Banca de QUALIFICAÇÃO: FLAVIO VINICIUS DA SILVA RIBEIRO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: FLAVIO VINICIUS DA SILVA RIBEIRO
DATA: 14/10/2024
HORA: 10:00
LOCAL: G-meet
TÍTULO:

AVALIAÇÃO ESTRUTURAL E ENERGÉTICA DE INIBIDORES NÃO-COVALENTES DE PROTEASE SEMELHANTE À PAPAÍNA (PLpro) DE SARS-CoV-2

PALAVRAS-CHAVES:

COVID-19, PLpro, Simulação Computacional, Energia Livre

PÁGINAS: 73
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Química
SUBÁREA: Físico-Química
ESPECIALIDADE: Química Teórica
RESUMO:

O SARS-CoV-2 é o vírus causador da doença conhecida como Doença do Coronanavírus 2019 (Coronavirus desease – COVID19), que assolou em uma pandemia entre os anos de 2020 e 2022, chegando a quase 800 milhões de casos e 7 milhões de mortos, de acordo com dados oficiais da Organização Mundial da Saúde. Nesse contexto, a Papaína Semelhante à Protease (PLpro) é uma proteína da família das proteases, de fundamental  importância para a maturação e replicação viral, além de estar ligada ao enfraquecimento da resposta imunológica do hospedeiro. Assim, este estudo propõe o uso de técnicas computacionais, a exemplo do ancoramento e da Dinâmica Molecular (DM) tornam-se fundamentais para compreender o comportamento estrutural e energético nos inibidores propostos, realizando análise de RMSD, RMSF e cálculos de energia livre, empregando métodos de MMGB/PBSA e SIE, além dos perfis de energia livre (FEL) para compreender as estruturas mínima, ou seja, os estados que caracterizam a inibição em PLpro. Os estudos mostraram que dos ligantes avaliados, o XR8-24 corresponde melhor a inibição da PLpro, pois realiza interações intermoleculares que permitem o estado fechado da região looping bloqueado na proteína, blindando assim o sítio ativo, e impedindo o contato com seu substrato natural.  Assim, cria-se uma elucidação otimista a certa dos conceitos teóricos que podem explicar a inibição não-covalente desta protease, contribuindo com o planejamento e desenvolvimento de fármacos. 

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1268476 - JOSE ROGERIO DE ARAUJO SILVA
Externo à Instituição - CLAUBER HENRIQUE SOUZA DA COSTA
Externo à Instituição - JESSICA DE OLIVEIRA ARAUJO
Externo à Instituição - RICARDO MORAIS DE MIRANDA