PADRONIZAÇÃO DE REAÇÃO EM CADEIA DA POLIMERASE EM TEMPO REAL (qPCR) PARA DETECÇÃO DE Chlamydia trachomatis EM AMOSTRAS ENDOCERVICAIS
Chlamydia trachomatis, RT-qPCR, diagnóstico molecular.
A Chlamydia trachomatis é bactéria sexualmente transmissível mais comum entre adolescentes sexualmente ativos e, quando não tratadas e mulheres, podem levar a sequelas tais como gravidez ectópica, infertilidade, dor pélvica crônica e doença inflamatória pélvica. O diagnóstico laboratorial ainda é um obstáculo para a rápida identificação e tratamento dos indivíduos infectados. O presente estudo teve como principal objetivo a padronização de um ensaio de PCR em tempo real (RT-qPCR) para a detecção da C. trachomatis em amostras de endocérvice uterina. Para a padronização do teste foram utilizadas duas amostras endocervicais (uma positiva e uma negativa para C. trachomatis) previamente testadas por PCR convencional e um controle endógeno da reação (Beta actina). Todos os procedimentos foram realizados visando a melhor relação custo-benefício e menor tempo de resultado. A extração de DNA foi realizada por kits previamente selecionados que oferecem DNA em quantidade e qualidade necessária para reação de RT-qPCR. Os primers e sondas para as reações foram desenhados e avaliados por softwares específicos e levaram em conta as sequências genômicas da C. trachomatis depositadas on-line. Os experimentos foram padronizados para a utilização das menores concentrações possíveis dos reagentes (primers, dNTPs, Taq polimerase, master mix, etc) e do menor tempo possível de ciclagem em cada reação. foi padronizado um novo protocolo utilizando PCR em tempo real para a detecção de Chlamydia trachomatis em amostras de swab cervical. A inserção de um controle interno de amplificação baseado em um housekeeping gene humano na reação, garante todo o processo de análise desde o procedimento de coleta das amostras, qualidade dos reagentes utilizados e o correto funcionamento dos equipamentos e acessórios. Assim o protocolo padronizado neste estudo pode ser utilizado na rotina de diagnóstico laboratorial para a detecção de Chlamydia trachomatis de forma confiável sendo sensível, específico e rápido podendo-se obter os resultados das análises no mesmo dia.