"PERFIL DE EXPRESSÃO DIFERENCIAL DE CORYNEBACTERIUM PSEUDOTUBERCULOSIS LINHAGEM 258 SUBMETIDA À CONDIÇÃO DE ESTRESSE ÁCIDO IN VITRO".
Corynebacterium pseudotuberculosis, transcriptoma, RNA-seq, estresse ácido.
A Corynebacterium pseudotuberculosis é uma bactéria patogênica Gram-positiva, intracelular facultativa, não-esporulante, não-capsulada, pleomórfica e imóvel. O seu genoma presenta um 52,2% de conteúdo G+C e pertence ao grupo CMNR (Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia e Rodococcus) da classe das Actiniobactérias. É responsável por manifestar diversas doenças, entre elas a linfangite ulcerativa em equinos, entretanto pode infectar outros hospedeiros, inclusive humanos. Apresenta uma alta capacidade de adaptação em ambiente intracelular, sendo submetida a diferentes estresses. Entretanto, os determinantes de virulência desta bactéria ainda são pouco conhecidos. Para o estudo, foram selecionados os genes determinantes de virulência e os genes envolvidos nas ilhas de patogenicidade, considerados diferencialmente expressos de acordo com o valor de corte de fold-change. Os genes determinantes de virulência estão envolvidos nos mecanismos de replicação, disseminação, e resistência da bactéria no hospedeiro, incluindo aqueles responsáveis por contornar os mecanismos de defesa do hospedeiro. Os genes presentes nas ilhas sugerem forte participação na virulência desta bactéria, e apresentam a capacidade de aderir e invadir o epitélio da célula hospedeira, produzir toxinas, captar ferro do meio ambiente e mecanismos de resistência. A identificação de tais genes é importante para compreender melhor os processos de infecção e os mecanismos utilizados pelo invasor para sobreviver aos diversos tipos de estresses submetidos, além de proporcionar a busca de alvos terapêuticos. Desta forma, foi analisado o perfil transcricional de Corynebacterium pseudotuberculosis linhagem 258 em condição fisiológica de cultivo e sob a condição de estresse ácido (pH=5). O sequenciamento foi realizado pela plataforma SOLiD V3, e a analise dos transcritos pela tecnologia de RNA-seq. A identificação dos genes diferencialmente expressos foi realizada através do programa DEseq. A análise de expressão diferencial foi realizado pelo software Cufflinks, e a analise funcional pelo software Blast2GO.