estão acima dos critérios mínimos aceitáveis capaz de validar o modelo estatístico (q2 > 0,5 e r2 > 0,6). Todos os modelos construídos possuí boa capacidade preditiva, apresentando r2pred de 0.64 e 0.68 para os modelos CoMFA e CoMSIA, respectivamente, os mapas de contorno forneceram informações úteis para projetar relações sobre o caráter eletrostático, estérico, hidrofóbico e doador/receptor de ligação de hidrogênio com aumento das atividades de inibidores. Simulações de dock molecular e dinâmica molecular foram realizadas para o inibidor 3 (menor atividade biológica, pIC50 = 6,36) bem como para o inibidor 30 (maior atividade biológica, pIC50 = 8,69). A energia livre de interação obtidas por meio de dock molecular, -12,05 Kcal/mol e 13,26 Kcal/mol para o complexo com o inibidor 3 e 30, respectivamente, indicam interações favoráveis para ambos sistemas, sendo o complexo formado com o inibidor 30 mais favorável. A simulação de dinâmica molecular possibilitou o emprego de características termodinâmicas e permitiu investigar as interações de modo mais realístico. Assim, pôde-se calcular a energia livre de ligação com método MMGBSA, onde se obteve valores de -14,67 Kcal/mol e -31,49 Kcal/mol para o complexo com o inibidor 3 e 30, respectivamente, confirmando o caráter favorável para ambos sistemas. O emprego de diferentes abordagens combinadas possibilitaram, compreender as principais características dos inibidores bem como da enzima 2-trans-Enoil-ACP (CoA) Redutase de Mycobacterium tuberculosis capazes de indicar as interações responsáveis pelo caráter inibitório dos ligantes, com consequente morte bacteriana.
MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1662562 - JERONIMO LAMEIRA SILVA
Interno - 2278490 - DAVI DO SOCORRO BARROS BRASIL
Interno - 1268476 - JOSE ROGERIO DE ARAUJO SILVA
Externo ao Programa - 1866874 - AGNALDO DA SILVA CARNEIRO
Externo à Instituição - ANDERSON HENRIQUE LIMA E LIMA
Externo à Instituição - NELSON ALBERTO NASCIMENTO DE ALENCAR
Externo à Instituição - ANTONIO FLORENCIO DE FIGUEIREDO