O uso do sequenciamento genômico em diferentes graus de cobertura para o estudo da biodiversidade e evolução em peixes.
Adaptação evolutiva, sequenciamento, genômica, peixes, Amazônia.
As técnicas moleculares que se baseiam no DNA têm uma importância fundamental na investigação da diversidade biológica e na formulação de estratégias para monitorar diversas espécies. A necessidade de ampliar bancos referenciais genéticos desde a introdução do DNA barcoding como um método para identificar espécies molecularmente tornou-se evidente com o surgimento de métodos mais avançados como o metabarcoding. Técnicas mais aprimoradas como o whole-genome sequencing (WGS) e o ressequenciamento genômico têm sido eficazes na análise da variação genética em ampla escala, possibilitando a identificação de áreas do genoma suscetíveis a processos de seleção e seu efeito na estrutura na distribuição e na manutenção das espécies. A partir de uma maior cobertura de sequenciamento, têm sido possível explorar a arquitetura genética responsável pelos processos e dinâmicas evolutivas em diferentes condições ambientais que levaram à adaptação de diversas espécies com caráter modelo para este tipo de estudo. Os linguados e peixes-agulha são peixes que possuem uma origem marinha, mas que conseguiram colonizar os ambientes de água doce a partir da adaptação do metabolismo necessário diante da variação ambiental encontrada. Dessa forma, o presente estudo pretende aplicar o sequenciamento genômico utilizando diferentes métodos que garantam uma estimação mais precisa da diversidade de peixes de água doce na Amazônia, além de investigar a base molecular genômica que levou a adaptação em linguados e peixes-agulha debaixo da genômica evolutiva. Já possuímos amostras com dados de sequenciamento low-coverage prontos que em breve serão processadas para montagem de mitogenomas. Além disso, amostras já se encontram na UiO para o sequenciamento de média cobertura.