Sequenciamento, Arbovírus, Changuinola.
Este trabalho consiste em aprofundar os conhecimentos acerca do genoma do sorogrupo Changuinola pertencente ao gênero Orbivirus da família Reoviridae, que agrupa vírus de RNA de dupla fita. Sabe-se pouco sobre a incidência e a distribuição do vírus Changuinola, no entanto, os primeiros relatos ocorreram nas áreas de floresta tropical da América, onde o principal artrópode vetor deste vírus encontra-se em abundância devido às condições favoráveis de adaptação e reprodução existentes. Os estudos sobre o sorogrupo Changuinola estão restritos a aspectos sorológicos e de caracterização morfológica e fisico-químicas não havendo dados a respeito da organização genômica. Portanto, estudos direcionados a obtenção de sequências nucleotídicas completas fornecerão dados para um melhor entendimento da epidemiologia molecular e evolução deste extenso grupo de arbovírus. As cinco cepas virais do sorogrupo Changuinola serão obtidas do acervo de vírus da Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas (SAARB) do Instituto Evandro Chagas (IEC). Para a obtenção do RNA genômico será utilizado o equipamento MagNA Pure LC 2.0 (Roche, Alemanha) utilizando o kit MagNA Pure LC Total Nucleic Acid Isolation, seguindo as instruções do fabricante. Para a obtenção das sequências nucleotídicas completas serão utilizadas duas diferentes plataformas de sequenciamento: GS FLX Genome Sequencer 454 (Life Science, Roche) e ABI 3130 (Applied Biosystems). As análises filogenéticas serão realizadas basicamente utilizando os métodos de agrupamento de vizinhos, máxima verossimilhança e Bayesiano.