O Uso Do Metabarcoding Para Avaliar Comunidades Zooplanctônicas marinhas da Amazônia Azul.
Biodiversidade; Costa Amazônica; Identificação molecular; Plâncton; Plataforma Continental Amazônica; Sequenciamento de alto rendimento
A comunidade planctônica é taxonomicamente diversa, com representantes em todos os níveis tróficos e domínios da vida. O zooplâncton constitui a porção heterotrófica do plâncton e desempenha um papel essencial na manutenção da cadeia alimentar aquática. Devido ao curto período de vida e resposta rápida frente às mudanças ambientais, esses organismos atuam como excelentes bioindicadores da qualidade ambiental. Na Amazônia, o levantamento da diversidade planctônica é predominantemente baseado em métodos tradicionais de identificação. Embora a microscopia seja eficaz para diversos grupos, suas limitações podem levar a avaliações imprecisas da biodiversidade. Baseado nisso, o metabarcoding surge como alternativa rápida, sensível e economicamente viável, que permite identificar espécies que dificilmente seriam detectadas por microscopia. As amostras utilizadas neste estudo foram coletadas na Plataforma Continental Amazônica durante uma única campanha realizada em outubro de 2018. O zooplâncton foi capturado através da filtragem da água superficial utilizando uma rede de plâncton de 200 µm. O DNA total das amostras foi extraído seguindo protocolo que utiliza o composto CTAB. Posteriormente, o DNA isolado foi amplificado utilizando o conjunto de primers Leray-COI. As bibliotecas de DNA foram preparadas e sequenciadas na plataforma Illumina NovaSeq. As sequências brutas foram analisadas e curadas usando o Software OBITools e atribuição taxonômica foi feita no Software R Studio, utilizando a ferramenta MegaBLAST. Para visualizar as diferenças de composição entre as amostras, foi utilizada a análise de NMDS nos dados de abundância, utilizando uma matriz de distância Bray-Curtis. Um total de 88 espécies foi identificado, distribuídas em vários níveis taxonômicos, incluindo oito filos, 11 classes, 27 ordens, 53 famílias e 73 gêneros. Dentre elas, recuperamos espécies de grande relevância ecológica, como espécies invasoras (Charybdis hellerii e Temora turbinata), vulnerável (Balistes capriscus) e bioindicadores (Heliconoides inflatus e Limacina inflata). Também foram identificadas espécies importantes para a pesca, como os decápodes (Callinectes ornatus e Rimapenaeus constrictus) e ictioplâncton (Caranx crysos, Lutjanus synagris, Micropogonias furnieri). As comunidades analisadas apresentaram bastante variação na resposta total e por grupo taxonômico, indicando influência da combinação dos fatores ou variáveis analisados e pouca associação aos fatores separadamente. Concluímos que o metabarcoding foi eficaz na amostragem da diversidade global de zooplâncton, detectando sinais de diversos grupos taxonômicos distintos.