ANÁLISE DA EXPRESSÃO GÊNICA DE PACIENTES COM ADENOCARCINOMA GÁSTRICO ASSOCIADO AO VÍRUS EPSTEIN-BARR
Vírus Epstein-Barr, Adenocarcinoma gástrico, RNA-seq
O adenocarcinoma gástrico (AG) é responsável por aproximadamente 95% dos tumores no estômago no Brasil, onde a maior incidência foi observada em Belém. Dentre suas classificações, há a classificação molecular que é dividida em quatro subtipos: instabilidade de microssatélites, estáveis genomicamente, instabilidade cromossômica e positivos para o vírus Epstein-Barr. O Epstein-Barr (EBV) é um vírus que possui atividade oncogênica e foi o primeiro a ser associado a doenças malignas como linfoma de Hodgkin, linfoma de Burkitt e CG. A detecção de EBV pode ser feita tanto por hibridização in situ e atualmente, também, por meio de utilização de técnicas de sequenciamento de RNA para identificar a presença de genes virais em amostras. Nesse sentido, buscando compreender melhor sobre o subtipo positivo para EBV, este trabalho propõe uma classificação molecular por meio de sequenciamento de RNA de 200 amostras, divididas entre tecidos tumorais e tecidos adjacentes do tumor diagnosticados com AG. Para isso, serão utilizados para a classificação as ferramentas Centrifuge e sRNAnalyzer e em seguida será realizado uma análise de expressão diferencial, curva ROC, e análises de enriquecimento dos genes que forem considerados diferencialmente expressos. Portanto, o objetivo deste estudo está relacionado a investigação dos dados para avaliar a relevância deles para a progressão tumoral e também para avaliar possíveis biomarcadores para o AG subtipo EBV+ que possam nortear o desenvolvimento de regimes de fármacos mais eficazes para a imunoterapia. Além da geração de um produto final que realize a classificação molecular do AG por meio de métodos de RNA-seq.