Banca de QUALIFICAÇÃO: MAYCON VINICIUS DAMASCENO DE OLIVEIRA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: MAYCON VINICIUS DAMASCENO DE OLIVEIRA
DATA: 28/09/2022
HORA: 15:30
LOCAL: Auditório da Faculdade de Química
TÍTULO:

AVALIAÇÃO COMPUTACIONAL DA CINÉTICA E TERMODINÂMICA DE LIGAÇÃO ENTRE ÁCIDO UDP-N-ACETILMURÂMICO (UNAM) E A ENZIMA UDP-N-ACETILGLICOSAMINA ENOLPIRUVIL TRANSFERASE (MURA)

PALAVRAS-CHAVES:

MurA; UNAG; UNAM; dinâmica molecular; τ–RAMD; tempo de residência; constante de dissociação.

PÁGINAS: 53
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Química
SUBÁREA: Físico-Química
ESPECIALIDADE: Química Teórica
RESUMO:

O peptidoglicano é responsável por estabilizar a parede celular e, também, fornecer a integridade estrutural da célula para que as bactérias resistam à pressão osmótica. A biossíntese responsável pela formação do peptidoglicano ocorre em três fases diferentes sendo: citoplasmática, associada à membrana e periplasmática. A enzima MurA é a primeira enzima da família Mur presente na etapa citoplasmática responsável por realizar a reação catalítica entre fosfoenolpiruvato (PEP) e UDP-N-acetilglucosamina (UNAG) para formar o UDP-N-acetilglucosamina enolpiruvato (EP-UNAG) e fosfato inorgânico (Pi). A MurA é inibida covalentemente por um análogo do PEP, seu substrato natural, o antibiótico fosfomicina, na qual, desde o seu descobrimento, em 1969, continua sendo o único fármaco aprovado pela Food and Drug Administration. O estudo de Zhu et al., em 2012, identificou pela primeira vez a presença do ácido UDP-N-acetilmurâmico (UNAM) fortemente complexado com a MurA. A presença deste, que é produto da reação da enzima MurB (catalisa a segunda etapa da via) faz com que o complexo seja extremamente rígido e capaz de ficar por um longo tempo na etapa do citoplasma, além da já conhecida presença do substrato PEP covalentemente ligado à cisteína 115 no sítio ativo da MurA. O complexo UNAM-MurA pode bloquear a via quando a quantidade de UNAM for alta no sítio ativo. Um novo inibidor da MurA é difícil de obter, pois o inibidor precisa competir com PEP e UNAM ou UNAG e deve ter a capacidade de desbloquear o complexo UNAM-MurA. Através de métodos computacionais como a dinâmica molecular clássica, demonstramos que o UNAM realiza interações intermoleculares mais fortemente com a proteína do que o substrato UNAG. O UNAM realiza interações de hidrogênio mais forte com o resíduo Arg120 e Arg91 em contraste com UNAG. Esses resíduos desempenham um papel fundamental na estabilização da conformação fechada da MurA. Além disso, o UNAM possui uma afinidade maior que o do UNAG sendo -68,73 (± 8,42) e -8,82 (± 0,76), para os métodos MM/GBSA e SIE, respectivamente. Os dados cinéticos obtidos pelo método τ–RAMD mostram que o UNAM possui um tempo de residência e constante de dissociação maior que o do UNAG o que explica a presença do UNAM, produto da reação da MurB, presente no sítio ativo da MurA.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1316033 - ANDERSON HENRIQUE LIMA E LIMA
Interno - 1662562 - JERONIMO LAMEIRA SILVA
Interno - 1268476 - JOSE ROGERIO DE ARAUJO SILVA
Externo à Instituição - KAUÊ SANTANA DA COSTA